Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Сара Тайхманн

ФРС FMedSci
Сара Тейхманн-ISMB2016 (28960321841) .jpg
Сара Тайхманн выступает на конференции « Интеллектуальные системы для молекулярной биологии» (ISMB) в 2016 году в Орландо, Флорида
Родившийся
Сара Амалия Тайхманн

( 1975-04-15 )15 апреля 1975 г. (45 лет) [1]
Карлсруэ, Германия
Национальность
  • Немецкий
  • Американец [1]
  • Британский
ОбразованиеЕвропейская школа, Карлсруэ
Альма-матерКембриджский университет (бакалавр, магистр, доктор философии)
Дети2 [2] [3] [4]
Награды
Научная карьера
Поля
Учреждения
ТезисЭволюция генома: анализ протеомов новыми методами  (1999)
ДокторантСайрус Чотиа [12] [13]
ДокторантыМ. Мадан Бабу [14]
Влияния
  • Сайрус Чотиа [15]
  • Джанет Торнтон [16] [3]
  • Кристин Оренго [15]
  • Кэрол В. Робинсон [15]
  • Майкл Левитт [15]
  • Вероника ван Хейнинген [17]
Интернет сайтteichlab .org

Сара Амалия Тейхманн (1975 г.р.) [1] FRS FMedSci [18] - руководитель отдела клеточной генетики в Институте Велкома Сэнгера [19] и руководитель исследовательской группы в Европейском институте биоинформатики (EMBL-EBI). [20] [12] Она служит в качестве директора по исследованиям (эквивалент профессора) [21] в Кавендишской лаборатории , [22] в Кембриджском университете и старший научный сотрудник в Черчилль - колледже в Кембридже . [23] [15]

Образование [ править ]

Тайхманн получила образование в Европейской школе в Карлсруэ в Германии с 1981 по 1993 год, где в 1993 году получила европейский бакалавриат . [24] Тейхманн продолжила изучать курсы естественных наук в Тринити-колледже в Кембридже и получила степень бакалавра искусств первого класса. в 1996 году. В 1999 году она защитила кандидатскую диссертацию под руководством Сайруса Чотиа [25] в Лаборатории молекулярной биологии (LMB) по эволюции генома . [26]

Карьера и исследования [ править ]

Получив докторскую степень, Тайхманн провела постдокторское исследование под руководством Джанет Торнтон в Университетском колледже Лондона [20] и финансировалась стипендией Beit Memorial Fellowships for Medical Research . С 2001 по 2012 год она была руководителем программы Совета по медицинским исследованиям (MRC), изучая паттерны белковых взаимодействий и сетей регуляции транскрипции . [27] [28]

В 2013 году Тайхманн был назначен на совместную должность в Wellcome Trust Sanger Institute и Европейском институте биоинформатики (EMBL-EBI). С 2005 по 2015 год она работала научным сотрудником и руководителем исследований в Тринити-колледже в Кембридже . С 2016 года Тейхманн занимал пост главы отдела клеточной генетики в Wellcome Trust Sanger Institute [19] и был руководителем исследовательской группы в EBI. [12]

В исследовании Тейхмана [29] [30] [31] [32] изучается экспрессия генов [33] [34] [35] и сборка белковых комплексов [36] с использованием методов влажной лаборатории и вычислительной биологии . [37] В частности, ее исследовательская группа:

... стремится выяснить принципы эволюции структуры белка, более высокого порядка структуры белков и сворачивания белков , а также принципы , лежащие в основе образования комплекса белков и организации. У нас есть давний интерес к пониманию регуляции экспрессии генов , и в нашей лаборатории в Институте Сэнгера мы используем Т-хелперные клетки мыши в качестве модели дифференцировки клеток . [38]

Исследования Teichmann была финансируется Европейским исследовательским советом (ERC), в Совет по медицинским исследованиям (MRC), в области биотехнологии и биологических наук Исследовательского Совета (BBSRC), [39] Wellcome Trust , то Европейская Molecular Biology организации (EMBO), то Рамочные программы исследований и технологического развития и европейское сотрудничество в области науки и технологий (COST) . [24]

