Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Sulfolobus solfataricus
Научная классификация
Домен:
Архей
Королевство:
Crenarchaeota
Тип:
Crenarchaeota
Учебный класс:
Термопротеи
Заказ:
Сульфолобалес
Семья:
Sulfolobaceae
Род:
Saccharolobus
Разновидность:
S. solfataricus
Биномиальное имя
Saccharolobus solfataricus
(Стеттер и Зиллиг, 1980 г.) Сакаи и Куросава, 2018 г.

Saccharolobus solfataricus является вид из термофильных archaeon . Он был переведен из рода Sulfolobus в новый род Saccharolobus с описанием Saccharolobus caldissimus в 2018 г. [1]

Впервые он был изолирован и обнаружен в вулкане Сольфатара ( в честь которого он был впоследствии назван) в 1980 году двумя немецкими микробиологами Карлом Сеттером и Вольфрамом Циллигом на вулкане Сольфатара (Пишарелли-Кампания, Италия). [2]

Однако эти организмы не изолированы от вулканов, а встречаются по всему миру в таких местах, как горячие источники. Этот вид лучше всего растет при температуре около 80 ° по Цельсию, уровне pH от 2 до 4 и достаточном количестве серы для метаболизма сольфатарика , чтобы получить энергию. Эти условия квалифицируют его как экстремофил, и он особенно известен как термоацидофил из-за его предпочтения к высоким температурам и низким уровням pH, а также к аэробным и гетеротропным категориям для своей метаболической системы. [3] Он обычно имеет сферическую форму ячеек с частыми лепестками. Будучи автотрофом, он получает энергию от выращивания на сере или даже на различных органических соединениях. [4]

В настоящее время это наиболее изученный организм, относящийся к ветви Crenarchaeota . Solfataricus исследуются на предмет их методов репликации ДНК, клеточного цикла, хромосомной интеграции, транскрипции, обработки РНК и трансляции. Все данные указывают на то, что в организме имеется большой процент генов, специфичных для архей , что демонстрирует различия между тремя типами микробов: архей , бактерий и эукариев .

Геном [ править ]

Sulfolobus solfataricus является наиболее изученным микроорганизмом с молекулярной, генетической и биохимической точек зрения из-за его способности процветать в экстремальных условиях; легко культивируется в лаборатории; более того, он может обмениваться генетическим материалом посредством процессов трансформации, трансдукции и конъюгации.

Основная мотивация для секвенирования этих микроорганизмов из - за термостабильность из белков , которые обычно денатурации при высокой температуре . Полная последовательность геном из S. solfataricus был завершен в 2001 году [5] На одной хромосоме, есть 2,992,245 пар оснований , которые кодируют 2977 белков и обильный РНК. Одна треть белков, кодируемых S. solfataricus, не имеет гомологов в других геномах. Что касается остальных кодируемых белков, 40% специфичны для архей , 12% являются общими с бактериями и 2,3% являются общими с эукариями . [6]33% этих белков кодируется исключительно у Sulfolobus . Большое количество ORF (открытая рамка считывания) очень схожи в Thermoplasma . [3]

Небольшие ядрышковые РНК (мяРНК), уже присутствующие у эукариот, также были идентифицированы у S.Solfataricus и S.acidolcaldarius . Они уже известны своей ролью в посттранскрипционных модификациях и удалении интронов из рибосомной РНК у Eucarya. [7]

Геном Sulfolobus характеризуется наличием коротких тандемных повторов, вставок и повторяющихся элементов, он имеет широкий диапазон разнообразия, поскольку он имеет 200 различных элементов последовательности вставок IS.

