Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Темпл Смит
Темпл Ф. Смит в Йельском университете, 20 июня 2008 г.
Темпл Смит в Йельском университете в 2008 году
Родившийся
Темпл Феррис Смит

7 марта 1939 г. (возраст  ( 1939-03-07 )81)
Оберн, Нью-Йорк
Альма-матер
ИзвестенАлгоритм Смита-Ватермана [1]
Награды
Научная карьера
УчрежденияБостонский университет
ТезисАмплитуды дейтронов из теории ядерного рассеяния составных частиц  (1969)
ВлиянияМайкл Уотерман
Интернет сайтwww .bu .edu / eng / profile / Temple-f-smith-ph-d /

Темпл Феррис Смит (родился 7 марта 1939 г.) - заслуженный профессор биомедицинской инженерии [4] [5], который помог разработать алгоритм Смита-Уотермана с Майклом Уотерманом в 1981 году. [1] Алгоритм Смита-Уотермана служит основой. для сравнений нескольких последовательностей, идентифицирующих сегмент с максимальным локальным сходством последовательностей, см. выравнивание последовательностей . Этот алгоритм используется для идентификации похожих сегментов ДНК , РНК и белков . Он был директором [ когда? ] Исследовательского центра биомолекулярной инженерии [4] вБостонскому университету двадцать лет, а теперь [ когда? ] заслуженный профессор .

Образование [ править ]

Смит получил степень бакалавра в 1963 году на физическом факультете Университета Пердью , а затем докторскую степень в 1969 году на физическом факультете Университета Колорадо в Боулдере . [6]

Исследования и карьера [ править ]

Получив докторскую степень, Смит проводил постдокторское исследование с марта 1969 по август 1971 года на кафедре биофизики и генетики Медицинской школы Университета Колорадо в Боулдере. [ необходима цитата ]

Его исследования сосредоточены на применении различных компьютерных и математических методов для открытия синтаксических и семантических паттернов в последовательностях нуклеиновых кислот и аминокислот. В последние годы это было сосредоточено на молекулярной эволюции семейств белков. такие как бета-пропеллеры WD-повторов, ассоциированная с трансляцией GTPase и рибосомные белки. [7] Он известен созданием алгоритма Смита-Уотермана . [1]

Смит занимал следующие должности:

  • 1965–1966: инструктор , ВВС США Лоури, Денвер, Колорадо.
  • 1971–1984: профессор факультета физики Университета Северного Мичигана, Маркетт, Мичиган.
  • 1985–1991: директор отдела компьютерных исследований молекулярной биологии, Институт рака Дана-Фарбер, Гарвардская медицинская школа и Гарвардская школа общественного здравоохранения.
  • 1991–2009: директор Ресурсного центра биомолекулярной инженерии Бостонского университета.
  • 1999–: Соорганизатор , 1999 Институт академического развития молодежи, открывающий День биотехнологии
  • 2000–: соучредитель и директор по информационным технологиям Modular Genetics, Inc.
  • 2000–: Молодежный тренер по хоккею [ необходима цитата ]

Избранные публикации [ править ]

