Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Сенекавирус
3CJI Senecavirus.png
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Класс:Pisoniviricetes
Заказ:Пикорнавиралес
Семья:Picornaviridae
Род:Сенекавирус
Типовой вид
Сенекавирус А
Синонимы
  • Вирус долины Сенека
  • Вирус долины Сенека-001

Senecavirus - это род вирусов отряда Picornavirales в семействе Picornaviridae . Свинья и, возможно, корова служат естественными хозяевами. Существуетнастоящее время только один вид в этом роде: видовой типа Senecavirus . [1] [2] Сенекавирус - онколитический пикорнавирус, способный к репликации. Он обладает избирательным тропизмом в отношении рака с нейроэндокринными особенностями, включая мелкоклеточный рак легкого (SCLC) и несколько детских солидных опухолей, включая ретинобластому, нейробластому и медуллобластому. [3] Фаза I клинических испытаний сенекавируса.у взрослых с нейроэндокринными опухолями показали, что сенекавирус, по-видимому, безопасен для введения в дозах до 1E11 vp / кг. [4] Обладает потенциальной противоопухолевой активностью. [5] [6]

Структура [ править ]

Вирусы в Senecavirus не имеют оболочки, имеют икосаэдрическую, сферическую и круглую геометрию, с симметрией T = pseudo3. Диаметр около 30 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 7,3 килобайт. [1]

РодСоставСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
СенекавирусИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл [ править ]

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в хозяйскую клетку достигается прикреплением вируса к рецепторам хозяина, что опосредует эндоцитоз. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем лизиса и виропоринов. Свинья и, возможно, также корова служат естественным хозяином. [1]

Рецептор вируса долины Сенека был идентифицирован как рецептор токсина сибирской язвы 1 . [7]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
СенекавирусСвиньи, КороваОнколитическийЭндоцитоз клеточных рецепторовЛизисЦитоплазмаЦитоплазмаНеизвестный

Таксономия [ править ]

Группа: оцРНК (+)

Заказ: Picornavirales
  • Семья: Picornaviridae
    • Род: Senecavirus
      • Сенекавирус А

[2]

Открытие и происхождение [ править ]

Полная последовательность генома сенекавируса была завершена в 2008 г. [8]

Об инфекционном клоне сенекавируса было сообщено в 2012 году [9].

Предполагается, что сенекавирус атакует раковые стволовые клетки. [10]

Диагностические моноклональные антитела были созданы против сенекавируса. [11]

В то время как последовательность кодирующего белка генома SVV является наиболее близкими членами в Cardiovirus роде, некодирующая РНК сайт вхождения рибосом (IRES), наиболее похожий на те из пестивирусу рода, в том числе и вируса классической чумы свиней и Hepacivirus рода , в том числе вируса гепатита С . [12]

РНК SVV IRES имеет сходство по последовательности, структуре и функциям с IRES вируса гепатита С. Субдомен IIa IRES SVV и HCV имеет сходную структуру и функцию связывания лиганда, как видно из его кристаллической структуры. [13] Эта область субдомена IIa классифицируется как лиганд-чувствительный переключатель РНК, который принимает четко определенные свободные от лиганда и связанные конформации без разрыва или образования каких-либо пар оснований в своей вторичной структуре при взаимном преобразовании между двумя состояниями. [14] Этот переключатель РНК из SVV IRES был включен в треугольные наноструктуры РНК. [15]

Клинические испытания [ править ]

Первоначальный изолят разрабатывается в качестве противоракового терапевтического средства виртуальной компанией Neotropix, Inc. под названием NTX-010.

Фаза I

  • Исследование безопасности сенекавируса у пациентов с солидными опухолями с нейроэндокринными особенностями. [16] Это исследование было опубликовано в 2011 году, и данные показывают, что вирус хорошо переносился 30 пациентами, и наблюдались некоторые признаки противоопухолевой активности. Полученные данные потребовали дальнейшего изучения вируса в ходе испытания II фазы мелкоклеточного рака легкого . [4]

Фаза II

  • Сенекавирус после химиотерапии при лечении пациентов с мелкоклеточным раком легкого на обширной стадии [17]
  • Сенекавирус и циклофосфамид у молодых пациентов с нейробластомой , рабдомиосаркомой или редкими опухолями с нейроэндокринными особенностями [18]

Репликация вируса [ править ]

Считается, что сенекавирус интернализуется посредством интернализации, опосредованной рецептором, но рецептор-хозяин пока не идентифицирован.

См. Также [ править ]

  • Виротерапия
  • Онколитический вирус

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  2. ^ а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Проверено 15 июня 2015 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  3. ^ Редди, PS; Берроуз, KD; Хейлз, Л. М.; Ганеш, С .; Джонс, BH; Idamakanti, N .; Hay, C .; Ли, СС; Skele, KL; Васько, А. -Дж .; Yang, J .; Уоткинс, DN; Рудин, СМ; Халленбек, PL (2007). «Вирус долины Сенека, онколитический пикорнавирус с системным распространением и лечение нейроэндокринного рака» . Журнал JNCI Национального института рака . 99 (21): 1623–1633. DOI : 10,1093 / JNCI / djm198 . PMC 5261858 . PMID 17971529 .  
  4. ^ a b Рудин CM, Пуарье JT, Senzer NN, Stephenson J, Loesch D, Burroughs KD, Reddy PS, Hann CL, Hallenbeck PL (15 февраля 2011 г.). «Фаза I клинического исследования вируса долины Сенеки (SVV-001), пикорнавируса, способного к репликации, в запущенных солидных опухолях с нейроэндокринными особенностями» . Клинические исследования рака . 17 (4): 888–95. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-10-1706 . PMC 5317273 . PMID 21304001 . Проверено 30 мая 2013 года .   CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  5. ^ Определение Национального института рака Seneca Valley вируса-001 . Национальный институт рака. Проверено 9 октября 2008 г.
  6. ^ Morton CL, Houghton PJ, Kolb EA и др. (Август 2010 г.). «Первоначальное тестирование репликационного вируса долины Сенека (NTX-010) программой педиатрических доклинических испытаний» . Педиатр Рак крови . 55 (2): 295–303. DOI : 10.1002 / pbc.22535 . PMC 3003870 . PMID 20582972 .  
  7. ^ Miles LA, Burga LN, Gardner EE, Bostina M, Poirier JT, Rudin CM (2017) Рецептор токсина сибирской язвы 1 является клеточным рецептором для вируса долины Сенека. J Clin Invest
  8. ^ Хейлз, LM; Ноулз, штат Нью-Джерси; Редди, PS; Xu, L .; Hay, C .; Халленбек, Польша (2008). «Полный анализ последовательности генома вируса-001 долины Сенека, нового онколитического пикорнавируса» . Журнал общей вирусологии . 89 (5): 1265–1275. DOI : 10.1099 / vir.0.83570-0 . PMID 18420805 . 
  9. ^ Пуарье, JT; Редди, PS; Idamakanti, N .; Ли, СС; Пень, КЛ; Берроуз, KD; Hallenbeck, PL; Рудин, CM (2012). «Характеристика полноразмерного инфекционного клона кДНК и репортерного производного GFP онколитического пикорнавируса SVV-001» . Журнал общей вирусологии . 93 (Pt 12): 2606–2613. DOI : 10.1099 / vir.0.046011-0 . PMID 22971818 . 
  10. ^ Фридман, GK; Кэссиди, KA; Байерле, EA; Маркерт, JM; Гиллеспи, GY (2012). «Нацеливание на педиатрические стволовые клетки рака с помощью онколитической виротерапии» . Педиатрические исследования . 71 (4–2): 500–510. DOI : 10.1038 / pr.2011.58 . PMC 3607376 . PMID 22430386 .  
  11. ^ Ян, М .; Van Bruggen, R .; Сюй, В. (2011). «Создание и диагностическое применение моноклональных антител против вируса долины Сенека» . Журнал ветеринарных диагностических исследований . 24 (1): 42–50. DOI : 10.1177 / 1040638711426323 . PMID 22362934 . 
  12. ^ Уиллкокс, ММ; Шкафчик, N .; Gomwalk, Z .; Royall, E .; Бахшеш, М .; Belsham, GJ; Idamakanti, N .; Берроуз, KD; Редди, PS; Hallenbeck, PL; Робертс, LO (2011). "Структурные особенности элемента внутреннего входа рибосомы вируса долины Сенека (IRES): пикорнавирус с пестивирусоподобным IRES" . Журнал вирусологии . 85 (9): 4452–4461. DOI : 10,1128 / JVI.01107-10 . PMC 3126232 . PMID 21325406 .  
  13. ^ Бурнеке, Марк; Дибров, Сергей; Гу, Цзин; Уайлс, Дэвид; Германн, Томас (11 ноября 2014 г.). «Функциональная консервация, несмотря на структурную дивергенцию в переключателях РНК, реагирующих на лиганд» . Proc Natl Acad Sci USA . 111 (45): 15952–7. Bibcode : 2014PNAS..11115952B . DOI : 10.1073 / pnas.1414678111 . PMC 4234586 . PMID 25349403 .  
  14. ^ Бурнеке, Марк; Германн, Томас (август 2015 г.). «Механические переключатели РНК, реагирующие на лиганд» . Биология РНК . 12 (8): 780–786. DOI : 10.1080 / 15476286.2015.1054592 . PMC 4615790 . PMID 26158858 .  
  15. ^ Бурнеке, Марк; Дибров, Сергей; Германн, Томас (23 февраля 2016 г.). "Кристаллическая структура-управляемый дизайн самособирающихся нанотреугольников РНК" . Angew Chem Int Ed Engl . 55 (12): 4097–100. DOI : 10.1002 / anie.201600233 . PMC 4824544 . PMID 26914842 .  
  16. ^ «Исследование безопасности вируса долины Сенека у пациентов с солидными опухолями с нейроэндокринными особенностями» .
  17. ^ «Вирус долины Сенека-001 после химиотерапии при лечении пациентов с мелкоклеточным раком легких в обширной стадии» .
  18. ^ «Вирус-001 долины Сенека и циклофосфамид в лечении молодых пациентов с рецидивирующей или рефрактерной нейробластомой, рабдомиосаркомой или редкими опухолями с нейроэндокринными особенностями» .

Внешние ссылки [ править ]

  • Структура вируса-001 долины Сенека - в Virus Particle ExploreR (VIPERdb)
  • Вирусная зона : Сенекавирус
  • ICTV