AnimalBase - это проект, реализованный в 2004 году и поддерживаемый Геттингенским университетом , Германия. Целью проекта AnimalBase является оцифровка ранней зоологической литературы, обеспечение открытого доступа без авторских прав к зоологическим работам и предоставление проверенных вручную списков названий зоологических родов и видов в качестве бесплатного ресурса для общественности. AnimalBase внесла свой вклад в открытие классической таксономической литературы, которая считается полезной, потому что доступ к ранней литературе (особенно для конца 18 века) может быть затруднен для исследователей, которым нужны старые источники для своих таксономических исследований . [1]
Данные AnimalBase являются общественным достоянием . Публичное использование данных AnimalBase не ограничено и не обусловлено. [2] AnimalBase охватывает все зоологические дисциплины. В области информатики биоразнообразия AnimalBase уникальна тем, что обеспечивает связи между названиями родовых и конкретных таксонов и их оцифрованными исходными описаниями, уделяя особое внимание литературе и названиям, опубликованным до 1800 года.
История
Проект был инициирован в 2003 году при финансовой поддержке Немецкого исследовательского фонда (DFG). База данных и ее веб-интерфейс начали разрабатываться в 2004 году и были запущены в интерактивном режиме в 2005 году. Веб-интерфейс был разработан так, чтобы быть доступным для старых поколений компьютеров и веб-браузеров . В период с 2003 по 2005 год около 400 зоологических публикаций с 1550 по 1770 годы были оцифрованы, а 10 000 связанных зоологических названий были включены в базу данных. Вторая попытка (2008–2011 гг.) Включала дополнительную оцифрованную литературу, дающую доступ к еще нескольким десяти тысячам зоологических названий, которые были извлечены из оригинальных источников и связаны с их оцифрованными оригинальными описаниями.
Оцифровка и ссылки на оцифрованную литературу из других источников
Ранние зоологические публикации оцифровываются в соответствии с высочайшими стандартами качества Центром ретроспективной оцифровки в Геттингене ( Göttinger Digitalisierungszentrum , GDZ) Государственной и университетской библиотеки Геттингена (Staats- und Universitätsbibliothek Göttingen, SUB), который является одной из крупнейших библиотек Германии, включая более 4,5 миллионов томов. Если доступно, AnimalBase также предоставляет ссылки на оцифрованный контент , являющийся общественным достоянием других поставщиков, таких как Библиотека наследия биоразнообразия (BHL) или Gallica .
Извлечение таксономических названий из литературы
Зоологические названия родовых и специфических таксонов, которые были установлены в ранних зоологических публикациях, были вручную введены в базу данных, включая оригинальные и исправленные написание названий, типовые местонахождения и номера страниц, где эти названия были первоначально установлены в публикациях. Кроме того, имена были сопоставлены с записями в Чарльз Дэвис Sherborn «s Индекс Animalium (1902, 1922-1933) и номенклатурный Zoologicus по Neave (1939/1940, обновлено). Номенклатурный статус названий подтвержден действующей редакцией Международного кодекса зоологической номенклатуры (ICZN). Возможные расхождения между старыми базами данных и результатами исследования названий AnimalBase (например, номенклатурный приоритет или неправильное написание) иногда обсуждались в комментариях, предоставленных для каждого таксона. Весь процесс соответствует установленному стандарту AnimalBase.
Стандарт AnimalBase
Конкретные и родовые названия таксонов вводятся вручную со ссылкой на исходное описание. Базовая запись названия таксона соответствует стандарту AnimalBase, который состоит из следующих рекомендаций:
- Правильное первоначальное написание родового и специфического названий проверяется в соответствии с номенклатурными правилами (Кодекс ICZN, текущая редакция).
- Конкретные названия вводятся строго в сочетании с родом, к которому они были отнесены в первоначальном описании. В случаях, когда родовое имя было неправильно написано автором, установившим конкретное имя, команда AnimalBase объединяет конкретное имя с правильным написанием этого рода.