  • М. Мариотти, Т.Ф. Смит, PH Судмант и Г. Голдбергер, «Псевдогенизация семенников-специфичного Lfg5 предшествует расхождению человека / неандертальца», Journal of Human Genetics 59, 288–291 (2014)
  • Хайман Хартман и Темпл Ф. Смит «Эволюция рибосомы и генетический код», Life, 4 (2), 227–249 (2014).
  • Хартман, Х. и Т.Ф. Смит, «ГТФазы и происхождение рибосомы», Biology Direct, 5: 36-39, (2010)
  • Хартман, Хайман и Смит, Темпл Ф. «Эволюция ресничек и эукариотической клетки» Подвижность клеток и цитоскелет. 66: 215-219. (2009)
  • Ху, Лан, Смит, Темпл Ф. и Гольдбергер, Габриэль. «LFG: кандидат в семейство регуляторных генов апоптоза» Апоптоз. 14: 1255-1265. (2009)
  • Смит, Темпл Ф., Ли, Юнг К., Гутелл, Робин Р. и Хартман, Хайман. «Происхождение и эволюция рибосомы» Biology Direct 3: 16, 1–13 (2008)
  • Смит, Темпл Ф. «Глава 2: Разнообразие белков-повторов WD» Семейство белков Coronin, 20–30 (2008)
  • Бхуткар, Арджун В., Гелбарт, Уильям М. и Смит, Темпл Ф. (2007). Вывод филогении реаранжировки в масштабе генома и предкового порядка генов: тематическое исследование дрозофилы. Геном Биология 8, R236
  • Бхуткар, Арджун, Руссо, Сьюзан М., Смит, Темпл Ф. и Гелбарт, Уильям М. «Анализ генома в масштабе генома позиционно перемещенных генов» Исследование генома 17: 1880-1887 (2007)
  • Хартман, Хайман, Фаваретто, Паола и Смит, Темпл Ф. «Архейское происхождение эукариотической трансляционной системы» Archaea 2: 1-9 (2006)
  • Бьенковска, Ядвига, Хартман, Хайман и Смит, Темпл Ф. (2003). Метод поиска гомологов малых белков, убиквитиноподобных белков в прокариотических клетках? Protein Engineering 16 (12), 897–904.
  • Венкатесан, Кавита, Макманус, Хизер Р., Мелло, Крейг К., Смит, Темпл Ф. и Хансен, Улла. (2003). Функциональная консервация между членами древнего семейства дублированных транскрипционных факторов, LSF / Grainyhead. Исследование нуклеиновых кислот 31 (15), 4304–4316.
  • Чжан YX1, Фокс JG, Хо И, Чжан Л., Стиллз Х.Ф. младший, Смит Т.Ф. Сравнение гена главного белка внешней мембраны (MOMP) пневмонита мыши (MoPn) и штаммов SFPD хомяка Chlamydia trachomatis с другими штаммами Chlamydia. Mol Biol Evol. 1993 ноябрь; 10 (6): 1327–42.

Награды и награды [ править ]

Смит был награжден премией ISCB Senior Scientist Award [2] и избран членом ISCB в 2009 году Международным обществом вычислительной биологии . [3]

В 2002 году он был принят в Американский институт медицинской и биологической инженерии (AIMBE) «за выдающийся вклад в определение и развитие области биоинформатики с упором на новые инженерные методы для прогнозирования структуры и функции белков». [ необходима цитата ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Смит, Т .; Waterman, MS (1981). «Идентификация общих молекулярных подпоследовательностей». Журнал молекулярной биологии . 147 (1): 195–197. CiteSeerX  10.1.1.63.2897 . DOI : 10.1016 / 0022-2836 (81) 90087-5 . PMID  7265238 .
  2. ^ a b Майзель, М. (2007). "ISCB чествует Темпл Ф. Смита и Эрана Сигала" . PLOS Вычислительная биология . 3 (6): e128. Bibcode : 2007PLSCB ... 3..128M . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.0030128 . PMC 1904388 . PMID 17604447 .  
  3. ^ a b "Стипендиаты ISCB" . iscb.org . Международное общество вычислительной биологии . 2017. Архивировано из оригинала на 2017-03-20.
  4. ^ a b "Исследовательский центр биомолекулярной инженерии | Бостонский университет" . Bmerc-www.bu.edu . Проверено 24 марта 2017 .
  5. ^ "Архивная копия" . Архивировано из оригинала на 2007-07-07 . Проверено 3 мая 2007 .CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка )
  6. ^ Смит, Темпл Феррис (1969). Амплитуды дейтронов из теории ядерного рассеяния составных частиц (кандидатская диссертация). Колорадский университет в Боулдере. OCLC 50252533 . ProQuest 302393082 .  
  7. ^ "Архивная копия" . Архивировано из оригинала на 2012-04-04 . Проверено 28 октября 2011 .CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка )