Фактор некроза опухоли ( ФНО ) надсемейство является белком надсемейства из типа II трансмембранных белков , содержащих домен гомологии ФНО и образующих тримеры . Члены этого суперсемейства могут высвобождаться из клеточной мембраны посредством внеклеточного протеолитического расщепления и функционировать как цитокин . Эти белки экспрессируются преимущественно иммунными клетками и регулируют различные клеточные функции, включая иммунный ответ и воспаление, а также пролиферацию, дифференцировку, апоптоз и эмбриогенез. [2] [3]
Надсемейство факторов некроза опухолей | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | TNF | |||||||
Pfam | PF00229 | |||||||
ИнтерПро | IPR006052 | |||||||
ПРОФИЛЬ | PDOC00224 | |||||||
SCOP2 | 1тнф / СФЕРА / СУПФАМ | |||||||
OPM суперсемейство | 292 | |||||||
Белок OPM | 2hew | |||||||
Мембранома | 80 | |||||||
|
TNF | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | TNF | |||||||
Pfam | PF00229 | |||||||
Клан пфам | CL0100 | |||||||
ИнтерПро | IPR006052 | |||||||
ПРОФИЛЬ | PDOC00561 | |||||||
SCOP2 | 1тн / СФЕРА / СУПФАМ | |||||||
|
Суперсемейство состоит из 19 членов, которые связываются с 29 членами суперсемейства рецепторов TNF . [4] Появление ортологов у беспозвоночных намекает на древнее происхождение этого надсемейства в эволюции. [2]
PROSITE картина этого надсемейства находится в бета - листе в центральной части белка , который является консервативным во всех членах.
Члены
Существует 19 членов семьи, которые численно классифицируются как TNFSF #, где # обозначает номер члена, иногда за которым следует буква. [4] [2]
TNFSF № | Имя | Синонимы | Ген | Функция |
---|---|---|---|---|
1 | Лимфотоксин альфа | TNFβ, TNFSF1B | LTA | Вызвание воспаления и противовирусный ответ, развитие вторичных лимфоидных органов , роль в онкогенезе |
2 | Фактор некроза опухоли | TNFα, Dif, некрозин, TNFSF1A, ... | TNF | Регулирование иммунных клеток, индукция лихорадки , кахексии , воспаления и апоптоза , ингибирование онкогенеза и репликации вирусов и ответ на сепсис |
3 | Лимфотоксин бета | TNFγ | LTB | Вызвание воспаления и противовирусный ответ, развитие вторичных лимфоидных органов , роль в онкогенезе |
4 | Лиганд OX40 | CD252, Gp34, CD134L | TNFSF4 | Активация Т-клеточного иммунного ответа костимуляцией Т-клеток |
5 | Лиганд CD40 | CD154, TRAP, Gp39, T-BAM | CD40LG | Регулирование адаптивного иммунного ответа путем активации антигенпрезентирующей клетки |
6 | Fas лиганд | CD178, APTL, CD95L | FASLG | Регулирование гомеостаза Т-клеток путем индукции апоптоза |
7 | Лиганд CD27 | CD70 | CD70 | Регулирование активации В-клеток и гомеостаза Т-клеток |
8 | Лиганд CD30 | CD153 | TNFSF8 | Индукция апоптоза в Т - клеток и В - клеток , профилактики аутоиммунных заболеваний |
9 | CD137 лиганд | 4-1 баррелей | TNFSF9 | |
10 | Связанный с TNF лиганд, индуцирующий апоптоз | CD253, APO-2L | TNFSF10 | Подавление онкогенеза , индукция апоптоза |
11 | Рецепторный активатор ядерного фактора каппа-лиганд | CD254, OPGL, TRANCE, ODF | TNFSF11 | Рост тканей (особенно регенерация и ремоделирование костей), созревание дендритных клеток |
12 | TNF-связанный слабый индуктор апоптоза | АПО-3Л, ДР3Л | TNFSF12 | Регуляция ангиогенеза , индукция апоптоза |
13 | Лиганд, индуцирующий пролиферацию | CD256, TALL-2, TRDL1 | TNFSF13 | Регулирование развития В-клеток и выживания плазматических клеток |
13B | Фактор активации В-клеток | CD257, BLyS, TALL-1, TNFSF20, ... | TNFSF13B | Стимуляция пролиферации и дифференцировки В-клеток |
14 | СВЕТ | CD258, HVEML | TNFSF14 | Стимуляция пролиферации Т-клеток , регуляция апоптоза |
15 | Ингибитор роста эндотелия сосудов | TL1, TL-1A | TNFSF15 | Подавление ангиогенеза |
18 | Член суперсемейства TNF 18 | ДЕВУШКА, АИТРЛ, ТЛ-6 | TNFSF18 | Регулирование выживаемости Т-клеток |
19 | Эктодисплазин А | ЭД1-А1, ЭД1-А2 | EDA | Развитие эктодермальных тканей |
Рекомендации
- ^ Байенс KJ, De Bondt HL, Raeymaekers A, Фирс W, De пустослов CJ (апрель 1999). «Структура фактора некроза опухолей мыши с разрешением 1,4 A: в сторону модуляции его селективности и тримеризации». Acta Crystallographica Раздел D . 55 (Pt 4): 772–8. DOI : 10.1107 / s0907444998018435 . PMID 10089307 .
- ^ а б в Эволюция иммунной системы: сохранение и разнообразие . Амстердам: Эльзевир. 2016. ISBN. 978-0-12-801975-7. OCLC 950694824 .
- ^ Аббас А.К., Лихтман А.Х., Пиллаи С. Клеточная и молекулярная иммунология (Девятое изд.). Филадельфия, Пенсильвания. ISBN 978-0-323-47978-3. OCLC 973917896 .
- ^ а б Аггарвал ББ, Гупта СК, Ким Дж.Х. (январь 2012 г.). «Исторические взгляды на фактор некроза опухоли и его надсемейство: 25 лет спустя, золотое путешествие» . Кровь . 119 (3): 651–65. DOI : 10.1182 / кровь-2011-04-325225 . PMC 3265196 . PMID 22053109 .
Внешние ссылки
- Опухоль + некроз + факторы в медицинских предметных рубриках Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
- ген фактора некроза опухоли pex1