Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с мяРНК U11 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Сплайсосомная РНК U11
U11 вторичная структура.png
Вторичная структура сплайсосомной РНК U11 человека
Идентификаторы
СимволU11
РфамRF00548
Прочие данные
Тип РНКДжин ; мяРНК ; сращивание
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИGO: 0000369 GO: 0030627 GO: 0005692
ТАКТАК: 0000398
Структуры PDBPDBe

U11 мяРНК ( малая ядерная рибонуклеиновая кислота ) является важным некодирующим РНКОМ в незначительной сплайсосоме белкового комплексе , который активирует альтернативный механизм сплайсинга . Минорная сплайсосома связана с такими же белковыми компонентами, как и основная сплайсосома . Он использует мяРНК U11 для распознавания 5 'сайта сплайсинга (функционально эквивалентна мяРНК U1 ), в то время как мяРНК U12 связывается с точкой ветвления для распознавания 3' сайта сплайсинга (функционально эквивалентна мяРНК U2 ). [1]

Вторичная структура [ править ]

U11 мяРНК имеет структуру петля-стержень с 5'-концом в качестве последовательности сайта сплайсинга (5 'ss) [2] и содержит четыре структуры петли стержня (I-IV). Структурное сравнение мяРНК U11 между растениями, позвоночными и насекомыми показывает, что она свернута в структуру с четырехсторонним соединением в 5'-сайте и в структуру петли стебля на 3'-сайте. [3]

Сайт связывания во время сборки [ править ]

Область 5'-сайта сплайсинга обладает последовательностью, комплементарной 5'-сайту сплайсинга интронов пре-мРНК эукариотического типа U12 . И 5'-сайт сплайсинга, и сайт связывания Sm являются высококонсервативными у всех видов. [3] Кроме того, стволовая петля III является либо возможным сайтом связывания белка, либо областью спаривания оснований, поскольку она имеет высококонсервативную нуклеотидную последовательность «AUCAAGA». [3]

Роль при альтернативном сращивании [ править ]

Незначительный сплайсосомный механизм

SnRNPs U11 и U12 (минорный сплайсосомный путь) являются функциональными аналогами snRNP U1 и U2 (основной сплайсосомный путь), тогда как snRNP U4 atac / U6 atac подобны U4 / U6 . В отличие от основного пути сплайсинга, мяРНП U11 и U12 связываются с мРНК в виде стабильного, предварительно сформированного комплекса ди-мяРНП U11 / U12. Это достигается за счет использования семи белков (65K, 59K, 48K, 35K, 31K, 25K и 20K). Четыре из них (59K, 48K, 35K и 25K) связаны с мяРНК U11. [4]

Во время образования сплайсосомы 5'-конец мяРНК U11 и U12 взаимодействует с 5'-сайтом сплайсинга и последовательностью точки ветвления мРНК соответственно посредством спаривания оснований. [4] [5] U11 snRNP связывается с тандемным повтором, известным как U11 snRNP-binding энхансером сплайсинга (USSE), и инициирует процесс сплайсинга. [6] Так как мяРНК U11 и U12 объединяются в бикомплекс, они образуют молекулярный мост между двумя концами интронов в пре-сплайсосомном комплексе. [4] Белки U11-48K и U11 / U12-65K распознают сайт сплайсинга интрона типа U12 и стабилизируют би-комплекс U11 / U12. [6] После активации сплайсосомного комплекса мяРНК U11 покидает сборку.

Этот вид распознавания 5'-сайтов сплайсинга и связывания интронов посредством взаимодействий белок-белок , белок-РНК и РНК-РНК является уникальным в минорном сплайсесомном комплексе, в отличие от главного сплайсосомного. [4] Поскольку альтернативный сплайсинг является ключом к изменению экспрессии генов (мРНК), кодирующих белки, U11 играет решающую роль в этом регуляторном процессе и ответственен за формирование протеомного пула . Следовательно, мяРНК U11 важна с точки зрения эволюционных аспектов. [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Эллиот, Дэвид; Ладомери, Майкл (2011). Молекулярная биология РНК . Издательство Оксфордского университета. п. 124.
  2. Перейти ↑ Russell AG, Charette JM, Spencer DF, Gray MW (октябрь 2006 г.). «Раннее эволюционное происхождение минорной сплайсосомы». Природа . 443 (7113): 863–6. Bibcode : 2006Natur.443..863R . DOI : 10,1038 / природа05228 . PMID 17051219 . S2CID 4419061 .  
  3. ^ a b c Шнайдер С., Уилл К.Л., Брозиус Дж., Фриландер М.Дж., Люрманн Р. (июнь 2004 г.). «Идентификация эволюционно расходящейся малой ядерной рибонуклеопротеиновой частицы U11 у дрозофилы» (PDF) . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (26): 9584–9. Bibcode : 2004PNAS..101.9584S . DOI : 10.1073 / pnas.0403400101 . PMC 470718 . PMID 15210936 .   
  4. ^ a b c d Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T., Lührmann R (июнь 2004 г.). «18S U11 / U12 snRNP человека содержит набор новых белков, не обнаруженных в U2-зависимой сплайсосоме» . РНК . 10 (6): 929–41. DOI : 10,1261 / rna.7320604 . PMC 1370585 . PMID 15146077 .  
  5. ^ Колосова I, Паджетт RA (март 1997). «МнРНК U11 взаимодействует in vivo с 5'-сайтом сплайсинга U12-зависимых (AU-AC) интронов пре-мРНК» . РНК . 3 (3): 227–33. PMC 1369475 . PMID 9056760 .  
  6. ^ a b Verbeeren J, Niemelä EH, Turunen JJ, Will CL, Ravantti JJ, Lührmann R, Frilander MJ (март 2010 г.). «Древний механизм контроля сплайсинга: мяРНП U11 как активатор альтернативного сплайсинга». Молекулярная клетка . 37 (6): 821–33. DOI : 10.1016 / j.molcel.2010.02.014 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0012-D5F2-D . PMID 20347424 . 
  7. ^ Кашьяп, Лув; Трипати Парул. «Альтернативный сплайсинг: как один ген может производить множество белков» (PDF) . Объяснение биологических наук .

Внешние ссылки [ править ]

  • Страница для сплайсосомальной РНК U11 в Rfam