Термофильная обратная гираза [ править ]

Стабилизация двойной спирали против денатурации у архей обусловлена ​​присутствием особого специфического термофильного фермента , обратной гиразы. Он был обнаружен у гипертермофильных и термофильных архей и бактерий. Есть два гена в Sulfolobus , что каждый кодируют обратной гиразы. [8] Это определяется атипичной топоизомеразой ДНК, и основная деятельность заключается в производстве положительных суперспиралей в замкнутой кольцевой ДНК. Положительная суперспирализация важна для предотвращения образования открытых комплексов. Обратные спирали состоят из двух областей: первая - это геликаза.подобным и вторым является топоизомераза I. Возможная роль обратной гиразы может заключаться в использовании положительной суперспирализации для сборки хроматиноподобных структур. [9] В 1997 году ученые обнаружили еще одну важную особенность Sulfolobus  : этот микроорганизм содержит топоизомеразу типа II, называемую TopoVI, чья субъединица A гомологична фактору мейотической рекомбинации Spo11, который играет доминирующую роль в инициации мейотической рекомбинации у всех эукарий. [10] [11]

S. solfataricus состоит из трех топоизомераз типа I, TopA, и двух обратных гираз, TopR1 и TopR2, и одной топоизомеразы типа II, TopoVI. [12]

Белки, связывающие ДНК [ править ]

В Филюме Crenarchaeota есть три белок , которые связываются с малой бороздкой Dna как гистоны : Alba, Cren7 и Sso7d, которые были изменены после процесса перевода. Они небольшие и были обнаружены в нескольких штаммах Sulfolobus, но не в другом геноме. Хроматиновый белок у Sulfolobus составляет 1-5% от общего количества. Они могут иметь как структурные, так и регулирующие функции. Они похожи на человеческие белки HMG-box из-за их влияния на геномы, экспрессию и стабильность, а также на эпигенетические процессы. [13] У видов, лишенных гистонов, они могут быть ацетилированы и метилированы, как гистоны эукариот. [14] [15] [16] [17] СульфолобусШтаммы представляют различные специфические ДНК-связывающие белки, такие как семейство белков Sso7d. Они стабилизируют двойную спираль, предотвращая денатурацию при высокой температуре, тем самым способствуя отжигу выше точки плавления . [18]

Главный компонент хроматина архей представлен белком семейства Sac10b, известным как Alba (ацетилирование снижает сродство связывания). [19] [20] Эти белки представляют собой небольшие основные и димерные связывающие нуклеиновые кислоты белки. Более того, он консервативен в большинстве секвенированных археальных геномов. [21] [22] Состояние ацетилирования Alba, например, влияет на доступ к промотору и транскрипцию in vitro, тогда как состояние метилирования другого белка хроматина Sulfolobus , Sso7D, изменяется в зависимости от температуры культивирования. [23] [24]

Работа группы Вольфрама Зиллига, представляющая ранние доказательства эукариотических характеристик транскрипции в Archea, с тех пор сделала Sulfolobus идеальной модельной системой для исследований транскрипции. Недавние исследования на Sulfolobus, в дополнение к другим видам архей, в основном сосредоточены на составе, функции и регуляции аппарата транскрипции в этих организмах и на фундаментальных консервативных аспектах этого процесса как у Eucarya, так и у Archaea. [25]

Перенос ДНК [ править ]

Воздействие на Saccharolobus solfataricus повреждающих ДНК агентов УФ-облучение , блеомицин или митомицин C вызывает агрегацию клеток. [26] Другие факторы физического стресса, такие как изменение pH или температурный сдвиг, не вызывают агрегации, что позволяет предположить, что индукция агрегации вызвана именно повреждением ДНК. Ajon et al. [27] показали, что УФ-индуцированная агрегация клеток опосредует обмен хромосомными маркерами с высокой частотой. Скорость рекомбинации превышала таковую в неиндуцированных культурах до трех порядков. Frols et al. [26] [28] и Ajon et al. [27]предположили, что процесс переноса ДНК, индуцируемый УФ-излучением, и последующая гомологичная рекомбинационная репарация представляют собой важный механизм для поддержания целостности хромосом. Этот ответ может быть примитивной формой сексуального взаимодействия, подобной более хорошо изученной бактериальной трансформации, которая также связана с переносом ДНК между клетками, приводящим к гомологичной рекомбинационной репарации повреждений ДНК. [ необходима цитата ]

