Минорная сплайсосомная РНК U12 образуется из малых ядер U12 ( мяРНК ) вместе с мяРНК U4atac / U6atac , U5 и U11 и ассоциированными белками, образует сплайсосому, которая расщепляет дивергентный класс интронов пре- мРНК с низким содержанием . Хотя последовательность U12 сильно отличается от последовательности U2 , они функционально аналогичны. [1]
Минорная сплайсосомная РНК U12 | |
---|---|
Идентификаторы | |
Символ | U12 |
Рфам | RF00007 |
Прочие данные | |
Тип РНК | Джин ; мяРНК ; сращивание |
Домен (ы) | Эукариоты |
ИДТИ | GO: 0000371 GO: 0045131 GO: 0005693 |
ТАК | ТАК: 0000399 |
Структуры PDB | PDBe |
Состав
Предсказанная вторичная структура РНК U12 опубликована [2] . Однако показанная здесь альтернативная одиночная шпилька на 3'-конце, по-видимому, лучше соответствует выравниванию расходящихся последовательностей Drosophila melanogaster и Arabidopsis thaliana . [3] Вырезанные последовательности интронов U12 собираются в биологической базе данных, называемой базой данных интронов U12 .
Рекомендации
- ↑ Tarn WY, Steitz JA (апрель 1997 г.). «Сплайсинг пре-мРНК: открытие новой сплайсосомы удваивает сложность». Направления биохимических наук . 22 (4): 132–7. DOI : 10.1016 / S0968-0004 (97) 01018-9 . PMID 9149533 .
- ^ Шукла Г.К., Пэджетт Р.А. (апрель 1999 г.). «Сохранение функциональных характеристик мяРНК U6atac и U12 между позвоночными и высшими растениями» . РНК . 5 (4): 525–38. DOI : 10.1017 / S1355838299982213 . PMC 1369779 . PMID 10199569 .
- ^ Отаке Л. Р., Скамборова П., Хашимото С., Стейтц Дж. А. (февраль 2002 г.). «Дивергентная сплайсосома типа U12 необходима для сплайсинга пре-мРНК и важна для развития у дрозофилы». Молекулярная клетка . 9 (2): 439–46. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00441-0 . PMID 11864616 .
Внешние ссылки
- Страница минорной сплайсосомной РНК U12 в Rfam