Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

АДФ рибоза

АДФ-рибозилирование - это добавление одного или нескольких фрагментов АДФ-рибозы к белку . [1] [2] Это обратимая посттрансляционная модификация, которая участвует во многих клеточных процессах, включая передачу клеточных сигналов , репарацию ДНК , регуляцию генов и апоптоз . [3] [4] Неправильное АДФ-рибозилирование связано с некоторыми формами рака. [5] Это также является основой для токсичности бактериальных соединений , таких как холерного токсина , дифтерийного токсина и другие. [6]

История [ править ]

Первое предположение об АДФ-рибозилировании появилось в начале 1960-х годов. В это время Пьер Шамбон и его коллеги наблюдали включение АТФ в экстракт ядер печени курицы. [7] После обширных исследований нерастворимой в кислоте фракции несколько различных исследовательских лабораторий смогли идентифицировать АДФ-рибозу , полученную из НАД + , как включенную группу. Несколько лет спустя ферменты, ответственные за это включение, были идентифицированы и получили название поли (АДФ-рибоза) полимераза. Первоначально считалось, что эта группа представляет собой линейную последовательность АДФ-рибозных единиц, ковалентно связанных рибозной гликозидной связью. Позже сообщалось, что разветвление может происходить через каждые 20-30 остатков АДФ. [8]

Первое проявление моно-АДФ-рибозилирования произошло годом позже во время исследования токсинов: было показано, что токсин коринебактерии дифтерии дифтерии зависит от НАД +, чтобы быть полностью эффективным, что привело к открытию ферментативной конъюгации одного АДФ. -рибозная группа моно-АДФ-рибозилтрансферазой.

Первоначально считалось, что АДФ-рибозилирование является посттрансляционной модификацией, участвующей исключительно в регуляции генов. Однако по мере того, как было обнаружено больше ферментов, способных к АДФ-рибозилированию белков, стала очевидной многофункциональная природа АДФ-рибозилирования. Первый фермент млекопитающих с активностью поли-АДФ-рибозы трансферазы был открыт в конце 1980-х годов. В течение следующих 15 лет считалось, что это единственный фермент, способный добавлять цепь АДФ-рибозы в клетки млекопитающих. [9] В конце 1980-х годов были открыты АДФ-рибозилциклазы, которые катализируют присоединение циклических АДФ-рибозных групп к белкам. Наконец, сиртуиныБыло обнаружено, что семейство ферментов, которые также обладают НАД + -зависимой активностью деацилирования, также обладают активностью моно-АДФ-рибозилтрансферазы. [10] [11]

Каталитический механизм [ править ]

Механизм ADP-рибозилирования, остатки катализирующего фермента показаны синим цветом. [ спорный - обсудить ]

Источником АДФ-рибозы для большинства ферментов, осуществляющих эту модификацию, является редокс-кофактор NAD + . В этой реакции переноса N-гликозидная связь NAD +, которая связывает молекулу ADP-рибозы и никотинамидную группу, расщепляется с последующей нуклеофильной атакой боковой цепи целевой аминокислоты. АДФ-рибозилтрансферазы могут осуществлять два типа модификаций: моно-АДФ-рибозилирование и поли-АДФ-рибозилирование.

Моно АДФ-рибозилирование [ править ]

Моно-АДФ-рибозилтрансферазы обычно катализируют добавление АДФ-рибозы к боковым цепям аргинина с использованием высококонсервативного мотива RS-EXE фермента. [12] Реакция протекает путем разрыва связи между никотинамидом и рибозой с образованием иона оксония . Затем боковая цепь аргинина целевого белка действует как нуклеофил, атакуя электрофильный углерод, расположенный рядом с ионом оксония. Для того , чтобы этот шаг происходит, аргинин нуклеофил депротонируют с помощью глутамата остатка на катализирующем ферменте [ оспаривался - обсудить ]. Другой консервативный остаток глутамата образует водородную связь с одной из гидроксильных групп в цепи рибозы, чтобы дополнительно облегчить эту нуклеофильную атаку. В результате реакции расщепления высвобождается никотинамид. Модификация может быть обращена АДФ-рибозилгидролазами, которые расщепляют N-гликозидную связь между аргинином и рибозой, высвобождая АДФ-рибозу и немодифицированный белок; НАД + не восстанавливается обратной реакцией.