Метаболизм [ править ]

Известно, что Sulfolobus solfataricus хемоорганотрофно растет в присутствии кислорода на различных органических соединениях, таких как сахара, спирты, аминокислоты и ароматические соединения, такие как фенол . [29]

Он использует модифицированный путь Энтнера-Дудроффа для окисления глюкозы, и полученные молекулы пирувата могут быть полностью минерализованы в цикле TCA . [29]

Молекулярный кислород - единственный известный акцептор электронов на конце цепи переноса электронов . [30] Помимо органических молекул, этот вид Archea может также использовать сероводород [6] и элементарную серу в качестве доноров электронов и фиксировать CO2 , возможно, с помощью цикла HP / HB [29], что делает его также способным к хемоавтотрофической жизни. Недавние исследования показали также способность расти, хотя и медленно, к окислению молекулярного водорода. [1]

Ферредоксин [ править ]

Предполагается, что ферредоксин действует как основной метаболический переносчик электронов у S. solfataricus . Это контрастирует с большинством видов бактерий и эукарий, которые обычно полагаются на НАДН в качестве основного переносчика электронов. S. solfataricus обладает сильными эукариотическими особенностями в сочетании со многими уникальными особенностями архей. Результаты открытий пришли из различных методов их ДНК-механизмов, клеточных циклов и переходного аппарата. В целом, исследование явилось ярким примером различий, обнаруженных у кренархей и эвриархий . [6] [31]

Экология [ править ]

Среда обитания [ править ]

S. solfataricus является экстремальным термофилом Archea, как и остальные виды рода Sulfolobus, он имеет оптимальные условия роста в областях с сильной вулканической активностью, с высокой температурой и очень кислым pH, [32] эти специфические условия типичны для вулканических областей. как гейзер или терамловые источники, на самом деле наиболее изученными странами, где были обнаружены микроорганизмы, являются: США (Йеллоустонский национальный парк), [33] Новая Зеландия, [34] остров и Италия, известные своими вулканическими явлениями. Исследование, проведенное группой индонезийских ученых, показало присутствие сообщества Sulfolobus также на Западной Яве, подтверждая, что высокие опасения, низкий уровень pH и присутствие серы являются необходимыми условиями для роста этих микробов. [35]

Фумарола вулкана Сольфатара - Кампания, Италия.

Подкисление почвы [ править ]

S. solfataricus способен окислять серу в соответствии с метаболической стратегией, одним из продуктов этих реакций является H + и, как следствие, это приводит к медленному подкислению окружающей среды. Подкисление почвы усиливается там, где происходят выбросы загрязняющих веществ в результате промышленной деятельности, и этот процесс снижает количество гетеротрофных бактерий, участвующих в разложении, что является основой для повторного использования органических веществ и, в конечном итоге, для удобрения почвы. [36]

Биотехнология: использование ресурса Sulfolobus [ править ]

Сегодня во многих областях применения мы заинтересованы в использовании Sulfolobus sulfataricus в качестве источника ферментов термостабильности для исследований и диагностики, а также в пищевой, текстильной и чистящей промышленности, а также в целлюлозно-бумажной промышленности. Кроме того, этот фермент перегружен из-за его каталитического разнообразия, высокой стабильности pH и температуры, повышенной устойчивости к органическим растворителям и устойчивости к протеолизу. [37] [38]

В настоящее время все большее значение приобретают тетраэфирные липиды, мембранные везикулы с антимикробными свойствами, компоненты трегалозы и новые β-галактоолигосахариды. [39]

β-галактозидаза [ править ]

Термостабильный фермент β-галактозидаза выделен из экстремально термофильных архебактерий Sulfolobus solfataricus, штамм МТ-4.

Этот фермент используется во многих промышленных процессах жидкостей, содержащих лактозу, путем очистки и определения их физико-химических свойств. [40]

Протеазы [ править ]

Промышленность заинтересована в стабильных протеазах, а также во многих изученных протеазах сульфолобусов. [41]

Активные аминопептидазы , связанные с шаперониной из Solfobulus solfataricus МТ4 была описаны . [42]

Sommaruga et al. (2014) [43] также улучшили стабильность и выход реакции хорошо охарактеризованной карбоксипептидазы из S.solfataricus MT4 за счет иммобилизации фермента магнитными наночастицами.

Эстеразы / липазы [ править ]

Новый термостабильный внеклеточного липолитический фермент серин arylesterase который первоначально обнаружен для их большого действия в результате гидролиза фосфорорганических соединений из thermoacidophilic archaeon Sulfolobus solfataricus P1 . [44]

Шаперонины [ править ]

В ответ на температурный шок (50,4 ° C) в клетках кишечной палочки крошечный теплый оглушающий белок (S.so-HSP20) из S.solfataricus P2 эффективно использовался для улучшения толерантности. [45]

Принимая во внимание тот факт, что шаперонин Ssocpn (920 кДа), который включает АТФ , K + и Mg2 +, но не продуцировал никаких дополнительных белков в S.solfataricus для доставки свернутых и динамических белков из денатурированных материалов, он хранился в ячейке ультрафильтрации пока ренатурированные подложки перемещались через пленку. [46]

Липосомы [ править ]

