Желтый флуоресцентный белок (YFP) - это генетический мутант зеленого флуоресцентного белка (GFP), первоначально полученный из медузы Aequorea victoria . [1] Его пик возбуждения составляет 513 нм, а пик излучения - 527 нм. [2] Как и родительский GFP, YFP является полезным инструментом в клеточной и молекулярной биологии, поскольку пики возбуждения и излучения YFP отличаются от GFP, что позволяет изучать несколько процессов / белков в рамках одного эксперимента.
Три улучшенные версии YFP - это Citrine, Venus и Ypet. У них пониженная чувствительность к хлоридам, более быстрое созревание и повышенная яркость (определяемая как произведение коэффициента экстинкции и квантового выхода ). Обычно YFP служит акцептором для генетически кодируемых сенсоров FRET , из которых наиболее вероятным донором FP является мономерный голубой флуоресцентный белок (mCFP). Красный сдвиг относительно GFP вызван взаимодействием стэкинга Pi-Pi в результате замены T203Y, введенной мутацией, которая существенно увеличивает поляризуемость локального окружения хромофора, а также обеспечивает дополнительную электронную плотность в хромофор.
«Венера» содержит новую аминокислотную замену –F46L–, которая ускоряет окисление хромофора при 37 ° C, стадии, ограничивающей скорость созревания. Белок имеет другие замены (F64L / M153T / V163A / S175G), позволяющие Венере хорошо складываться и обеспечивающие относительную устойчивость к ацидозу и Cl - . [3]
Эволюция YFP от GFP [ править ]
Для создания мутанта YFP потребовались четыре белковые мутации GFP дикого типа, обнаруженные у медузы Aequorea Victoria. Наиболее важной мутацией была замена треонина на тирозин в положении белка 203 [1] (T203Y используется для описания того же самого, где T и Y представляют собой однобуквенный код для аминокислот треонина и тирозина соответственно).
См. Также [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ а б Ормё, Матс; Cubitt, Эндрю Б .; Каллио, Карен; Гросс, Ларри А.; Tsien, Roger Y .; Ремингтон, С. Джеймс (1996-09-06). «Кристаллическая структура зеленого флуоресцентного белка Aequorea victoria» . Наука . 273 (5280): 1392–1395. DOI : 10.1126 / science.273.5280.1392 . ISSN 0036-8075 . PMID 8703075 .
- ^ Ламберт, Талли. «EYFP на базе FPbase» . FPbase . Проверено 22 февраля 2021 года .
- ^ Нагай, Т; Ибата, К; Парк, ЕС; Кубота, М; Mikoshiba, K; Мияваки, А (2002). «Вариант желтого флуоресцентного белка с быстрым и эффективным созреванием для клеточно-биологических применений». Природа Биотехнологии . 20 (1): 87–90. DOI : 10.1038 / nbt0102-87 . PMID 11753368 .
Внешние ссылки [ править ]
- Введение в флуоресцентные белки
- EYFP на базе FPbase
- Мияваки, Ацуши; Ллопис, Хуан; Хайм, Роджер; Маккаффери, Дж. Майкл; Адамс, Джозеф А .; Икура, Мицухико; Цзянь, Роджер Ю. (1997). «Флуоресцентные индикаторы Са2 + на основе зеленых флуоресцентных белков и кальмодулина». Природа . 388 (6645): 882–7. DOI : 10.1038 / 42264 . PMID 9278050 .
