Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ACADS
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2VIG

Идентификаторы
ПсевдонимыACADS , ацил-CoA дегидрогеназа, короткая цепь от C-2 до C-3, ACAD3, SCAD, короткая цепь ацил-CoA дегидрогеназы
Внешние идентификаторыOMIM: 606885 MGI: 87868 HomoloGene: 20057 Генные карты : ACADS
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение ACADS
Геномное расположение ACADS
Группа12q24.31Начинать120 725 774 п.н. [1]
Конец120 740 008 б.п. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 5 (мышь)
Chr.Хромосома 5 (мышь) [2]
Хромосома 5 (мышь)
Геномное расположение ACADS
Геномное расположение ACADS
Группа5 55,99 см | 5 FНачинать115 110 299 п.н. [2]
Конец115 119 346 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• оксидоредуктазная активность
• оксидоредуктазная активность, действующая на группу CH-CH доноров
• активность бутирил-КоА дегидрогеназы
• связывание флавинадениндинуклеотида
• активность ацил-КоА дегидрогеназы
Сотовый компонент• ядро клетки
• митохондриальный матрикс
• митохондрия
• нуклеоплазма
Биологический процесс• бета-окисление жирных кислот
• метаболизм липидов
• метаболизм
• метаболический процесс жирных кислот
• окислительно-восстановительный процесс
• бета-окисление жирных кислот с использованием ацил-КоА дегидрогеназы
• катаболический процесс бутирата
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

35 год

11409

Ансамбль

ENSG00000122971

ENSMUSG00000029545

UniProt

P16219

Q07417

RefSeq (мРНК)

NM_001302554
NM_000017

NM_007383

RefSeq (белок)

NP_000008
NP_001289483
NP_001289483.1

NP_031409

Расположение (UCSC)Chr 12: 120,73 - 120,74 МбChr 5: 115.11 - 115.12 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ацил-КоА - дегидрогеназа, C-2 до С-3 короткой цепью представляет собой фермент , который у человека кодируется ACADS гена . [5] Этот ген кодирует тетрамерный митохондриальный флавопротеин , который является членом семейства ацил-КоА-дегидрогеназ . Этот фермент катализирует начальную стадию пути бета-окисления митохондриальных жирных кислот . ACADS ген , связанный с ацил-коэнзим А дегидрогеназы с короткой цепью . [6] [5]

Структура [ править ]

Ген ACADS имеет длину примерно 13 т.п.н. и имеет 10 экзонов. Кодирующая последовательность этого гена составляет 1239 п.н. [7] Кодируемый белок содержит 412 аминокислот, а его размер составляет 44,3 кДа (человек) или 44,9 кДа (мышь). [8] [9]

Функция [ править ]

Фермент SCAD катализирует первую часть бета-окисления жирной кислоты , образуя транс-двойную связь C2-C3 в жирной кислоте посредством дегидрирования флавофермента. SCAD специфичен для короткоцепочечных жирных кислот, от C2 до C3-acylCoA. Конечным результатом бета-окисления является ацетил-КоА. [10] Когда есть дефекты, которые приводят к неправильному свертыванию SCAD, происходит повышенное производство активных форм кислорода (ROS); повышенные ROS заставляют митохондрии подвергаться делению, и митохондриальный ретикулум приобретает зерноподобную структуру. [11]

Клиническое значение [ править ]

Мутации гена ACADS связаны с дефицитом белка дегидрогеназы ацил-кофермента А с короткой цепью (SCADD); это также известно как дефицит бутирил-КоА дегидрогеназы. Многие мутации были идентифицированы в конкретных популяциях, и были проведены крупномасштабные исследования для определения аллельной и генотипической частоты дефектного гена. [12] [13]Поскольку короткоцепочечная ацил-КоА-дегидрогеназа участвует в бета-окислении, дефицит этого фермента отмечен повышенным количеством жирных кислот. Этот дефицит характеризуется повышенным содержанием бутирилкарнитина (C4) в плазме крови и повышенными концентрациями этилмалоновой кислоты (EMA) в моче. Генотипы людей с этим дефицитом имеют его в результате мутации, варианта или их комбинации. [14] Среди одной популяции с этим заболеванием были выделены три подгруппы: одна группа страдает недостаточным ростом, проблемами с кормлением и гипотонией; у другой группы были припадки; наконец, у одной группы была гипотония и не было припадков. [15]Другие исследования показали, что дефицит может протекать бессимптомно у некоторых людей в нормальных условиях, а симптомы проявляются в условиях физиологического стресса, таких как голодание или болезнь. [16] Лечение этого дефицита иногда может быть неясным, потому что иногда оно может протекать бессимптомно. Лечение этого заболевания аналогично лечению других нарушений окисления жирных кислот, пытаясь восстановить биохимический и физиологический гомеостаз, способствуя анаболизму и обеспечивая альтернативные источники энергии. [14] Добавки флавинадениндинуклеотида также были определены как терапия для этого дефицита, потому что это важный кофактор для правильного функционирования SCAD. [17]Дефицит SCAD наследуется по аутосомно-рецессивному типу. Тестирование на носительство может быть выполнено для членов семьи из группы риска, также возможно пренатальное тестирование. [14]

Ген ACADS также участвует в отсрочке начала синдрома Прадера-Вилли , который характеризуется гипотонией, задержкой роста и задержкой нервного развития в первые годы жизни, а также гиперфагией и ожирением намного позже. [18]

В исследованиях геномной ассоциации (GWAS) SCAD был связан с пониженным высвобождением инсулина, показанным пероральным тестом на толерантность к глюкозе , или OGTT. [19]

См. Также [ править ]

