Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из Archaeoglobus veneficus )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Archaeoglobus - это род типа Euryarchaeota . [1] Archaeoglobus можно найти на высокотемпературных месторождениях нефти, где они могут способствовать закисанию нефтяных месторождений.

Метаболизм [ править ]

Археоглобусы растут анаэробно при чрезвычайно высоких температурах от 60 до 95 ° C, с оптимальным ростом при 83 ° C (подвид A. fulgidus VC-16). [2] Это сульфатредуцирующие археи , сочетающие восстановление сульфата до сульфида с окислением многих различных источников органического углерода, включая сложные полимеры.

A. lithotrophicus хемолито-автотрофно живет засчет водорода , сульфата и углекислого газа . Также A. profundus растет литотрофно , но, хотя этот вид нуждается в ацетате и CO 2 для биосинтеза, они гетеротрофны . [3]

Полная последовательность генома A. fulgidus выявила наличие почти полного набора генов метаногенеза . Функция этих генов у A. fulgidus остается неизвестной, в то время как отсутствие фермента метил-СоМ редуктазы не позволяет метаногенезу происходить по механизму, аналогичному механизму, обнаруженному в других метаногенах .

Описание и значение [ править ]

Представители Archaeoglobus - гипертермофилы, обитающие в гидротермальных источниках, нефтяных месторождениях и горячих источниках. Они могут образовывать биопленку при воздействии внешних факторов, таких как экстремальный pH или температура, высокие концентрации металла или добавление антибиотиков, ксенобиотиков или кислорода. Известно, что эти археоны вызывают коррозию железа и стали в системах переработки нефти и газа, производя сульфид железа. Однако их биопленки могут иметь промышленное или исследовательское применение в форме детоксикации образцов, загрязненных металлами, или для сбора металлов в экономически извлекаемой форме.

Структура генома [ править ]

Fulgidus Archaeoglobus геном представляет собой круглую хромосому примерно в два раза меньше кишечной палочки в 2,178,000 пар оснований. Четверть генома кодирует законсервированные белки, функции которых еще не определены, но они экспрессируются в других археонах, таких как Methanococcus jannaschii . Другая четверть кодирует белки, уникальные для архейного домена. Одно наблюдение, касающееся генома, заключается в том, что существует множество дупликаций генов, и дублированные белки не идентичны. Это предполагает метаболическую дифференциацию, в частности, в отношении путей разложения и рециркуляции углерода через очищенные жирные кислоты. Дублированные гены также увеличивают размер генома, чем у его собрата-архея M. jannaschii . Также отмечается, что Archaeoglobusне содержали интеинов в кодирующих областях, где у M. jannaschii было 18.

Молекулярные сигнатуры, показывающие родство с метаногенами и термококками [ править ]

Сравнительные геномные исследования геномов архей свидетельствуют о том, что представители рода Archaeoglobus являются ближайшими родственниками метаногенных архей. Это подтверждается наличием 10 консервативных сигнатурных белков, которые уникально обнаруживаются во всех метаногенах и Archaeoglobus . Кроме того, было идентифицировано 18 белков, которые уникально обнаружены у представителей Thermococci , Archaeoglobus и метаногенов , что позволяет предположить, что эти три группы архей могли иметь общего родственника, за исключением других архей. Однако нельзя исключить возможность того, что общее присутствие этих сигнатурных белков в этих архейных клонах связано с латеральным переносом генов. [4]

Экология [ править ]

Виды Archaeoglobus используют окружающую среду, действуя как мусорщики со многими потенциальными источниками углерода. Они могут получать углерод из жирных кислот, разложения аминокислот, альдегидов, органических кислот и, возможно, также CO. Более высокие температуры (примерно 83 ° C) являются идеальными температурами для роста Archaeoglobus , хотя биопленочная среда обеспечивает некоторую эластичность окружающей среды. Биопленка состоит из полисахаридов, белков и металлов.

Медицина [ править ]

Клетки, защищенные биопленкой, трудно уничтожить с помощью традиционной антимикробной терапии, что дает им лечебные возможности. [2]

Научные базы данных [ править ]

  • Ссылки PubMed на Archaeoglobus
  • Ссылки PubMed Central на Archaeoglobus
  • Ссылки Google Scholar для Archaeoglobus

Ссылки [ править ]

  1. ^ См. Веб-страницу NCBI на Archaeoglobus . Данные извлечены из "ресурсов таксономии NCBI" . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 .
  2. ^ а б Кленк и др. Полная последовательность генома гипертермофильной сульфатредуцирующей археи Archaeoglobus fulgidus  PDF Nature 390, 364-370 (ноябрь 1997 г.); DOI : 10.1038 / 37052
  3. ^ J. Vorholt et al. Ферменты и коферменты пути дегидрогеназы монооксида углерода для автотрофной фиксации CO2 у Archaeoglobus lithotrophicus и отсутствие дегидрогеназы монооксида углерода у гетеротрофных A. profundus Arch. Microbiol. 163, 112–118 (1995). DOI : 10.1007 / s002030050179
  4. Перейти ↑ Gao, B. and Gupta, RS (2007). Филогеномный анализ белков, характерных для архей и ее основных подгрупп, и происхождение метаногенеза. BMC Genomics. 8:86. DOI: 10.1186 / 1471-2164-8-86.

Внешние ссылки [ править ]

  • Страница таксономии NCBI для Archaeoglobus
  • Поиск по страницам таксономии Древо жизни для Archaeoglobus
  • Страница поиска видов2000 для Archaeoglobus
  • Страница MicrobeWiki для Archaeoglobus
  • Страница LPSN для Archaeoglobus
  • Archaeoglobus в Bac Dive - база метаданных по разнообразию бактерий

Дальнейшее чтение [ править ]

Научные журналы [ править ]

  • Стеттер, К.О. (1988). «Archaeoglobus fulgidus gen. Nov., Sp. Nov. Новый таксон чрезвычайно теплолюбивых архебактерий». Syst. Прил. Microbiol . 10 (2): 172–173. DOI : 10.1016 / s0723-2020 (88) 80032-8 .

Научные книги [ править ]

  • Мэдиган, штат Монтана; Мартинко, JM (2005). Брок Биология микроорганизмов, 11-е изд . Пирсон Прентис Холл.
  • Хубер Х, Стеттер К.О. (2001). "Семья I. Archaeoglobaceae fam. Nov. Stetter 1989, 2216" . В DR Boone, RW Castenholz (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии Том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag. ISBN 978-0-387-98771-2.
  • Стеттер, К.О. (1989). «Группа II. Сульфатредукторы археобактерий. Отряд Archaeoglobales». В JT Staley; Депутат Брайант; Н. Пфенниг; Дж. Г. Холт (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, Том 3 (1-е изд.). Балтимор: Williams & Wilkins Co.