Поли АДФ-рибозилирование [ править ]

Поли- (АДФ-рибоза) полимеразы (ПАРП) обнаруживаются в основном у эукариот и катализируют перенос множества молекул АДФ-рибозы к белкам-мишеням. Как и в случае моно-АДФ-рибозилирования, источником АДФ-рибозы является НАД + . PARP используют каталитическую триаду His-Tyr-Glu для облегчения связывания NAD + и позиционирования конца существующей цепи поли-ADP рибозы на целевом белке; Glu способствует катализу и образованию (1-> 2) O-гликозидной связи между двумя молекулами рибозы. Есть несколько других ферментов, которые распознают цепи поли-АДФ-рибозы, гидролизуютих или образуют ответвления; аннотировано более 800 белков, содержащих слабо определенный мотив связывания поли-АДФ-рибозы; поэтому, помимо этой модификации, изменяющей конформацию и структуру целевого белка, его также можно использовать в качестве метки для набора других белков или для регулирования целевого белка. [13]

Аминокислотная специфичность [ править ]

Многие различные боковые цепи аминокислот были описаны как акцепторы ADP-рибозы. С химической точки зрения эта модификация представляет собой гликозилирование белка : перенос АДФ-рибозы происходит на боковые цепи аминокислот с нуклеофильным кислородом, азотом или серой, что приводит к N-, O- или S-гликозидной связи с рибозой АДФ-рибоза. [14] Первоначально кислые аминокислоты ( глутамат и аспартат ) были описаны как основные сайты ADP-рибозилирования. Однако многие другие сайты акцепторов АДФ-рибозы, такие как серин , [15] [16] аргинин , [17] цистеин , [18] лизин , [19] дифтамид , [20] фосфосерин , [21] и аспарагин [22] были идентифицированы в последующих работах.

Функция [ править ]

Апоптоз [ править ]

Во время повреждения ДНК или клеточного стресса PARP активируются, что приводит к увеличению количества поли-АДФ-рибозы и уменьшению количества НАД +. [23] Более десяти лет считалось, что PARP1 является единственной поли-АДФ-рибозной полимеразой в клетках млекопитающих, поэтому этот фермент был наиболее изучен. Каспазы - это семейство цистеиновых протеаз, которые, как известно, играют важную роль в запрограммированной гибели клеток . Эта протеаза расщепляет PARP-1 на два фрагмента, оставляя его полностью неактивным, чтобы ограничить продукцию поли-АДФ-рибозы. Один из его фрагментов мигрирует из ядра в цитоплазму и считается мишенью аутоиммунитета.

Во время каспазно-независимого апоптоза , также называемого партанатосом, накопление поли-АДФ-рибозы может происходить из-за активации PARP или инактивации поли (АДФ-рибоза) гликогидролазы , фермента, который гидролизует поли (АДФ-рибозу) с образованием свободной АДФ-рибозы. . Исследования показали, что поли-АДФ-рибоза управляет транслокацией белка фактора, вызывающего апоптоз, в ядро, где он будет опосредовать фрагментацию ДНК . Было высказано предположение, что если произойдет сбой активации каспаз в стрессовых условиях, произойдет некроптоз. Сверхактивация PARP привела к некротической гибели клеток, регулируемой белком фактора некроза опухоли.. Хотя механизм еще не изучен, было показано, что ингибиторы PARP влияют на некроптоз. [24]

Генная регуляция [ править ]

АДФ-рибозилирование может влиять на экспрессию генов почти на всех уровнях регуляции, включая организацию хроматина, рекрутирование и связывание факторов транскрипции, а также процессинг мРНК.

Организация нуклеосом является ключом к регуляции экспрессии генов: расположение и организация нуклеосом изменяет то, какие области ДНК доступны для транскрипционного аппарата для связывания и транскрипции ДНК. Было показано, что PARP1 , поли-АДФ-рибозная полимераза, влияет на структуру хроматина и способствует изменениям в организации нуклеосом посредством модификации гистонов .

Кристаллическая структура домена цинкового пальца PARP1, связанного с ДНК (фиолетовый). PDB: 4AV1

Было показано, что PARP влияют на структуру фактора транскрипции и вызывают рекрутирование многих факторов транскрипции с образованием комплексов в ДНК и вызывают транскрипцию. Также показано, что моно-АДФ-рибозилтрансферазы влияют на связывание факторов транскрипции на промоторах. Например, было показано, что PARP14, моно-АДФ-рибозилтрансфераза, влияет на связывание фактора транскрипции STAT .

Было показано, что другие АДФ-рибозилтрансферазы модифицируют белки, связывающие мРНК , что может вызывать молчание транскрипта этого гена. [25]

Ремонт ДНК [ править ]

Полимеразы поли-АДФ-рибозы (PARP) могут функционировать в репарации ДНК как одноцепочечных разрывов, так и двухцепочечных разрывов. При репарации одноцепочечных разрывов ( эксцизионная репарация оснований ) PARP может способствовать удалению окисленного сахара или расщеплению цепи. PARP1 связывает одноцепочечные разрывы и закрывает любые близлежащие промежуточные продукты эксцизионной репарации оснований. Эти промежуточные продукты включают XRCC1 и APLF, и они могут быть задействованы напрямую или через домен PBZ APLF. [26] Это приводит к синтезу поли-АДФ-рибозы. Домен PBZ присутствует во многих белках, участвующих в репарации ДНК, и позволяет связывать PARP и, таким образом, ADP-рибозилирование, которое привлекает факторы репарации для взаимодействия в месте разрыва.PARP2 является вторичным ответчиком на повреждение ДНК, но служит для обеспечения функциональной избыточности при репарации ДНК. [27]

Реставрация ДНК облегчается привлечением PARP1 ферментов репарации. Ремонт однонитевого разрыва в ДНК инициируется связыванием PARP1. PARP1 связывает одноцепочечные разрывы и закрывает промежуточные соединения эксцизионной репарации оснований, что приводит к синтезу поли-АДФ-рибозы. XRCC1 представляет собой перекрестно комплементарный белок 1 для репарации рентгеновских лучей. XRCC1 комплексы с полинуклеотидкиназой (PNK), которая обрабатывает концы ДНК. PCNA представляет собой ядерный антиген пролиферирующих клеток, который служит зажимом ДНК, который способствует активности ДНК-полимеразы (ДНК-pol). Затем FEN1 (эндонуклеаза лоскута 1) задействуется для удаления выступающего 5 'лоскута. Последний этап репарации ДНК включает в себя ДНК-лигазу, которая объединяет конечные нити ДНК в фосфодиэфирную связь.

Существует множество механизмов восстановления поврежденной двухцепочечной ДНК. PARP1 может действовать как фактор синапса при альтернативном негомологичном соединении концов. Кроме того, было высказано предположение, что PARP1 необходим для замедления репликационных вилок после повреждения ДНК и способствует гомологичной рекомбинации на репликационных вилках, которые могут быть дисфункциональными. Возможно, что PARP1 и PARP3работают вместе в репарации двухцепочечной ДНК, и было показано, что PARP3 имеет решающее значение для разрешения двухцепочечных разрывов. Существуют две гипотезы о совпадении PARP1 и PARP3. Первая гипотеза утверждает, что две АДФ-рибозилтрансферазы служат для функционирования друг друга при неактивности. Если PARP3 теряется, это приводит к однонитевым разрывам и, таким образом, привлечению PARP1. Вторая гипотеза предполагает, что два фермента работают вместе; PARP3 катализирует моно-ADP-рибозилирование и короткое поли-ADP-рибозилирование и служит для активации PARP1. [27]

У PARP есть много белковых мишеней в месте повреждения ДНК. Белок KU и ДНК-PKcs представляют собой компоненты репарации двухцепочечных разрывов с неизвестными сайтами ADP-рибозилирования. Гистоны - еще одна белковая мишень для PARP. Все коровые гистоны и линкерный гистон H1 подвергаются АДФ-рибозилированию после повреждения ДНК. Функция этих модификаций до сих пор неизвестна, но было высказано предположение, что АДФ-рибозилирование модулирует структуру хроматина более высокого порядка, пытаясь облегчить более доступные сайты для миграции факторов репарации к повреждению ДНК.