Из-за своего тетраэфирного липидного материала мембрана чрезвычайно термофильных архей уникальна по своему составу. Липиды архей - многообещающий источник липосом с исключительной стабильностью температуры и pH и плотностью против утечки растворенного вещества. Такие археосомы - возможные инструменты для доставки лекарств, вакцин и генов. [47]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b Сакаи HD, Куросава Н. (апрель 2018 г.). "Saccharolobus caldissimus gen. Nov., Sp. Nov., Факультативно анаэробный железоредуцирующий гипертермофильный археон, выделенный из кислых горячих источников на суше, и реклассификация Sulfolobus solfataricus как Saccharolobus solfataricus comb. Nov. И Sulfolobacata shibata shibata. " . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 68 (4): 1271–1278. DOI : 10.1099 / ijsem.0.002665 . PMID  29485400 .
  2. ^ "Где был впервые обнаружен Sulfolobus solfataricus?" . www.intercept.cnrs.fr .
  3. ↑ a b Ciaramella M, Pisani FM, Rossi M (август 2002 г.). «Молекулярная биология экстремофилов: недавний прогресс гипертермофильных архей Sulfolobus». Антони ван Левенгук . 81 (1–4): 85–97. DOI : 10,1023 / A: 1020577510469 . PMID 12448708 . 
  4. Перейти ↑ Brock TD, Brock KM, Belly RT, Weiss RL (1972). «Sulfolobus: новый род сероокисляющих бактерий, живущих при низких значениях pH и высоких температурах». Archiv für Mikrobiologie . 84 (1): 54–68. DOI : 10.1007 / bf00408082 . PMID 4559703 . 
  5. ^ Charlebois RL, Gaasterland T, Ragan MA, Дулитл WF, Sensen CW (июнь 1996). «Проект генома Sulfolobus solfataricus P2». Письма FEBS . 389 (1): 88–91. DOI : 10.1016 / s0014-5793 (97) 81281-1 . PMID 8682213 . 
  6. ^ а б в Ше К., Сингх Р.К., Конфалониери Ф., Живанович Й., Аллард Дж., Авайез М.Дж. и др. (Июль 2001 г.). «Полный геном кренархея Sulfolobus solfataricus P2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (14): 7835–40. Bibcode : 2001PNAS ... 98.7835S . DOI : 10.1073 / pnas.141222098 . PMC 35428 . PMID 11427726 .  
  7. Перейти ↑ Omer AD, Lowe TM, Russell AG, Ebhardt H, Eddy SR, Dennis PP (апрель 2000 г.). «Гомологи малых ядрышковых РНК у архей» . Наука . 288 (5465): 517–22. Bibcode : 2000Sci ... 288..517O . DOI : 10.1126 / science.288.5465.517 . PMID 10775111 . 
  8. ↑ Couturier M, Bizard AH, Garnier F, Nadal M (сентябрь 2014 г.). «Понимание клеточного участия двух обратных извилин из гипертермофильных архей Sulfolobus solfataricus» . BMC Molecular Biology . 15 (1): 18. DOI : 10,1186 / 1471-2199-15-18 . PMC 4183072 . PMID 25200003 .  
  9. ^ Déclais AC, Marsault J, F Конфалоньери, де Латур CB, Duguet M (июнь 2000). «Обратная гираза, два домена тесно взаимодействуют, способствуя положительной суперспирализации» . Журнал биологической химии . 275 (26): 19498–504. DOI : 10,1074 / jbc.m910091199 . PMID 10748189 . 
  10. ^ Bergerat А, де Масси B, D, Gadelle Varoutas PC, Николя А, Фортер Р (март 1997 года). «Атипичная топоизомераза II из архей с последствиями для мейотической рекомбинации». Природа . 386 (6623): 414–7. Bibcode : 1997Natur.386..414B . DOI : 10.1038 / 386414a0 . PMID 9121560 . 
  11. ^ Фортер P, Bergerat A, Lopez-Гарсиа P (май 1996). «Уникальная топология ДНК и ДНК-топоизомеразы гипертермофильных архей» . FEMS Microbiology Reviews . 18 (2–3): 237–48. DOI : 10.1111 / j.1574-6976.1996.tb00240.x . PMID 8639331 . 
  12. ^ Кутюрье М, Gadelle Д, Фортер Р, М Надаль, Garnier F (ноябрь 2019). «Обратная гираза TopR1 отвечает за гомеостатический контроль суперспирализации ДНК у гипертермофильных архей Sulfolobus solfataricus». Молекулярная микробиология . 113 (2): 356–368. DOI : 10.1111 / mmi.14424 . PMID 31713907 . 
  13. ^ Маларки CS, Черчилль ME (декабрь 2012 г.). «Групповой ящик с высокой мобильностью: самый полезный игрок ячейки» . Направления биохимических наук . 37 (12): 553–62. DOI : 10.1016 / j.tibs.2012.09.003 . PMC 4437563 . PMID 23153957 .  
  14. Перейти ↑ Payne S, McCarthy S, Johnson T, North E, Blum P (ноябрь 2018 г.). «Sulfolobus solfataricus» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (48): 12271–12276. DOI : 10.1073 / pnas.1808221115 . PMC 6275508 . PMID 30425171 .  
  15. ^ Guagliardi A, Черчиа L, M Moracci, Росси M (октябрь 2000). «Хромосомный белок sso7d кренархея Sulfolobus solfataricus восстанавливает агрегированные белки зависимым от гидролиза АТФ способом» . Журнал биологической химии . 275 (41): 31813–8. DOI : 10,1074 / jbc.m002122200 . PMID 10908560 . 
  16. ^ Shehi Е, Граната В, Дель Веккио P, G Бароне, Фуси Р, Р Тортора, Грациано G (июль 2003 г.). «Термическая стабильность и ДНК-связывающая активность вариантной формы белка Sso7d из архона Sulfolobus solfataricus, усеченного по лейцину 54». Биохимия . 42 (27): 8362–8. DOI : 10.1021 / bi034520t . PMID 12846585 . 
  17. ^ Baumann Н, Кнапп S, Karshikoff А, Ladenstein Р, Т HARD (апрель 1995 г.). «ДНК-связывающая поверхность белка Sso7d из Sulfolobus solfataricus». Журнал молекулярной биологии . 247 (5): 840–6. DOI : 10.1006 / jmbi.1995.0184 . PMID 7723036 . 
  18. ^ Guagliardi A, Napoli A, Росси M, Сиарамелла M (апрель 1997). «Отжиг комплементарных цепей ДНК выше точки плавления дуплекса, вызванный архейным белком». Журнал молекулярной биологии . 267 (4): 841–8. DOI : 10.1006 / jmbi.1996.0873 . PMID 9135116 . 
  19. ^ Фортер P, Конфалоньери F, S Кнапп (май 1999). «Идентификация гена, кодирующего специфичные для архей ДНК-связывающие белки семейства Sac10b». Молекулярная микробиология . 32 (3): 669–70. DOI : 10.1046 / j.1365-2958.1999.01366.x . PMID 10320587 . 
  20. ↑ Xue H, Guo R, Wen Y, Liu D, Huang L (июль 2000 г.). «Обильный ДНК-связывающий белок из гипертермофильной археи Sulfolobus shibatae влияет на суперспирализацию ДНК в зависимости от температуры» . Журнал бактериологии . 182 (14): 3929–33. DOI : 10.1128 / JB.182.14.3929-3933.2000 . PMC 94576 . PMID 10869069 .  
  21. ^ Гоял M, Банерджи C, Наг S, Bandyopadhyay U (май 2016). «Семейство белков Alba: структура и функции». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1864 (5): 570–83. DOI : 10.1016 / j.bbapap.2016.02.015 . PMID 26900088 . 
  22. ^ Wardleworth BN, Russell RJ, Bell SD, Taylor GL, White MF (сентябрь 2002). «Структура Alba: белок хроматина архей, модулированный ацетилированием» . Журнал EMBO . 21 (17): 4654–62. DOI : 10,1093 / emboj / cdf465 . PMC 125410 . PMID 12198167 .  
  23. ^ Bell SD, Botting CH, Wardleworth BN, Джексон SP, White MF (апрель 2002). «Взаимодействие Alba, консервативного белка хроматина архей, с Sir2 и его регуляция ацетилированием» . Наука . 296 (5565): 148–51. Bibcode : 2002Sci ... 296..148B . DOI : 10.1126 / science.1070506 . PMID 11935028 . 
  24. ^ Baumann Н, Кнапп S, Lundbäck Т, Ladenstein Р, Т HARD (ноябрь 1994 года). «Структура раствора и ДНК-связывающие свойства термостабильного белка из археи Sulfolobus solfataricus». Структурная биология природы . 1 (11): 808–19. DOI : 10.1038 / nsb1194-808 . PMID 7634092 . 
  25. ^ Zillig W, Штеттер KO, Janeković D (июнь 1979). «ДНК-зависимая РНК-полимераза из архебактерии Sulfolobus acidocaldarius» . Европейский журнал биохимии . 96 (3): 597–604. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1979.tb13074.x . PMID 380989 . 
  26. ^ а б Фрелс С., Аджон М., Вагнер М., Тейхманн Д., Золгадр Б., Фолеа М. и др. (Ноябрь 2008 г.). «Индуцируемая УФ-излучением клеточная агрегация гипертермофильной археи Sulfolobus solfataricus опосредована образованием пилей» (PDF) . Молекулярная микробиология . 70 (4): 938–52. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.2008.06459.x . PMID 18990182 .  
  27. ^ a b Ajon M, Fröls S, van Wolferen M, Stoecker K, Teichmann D, Driessen AJ, et al. (Ноябрь 2011 г.). «УФ-индуцируемый обмен ДНК в гипертермофильных архее, опосредованный пилями IV типа» (PDF) . Молекулярная микробиология . 82 (4): 807–17. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.2011.07861.x . PMID 21999488 .  
  28. ^ Fröls S, White MF, Schleper C (февраль 2009). «Реакции на УФ-повреждение у модельного архея Sulfolobus solfataricus» . Труды биохимического общества . 37 (Pt 1): 36–41. DOI : 10.1042 / BST0370036 . PMID 19143598 . 
  29. ^ a b c Улас Т., Ример С.А., Запарты М., Зиберс Б., Шомбург Д. (31.08.2012). «Реконструкция в масштабе генома и анализ метаболической сети гипертермофильных архей Sulfolobus solfataricus» . PLOS ONE . 7 (8): e43401. Bibcode : 2012PLoSO ... 743401U . DOI : 10.1371 / journal.pone.0043401 . PMC 3432047 . PMID 22952675 .  
  30. ^ Саймон G, Вальтер Дж, Zabeti N, Combet-Blanc , Y, R Auria, ван - дер - Оост J, Casalot л (октябрь 2009 г.). «Влияние концентрации O2 на Sulfolobus solfataricus P2» . Письма о микробиологии FEMS . 299 (2): 255–60. DOI : 10.1111 / j.1574-6968.2009.01759.x . PMID 19735462 . 
  31. ^ Zillig W, Штеттер KO, Wunderl S, Schulz W, Присс H, Scholz I (апрель 1980). «Группа Sulfolobus-« Caldariella »: систематика на основе структуры ДНК-зависимых РНК-полимераз». Архив микробиологии . 125 (3): 259–69. DOI : 10.1007 / BF00446886 .
  32. ^ Grogan DW (декабрь 1989). «Фенотипическая характеристика архебактерий рода Sulfolobus: сравнение пяти штаммов дикого типа» . Журнал бактериологии . 171 (12): 6710–9. DOI : 10.1128 / jb.171.12.6710-6719.1989 . PMC 210567 . PMID 2512283 .  
  33. ^ "Сульфолобус" . Microbewiki .
  34. ^ Hetzer A, Morgan HW, McDonald ИК, Daughney CJ (июль 2007). «Микробная жизнь в бассейне с шампанским, геотермальный источник в Вайотапу, Новая Зеландия». Экстремофилы . 11 (4): 605–14. DOI : 10.1007 / s00792-007-0073-2 . PMID 17426919 . 
  35. ^ Aditiawati P, Yohandini H, Madayanti F (2009). «Микробное разнообразие кислого горячего источника (kawah hujan B) в геотермальном поле области Камоджанг, западная Ява-Индонезия» . Открытый журнал микробиологии . 3 : 58–66. DOI : 10.2174 / 1874285800903010058 . PMC 2681175 . PMID 19440252 .  
  36. ^ Bryant RD, Горди Е.А., Laishley EJ (1979). «Влияние закисления почвы на почвенную микрофлору». Загрязнение воды, воздуха и почвы . 11 (4): 437. Bibcode : 1979WASP ... 11..437B . DOI : 10.1007 / BF00283435 .
  37. ↑ Степанкова, Вероника (14 октября 2013 г.). «Стратегии стабилизации ферментов в органических растворителях». Катализ ACS . 3 (12): 2823–2836. DOI : 10.1021 / cs400684x .
  38. ^ DANIEL, RM (1982). «Корреляция между термостабильностью белка и устойчивостью к протеолизу» . Биохимический журнал . 207 (3): 641–644. DOI : 10.1042 / bj2070641 . PMC 1153914 . PMID 6819862 .  
  39. ^ Quehenberger, Julian (2017). «Sulfolobus - потенциальный ключевой организм в биотехнологии будущего» . Границы микробиологии . 8 : 2474. DOI : 10,3389 / fmicb.2017.02474 . PMC 5733018 . PMID 29312184 .  
  40. ^ М. PISANI, Франческа (1990). «Термостабильная β-галактозидаза из архебактерии Sulfolobus solfataricus». Европейский журнал биохимии . 187 (2): 321–328. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1990.tb15308.x . PMID 2105216 . 
