При подаче документов (09 июня 1686) для внесения рода в Бархатную книгу, была предоставлена родословная роспись Шишкиных. При составлении «Реестр родословных росписей» (1741), указано, что при подаче росписей в «Палату родословных дел» документы подавал воевода, стольник Юрий Фёдорович Шишкин, что и записано в реестре: Юрья Шишкиных за их руками. Шишкины. Выехали из Польши. Название приняли от первовыехавшего, который назывался Шишка. Родословная их под № 490[8][9].
В книге Н.А. Баскакова: «Русские фамилии тюркского происхождения»[10], фамилия Шишкин значится, как тюркская по происхождению. В этом случае она оказалась бы связанной со словом «шишак» (разновидность шлема). Также шишкой на Украине и в Польше, по некоторым данным, называли булаву. Однако, фамилия Шишкин может также иметь славянское происхождение и происходить от прозвища Шишка.
В щите имеющем красное поле, между двумя золотыми Лунами рогами обращёнными к бокам Щита, изображён серебряный Меч с переломленным Ефесом, над которым находится серебряная шестиконечная Звезда. Щит увенчан обыкновенным Дворянским Шлемом с Дворянскою на нём Короною и тремя Строусовыми перьями, по сторонам коих видны Масленичная и Пальмовая Ветви. Намёт на щите красный, подложен золотом. Щитодержатели: два Льва смотрящие в стороны с загнутыми хвостами и выставленными языками.
Фамилии Шишкиных многие Российскому Престолу служили Наместниками и в иных чинах, и жалованы были от Государей в 1586 и других годах поместьями. Всё это доказывается копиями с жалованных на поместья грамот, справкой разрядного Архива и родословною Шишкиных.
В щите, имеющем красное поле, между двумя золотыми лунами, которые рогами обращены к бокам щита, изображён серебряный меч остроконечием вниз. Щит увенчан дворянским шлемом и короной со страусовыми перьями. Намёт на щите красный, подложенный золотом.
В Гербовнике Анисима Титовича Князева 1785 года, имеются изображения печатей с гербами представителей рода. Ни один из изображённых на печатях гербов, не имеет ничего общего, ни с одним из двух Высочайше утверждённых, схожих между собой, гербов «Остоя», жалованных вотчинами представителям рода (1586 и 1630).