Эта статья включает в себя список литературы , связанной литературы или внешних ссылок , но ее источники остаются неясными, поскольку в ней отсутствуют встроенные цитаты . ( Октябрь 2017 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения ) |
Субтрактивная гибридизация - это технология, которая позволяет на основе ПЦР амплифицировать только фрагменты кДНК, которые различаются между контрольным (драйвером) и экспериментальным транскриптомом . кДНК производится из мРНК . Выделены различия в относительном количестве транскриптов, а также генетические различия между видами. Метод основан на удалении дцДНК, образованной гибридизацией между контрольным и тестовым образцами, таким образом устраняя кДНК или гДНК аналогичного количества и сохраняя дифференциально экспрессируемые или вариабельные по последовательности транскрипты или геномные последовательности.
Подавляющая субтрактивная гибридизация также успешно использовалась для идентификации штаммов или видоспецифичных последовательностей ДНК у различных бактерий, включая виды Vibrio ( метагеномика ).
См. Также [ править ]
Внешние ссылки [ править ]
- Обзор на evrogen.com
- Munir, S .; Singh, S .; Kaur, K .; Капур, В. (2004). «Подавление субтрактивной гибридизации в сочетании с анализом микрочипов для изучения дифференциальной экспрессии генов в инфицированных вирусом клетках» . Биологические процедуры онлайн . 6 : 94–104. DOI : 10.1251 / bpo77 . PMC 420231 . PMID 15181476 .
- Дьяченко, Л. (1996). «Подавляющая субтрактивная гибридизация: метод создания дифференциально регулируемых или тканеспецифичных зондов и библиотек кДНК» . Труды Национальной академии наук . 93 (12): 6025–6030. DOI : 10.1073 / pnas.93.12.6025 . PMC 39182 . PMID 8650213 .
- Гэлбрейт, EA; Antonopoulos, DA; Белый, BA (2004). «Подавляющая субтрактивная гибридизация как инструмент для определения генетического разнообразия в метагеноме окружающей среды: рубец как модель». Экологическая микробиология . 6 (9): 928–937. DOI : 10.1111 / j.1462-2920.2004.00575.x . PMID 15305918 .