  41. ^ Ханнер, Маркус (1990). Выделение и характеристика внутриклеточной аминопептидазы из чрезвычайно термофильной архебактерии Sulfolobus solfataricus . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - общие предметы . 1033 . Elsevier BV, стр. 148–153. DOI : 10.1016 / 0304-4165 (90) 90005-H . ISBN 0117536121. PMID  2106344 .
  42. ^ Кондо, Ивано; Руджеро, Давиде (1998). «Новая аминопептидаза, связанная с шаперонином 60 кДа у термофильных архей Sulfolobus solfataricus. Mol. Microbiol» . Молекулярная микробиология . 29 (3): 775–785. DOI : 10.1046 / j.1365-2958.1998.00971.x . PMID 9723917 . 
  43. ^ Соммаруге, Сильвия (2014). «Ммобилизация карбоксипептидазы из Sulfolobus solfataricus на магнитных наночастицах улучшает стабильность и функциональность ферментов в органических средах. BMC Biotechnol» . BMC Biotechnology . 14 (1): 82. DOI : 10,1186 / 1472-6750-14-82 . PMC 4177664 . PMID 25193105 .  
  44. Перейти ↑ Park, Young-Jun (2016). «Очистка и характеристика нового индуцируемого термостабильного внеклеточного липолитического фермента из термоацидофильной археи Sulfolobus solfataricus P1». Журнал молекулярного катализа B: энзиматический . 124 : 11–19. DOI : 10.1016 / j.molcatb.2015.11.023 .
  45. ↑ Ли, Донг-Чхоль (август 2011 г.). «Термотолерантность и функция молекулярных шаперонов небольшого белка теплового шока HSP20 из гипертермофильных архей, Sulfolobus solfataricus P2. Шапероны клеточного стресса» . Клеточный стресс и шапероны . 17 (1): 103–108. DOI : 10.1007 / s12192-011-0289-Z . PMC 3227843 . PMID 21853411 .  
  46. ^ Черчиа, Лаура (7 августа 1999). «Реактор на основе архейного шаперонина для ренатурации денатурированных белков. Экстремофил». Экстремофилы: жизнь в экстремальных условиях . 4 (1): 1–7. DOI : 10.1007 / s007920050001 . PMID 10741831 . 
  47. ^ B. Patel, Girishchandra (1999). «Археобактериальные эфирные липидные липосомы (археосомы) как новые системы доставки вакцин и лекарств». Критические обзоры в биотехнологии . 19 (4): 317–357. DOI : 10.1080 / 0738-859991229170 . PMID 10723627 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Fiorentino G, Del Giudice I, Petraccone L, Bartolucci S, Del Vecchio P (июнь 2014 г.). «Конформационная стабильность и свойства связывания лиганда BldR, члена семейства MarR, из Sulfolobus solfataricus». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1844 (6): 1167–72. DOI : 10.1016 / j.bbapap.2014.03.011 . PMID  24704039 .
  • de Rosa M, Bemporad F, Pellegrino S, Chiti F, Bolognesi M, Ricagno S (сентябрь 2014 г.). «Конструирование краевой цепи предотвращает агрегацию, подобную нативной, в ацилфосфатазе Sulfolobus solfataricus» . Журнал FEBS . 281 (18): 4072–84. DOI : 10.1111 / febs.12861 . PMID  24893801 .
  • Gamsjaeger R, Kariawasam R, Touma C, Kwan AH, White MF, Cubeddu L (октябрь 2014 г.). «Назначение резонансов ¹H, ¹³C и ¹⁵N основной цепи и боковой цепи OB-домена одноцепочечного ДНК-связывающего белка из Sulfolobus solfataricus и картирование химического сдвига ДНК-связывающего интерфейса». Назначение биомолекулярного ЯМР . 8 (2): 243–6. DOI : 10.1007 / s12104-013-9492-4 . PMID  23749431 .
  • Ван Дж, Чжу Дж, Мин С, Ву С (май 2014 г.). «Слитая γ-лактамаза с CBD-связывающим доменом из Sulfolobus solfataricus является эффективным катализатором производства (-) γ-лактама» . BMC Biotechnology . 14 : 40. DOI : 10,1186 / 1472-6750-14-40 . PMC  4041915 . PMID  24884655 .

'

Внешние ссылки [ править ]

  • Типовой штамм Sulfolobus solfataricus в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию