Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ACVR1B
Белок ACVR1B PDB 1rw8.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3H9R , 3MTF , 3OOM , 3Q4U , 4BGG , 4C02 , 4DYM

Идентификаторы
ПсевдонимыACVR1B , ACTRIB, ACVRLK4, ALK4, SKR2, рецептор активина A типа 1B
Внешние идентификаторыOMIM : 601300 MGI : 1338944 HomoloGene : 20906 GeneCards : ACVR1B
Расположение гена ( человек )
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человека) [1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение ACVR1B
Геномное расположение ACVR1B
Группа12q13.13Начинать51 951 699 п.н. [1]
Конец51 997 078 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 15 (мышь)
Chr.Хромосома 15 (мышь) [2]
Хромосома 15 (мышь)
Геномное расположение ACVR1B
Геномное расположение ACVR1B
Группа15 F1 | 15 56,48 смНачинать101 174 067 п.н. [2]
Конец101 213 684 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• трансферазной активность
• связывание нуклеотида
• активность протеинкиназы
• фактор рост связывание
• активин связывания
• ион металла связывание
• активность киназы
• трансмембранного белка рецептора серин / треонин киназа активность
• ингибина связывания
• GO: связывание 0001948 белка
• активина-активированная активность рецептора
• АТФ связывание
• связывание убиквитин-протеин-лигазы
• активность протеин-серин / треонинкиназы
• активность рецептора активина, тип I
• связывание SMAD
• трансформирующая активность рецептора бета-активированного фактора роста
• трансформирующая активность рецептора бета фактора роста, тип I
Сотовый компонент• составной компонент мембраны
• мембрана
• рецепторный комплекс
• клеточная мембрана
• интегральный компонент плазматической мембраны
• рецепторный комплекс активина
• поверхность клетки
• цитозоль
Биологический процесс• развитие волосяных фолликулов
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• позитивная регуляция дифференцировки эритроцитов
• внешний апоптотический сигнальный путь
• фосфорилирование
• позитивная регуляция ограниченного путями фосфорилирования белка SMAD
• внутриутробное эмбриональное развитие
• негативная регуляция экспрессии генов
• узловой сигнальный путь
• положительная регуляция миграции клеток трофобласта
• фосфорилирование белков
• развитие центральной нервной системы
• развитие основных женских половых признаков
• положительная регуляция экспрессии гена
• сигнальный путь трансмембранного рецепторного белка серин / треонинкиназы
• позитивная регуляция сигнального пути рецептора активина
• регуляция передачи сигнала
• негативная регуляция роста клеток
• аутофосфорилирование
• фосфорилирование пептидил-треонина
• передача сигнала
• позитивная регуляция транскрипции от Промотор РНК-полимеразы II
• сигнальный путь рецептора активина
• G1 / S-переход митотического клеточного цикла
• сигнальный путь бета-рецептора трансформирующего фактора роста
• процесс спецификации шаблона
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

91

11479

Ансамбль

ENSG00000135503

ENSMUSG00000000532

UniProt

P36896

Q61271

RefSeq (мРНК)

NM_004302
NM_020327
NM_020328

NM_007395

RefSeq (белок)

NP_004293
NP_064732
NP_064733

NP_031421

Расположение (UCSC)Chr 12: 51.95 - 52 МбChr 15: 101.17 - 101.21 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Активина рецептора типа-1B представляет собой белок , который у человека кодируется ACVR1B гена . [5] [6]

ACVR1B или ALK-4 действует как преобразователь сигналов активина или активин-подобных лигандов (например, ингибина ). Активин связывается либо с ACVR2A, либо с ACVR2B, а затем образует комплекс с ACVR1B. Они продолжают набирать R-SMADs SMAD2 или SMAD3 . [7] ACVR1B также передает сигналы узловых , GDF-1 и Vg1 ; однако, в отличие от активина, им требуются другие молекулы корецепторов, такие как белок Cripto . [8]

Функция [ править ]

Активины представляют собой димерные факторы роста и дифференцировки, которые принадлежат к суперсемейству трансформирующих факторов роста-бета (TGF-бета) структурно связанных сигнальных белков. Активины передают сигнал через гетеромерный комплекс рецепторных серинкиназ, который включает по крайней мере два рецептора типа I (I и IB) и два типа II (II и IIB). Все эти рецепторы представляют собой трансмембранные белки, состоящие из связывающего лиганд внеклеточного домена с богатой цистеином областью, трансмембранным доменом и цитоплазматическим доменом с предсказанной серин / треониновой специфичностью. Рецепторы типа I необходимы для передачи сигналов, а рецепторы типа II необходимы для связывания лигандов и для экспрессии рецепторов типа I. Рецепторы типа I и II образуют стабильный комплекс после связывания лиганда, что приводит к фосфорилированиюрецепторов типа I рецепторами типа II. Этот ген кодирует рецептор активина А типа IB, состоящий из 11 экзонов. Альтернативный сплайсинг и альтернативное полиаденилирование приводят к 3 полностью описанным вариантам транскрипта. Экспрессия мРНК вариантов 1, 2 и 3 подтверждена, и потенциальный четвертый вариант содержит альтернативный экзон 8 и не имеет экзонов с 9 по 11, но его экспрессия мРНК не подтверждена. [6]

Взаимодействия [ править ]

ACVR1B взаимодействует с

  • ACVR2A , [9] [10] и ACVR2B [11] [9]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000135503 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000532 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ тен Дейк П., Итиджо Х., Франзен П., Шульц П., Сарас Дж., Тойошима Х, Хелдин СН, Миядзоно К. (октябрь 1993 г.). «Киназы, подобные рецепторам активина: новый подкласс рецепторов клеточной поверхности с предсказанной серин / треонинкиназной активностью». Онкоген . 8 (10): 2879–87. PMID 8397373 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: рецептор активина A ACVR1B, тип IB» .
  7. ↑ Inman GJ, Николас FJ, Callahan JF, Harling JD, Gaster LM, Reith AD, Laping NJ, Hill CS (2002). «SB-431542 является мощным и специфическим ингибитором трансформирующего фактора роста-бета суперсемейства активина типа I, подобного рецептору киназы (ALK), рецепторов ALK4, ALK5 и ALK7». Мол. Pharmacol . 62 (1): 65–74. DOI : 10.1124 / mol.62.1.65 . PMID 12065756 . 
  8. ^ Harrison CA, Серый PC, Кербер SC, Fischer W, Vale W (2003). «Идентификация функционального сайта связывания активина на рецепторе типа I ALK4» . J. Biol. Chem . 278 (23): 21129–35. DOI : 10.1074 / jbc.M302015200 . PMID 12665502 . 
  9. ^ а б Де Винтер Дж. П., Де Врис С. Дж., Ван Ахтерберг Т. А., Амерун Р. Ф., Фейен А., Сугино Х., Де Вале П., Хюйлброк Д., Вершуерен К., Ван ден Эйден-Ван Раай А. Дж. (май 1996 г.). «Усеченные рецепторы активина типа II ингибируют биоактивность за счет образования гетеромерных комплексов с рецепторами активина типа I.». Exp. Cell Res . 224 (2): 323–34. DOI : 10.1006 / excr.1996.0142 . PMID 8612709 . 
  10. ^ Лебрен JJ, Takabe K, Chen Y, W Vale (январь 1999). «Роли пути-специфических и ингибирующих Smads в передаче сигналов рецептора активина». Мол. Эндокринол . 13 (1): 15–23. DOI : 10.1210 / mend.13.1.0218 . PMID 9892009 . 
  11. ^ Attisano L, Wrana ДЛ, Монталво Е, Массаге J (март 1996 г.). «Активация передачи сигналов рецепторным комплексом активина» . Мол. Клетка. Биол . 16 (3): 1066–73. DOI : 10,1128 / MCB.16.3.1066 . PMC 231089 . PMID 8622651 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение генома человека ACVR1B и страница сведений о гене ACVR1B в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Велт СК (2002). «Физиология и патофизиология ингибина, активина и фоллистатина в женской репродукции». Curr. Opin. Акушерство. Гинеколь . 14 (3): 317–23. DOI : 10.1097 / 00001703-200206000-00012 . PMID  12032389 . S2CID  44327401 .
  • Лю Ф, Вентура Ф, Дуди Дж, Массагуэ Дж (1995). «Человеческий рецептор типа II для костных морфогенных белков (BMP): расширение модели двухкиназного рецептора на BMP» . Мол. Клетка. Биол . 15 (7): 3479–86. DOI : 10.1128 / mcb.15.7.3479 . PMC  230584 . PMID  7791754 .
  • Сюй Дж., Мацузаки К., МакКихан К., Ван Ф., Кан М., Маккихан В.Л. (1994). «Геномная структура и клонированные кДНК предсказывают, что четыре варианта в киназном домене серин / треонинкиназных рецепторов возникают в результате альтернативного сплайсинга и добавления поли (A)» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (17): 7957–61. Bibcode : 1994PNAS ... 91.7957X . DOI : 10.1073 / pnas.91.17.7957 . PMC  44523 . PMID  8058741 .
  • Cárcamo J, Weis FM, Ventura F, Wieser R, Wrana JL, Attisano L, Massagué J (1994). «Рецепторы типа I определяют ингибирующие рост и транскрипционные ответы на трансформирующий фактор роста бета и активин» . Мол. Клетка. Биол . 14 (6): 3810–21. DOI : 10,1128 / MCB.14.6.3810 . PMC  358748 . PMID  8196624 .
  • Де Винтер Дж.П., Де Фрис К.Дж., Ван Ахтерберг Т.А., Амерун Р.Ф., Фейен А., Сугино Х., Де Вале П., Хайлеброк Д., Вершуерен К., Ван Ден Эйден-Ван Райдж А.Дж. (1996). «Усеченные рецепторы активина типа II ингибируют биоактивность за счет образования гетеромерных комплексов с рецепторами активина типа I.». Exp. Cell Res . 224 (2): 323–34. DOI : 10.1006 / excr.1996.0142 . PMID  8612709 .
  • Attisano L, Wrana JL, Montalvo E, Massagué J (1996). «Активация передачи сигналов рецепторным комплексом активина» . Мол. Клетка. Биол . 16 (3): 1066–73. DOI : 10,1128 / MCB.16.3.1066 . PMC  231089 . PMID  8622651 .
  • Лебрен JJ, Вейл WW (1997). «Активин и ингибин обладают антагонистическим действием на лиганд-зависимую гетеромеризацию рецепторов активина типа I и типа II и дифференцировку эритроидов человека» . Мол. Клетка. Биол . 17 (3): 1682–91. DOI : 10,1128 / MCB.17.3.1682 . PMC  231893 . PMID  9032295 .
  • Ройер Э., Миязоно К., Астрём А.К., Геуртс ван Кессель А, тен Дейке П., Стенман Г. (1998). «Хромосомная локализация трех генов человека, кодирующих членов суперсемейства TGF-бета рецепторов серина / треонинкиназы типа I». Мамм. Геном . 9 (3): 266–8. DOI : 10.1007 / s003359900745 . PMID  9501322 . S2CID  21839781 .
  • Souchelnytskyi S, Nakayama T., Nakao A, Morén A, Heldin CH, Christian JL, ten Dijke P (1998). «Физическое и функциональное взаимодействие мышей и Xenopus Smad7 с рецепторами морфогенетических белков кости и рецепторами трансформирующего фактора роста бета» . J. Biol. Chem . 273 (39): 25364–70. DOI : 10.1074 / jbc.273.39.25364 . PMID  9738003 .
  • Хашимото О, Ямато К., Косеки Т., Огучи М., Исисаки А., Сёдзи Х., Накамура Т., Хаяси Й., Сугино Х., Нишихара Т. (1998). «Роль рецепторов активина типа I в индуцированной активином А остановке роста и апоптозе в клетках мышиной B-клеточной гибридомы». Клетка. Сигнал . 10 (10): 743–9. DOI : 10.1016 / S0898-6568 (98) 00021-7 . PMID  9884026 .
  • Лебрен Дж. Дж., Такабе К., Чен Й, Вэйл В. (1999). «Роли пути-специфических и ингибирующих Smads в передаче сигналов рецептора активина». Мол. Эндокринол . 13 (1): 15–23. DOI : 10.1210 / mend.13.1.0218 . PMID  9892009 .
  • Грей П.С., Гринвальд Дж., Блаунт А.Л., Кунитаке К.С., Дональдсон С.Дж., Чоу С., Вэйл В. (2000). «Идентификация сайта связывания на рецепторе активина типа II для активина и ингибина» . J. Biol. Chem . 275 (5): 3206–12. DOI : 10.1074 / jbc.275.5.3206 . PMID  10652306 .
  • Чжоу Ю., Сунь Х., Данила Д.К., Джонсон С.Р., Сигай Д.П., Чжан Х, Клибански А. (2000). «Усеченные изоформы рецептора активина типа I Alk4 являются доминирующими отрицательными рецепторами, ингибирующими передачу сигналов активина» . Мол. Эндокринол . 14 (12): 2066–75. DOI : 10,1210 / me.14.12.2066 . PMID  11117535 .
  • Су Г.Х., Бансал Р., Мерфи К.М., Монтгомери Э., Йео С.Дж., Хрубан Р.Х., Керн С.Е. (2001). «Мутации гена ACVR1B (ALK4, рецептор активина типа 1B) при карциноме поджелудочной железы» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (6): 3254–7. Bibcode : 2001PNAS ... 98.3254S . DOI : 10.1073 / pnas.051484398 . PMC  30640 . PMID  11248065 .
  • Чепмен С.К., Вудрафф Т.К. (2001). «Модуляция передачи сигнала активина ингибином B и ингибин-связывающим белком (INhBP)» . Мол. Эндокринол . 15 (4): 668–79. DOI : 10,1210 / me.15.4.668 . PMID  11266516 .
  • Вюртнер Ю.Ю., Фрэнк Д.Б., Феличи А., Грин Х.М., Цао З., Шнайдер М.Д., МакНалли Дж. Г., Лехлейдер Р.Дж., Робертс А.Б. (2001). «Трансформирующий белок 1, связанный с рецептором фактора роста-бета, представляет собой шаперон Smad4» . J. Biol. Chem . 276 (22): 19495–502. DOI : 10.1074 / jbc.M006473200 . PMID  11278302 .
  • Паркс В.Т., Фрэнк Д.Б., Хафф С., Ренфрю Хафт С., Мартин Дж., Менг Х, де Цестекер М.П., ​​МакНалли Дж. Г., Редди А., Тейлор С. И., Робертс А. Б., Ван Т., Лехлейдер Р. Дж. (2001). «Сортировочный нексин 6, новый SNX, взаимодействует с семейством трансформирующего фактора роста бета рецепторных серин-треониновых киназ» . J. Biol. Chem . 276 (22): 19332–9. DOI : 10.1074 / jbc.M100606200 . PMID  11279102 .
  • Бирки Реффи С., Вюртнер Ю.Ю., Паркс В.Т., Робертс А.Б., Дакетт С.С. (2001). «Х-связанный ингибитор белка апоптоза действует как кофактор трансформации передачи сигналов фактора роста-бета» . J. Biol. Chem . 276 (28): 26542–9. DOI : 10.1074 / jbc.M100331200 . PMID  11356828 .
  • Бьянко С., Адкинс Х.Б., Вексельбергер С., Сено М., Норманно Н., Де Лука А., Сан Y, Хан Н., Кенни Н., Эберт А., Уильямс КП, Саникола М., Саломон Д.С. (2002). «Cripto-1 активирует узловые и ALK4-зависимые и независимые пути передачи сигналов в эпителиальных клетках молочной железы» . Мол. Клетка. Биол . 22 (8): 2586–97. DOI : 10.1128 / MCB.22.8.2586-2597.2002 . PMC  133714 . PMID  11909953 .