Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Андерс Крог
НациональностьДатский
Альма-матерКопенгагенский университет
ЗанятиеПрофессор
Известенскрытые марковские модели , нейронные сети
НаградыЧлен ISCB (2017)
Научная карьера
ПоляБиоинформатика
УчрежденияКопенгагенский университет
Веб-сайтлюди .binf .ku .dk / krogh

Андерс Крог является bioinformatician в Университете Копенгагена , [1] , где он ведет университета биоинформатики центр . Он известен своей новаторской работой по использованию скрытых марковских моделей в биоинформатике (вместе с Дэвидом Хаусслером ) [2] [3] [4] и является соавтором широко используемого учебника по биоинформатике. [5] Кроме того, он также является соавтором одного из первых учебников по нейронным сетям . [6] Его текущие исследовательские интересы включают анализ промоторов , [7] [8] [9] некодирующая РНК , [10] [11] [12] предсказание генов [13] [14] [15] и предсказание структуры белка . [16] [17] [18] [19] [20]

В 2017 году Крог был избран членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB). [21]

См. Также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Архивная копия" . Архивировано из оригинала на 2011-09-02 . Проверено 14 апреля 2011 .CS1 maint: заархивированная копия как заголовок ( ссылка ) Профессор Андерс Крог, Центр биоинформатики, факультет молекулярной биологии, Копенгагенский университет
  2. ^ Крог A, M Brown, Миан IS, Сджоландер K, Хаусслер D (1994). «Скрытые марковские модели в вычислительной биологии. Приложения к моделированию белков». J. Mol. Биол . 235 (5): 1501–31. DOI : 10.1006 / jmbi.1994.1104 . PMID 8107089 . 
  3. Перейти ↑ Krogh A, Mian IS, Haussler D (1994). «Скрытая марковская модель, которая находит гены в ДНК E. coli» . Nucleic Acids Res . 22 (22): 4768–78. DOI : 10.1093 / NAR / 22.22.4768 . PMC 308529 . PMID 7984429 .  
  4. ^ Sjölander K, Karplus K, Brown M и др. (1996). «Смеси Дирихле: метод улучшенного обнаружения слабой, но значительной гомологии белковых последовательностей» . Comput. Прил. Biosci . 12 (4): 327–45. DOI : 10.1093 / биоинформатики / 12.4.327 . PMID 8902360 . 
  5. ^ Дурбин, Ричард М .; Эдди, Шон Р .; Крог, Андерс ; Митчисон, Грэм (1998), Анализ биологической последовательности: вероятностные модели белков и нуклеиновых кислот (1-е изд.), Кембридж, Нью-Йорк: Cambridge University Press , doi : 10.2277 / 0521629713 , ISBN 0-521-62971-3, OCLC  593254083
  6. ^ Введение в теорию нейронных вычислений (Исследования Института Санта-Фе в науках о сложности). (1991) Джон А. Герц, Ричард Г. Палмер, Андерс Крог, Westview Press
  7. ^ Марстранд ТТ, Фрелльсен Дж, Мольтке I и др. (2008). Копли Р. (ред.). «Как можно скорее: структура для статистики избыточного представления для сайтов связывания факторов транскрипции» . PLOS ONE . 3 (2): e1623. Bibcode : 2008PLoSO ... 3.1623M . DOI : 10.1371 / journal.pone.0001623 . PMC 2229843 . PMID 18286180 .  
  8. ^ Фрит МС, Вален Е, Крог А, Хаясидзаки Y, Carninci Р, Санделин А (2008). «Код для инициации транскрипции в геномах млекопитающих» . Genome Res . 18 (1): 1–12. DOI : 10.1101 / gr.6831208 . PMC 2134772 . PMID 18032727 .  
  9. ^ Bryne JC, Valen E, Tang MH, et al. (2008). «JASPAR, база данных с открытым доступом профилей связывания факторов транскрипции: новый контент и инструменты в обновлении 2008 года» . Nucleic Acids Res . 36 (выпуск базы данных): D102–6. DOI : 10.1093 / NAR / gkm955 . PMC 2238834 . PMID 18006571 .  
  10. ^ Линдоу М, Джекобсен А, Найгаард S, Манг Y, Крог А (2007). «Внутригеномное сопоставление обнаруживает огромный потенциал miRNA-опосредованной регуляции у растений» . PLOS Comput. Биол . 3 (11): e238. Bibcode : 2007PLSCB ... 3..238L . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.0030238 . PMC 2098865 . PMID 18052543 .  
  11. ^ Lindgreen S, Гарднер PP, Крог A (2007). «MASTR: множественное выравнивание и предсказание структуры некодирующих РНК с использованием моделирования отжига». Биоинформатика . 23 (24): 3304–11. CiteSeerX 10.1.1.563.7072 . DOI : 10.1093 / биоинформатики / btm525 . PMID 18006551 .  
  12. ^ Lindgreen S, Гарднер PP, Крог A (2006). «Измерение ковариации в выравнивании РНК: физический реализм улучшает информационные меры» . Биоинформатика . 22 (24): 2988–95. DOI : 10.1093 / биоинформатики / btl514 . PMID 17038338 . 
  13. Перейти ↑ Munch K, Krogh A (2006). «Автоматическая генерация геноискателей для эукариотических видов» . BMC Bioinformatics . 7 : 263. DOI : 10,1186 / 1471-2105-7-263 . PMC 1522026 . PMID 16712739 .  
  14. Перейти ↑ Munch K, Gardner PP, Arctander P, Krogh A (2006). «Подход со скрытой марковской моделью для определения экспрессии из геномных мозаичных микромассивов» . BMC Bioinformatics . 7 : 239. DOI : 10,1186 / 1471-2105-7-239 . PMC 1481622 . PMID 16672042 .  
  15. Перейти ↑ Nielsen P, Krogh A (2005). «Крупномасштабное предсказание прокариотических генов и сравнение с аннотацией генома» . Биоинформатика . 21 (24): 4322–9. DOI : 10.1093 / биоинформатики / bti701 . PMID 16249266 . 
  16. Перейти ↑ Krogh A, Larsson B, von Heijne G, Sonnhammer EL (2001). «Прогнозирование топологии трансмембранного белка со скрытой марковской моделью: приложение для полных геномов». J Mol Biol . 305 (3): 567–580. DOI : 10.1006 / jmbi.2000.4315 . PMID 11152613 . 
  17. ^ Винтер O, Крог A (2004). «Обучение компьютеров складыванию белков». Phys. Rev. E . 70 (3): 030903. arXiv : cond-mat / 0309497 . Bibcode : 2004PhRvE..70c0903W . DOI : 10.1103 / PhysRevE.70.030903 . PMID 15524499 . S2CID 103560 .  
  18. ^ Вон КДж, Hamelryck Т, Prügel-Беннет А, Крог А (2007). «Эволюционный метод изучения структуры HMM: предсказание вторичной структуры белка» . BMC Bioinformatics . 8 : 357. DOI : 10,1186 / 1471-2105-8-357 . PMC 2072961 . PMID 17888163 .  
  19. ^ Hamelryck T, Кент JT, Крог A (2006). «Выборка реалистичных белковых конформаций с использованием локального структурного смещения» . PLOS Comput. Биол . 2 (9): e131. Bibcode : 2006PLSCB ... 2..131H . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.0020131 . PMC 1570370 . PMID 17002495 .  
  20. ^ Бумсма Вт, Mardia К.В., Тейлор CC, Ferkinghoff-Борг Дж, Крог А, Hamelryck Т (2008). «Генеративная, вероятностная модель локальной структуры белка» . PNAS . 105 (26): 8932–8937. Bibcode : 2008PNAS..105.8932B . DOI : 10.1073 / pnas.0801715105 . PMC 2440424 . PMID 18579771 .  
  21. ^ «13 февраля 2017: Международное общество вычислительной биологии называет семь членов как класс стипендиатов ISCB 2017 года» . www.iscb.org . Проверено 13 февраля 2017 года .

Внешние ссылки [ править ]

  • Домашняя страница Копенгагенского университета