- Произвольно неправильное первоначальное написание названия таксона (т. Е. Отличное от правильного написания) вводится дополнительно с сохранением первоначального использования диакритических знаков , лигирования, прописных букв для конкретных имен, дефисов, пробелов между словами, неправильного последующего написания родовое название в использованном автором сочетании род-вид.
- Предоставляется имя автора, написанное в соответствии с именем, указанным на титульном листе первоисточника (примеры: Linnæus 1758, Linné 1766).
- Предоставляется год или дата публикации, как определено правилами номенклатуры (истинная дата публикации).
- Предоставляется гендерный подход (изменяемые или неизменяемые конкретные имена в соответствии с правилами постклассической латинской грамматики). Часто бывает сложно определить, является ли латинское имя прилагательным или нет, поэтому полученные в результате записи в AnimalBase этих данных могут быть ненадежными на 100%.
- Предоставляется ссылка на оцифрованную публикацию, содержащую исходное описание.
- Предоставляется страница исходного описания названия таксона (это страница, на которой название было впервые упомянуто и стало доступным). Если описываемое животное изображено на табличках с фигурками и без имени, упомянутого на табличках, это не обязательно указывается.
- Типовая локализация предоставляется, как указано в исходном описании, если она легко узнаваема или может быть неявно выведена из работы. Эта процедура может быть неточной (поскольку местонахождение типа - это местность, откуда произошли именованные типы, которые не исследуются командой AnimalBase), но, безусловно, предоставляет полезную информацию.
- Приводится высшая группа животных, к которой классифицируется таксон (тип, класс, отряд или аналогично клады).
- Записи сверяются с Index Animalium и (в случае родов) с Nomenclator Zoologicus. Неправильные записи (последующее использование ранее установленных имен, которые Шерборн часто неверно указывал как новые или nomina nuda ) и неправильное написание имен в этих базах данных не копируются в AnimalBase, если обнаруживаются как таковые.
- Неправильное последующее написание обычно не рассматривается как новые таксоны, но может быть указано как недоступное и обсуждаться, если название было упомянуто как новое название в Index Animalium или имеет другое значение.
- Все группы животных обрабатываются последовательно в соответствии с правилами ICZN (названия рыб подчиняются тем же правилам, что и названия насекомых).
Стандарт AnimalBase позволяет легко получить доступ к первичным данным исходного описания. Команда AnimalBase не согласовывает написание или авторство каждого первоначально установленного названия с теми, которые содержатся в различных зоологических базах данных, специализированных по дисциплинам или регионам. Основная задача AnimalBase - предоставить ссылки на оцифрованные оригинальные описания, но с ней также можно ознакомиться для правильного написания и авторства зоологических названий. В этом отношении AnimalBase потенциально может предоставить полезное обновление индекса Animalium Шерборна.
AnimalBase также предоставляет возможность комбинировать исходные названия с их текущими присвоениями (текущие комбинации род-вид). Например, подробная биологическая информация и изображения доступны для 2500 видов европейских неморских моллюсков , включая более 6000 фотографий. AnimalBase - это совместный проект с открытыми ресурсами; все зарегистрированные соавторы могут исправлять или вводить данные. Это включает в себя загрузку изображений (без авторских прав ) видов животных, биологических данных, включая измерения и диагностические признаки, данные о распределении , текущий статус сохранения и т. Д. Изображения и данные, предоставленные AnimalBase, прямо разрешены для использования на других веб-сайтах (скопированы или связаны ). [ необходима цитата ]
Рекомендации
- ^ Холден, C. 2007. Netwatch: таксономия, первые годы. - Наука 315: с. 1643.
- ^ Группа проекта AnimalBase, 2005-2010. AnimalBase. Ранняя зоологическая литература в Интернете. Электронная публикация в Интернете http://www.animalbase.uni-goettingen.de, по состоянию на 30 июля 2010 г.
Внешние ссылки
- AnimalBase http://www.animalbase.org
- Индекс Animalium http://www.sil.si.edu/digitalcollections/indexanimalium/
- Номенклатурный Zoologicus https://web.archive.org/web/20121126194823/http://uio.mbl.edu/NomenclatorZoologicus/
- Центр оцифровки SUB Göttingen