Распад белка [ править ]

Система убиквитин-протеасома (UPS) играет важную роль в деградации белков. 26S протеасома состоит из каталитической субъединицы (20S , сердцевина частиц) и регуляторной субъединицы 19S (The колпака). [28] Полиубиквитиновые цепи маркируют белки для деградации протеасомами, что вызывает гидролиз меченых белков до более мелких пептидов.

Танкираза (TNKS), АДФ-рибозилтрансфераза, взаимодействует с регулятором протеасомы PI31 . Данные на линиях клеток дрозофилы и человека демонстрируют, что анкириновый домен (ANK) TNKS облегчает взаимодействие с N-концевым TNKS-связывающим мотивом и C-концевым доменом HbYX PI31. [29] Это способствует ADP-рибозилированию PI31 доменом PARP TNKS. Кроме того, было показано, что лечение Drosophilaклетки с ингибитором TNKS, XAV939, ослабляли активность протеасомы 26S. Более того, было продемонстрировано, что АДФ-рибозилирование PI31 блокирует опосредованное PI31 ингибирование α-субъединиц 20S частицы. Следовательно, рабочая гипотеза состоит в том, что опосредованное танкиразой АДФ-рибозилирование снижает активность PI31, что, в свою очередь, снижает деградацию белка, выполняемую протеасомой. [29]

Клиническое значение [ править ]

Рак [ править ]

PARP1 участвует в эксцизионной репарации оснований (BER), репарации одно- и двухцепочечных разрывов и хромосомной стабильности. Он также участвует в регуляции транскрипции, облегчая белок-белковые взаимодействия . PARP1 использует NAD + для выполнения своей функции при апоптозе. Если PARP становится сверхактивным, клетка будет иметь пониженные уровни кофактора NAD +, а также пониженные уровни АТФ и, таким образом, подвергнется некрозу . Это важно в канцерогенезе, потому что это может привести к отбору клеток с дефицитом PARP1 (но не истощенных) из-за их преимущества в выживании во время роста рака. [30]

Восприимчивость к канцерогенезу при дефиците PARP1 в значительной степени зависит от типа нанесенного повреждения ДНК. Есть много значений, что различные PARP участвуют в предотвращении канцерогенеза. Как указывалось ранее, PARP1 и PARP2 участвуют в BER и хромосомной стабильности. PARP3 участвует в регуляции центросом . Танкираза - еще одна АДФ-рибоза-полимераза, которая участвует в регуляции длины теломер . [5]

Ингибирование PARP1 также широко изучалось в противораковых терапевтических средствах. Механизм действия ингибитора PARP1 заключается в усилении повреждения раковой ДНК, наносимого химиотерапией, путем запрета репаративной функции PARP1 у индивидуумов с дефицитом BRCA1 / 2.

PARP14 - еще один АДФ-рибозилирующий фермент, который хорошо изучен в отношении целей терапии рака; он является преобразователем сигнала и активатором белка , взаимодействующего с транскрипцией STAT6 , и было показано, что он связан с агрессивностью В-клеточных лимфом. [30]

Бактериальные токсины [ править ]

Бактериальные ADP-рибозилирующие экзотоксины (BAREs) ковалентно переносят ADP-рибозную составляющую NAD + к целевым белкам инфицированных эукариот с образованием никотинамида и свободного иона водорода. BARE продуцируются как предшественники ферментов , состоящие из доменов «A» и «B»: домен «A» отвечает за активность ADP-рибозилирования; и домен «B» для транслокации фермента через мембрану клетки. Эти домены могут существовать совместно в трех формах: во-первых, как отдельные полипептидные цепи с ковалентно связанными доменами A и B; во-вторых, в мультибелковых комплексах с доменами A и B, связанными нековалентными взаимодействиями; и, в-третьих, в мультибелковых комплексах с доменами A и B, не взаимодействующими напрямую, до процессинга. [6]

Кристаллическая структура токсина дифтерии. PDB: 1MDT

После активации BAREs ADP-рибозилирует любое количество эукариотических белков; такой механизм имеет решающее значение для возникновения болезненных состояний, связанных с ADP-рибозилированием. В частности, GTP-связывающие белки хорошо известны в патофизиологии BARE. Например, холера и термолабильный энтеротоксин нацелены на α-субъединицу Gs гетеротримерных GTP-связывающих белков . Поскольку α-субъединица ADP-рибозилирована, она постоянно находится в «активном», GTP-связанном состоянии; последующая активация внутриклеточного циклического АМФ стимулирует высвобождение жидкости и ионов из эпителиальных клеток кишечника. Кроме того, C. Botulinum C3 ADP-рибозилирует GTP-связывающие белки Rho иRas и коклюшный токсин ADP-рибозилаты Gi , Go и Gt. Токсин дифтерии АДФ-рибозилирует фактор удлинения рибосом EF-2 , который ослабляет синтез белка. [6]

Есть целый ряд бактерий , в которых используются обнажает в инфекции: КАРТОЧКИ токсин Mycoplasma пневмонии , холерного токсина в холерный вибрион ; термолабильный энтеротоксин из E.Coli ; Экзотоксин из синегнойной палочки ; Токсин коклюша из B. коклюша ; С3 токсина из С. ботулизма ; и дифтерии токсин из Corynebacterium дифтерии . [31]

См. Также [ править ]

  • Код гистона
  • Передача сигналов клетки
  • ПАРП-1
  • Холерный токсин
  • НАД + АДФ-рибозилтрансфераза
  • Токсин коклюша
  • Посттрансляционная модификация

Ссылки [ править ]

  1. Перейти ↑ Belenky P, Bogan KL, Brenner C (2007). «Метаболизм НАД + в здоровье и болезни» (PDF) . Trends Biochem. Sci . 32 (1): 12–9. DOI : 10.1016 / j.tibs.2006.11.006 . PMID  17161604 .
  2. Перейти ↑ Ziegler M (2000). «Новые функции давно известной молекулы. Новые роли НАД в клеточной передаче сигналов». Евро. J. Biochem . 267 (6): 1550–64. DOI : 10.1046 / j.1432-1327.2000.01187.x . PMID 10712584 . 
  3. Перейти ↑ Berger F, Ramírez-Hernández MH, Ziegler M (2004). «Новая жизнь долгожителя: сигнальные функции НАД (П)». Trends Biochem. Sci . 29 (3): 111–8. DOI : 10.1016 / j.tibs.2004.01.007 . PMID 15003268 . 
  4. Перейти ↑ Corda D, Di Girolamo M (2003). «ОБЗОР НОВОГО ЧЛЕНА EMBO: Функциональные аспекты моно-АДФ-рибозилирования белка» . EMBO J . 22 (9): 1953-8. DOI : 10,1093 / emboj / cdg209 . PMC 156081 . PMID 12727863 .  
  5. ^ а б Скарпа ES, Фабрицио G, Ди Джироламо M (2013). «. Роль внутриклеточного моно-АДФ-рибозилирования в биологии рака» . Журнал FEBS . 280 (15): 3551–3562. DOI : 10.1111 / febs.12290 . PMID 23590234 . 
  6. ^ a b c Крюгер, КМ; Барбьери, JT (январь 1995 г.). «Семейство бактериальных АДФ-рибозилирующих экзотоксинов» . Обзоры клинической микробиологии . 8 (1): 34–47. DOI : 10.1128 / CMR.8.1.34 . PMC 172848 . PMID 7704894 .  
  7. ^ Шамбон, P; Weill, JD; Мандель, П. (1963). «Никотинамидмононуклеотидная активация нового ДНК-зависимого ядерного фермента, синтезирующего полиадениловую кислоту». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 11 : 39–43. DOI : 10.1016 / 0006-291x (63) 90024-х . PMID 14019961 . 
  8. ^ Hayaishi, O .; Уэда, К. (2012). Реакции поли- и моно (ADP-рибозилирования): их значение в молекулярной биологии. В реакциях ADP-рибозилирования: биология и медицина . Нью-Йорк: Academic Press.
  9. ^ Хасса, ПО; Haenni, SS; Elser, M .; Хоттигер, Миссури (2006). «Hassa, PO; Haenni, SS, Элзер, М .; Хоттигер, MO (2006) "Ядерная АДФ-Ribozylation реакции в клетках млекопитающих: где мы сегодня и куда мы идем" . ... Microbiol Mol Biol Rev . 70 (3): 789-829. DOI : 10,1128 / mmbr.00040-05 . ПМК 1594587 . PMID 16959969 .  
  10. ↑ Фрай, РА (24 июня 1999 г.). «Характеристика пяти человеческих кДНК, гомологичных гену SIR2 дрожжей: Sir2-подобные белки (сиртуины) метаболизируют НАД и могут обладать белковой АДФ-рибозилтрансферазной активностью». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 260 (1): 273–9. DOI : 10.1006 / bbrc.1999.0897 . PMID 10381378 . 
  11. ↑ Стойка, Йоханнес Грегор Матиас; Морра, Роза; Баркаускайте, Ева; Kraehenbuehl, Rolf; Ариза, Антонио; Цюй, Юэ; Ортмайер, Мэри; Лейдекер, Орсоля; Кэмерон, Дэвид Р. (16 июля 2015 г.). «Идентификация класса белковых ADP-рибозилирующих сиртуинов в микробных патогенах» . Молекулярная клетка . 59 (2): 309–320. DOI : 10.1016 / j.molcel.2015.06.013 . ISSN 1097-4164 . PMC 4518038 . PMID 26166706 .   
  12. ^ Laing, Сабрина; Унгер, Мэнди; Кох-Нольте, Фридрих; Хааг, Фридрих (21 июля 2010 г.). «АДФ-рибозилирование аргинина» . Аминокислоты . 41 (2): 257–269. DOI : 10.1007 / s00726-010-0676-2 . PMC 3102197 . PMID 20652610 .  
  13. ^ Aja, Roko; Микоч, Андрей; Баркаускайте, Ева; Ахель, Иван (21 декабря 2012 г.). «Молекулярное понимание узнавания и обработки поли (АДФ-рибозы)» . Биомолекулы . 3 (1): 1–17. DOI : 10.3390 / biom3010001 . PMC 4030884 . PMID 24970154 .  
  14. ^ Лю, Цян; Флорея, Богдан I .; Филиппов, Дмитрий В. (2017). «АДФ-рибозилирование идет нормально: серин как главный сайт модификации» . Клеточная химическая биология . 24 (4): 431–432. DOI : 10.1016 / j.chembiol.2017.04.003 . PMID 28431224 . 
  15. ^ Leidecker, Орсоля; Бонфлио, Хуан Хосе; Колби, Томас; Чжан, Ци; Атанасов, Илиан; Зая, Роко; Палаццо, Лука; Стокум, Анна; Ахель, Иван; Матич, Иван (2016). «Серин - новый целевой остаток для эндогенного ADP-рибозилирования гистонов» . Природа Химическая биология . 12 (12): 998–1000. DOI : 10.1038 / nchembio.2180 . PMC 5113755 . PMID 27723750 .  
  16. ^ Bonfiglio, Хуан Хосе; Фонтана, Пьетро; Чжан, Ци; Колби, Томас; Гиббс-Сеймур, Ян; Атанасов, Илиан; Бартлетт, Эдвард; Зая, Роко; Ахель, Иван; Матич, Иван (2017). «АДФ-рибозилирование серина зависит от HPF1» . Молекулярная клетка . 65 (5): 932–940.e6. DOI : 10.1016 / j.molcel.2017.01.003 . PMID 28190768 . 
  17. ^ Laing S, Koch-Nolte F, Haag F, Buck F. "Стратегии идентификации сайтов ADP-рибозилирования аргинина". Журнал протеомики. 2011; 75: 169–176.
  18. ^ Макдональд LJ, Мосс Дж. "Ферментативное и неферментативное ADP-рибозилирование цистеина". Mol Cell Biochem. 1994; 138: 221–226.
  19. ^ Месснер, Саймон; Альтмейер, Матиас; Чжао, Хунтао; Позивил, Андреа; Рошицки, Бернд; Гериг, Питер; Рутисхаузер, Доротея; Хуанг, Даньчжи; Кафлиш, Амедео; Хоттигер, Майкл О. (2010). «PARP1 ADP-рибозилат остатков лизина в хвостах коровых гистонов» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (19): 6350–6362. DOI : 10.1093 / NAR / gkq463 . PMC 2965223 . PMID 20525793 .  
  20. ^ Оппенгеймер NJ, Бодли JW. Токсин дифтерии. «Сайт и конфигурация ADP-рибозилирования дифтамида при коэффициенте удлинения 2». J Biol Chem. 1981; 256: 8579–8581.
  21. ^ Смит JA, Stocken LA. «Химические и метаболические свойства аденозиндифосфат рибозы производных ядерных белков». Biochem J. 1975; 147: 523–529.
  22. ^ Мэннинг Д. Р., Фрейзер Б. А., Кан Р. А., Гилман А. Г.. «АДФ-рибозилирование трансдуцина с помощью белка активации островков. Идентификация аспарагина как сайта АДФ-рибозилирования». J Biol Chem. 1984; 259: 749–756.
  23. ^ Сковасси, AI; Денегри, М; Donzelli, M; Росси, L; Бернарди, Р.; Мандарино, А; Фруэн, я; Негри, К. (1998). «Синтез поли (АДФ-рибозы) в клетках, подвергающихся апоптозу: попытка встретить смерть до деградации PARP». Европейский журнал гистохимии . 42 (4): 251–8. PMID 10068897 . 
  24. ^ Aredia, F; Сковасси, AI (1 июня 2014 г.). «Участие PARP в гибели клеток». Границы биологических наук . 6 (2): 308–17. DOI : 10,2741 / 707 . PMID 24896207 . 
  25. ↑ Ryu, Keun Woo; Ким, Дэ-Сок; Краус, В. Ли (9 января 2015 г.). «Новые аспекты регуляции экспрессии генов с помощью ADP-рибозилирования и поли (ADP-рибоза) полимераз» . Химические обзоры . 115 (6): 2453–2481. DOI : 10.1021 / cr5004248 . PMC 4378458 . PMID 25575290 .  
  26. ^ Шрайбер, V; Amé, JC; Dollé, P; Шульц, я; Ринальди, Б; Fraulob, V; Ménissier-de Murcia, J; de Murcia, G (21 июня 2002 г.). «Поли (АДФ-рибоза) полимераза-2 (PARP-2) необходима для эффективной репарации ДНК с эксцизией оснований в сочетании с PARP-1 и XRCC1» . Журнал биологической химии . 277 (25): 23028–36. DOI : 10,1074 / jbc.m202390200 . PMID 11948190 . 
  27. ^ a b Груши, Кэтрин Дж .; Коуту, К. Анн-Мари; Ван, Хун-Ю; Бурильщик, Кристина; Кили, Риан; Лакин, Николас Д. (28 октября 2014 г.). «Роль ADP-рибозилирования в регулировании репарации двухцепочечных разрывов ДНК» . Клеточный цикл . 11 (1): 48–56. DOI : 10.4161 / cc.11.1.18793 . PMC 3272231 . PMID 22186780 .  
  28. ^ Cheng, Ифань (апрель 2009). «К атомной модели протеасомы 26S» . Текущее мнение в структурной биологии . 19 (2): 203–208. DOI : 10.1016 / j.sbi.2009.02.004 . PMC 2743420 . PMID 19286367 .  
  29. ^ a b Чо-Парк, Парк Ф .; Стеллер, Герман (апрель 2013 г.). «Регулирование протеасомы с помощью ADP-рибозилирования» . Cell . 153 (3): 614–627. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.03.040 . PMC 3676968 . PMID 23622245 .  
  30. ^ a b Boulares HA, Яковлев А.Г., Смулсон ME (2000). «Деградация генома эндонуклеазой DNAS1L3: ключевое событие, регулируемое PARP-1 в апоптозе». База данных Madame Curie Bioscience .
  31. ^ Дэн, Цин; Барбьери, Джозеф Т. (октябрь 2008 г.). «Молекулярные механизмы цитотоксичности ADP-рибозилирующих токсинов». Ежегодный обзор микробиологии . 62 (1): 271–288. DOI : 10.1146 / annurev.micro.62.081307.162848 . PMID 18785839 .