По состоянию на 2015 год Тайхманн руководил несколькими аспирантами [40] [24], включая Мадана Бабу , [14] Вародома Чароенсаву [41] Субхаджьоти Де [42] Джей Хана, [43] Сара Кей Куммерфельд [44] [45] Тина Перика [46] и Цзин Су [47], а также несколько постдокторантов , которые впоследствии стали главными исследователями (ИП). [24] [48] [49] [50]

Награды и награды [ править ]

Тайхманн получил ряд наград. В 2010 году она была награждена медалью Колворта от Биохимического общества . [51] [52] В 2012 году Тейхман был награжден медалью Фрэнсиса Крика и лекцией , членством в Европейской организации молекулярной биологии (EMBO) [7] и премией Листера от Института профилактической медицины Листера . [6] В 2015 году она была награждена премией Майкла и Кейт Барань для молодых исследователей от Биофизического общества [53] и золотой медалью EMBO . Тайхман был избранЧлен Академии медицинских наук (FMedSci) в 2015 году. Ее цитата о выборах гласит:

Сара Тайхманн - руководитель исследовательской группы в Европейском институте биоинформатики EMBL и внесла значительный вклад в биологию за последние 15 лет. Фундаментальным открытием стала ее работа по определению ключевых биофизических механизмов сборки белковых комплексов, показывающая, что белковые комплексы собираются разными, упорядоченными путями. Она показала, что эти пути сборки сохраняются в процессе эволюции и как их можно предсказать из трехмерной структуры. Ее базы данных и методы вычислительного анализа оказали широкое и глубокое влияние на сообщество. Она представляет новое поколение ученых на стыке вычислительной и экспериментальной молекулярной биологии. [18]

Тайхманн также выступала за карьеру женщин в науке, давая возможность ученым в семьях продвигаться по карьерной лестнице, работая неполный рабочий день. [17] Она возглавила дискуссию « Секс в науке» в Wellcome Trust о том, как найти баланс между семейной жизнью и исследовательской работой. [ необходима цитата ] Тейхманн был избран членом ISCB в 2016 году Международным обществом вычислительной биологии . [10]

В 2020 году Тайхманн была включена в « Список научных авторитетов» The Times за ее работу над Атласом клеток человека [54] и избрана членом Королевского общества . [55] В 2012 году она выиграла научную премию « Избирательное право» . [51]

Личная жизнь [ править ]

У Тайхманна две дочери. [2] [4] Тейхманн - соавтор романа « Подростковые детективы» , посвященного языковому обучению детей , [56] который она написала в подростковом возрасте вместе со своей матерью, доктором Вирджинией Тайхманн, преподавателем английского языка в университете Карлсруэ . [57]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Тейхманн, Сара (2007). "Сара Амалия Тейхманн, доктор философии, степень бакалавра (с отличием) CV" (PDF) . mrc-lmb.cam.ac.uk . Лаборатория молекулярной биологии. Архивировано из оригинального (PDF) 26 февраля 2013 года.
  2. ^ a b Гринстрит, Розанна (2018). «Сара Тайхманн:« Я просыпаюсь уже в 4 утра и думаю о работе » » . theguardian.com . Лондон: Гардиан .
  3. ^ a b Маркс, Вивьен (2014). "Авторский файл: Джанет Торнтон". Природные методы . 11 (2): 115. DOI : 10.1038 / nmeth.2831 . PMID 24645189 . S2CID 1970327 .  
  4. ^ a b Боль, Элизабет (2015). «Использование мощности компьютера для понимания биологии». Наука . DOI : 10.1126 / science.caredit.a1500172 .
  5. ^ Перика, Тина; Марш, Джозеф А .; Sousa, Filipa L .; Натан, Эвиатар; Колвелл, Люси Дж .; Ahnert, Sebastian E .; Тайхманн, Сара А. (2012). «Возникновение белковых комплексов: четвертичная структура, динамика и аллостерия» . Сделки Биохимического Общества . 40 (3): 475–491. DOI : 10.1042 / BST20120056 . PMID 22616857 . S2CID 21452774 .  
  6. ^ a b "Доктор Сара Тайхманн, EMBL-Европейский институт биоинформатики и Институт Сэнгера Wellcome Trust" . lister-institute.org.uk . Архивировано из оригинала на 2014-10-15.
  7. ^ a b "Сара А. Тейхманн EBI, Кембридж (Хинкстон), Соединенное Королевство EMBO 2012" . Европейская организация молекулярной биологии. Архивировано из оригинала на 2016-01-19.
  8. ^ «Поиск закономерностей в генах и белках: расшифровка логики молекулярных взаимодействий» . Королевское общество . 2012. Архивировано из оригинала на 2012-11-10.
  9. ^ Обнаружение закономерностей в генах и белках: расшифровка логики молекулярных взаимодействий на YouTube , Королевское общество
  10. ^ а б Анон (2017). «Стипендиаты ISCB» . iscb.org . Международное общество вычислительной биологии . Архивировано из оригинала на 2017-03-20.
  11. ^ Публикации Сары Тейхманн, индексируемые Google Scholar
  12. ^ a b c "Люди и группы: Сара Тейхманн, руководитель группы - исследовательская группа Тейхманна" . EMBL-EBI. 2013. Архивировано из оригинала на 2013-04-03.
  13. ^ Парк, J; Teichmann, SA ; Хаббард, Т ; Chothia, C (1997). «Промежуточные последовательности увеличивают обнаружение гомологии между последовательностями» . Журнал молекулярной биологии . 273 (1): 349–54. DOI : 10.1006 / jmbi.1997.1288 . PMID 9367767 . S2CID 28606158 .  
  14. ^ а б Мохан, Мадан Бабу (2004). Эволюция сетей регуляции транскрипции . jisc.ac.uk (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC 890159758 . EThOS uk.bl.ethos.616113 .  
  15. ^ a b c d e Диллон, Paraminder; Тайхманн, Сара А. (2019). «В разговоре с Сарой Тайхманн» . Журнал FEBS . 286 (8): 1445–1450. DOI : 10.1111 / febs.14806 . ISSN 1742-464X . PMID 31012289 .  
  16. ^ Тейхманн, SA ; Rison, SC; Торнтон, Дж. М .; Райли, М; Гоф, Дж ; Chothia, C (2001). «Эволюция и структурная анатомия низкомолекулярных метаболических путей у Escherichia coli». Журнал молекулярной биологии . 311 (4): 693–708. CiteSeerX 10.1.1.121.1628 . DOI : 10.1006 / jmbi.2001.4912 . PMID 11518524 .  
  17. ^ a b Gaskell & Kostic (2015). "Неудержимая Сара Тайхманн о программировании, материнстве и сборке белкового комплекса: женщина-ученый" . Cell . Архивировано из оригинала на 2016-04-15 . Проверено 25 ноября 2015 .
  18. ^ а б Анон (2015). "Доктор Сара Тайхманн FMedSci" . acmedsci.ac.uk . Лондон: Академия медицинских наук . Архивировано из оригинала на 2015-07-06.
  19. ^ a b "Доктор Сара Тейхманн, FMedSci, руководитель отдела клеточной генетики" . Кембридж: sanger.ac.uk. Архивировано из оригинала на 2016-04-15.
  20. ^ a b Маркс, Вивьен (2016). "Авторский файл: Сара Тайхманн". Природные методы . 13 (4): 279. DOI : 10.1038 / nmeth.3808 . ISSN 1548-7091 . PMID 27203785 . S2CID 205424792 .   
  21. Перейти ↑ Anon (2013). «Должности и обязанности в Кембриджском университете» . Кембриджский университет. Архивировано из оригинала на 2013-07-03.
  22. ^ Анон (2015). "Доктор Сара Тайхманн FMedSci" . tcm.phy.cam.ac.uk . Кембридж. Архивировано из оригинала на 2015-09-12.
  23. ^ "Люди - Черчилль-колледж" . www.chu.cam.ac.uk .
  24. ^ а б в г Анон (2015). «Сара Тайхманн: 40-й Конгресс FEBS - Биохимическая основа жизни - Берлин, Германия» . Федерация европейских биохимических обществ. Архивировано из оригинала на 2015-02-20.
  25. ^ Chothia, C ; Гоф, Дж ; Vogel, C; Тейхманн, С.А. (2003). «Эволюция белкового репертуара» . Наука . 300 (5626): 1701–3. Bibcode : 2003Sci ... 300.1701C . DOI : 10.1126 / science.1085371 . PMID 12805536 . S2CID 27681885 .  
  26. ^ Тайхманн, Сара Амалия (1999). Эволюция генома: анализ протеомов новыми методами (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC 894602472 . EThOS uk.bl.ethos.624585 .  
  27. ^ Бабу, ММ; Ласкомб, Нью-Мексико; Аравинд, L; Герштейн, М ; Тейхманн, С.А. (2004). «Структура и эволюция сетей регуляции транскрипции». Текущее мнение в структурной биологии . 14 (3): 283–91. CiteSeerX 10.1.1.471.9692 . DOI : 10.1016 / j.sbi.2004.05.004 . PMID 15193307 .  
  28. ^ Ласкомб, Нью-Мексико; Бабу, ММ; Yu, H; Снайдер, М; Teichmann, SA ; Герштейн, М (2004). «Геномный анализ динамики регуляторной сети выявляет большие топологические изменения». Природа . 431 (7006): 308–12. Bibcode : 2004Natur.431..308L . DOI : 10,1038 / природа02782 . PMID 15372033 . S2CID 4391278 .  
  29. ^ Sarah A. Teichmann страницы профиля автора в ACM Digital Library
  30. ^ Сара Тейхманн насервере библиографии DBLP
  31. ^ Sarah Teichmann публикации индексированных Scopus библиографической базы данных. (требуется подписка)
  32. ^ Публикации Сары Тейхманн из Europe PubMed Central
  33. ^ Карнинчи, P; Kasukawa, T; Катаяма, S; Гоф, Дж ; Фрит, MC; Maeda, N; Ояма, Р. Раваси, Т; Ленхард, Б; Уэллс, С; Кодзиус, Р; Shimokawa, K; Баич, В.Б .; Brenner, SE ; Баталов, С; Форрест, АР; Заволан, М; Дэвис, MJ; Уилминг, LG; Aidinis, V; Аллен, Дж. Э .; Амбези-Импиомбато, А; Apweiler, R ; Атуралия, РН; Бейли, TL; Бансал, М; Бакстер, L; Байзель, кВт; Берсано, Т; и другие. (2005). «Транскрипционный ландшафт генома млекопитающих» . Наука . 309 (5740): 1559–63. Bibcode : 2005Sci ... 309.1559F . DOI : 10.1126 / science.1112014 . PMID 16141072 . S2CID  8712839 .
  34. ^ Drosophila 12 Genomes, Консорциум; Clark, AG; Эйзен, МБ ; Смит, Д.Р .; Бергман, CM; Оливер, B; Марков Т.А.; Кауфман, ТК; Келлис, М; Гелбарт, Вт; Айер, В.Н.; Поллард, DA; Sackton, TB; Ларракуэнте, AM; Сингх, Северная Дакота; Abad, JP; Abt, DN; Адриан, Б; Агуаде, М; Акаши, H; Андерсон, WW; Aquadro, CF; Арделл, DH; Arguello, R; Артьери, CG; Барбаш Д.А.; Баркер, Д; Barsanti, P; Баттерхэм, П; и другие. (2007). «Эволюция генов и геномов на филогении дрозофилы» . Природа . 450 (7167): 203–18. Bibcode : 2007Natur.450..203C . DOI : 10,1038 / природа06341 . PMID 17994087 .
  35. ^ Уилсон, D; Чароенсаван, V; Куммерфельд, СК; Тейхманн, С.А. (2008). «DBD - таксономически широкие предсказания факторов транскрипции: новое содержание и функциональность» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (выпуск базы данных): D88–92. DOI : 10.1093 / NAR / gkm964 . PMC 2238844 . PMID 18073188 .  
  36. ^ Леви, ED; Тейхманн, S (2013). «Структурные, эволюционные и сборочные принципы олигомеризации белков». Олигомеризация в здоровье и болезнях . Прогресс в молекулярной биологии и трансляционной науке. 117 . С. 25–51. DOI : 10.1016 / B978-0-12-386931-9.00002-7 . ISBN 9780123869319. PMID  23663964 .
  37. ^ Перика, Т; Кондо, Y; Тивари, ИП; Маклафлин, SH; Кемплен, КР; Чжан, X; Стюард, А; Reuter, N; Кларк, Дж ; Тейхманн, С.А. (2014). «Эволюция олигомерного состояния посредством аллостерических путей, имитирующих связывание лиганда» . Наука . 346 (6216): 1254346. DOI : 10.1126 / science.1254346 . PMC 4337988 . PMID 25525255 .  
  38. ^ "Исследование группы Тейхмана EMBL-EBI" . Европейский институт биоинформатики. 2013. Архивировано из оригинала на 2013-04-02.
  39. ^ Анон (2015). «Грант правительства Великобритании на исследования предоставлен Саре Тайхманн» . Исследовательские советы Великобритании . Архивировано из оригинала на 2015-03-03.
  40. ^ Teichmann, Сара (2015). «Выпускники группы Сары Тейхманн» . Европейский институт биоинформатики. Архивировано из оригинала на 2015-02-20.
  41. ^ Charoensawan, Varodom (2011). Эволюция и динамика факторов транскрипции и паттернов экспрессии генов . ethos.bl.uk (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC 890150091 . 
  42. ^ De, Subhajyoti (2008). Эволюция генома человека: изучение дивергенции белков, полиморфизмов и геномного соседства . ethos.bl.uk (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC 890154864 . 
  43. ^ Хан, Джей (2007). Структура, функция и эволюция белок-белковых взаимодействий (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  44. ^ Куммерфельд, Сара Кей (2006). На пути к пониманию белковой вселенной: исследования эволюции и регуляции генов в масштабе генома . ethos.bl.uk (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  45. ^ Леви, Эммануэль Дорам (2008). Классификация, эволюция и сборка белковых комплексов . ethos.bl.uk (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  46. ^ Перика, Тина (2013). Эволюционная и структурная динамика белковых комплексов (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC 890148231 . 
  47. Перейти ↑ Su, Jing (2012). Вычислительное прогнозирование регуляторных элементов (кандидатская диссертация). Кембриджский университет.
  48. ^ Адриан, B; Тейхманн, С.А. (2010). «Динамика онтогенетической экспрессии факторов транскрипции Drosophila melanogaster» . Геномная биология . 11 (4): R40. DOI : 10.1186 / ГБ-2010-11-4-r40 . PMC 2884543 . PMID 20384991 .  
  49. ^ Gsponer, J; Футчик, ME; Teichmann, SA; Бабу, ММ (2008). «Жесткое регулирование неструктурированных белков: от синтеза транскриптов до деградации белков» . Наука . 322 (5906): 1365–8. Bibcode : 2008Sci ... 322.1365G . DOI : 10.1126 / science.1163581 . PMC 2803065 . PMID 19039133 .  
  50. ^ Hebenstreit, D; Камедь; Haider, S; Тернер, диджей; Liò, P; Тейхманн, С.А. (2011). «EpiChIP: Генетическая количественная оценка уровней эпигенетической модификации» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (5): e27. DOI : 10.1093 / NAR / gkq1226 . PMC 3061070 . PMID 21131282 .  
  51. ^ а б Анон (2012). "Честь и реликвия Сары Тайхманн" . Лаборатория молекулярной биологии. Архивировано из оригинала на 2015-03-03.CS1 maint: date and year (link)
  52. ^ Анон (2015). «Женщины в Кембридже: Сара Амалия Тайхманн» . Кембриджский университет. Архивировано из оригинала на 2015-02-20.
  53. ^ «Биофизическое общество называет получателей премии 2015 года» (PDF) . Биофизическое общество.
  54. ↑ Франклин-Уоллис, Оливер (23 мая 2020 г.). «От пандемий до рака: список сил науки» . The Times . ISSN 0140-0460 . Проверено 26 мая 2020 . 
  55. ^ "Сара Тейхманн" . Королевское общество . Проверено 20 сентября 2020 .
  56. ^ Тайхманн, Сара; Тайхманн, Вирджиния (1991). Английская библиотека Корнельсена - Художественная литература: 8. Schuljahr, Stufe 1 - Подростковые детективы: Textheft. Mit Aufgaben und Activities . Германия: Cornelsen Verlag. ISBN 978-3464053362.
  57. ^ Анон. «Соты: доктор Вирджиния Тайхманн: любитель слов» (PDF) . expat-karlsruhe.com . Проверено 7 декабря 2015 .