  • Ацил-КоА-дегидрогеназа

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000122971 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029545 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Энтреза: Ацил-КоА дегидрогеназа, короткая цепь от C-2 до C-3» .
  6. ^ Тейн Я, Elpeleg О, Бен-Зеев В, Корман SH, Лассос А, Л. Д, Лерман-Sagie Т, Лещинский-серебро Е, Vockley Дж, Берри ГТ, Lamhonwah А.М., Matern D, Роу CR, Грегерсен N (февраль 2008 г.). «Мутация гена короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы (c.319C> T) имеет клиническую гетерогенность и является мутацией кандидата-основателя у лиц еврейского происхождения ашкенази». Молекулярная генетика и метаболизм . 93 (2): 179–89. DOI : 10.1016 / j.ymgme.2007.09.021 . PMID 18054510 . 
  7. ^ Коридон МДж, Андрезен Б.С., Bross Р, Kjeldsen М, Андрисен РН, Eiberg Н, Kølvraa S, Грегерсен N (декабрь 1997). «Структурная организация гена короткоцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы человека». Геном млекопитающих . 8 (12): 922–6. DOI : 10.1007 / s003359900612 . PMID 9383286 . S2CID 9157185 .  
  8. ^ «Информация о белке: P16219» . Атлас кардиоорганических белков (COPaKB) . Архивировано из оригинального 14 августа 2016 года . Проверено 23 июля 2016 года .
  9. ^ «Информация о белке: Q07417» . Атлас кардиоорганических белков (COPaKB) . Архивировано из оригинального 14 августа 2016 года . Проверено 23 июля 2016 года .
  10. ^ Voet DJ, Voet JG, Pratt CW (2010). «Глава 18, Митохондриальный синтез АТФ». Принципы биохимии (4-е изд.). Вайли. п. 667. ISBN 978-0-470-23396-2.
  11. ↑ Schmidt SP, Corydon TJ, Pedersen CB, Bross P, Gregersen N (июнь 2010 г.). «Неправильная укладка короткоцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы приводит к делению митохондрий и окислительному стрессу». Молекулярная генетика и метаболизм . 100 (2): 155–62. DOI : 10.1016 / j.ymgme.2010.03.009 . PMID 20371198 . 
  12. ^ Jethva R, Bennett MJ, Vockley J (декабрь 2008). «Недостаток короткоцепочечной ацил-кофермента А дегидрогеназы» . Молекулярная генетика и метаболизм . 95 (4): 195–200. DOI : 10.1016 / j.ymgme.2008.09.007 . PMC 2720545 . PMID 18977676 .  
  13. ^ Okuyaz С, Ezgü FS, Biberoglu G, Zeviani М, Tiranti В, Yilgör Е (июнь 2008). «Тяжелая детская гипотония с этилмалоновой ацидурией: клинический случай». Журнал детской неврологии . 23 (6): 703–5. DOI : 10.1177 / 0883073807313048 . PMID 18539996 . S2CID 46624539 .  
  14. ^ a b c Вулф Л., Джетва Р., Оглсби Д., Фокли Дж. (1993). «Дефицит короткоцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы». PMID 21938826 .  Цитировать журнал требует |journal=( помощь )
  15. ^ Pedersen CB, Kølvraa S, Kølvraa A, Stenbroen V, Kjeldsen M, Ensenauer R, Tein I, Matern D, Rinaldo P, Vianey-Saban C, Ribes A, Lehnert W, Christensen E, Corydon TJ, Andresen BS, Vang S , Болунд Л., Фокли Дж, Бросс П., Грегерсен Н. (август 2008 г.). «В спектре вариаций гена ACADS у 114 пациентов с дефицитом короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы (SCAD) преобладают бессмысленные вариации, приводящие к неправильной укладке белка на клеточном уровне». Генетика человека . 124 (1): 43–56. DOI : 10.1007 / s00439-008-0521-9 . PMID 18523805 . S2CID 25491212 .  
  16. ^ Бок LA, Vreken P, Wijburg FA, Вандерс RJ, Грегерсен N, Corydon MJ, Waterham HR, Duran M (ноябрь 2003). «Дефицит короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы: исследования в большой семье усложняют заболевание». Педиатрия . 112 (5): 1152–5. DOI : 10.1542 / peds.112.5.1152 . PMID 14595061 . 
  17. ^ Ван Maldegem BT, Duran M, Вандерс RJ, Waterham HR, Wijburg FA (март 2010). «Статус флавинадениндинуклеотида и эффекты лечения высокими дозами рибофлавина при дефиците короткоцепочечной ацил-КоА дегидрогеназы» . Педиатрические исследования . 67 (3): 304–8. DOI : 10.1203 / PDR.0b013e3181cbd57b . PMID 19952864 . 
  18. ^ Giurgiutiu Д.В., Эспиноза Л.М., Вуд TC, DuPont BR, Holden KR (январь 2008). «Устойчивое нарушение роста при синдроме Прадера-Вилли, связанное с вариантом гена ацил-КоА-дегидрогеназы с короткой цепью». Журнал детской неврологии . 23 (1): 112–7. DOI : 10.1177 / 0883073807307979 . PMID 18184946 . S2CID 31888136 .  
  19. ^ Hornbak М, Banasik К, Юстесен Ю.М., Краруп НТ, Sandholt СН, Андерссон Å, Sandbæk А, Лауритцен Т, Pisinger С, Витте ДР, Соренсен Т.А., Педерсен О, Т Хансен (6 января 2011 года). «Минорный C-аллель rs2014355 в ACADS связан со сниженным высвобождением инсулина после пероральной глюкозной нагрузки» . BMC Medical Genetics . 12 : 4. DOI : 10,1186 / 1471-2350-12-4 . PMC 3022800 . PMID 21211036 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о дефиците короткоцепочечной ацил-КоА-дегидрогеназы
  • Расположение генома человека ACADS и страница сведений о гене ACADS в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .