| Белок SecY / Sec61α | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура белок-проводящего канала. [1] | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | SecY | ||||||||
| Pfam | PF00344 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002208 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00612 | ||||||||
| SCOP2 | 1rh5 / СФЕРА / СУПФАМ | ||||||||
| TCDB | 3.A.5 | ||||||||
| OPM суперсемейство | 19 | ||||||||
| Белок OPM | 1rh5 | ||||||||
| Мембранома | 165 | ||||||||
| |||||||||
Белок SecY является основной трансмембранной субъединицей бактериальной Sec или типа II секреторного пути и белки-секретирующей АТФаза комплекса, известной также как SecYEG транслокон . Гомологи комплекса SecYEG обнаружены у эукариот и архей, субъединица которых известна как Sec61α. [2]
Секреция некоторых белков, несущих сигнальный пептид через внутреннюю мембрану у грамотрицательных бактерий, происходит через путь препротеиновой транслоказы. Белки продуцируются в цитоплазме в качестве предшественников и требуют шаперонной субъединицы, чтобы направлять их к компоненту транслоказы внутри мембраны. [3] Оттуда зрелые белки либо направляются на внешнюю мембрану, либо остаются в виде периплазматических белков. Белковые субъединицы транслоказы кодируются на бактериальной хромосоме.
Путь транслоказы включает 7 белков, включая белок-шаперон ( SecB ), АТФазу ( SecA ), интегральный мембранный комплекс (SecY, SecE и SecG) и два дополнительных мембранных белка, которые способствуют высвобождению зрелого пептида в периплазму ( SecD и SecF). [3] Белок-шаперон SecB [4] представляет собой высококислотный гомотетрамерный белок, который существует в виде «димера димеров» в бактериальной цитоплазме. SecB поддерживает препротеины в развернутом состоянии после трансляции и направляет их на периферический мембранный белок АТФазу SecA для секреции. [5]Структура сборки SecYEG Escherichia coli выявила сэндвич из двух мембран, взаимодействующих через обширные цитоплазматические домены. [6] Каждая мембрана состоит из димеров SecYEG. Мономерный комплекс содержит 15 трансмембранных спиралей.
Белок SecY эубактерий взаимодействует с сигнальными последовательностями секреторных белков, а также с двумя другими компонентами системы транслокации белков: SecA и SecE. SecY представляет собой интегральный белок плазматической мембраны, состоящий из 419–492 аминокислотных остатков, который, по-видимому, содержит 10 трансмембранных (TM), 6 цитоплазматических и 5 периплазматических областей. [7]
Цитоплазматические области 2 и 3 и TM-домены 1, 2, 4, 5, 7 и 10 хорошо консервативны: консервативные цитоплазматические области, как полагают, взаимодействуют с факторами цитоплазматической секреции, тогда как TM-домены могут участвовать в экспорте белка. [8] SecY также кодируется в геноме хлоропластов некоторых водорослей, где он может участвовать в системе экспорта белка, подобной прокариотам, через две мембраны эндоплазматического ретикулума хлоропластов (CER), который присутствует у хромофитных и криптофитных водорослей. [9]
Подсемейства [ править ]
- SecY-родственная транслоказа InterPro : IPR014269
Белки человека, содержащие этот домен [ править ]
SEC61A1 ; SEC61A2 ;
Ссылки [ править ]
- Перейти ↑ Van den Berg B, Clemons WM, Collinson I, Modis Y, Hartmann E, Harrison SC, Rapoport TA (январь 2004). «Рентгеновское строение белок-проводящего канала». Природа . 427 (6969): 36–44. Bibcode : 2004Natur.427 ... 36В . DOI : 10,1038 / природа02218 . PMID 14661030 . S2CID 4360143 .
- ^ Auer J, Spicker G, Böck A (июнь 1991). «Присутствие в архебактерии Methanococcus vannielii гена, гомологичного secY эубактерий». Биохимия . 73 (6): 683–8. DOI : 10.1016 / 0300-9084 (91) 90048-6 . PMID 1764515 .
- ^ a b Бикер К.Л., Филлипс Г.Дж., Силхави Т.Дж. (июнь 1990 г.). «Гены sec и prl кишечной палочки». Журнал биоэнергетики и биомембран . 22 (3): 291–310. DOI : 10.1007 / BF00763169 . PMID 2202721 . S2CID 10694864 .
- ^ Дриссен AJ (май 2001). «SecB, молекулярный шаперон с двумя лицами» (PDF) . Тенденции в микробиологии . 9 (5): 193–6. DOI : 10.1016 / S0966-842X (01) 01980-1 . PMID 11336818 .
- ^ Müller JP (июль 1999). «Эффекты сверхэкспрессии пре-протеина на синтез SecB в Escherichia coli». Письма о микробиологии FEMS . 176 (1): 219–27. DOI : 10.1016 / s0378-1097 (99) 00239-6 . PMID 10418149 .
- ^ Breyton C, Хаас W, Рапопорт Т.А., Kühlbrandt W, Коллинсон I (август 2002). «Трехмерная структура бактериального комплекса транслокации белков SecYEG». Природа . 418 (6898): 662–5. Bibcode : 2002Natur.418..662B . DOI : 10,1038 / природа00827 . PMID 12167867 . S2CID 4347664 .
- ↑ Ито К. (сентябрь 1992 г.). «SecY и интегральные мембранные компоненты системы транслокации белков Escherichia coli» . Молекулярная микробиология . 6 (17): 2423–8. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.1992.tb01417.x . PMID 1406280 . S2CID 37452721 .
- ^ Suh JW, Бойлан С. А., Томас М., Долан К., Оливер Д. Б., Цена CW (февраль 1990). «Выделение гомолога secY из Bacillus subtilis: доказательства общего пути экспорта белка у эубактерий». Молекулярная микробиология . 4 (2): 305–14. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.1990.tb00597.x . PMID 2110998 . S2CID 27373166 .
- Перейти ↑ Douglas SE (февраль 1992 г.). «Гомолог secY обнаружен в пластидном геноме Cryptomonas phi» . Письма FEBS . 298 (1): 93–6. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (92) 80029-G . PMID 1544427 . S2CID 22351990 .
