BGI , в настоящее время известная как BGI Group , ранее известная как Пекинский институт геномики , является китайской компанией по секвенированию генома со штаб-квартирой в Шэньчжэне , провинция Гуандун , Китай. [2] [3]
Тип | Приватная компания |
---|---|
Промышленность | Секвенирование генома Биотехнология |
Основан | 9 сентября 1999 г. (Пекин) |
Основатель | Ван Цзянь Юй Цзюнь Ян Хуаньмин Лю Сици |
Штаб-квартира | Шэньчжэнь, Гуандун, Китай |
Количество локаций | |
Обслуживаемая площадь | по всему миру |
Ключевые люди | Ван Цзянь (президент, председатель) |
Продукты | Платформа DNBseq (платформа секвенирования нового поколения), Тест NIFTY (неинвазивный пренатальный тест) |
Бренды | DNBseq ™, NIFTY® |
Доход | 251 миллион долларов (2016) [1] |
Чистый доход | 51,7 миллиона долларов (2016) [1] |
Владелец | Ван Цзянь |
Количество работников | ~ 6000 (по всему миру) |
Подразделения | BGI Китай (материк) BGI Азиатско-Тихоокеанский регион BGI Америка BGI Европа (Европа и Африка) |
Дочерние компании | Список дочерних компаний:
|
Веб-сайт | www.genomics.cn |
Он был основан в 1999 году для участия в проекте « Геном человека» в качестве центра генетических исследований. [4] Он также секвенирует геномы других животных, растений и микроорганизмов. [5] Компания превратилась из научно-исследовательского института, который расшифровывал ДНК панд и растений риса, в компанию, занимающуюся клонированием животных, тестированием здоровья и контрактными исследованиями, в то время как ее более ранние некоммерческие исследования были продолжены Пекинским институтом Геномика , Китайская академия наук.
История
Ван Цзянь , Ю Цзюнь, Ян Хуаньминь и Лю Сици создали BGI в сентябре 1999 г. [5] в Пекине, Китай, в качестве неправительственного независимого исследовательского института, чтобы участвовать в проекте « Геном человека» в качестве представителя Китая. [6] [7] После завершения проекта финансирование прекратилось, после чего BGI переехала в Ханчжоу в обмен на финансирование от муниципального правительства Ханчжоу. В 2002 году BGI секвенировал геном риса , о чем писали на обложке журнала Science . В 2003 году BGI расшифровала геном вируса SARS и создала набор для обнаружения вируса. [ необходима цитата ] В 2003 году Китайская академия наук в сотрудничестве с BGI основала Пекинский институт геномики, первым директором которого стал Ян Хуаньмин. BGI Ханчжоу и Чжэцзянский университет также основали новый исследовательский институт - Институт геномных наук Джеймса Д. Уотсона при Чжэцзянском университете . Институт Уотсона должен был стать крупным центром исследований и образования в Восточной Азии по образцу лаборатории Колд-Спринг-Харбор в США. [ необходима цитата ]
В 2007 году штаб-квартира BGI переехала в Шэньчжэнь как «первое некоммерческое исследовательское учреждение в Китае, управляемое гражданами». Ю Цзюнь покинул BGI в это время, якобы продав свою долю другим трем учредителям за номинальную сумму. [5] В 2008 году правительство Шэньчжэня официально признало BGI-Shenzhen некоммерческой организацией. [8] В 2008 году BGI опубликовал первый геном азиатского человека. [6] [9]
В 2010 году BGI Shenzhen был сертифицирован как отвечающий требованиям стандарта ISO9001: 2008 для разработки и предоставления услуг высокопроизводительного секвенирования [10]. В том же году BGI приобрела 128 машин для секвенирования генов Illumina HiSeq 2000, [4] [6] который был поддержан 1,5 миллиарда долларов США в виде «фондов сотрудничества» в течение следующих 10 лет от Китайского банка развития . [5] [11] [12] По сообщениям, к концу года у них был бюджет в 30 миллионов долларов. [13] В 2010 году была основана BGI Americas с главным офисом в Кембридже, Массачусетс , США, и BGI Europe в Копенгагене , Дания. [14] [15] К 2018 году они были расширены за счет офисов и лабораторий в Сиэтле и Сан-Хосе в США, [4] и Лондоне в Великобритании, а также были основаны BGI Asia Pacific с офисами в Гонконге , Кобе (Япония). , Бангкок (Таиланд), Лаос , Сингапур , Брисбен (Австралия) и многие другие. [16] [17]
В 2011 году BGI сообщила, что в нем работает 4000 ученых и техников [2], а доход составляет 192 миллиона долларов. [5] BGI провела секвенирование генома смертельной вспышки E. coli O104: H4 в Германии в 2011 году за три дня и выпустила его по открытой лицензии. [18] С 2012 года он начал коммерциализацию своих услуг, имея инвестиции от China Life Insurance Company , Citic's Goldstone Investment, Jack Ma 's Yunfeng Capital и SoftBank China Capital. [19] В том же году они запустили собственный научный журнал GigaScience , [20] в партнерстве с BioMed Central для публикации статей по науке о жизни с большим объемом данных. [21] В 2013 году BGI сообщила, что поддерживает отношения с 17 из 20 ведущих мировых фармацевтических компаний [5] [22], и сообщила, что предоставляет глобальным фармацевтическим компаниям услуги в области коммерческой науки, здравоохранения, сельского хозяйства и информатики. [23] В том же году она купила компанию Complete Genomics of Mountain View, Калифорния , крупного поставщика технологий секвенирования ДНК, за 118 миллионов долларов США. [5] [18] В том же году BGI был приблизительно оценен в 820 миллионов долларов. [5]
В 2015 году они подписали договор о сотрудничестве с Центром точной клинической медицины больницы Чжуншань в Шанхае, открытым в мае 2015 года, с бюджетом в 100 миллионов йен. Сообщается, что они участвуют в качестве института секвенирования в китайском исследовательском проекте медицинского обслуживания стоимостью 9,2 миллиарда долларов, который продлится 15 лет. [4] [24] В мае 2017 года было объявлено о создании инновационного центра Западного побережья, совмещенного в Сиэтле и Сан-Хосе, на первом месте, где планируется работать над точной медициной и налажено сотрудничество с Вашингтонским университетом , Институтом Аллена. Brain Science , Фонд Билла и Мелинды Гейтс и Университет штата Вашингтон , а во второй уже существующей лаборатории со 100 сотрудниками для разработки технологий секвенирования следующего поколения . [4] В мае 2018 года было достигнуто соглашение с больницей Mount Sinai (Торонто) , Канада, о первой установке платформ BGISEQ в Северной Америке. [25]
Дочерняя компания BGI Group, BGI Genomics, провела первичное публичное размещение акций в июле 2017 года на Шэньчжэньской фондовой бирже , собрав 547 миллионов йен (80,7 миллиона долларов), при этом оценка компании в первый день составила более 1,15 миллиарда долларов. [1] [26] В 2018 году BGI, как сообщается, на 85,3% принадлежала Ван Цзяню , а группа владеет 42,4% своего основного подразделения BGI Genomics. Заявленная рыночная стоимость BGI Genomics в июле 2018 года составила около 5 миллиардов долларов, как и другой дочерней компании, MGI Tech, специализирующейся на разработке и производстве технологий, IPO которой около 20% акций за 1 миллиард долларов запланировано на 2019 год в Гонконге. . [19]
Основные достижения
- Первая последовательность de novo и сборка геномов млекопитающих [27] и человека с коротким секвенированием (так называемое « секвенирование следующего поколения ») [28]
- Секвенировал геном первого древнего человека из сохранившихся в вечной мерзлоте волос вымершего палео-эскимоса, возраст которых составляет примерно 4000 лет [29]
- Секвенировал первый диплоидный геном азиатского человека [30] в рамках проекта Ян Хуанга.
- Инициировано построение карты последовательностей пангенома человека, который , по оценкам, содержит 19-40 миллионов оснований, которых нет в эталонном геноме человека [31] [32]
- Первый проект BGI внес 1% эталонного генома Проекта генома человека и был единственным институтом в развивающемся мире, который внес свой вклад [33]
- Предоставил 10% информации о последовательностях для Международного проекта HapMap [33]
- Проведено экспериментальное исследование по секвенированию микробиома пищеварительной системы человека, который, по оценкам, в 150 раз больше, чем геном человека [34] [35].
- Ключевой центр секвенирования в проекте « 1000 геномов» [33]
- Первое китайское учреждение, секвенировавшее вирус тяжелого острого респираторного синдрома (SARS), всего через несколько часов после первого секвенирования вируса канадцами [36]
- Ключевой игрок в открытом выпуске исходных данных и анализа 2011 кишечной палочки O104: H4 вспышки [37]
- Секвенировали 40 одомашненных и диких тутовых шелкопрядов , выявив 354 гена, которые, вероятно, важны для приручения. [38]
- Секвенировали первый геном гигантской панды [27], равный по размеру геному человека, менее чем за 8 месяцев. [39] Секвенирование показало, что гигантская панда, Ailuropoda melanoleuca , имеет мутацию сдвига рамки считывания в гене T1R1, участвующем в распознавании острых вкусов . Мутация может быть генетической причиной, по которой панда предпочитает бамбук мясу. Однако у панды также отсутствуют гены, необходимые для переваривания бамбука, поэтому ее микробиом может играть ключевую роль в метаболизме ее основного источника пищи. [27]
- Ключевой участник китайско-британского проекта «Геном курицы» [33]
- По состоянию на 2010 г.[Обновить]секвенированные геномы растений включают рис , огурец , сою и сорго . Секвенированные геномы животных включают тутового шелкопряда , медоносной пчелы , водяных блох , ящериц и гигантских панд . Также было секвенировано еще 40 видов животных и растений и более 1000 бактерий. [7] [38] [40]
- В 2010 году компания Nature поставила BGI Shenzhen на 4-е место среди 10 лучших учебных заведений Китая, а все остальные - это университеты и Китайская академия наук . Рейтинг составлен на основе статей внаучных журналах Nature . [41] К 2016 году он возглавил список корпоративных учреждений в Китае, а также был 13-м корпоративным учреждением в глобальном масштабе. [41] [42] [43] В 2017 году среди наиболее продуктивных корпоративно-академических совместных проектов в период с 2012 по 2016 годыпартнерствоBGI и Копенгагенского университета занимало 4-е место. [44]
- В период с 2001 по 2013 год BGI был представлен примерно в 250 статьях, опубликованных в первоклассных академических журналах. [45]
- В 2014 году сообщалось, что BGI производит 500 клонированных свиней в год для тестирования новых лекарств [46], что составляет примерно 25% мировых геномных данных. [4]
- В январе 2018 года генеральный директор BGI Genomics Инь Е заявил, что они секвенировали более 10000 образцов WGS, при этом еще 20000 секвенировали их платформой BGISEQ-500, около 70% животных и растений до настоящего времени были секвенированы компанией и их партнерами, поскольку хорошо проработала «более 10 миллионов клинических образцов, включая 2,8 миллиона неинвазивных пренатальных тестов, 2,6 миллиона тестов на вирус папилломы человека, 1,53 миллиона тестов на нарушение слуха, чуть более полумиллиона скрининговых тестов для новорожденных и около 25 000 тестов на редкие заболевания». [47]
- BGI Group объявила на конференции AGBT в феврале 2020 года, что сделает секвенирование генома дешевле, впервые преодолев 100-долларовый барьер. [48] Компания из Шэньчжэня заявляет, что низкая стоимость станет возможной благодаря «экстремальной» системе секвенирования ДНК, которую она планирует предложить, которая способна расшифровывать геномы 100 000 человек в год.
Текущие исследовательские проекты
Генетика человека
Проект "Геном человека"
Международный проект был запущен в 1990 году и объявлен завершенным в 2003 году. Они присоединились к нему в 1999 году и обеспечили 1% рабочей нагрузки. [45]
Международный проект HapMap
Международный проект, запущенный в 2002 году и объявленный завершенным в 2009 году, обеспечил 10% рабочей нагрузки. [45]
Проект Ян Хуан
Основанный в 2007 году и названный в честь двух императоров, которые, как считается, основали доминирующую этническую группу Китая [49], BGI планировал в этом проекте секвенировать по меньшей мере 100 китайцев для создания карты китайских генетических полиморфизмов с высоким разрешением. [50] [51] Первые данные о геноме были опубликованы в октябре 2007 года. [52] Анонимный китайский миллиардер пожертвовал проекту 10 миллионов юаней (около 1,4 миллиона долларов США), и его геном был секвенирован в начале проекта. [50] [51]
Проект 1000 геномов
Международный проект по созданию подробного каталога генетических вариаций человека был запущен в 2008 г. и объявлен завершенным в 2015 г. [45]
Международный проект генома рака
Международный проект, запущенный в 2008 году. [45]
Проект 1000 редких заболеваний
Международный проект, инициированный совместно с Детской больницей Филадельфии в 2011 году. [45] С его помощью были обнаружены гены и мутации, связанные с редкими заболеваниями, о которых сообщалось в более чем 20 научных публикациях. Они также «участвовали в разработке клинического диагностического теста всего экзома, предлагаемого при патологии CHOP с 2012 года». Они снова начали сотрудничать в 2017 году, когда к Консорциуму детских опухолевых тканей головного мозга CHOP присоединился китайский национальный генетический банк BGI . [53]
Проект когнитивной геномики
В августе 2012 года было объявлено о проекте под названием «Когнитивная геномика», посвященном исследованию генетической основы интеллекта . Американский физик Стивен Су присоединился в качестве научного консультанта и был одним из руководителей проекта. [54] Это было сделано на 2200 образцах, в основном из США [45] , из которых 1600 были индивидуумами, которые участвовали в исследовании математически недоразвитой молодежи и, как сообщается, имели IQ более 160 баллов , собранные американским психологом и генетиком Робертом Пломином . [54] [55] Помимо публикации новой улучшенной версии популярного инструмента исследования геномных ассоциаций PLINK , [56] проект так и не был завершен, и ведущие исследователи переехали в США, чтобы основать компанию Genomic Prediction, которая предоставляет расширенные генетические возможности. тестирование на ЭКО . [57]
Обвинения в генетическом надзоре в Синьцзяне
В 2019 году сообщалось, что дочерняя компания BGI, Forensic Genomics International, создала базу данных генетических профилей людей по всей стране с поддержкой WeChat . [58] [59] [60] [61] [62] В июле 2020 года сообщалось, что BGI вернула ссуду по Программе защиты зарплаты после проверки средств массовой информации. [63] В том же месяце, Министерство торговли США «s Бюро промышленности и безопасности размещены два BGI дочерние на его список Entity для оказания помощи в предполагаемых нарушениях прав человека в связи с его генетической аналитической работы в Синьцзяне . [64] [65] BGI ответили на листинг, заявив, что они «не потворствуют и никогда не будут участвовать в каких-либо нарушениях прав человека», и заявив, что они были озадачены этим решением, поскольку «упомянутая дочерняя компания была создана в ноябре 2016 года и имеет не осуществляла фактическую деятельность » [66]
Животные и растения
Проект генома 1000 растений
Названный 1000 геномов растений проекта (1KP), это был международный проект , начатый в 2008 году и объявил полный в 2015 году окончательные результаты были опубликованы в Nature в 2019 [67] В 2010 году BGI объявила , что будет способствовать US $ 100 млн крупномасштабные проекты секвенирования растений и животных. [12] [68] В 2018 году было объявлено, что на смену проекту 1KP пришел проект 10KP по секвенированию 10 000 видов растений до высокого (на уровне хромосом) качества. [69]
Проект "Три экстремальных экологических генома животных"
В 2009 году BGI-Shenzhen объявила о запуске трех геномных проектов, направленных на животных, живущих в экстремальных условиях . Три выбранных генома - это геномы двух полярных животных: белого медведя и императорского пингвина , а также одного животного из альтиплано : тибетской антилопы . [70] тибетская антилопа геном был опубликован в 2013 году [71] полярный медведь в 2014 году [72] , а император и пингвин Адели геномов в 2014 г. [73]
Международный проект по геному больших кошек
В 2010 году BGI, Пекинский университет, Маньчжурский тигровый зоопарк Хэйлунцзян , Институт зоологии Куньмин , Зоопарк Сан-Диего, Институт исследований по сохранению природы в Калифорнии и другие объявили, что будут высекать амурского тигра , южно-китайского тигра , бенгальского тигра , азиатского льва , африканского льва. лев , дымчатый леопард , снежный барс и другие представители семейства кошачьих. Тогда было объявлено, что BGI также секвенирует геномы и эпигеномы лигера и тигона . Поскольку два реципрокных гибрида имеют разные фенотипы, несмотря на то, что они генетически идентичны, ожидалось, что эпигеном может выявить основу таких различий. [74] Цель проекта заключалась в том, чтобы значительно продвинуть исследования по охране природы, и он был благоприятно объявлен китайским годом Тигра. [75] Проекты «Лигр» и «Тигон» так и не были реализованы, но в 2013 г. были опубликованы результаты по геномам амурского тигра , белого бенгальского тигра , африканского льва, белого африканского льва и снежного барса . [76]
Симбионт Геном Проект
Совместно финансируемый проект, объявленный 19 марта 2010 года, BGI объявил, что будет сотрудничать с Сидни К. Пирсом из Университета Южной Флориды и Чарльзом Делвишем из Университета Мэриленда в Колледж-Парке для секвенирования геномов морского слизня Elysia chlorotica и его корм для водорослей Vaucheria litorea . Морской слизень использует гены водорослей для синтеза хлорофилла , первого открытого межвидового переноса генов. Секвенирование их геномов могло бы выяснить механизм этого переноса. [77] Эта работа была в конечном итоге завершена, и была представлена сборка генома общей длиной 557 мегабайт. [78]
Проект БиоГеном Земли
Международный проект, инициированный Смитсоновским институтом и другими партнерами в 2018 году, по секвенированию ДНК 1,5 миллиона известных видов эукариот на планете. [53]
Микроорганизмы
Проект "Десять тысяч микробных геномов"
Проект был запущен 1 августа 2009 года с миссией по секвенированию 10 000 микробов в течение 3 лет. Он включает в себя секвенирование промышленных, сельскохозяйственных, медицинских микроорганизмов и многие другие. Это делается в сотрудничестве со многими институтами, университетами и предприятиями, включая Институт биотехнологических исследований Китайской академии сельскохозяйственных наук и Тяньцзиньский институт промышленной биотехнологии Китайской академии наук . [79]
Сотрудничество с китайскими военными
В январе 2021 года агентство Reuters сообщило, что BGI работала с Народно-освободительной армией и связанными с ней учреждениями, такими как Национальный университет оборонных технологий, над усилиями по повышению силы солдат и другими проектами. [80]
COVID-19
25 августа 2020 года агентство Reuters сообщило, что около 3700 человек в Швеции ошибочно сообщили, что у них есть коронавирус из-за неисправности набора для тестирования COVID-19 от BGI Genomics. [81] Несмотря на то, что он стал пятым тестом, включенным в Список ВОЗ для использования в чрезвычайных ситуациях, [82] и получил высшие оценки по тестам на чувствительность в голландском исследовании, которое независимо проверяло коммерчески доступные тесты. [83] BGI Genomics защищала продукт, обвиняя различия в пороговых значениях, используемых между лабораториями, изучающими очень низкие уровни вируса. [84]
Технология биоинформатики
В 2010 году институтский суперкомпьютер с 500 узлами обрабатывал 10 терабайт необработанных данных секвенирования каждые 24 часа с имеющихся 30 или около того анализаторов генома от Illumina . Годовой бюджет компьютерного центра составлял 9 миллионов долларов США. [13] В том же году вычислительные биологи BGI разработали первый успешный алгоритм, основанный на теории графов , для выравнивания миллиардов строк из 25-75 пар оснований, созданных секвенсорами следующего поколения, в частности Genome Analyzer компании Illumina , во время секвенирования de novo. Алгоритм, названный SOAPdenovo, может собрать геном за два дня и был использован для сборки массива геномов растений и животных. [32]
SOAPdenovo является частью « пакета анализа коротких олигонуклеотидов » (SOAP) , набора инструментов, разработанных BGI для сборки de novo геномов человеческого размера, выравнивания, обнаружения SNP, повторного секвенирования, поиска инсерций и анализа структурных вариаций. SOAPdenovo, созданный для коротких считываний секвенсоров Illumina, использовался для сборки нескольких геномов человека [28] [29] [30] (идентификация вставки в восемь килобаз, не обнаруженной путем сопоставления с эталонным геномом человека [85] ) и животных, таких как гигантская панда. [27]
Вплоть до 2015 года, BGI выпустила BGISEQ-100, на основе Thermo Fisher Scientific «s Ion Torrent устройства и BGISEQ-1000, на основе аналогичной технологии по Полному Genomics , для обоих из которых получило одобрение от CFDA для NIFTY (Non -инвазивный тест на трисомию плода) пренатальный тест. [86] [87] В октябре 2015 года BGI запустила BGISEQ-500 [88], большую настольную систему секвенирования, которая через год получила одобренную регистрацию в качестве медицинского устройства CFDA. Сообщается , что он не получил более 500 заказов для системы и набегает 112000 испытаний до конца 2016 года [87] China National GeneBank , открыл BGI и китайского правительства в сентябре 2016 года, [89] имеет 150 инструментов системы. [87] BGISEQ-500 был разработан как платформа для секвенирования, способная конкурировать с платформами Illumina своим качеством и сниженной ценой. [86] В ноябре 2016 года BGI выпустила BGISEQ-50, миниатюрную версию настольного секвенсора. [90] В 2017 году BGI начала предлагать WGS по цене 600 долларов. [4] В октябре 2017 года MGI Tech, дочерняя компания BGI, выпустила два новых секвенсора MGISEQ-2000 и MGISEQ-200 (позже переименованных в DNBSEQ-G400 и DNBSEQ-G50) [91], а годом позже - в DNBSEQ-T7. [92]
Иски о нарушении патентных прав
В 2019 году конкурент Illumina, Inc. подал несколько исков о нарушении патентных прав против BGI. [93] [94] В ответ BGI подала иски о нарушении патентных прав против Illumina, заявив о нарушении федерального антимонопольного законодательства и законов Калифорнии о недобросовестной конкуренции . [95]
Смотрите также
- Китайский национальный центр генома человека
- Институт Wellcome Sanger
- Broad Institute
Рекомендации
- ^ a b c «BGI Genomics привлекает 81 млн долларов в ходе IPO» . Новости генной инженерии и биотехнологии. 17 июля 2017 . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ a b Одинокий Фрэнк, High-Quality DNA , 24 апреля 2011 г., The Daily Beast
- ^ «Введение» . BGI Group.
- ^ Б с д е е г Меган Молтени (18 мая 2017 г.). «Китайский геномный гигант нацелился на совершенный секвенсор» . Проводной . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ Б с д е е г ч Шу-Чинг Жан Чен (2 сентября 2013 г.). «Геномные мечты сбываются в Китае» . Forbes Asia . Проверено 27 октября 2014 года .
- ^ a b c Кевин Дэвис, (27 сентября 2011 г.) The Bedrock of BGI: Huanming Yang Bio-IT World, дата обращения 14 января 2014 г.
- ^ a b ДНК дракона , 17 июня 2010 г., The Economist
- ^ О BGI , BGI
- ↑ Ye, Jia (2008) Интервью с лидером в области геномики - Beijing Genomics Institute Asia Biotech, последнее обращение 14b января 2013 г.
- ^ «Новое поколение услуг высокопроизводительного секвенирования BGI получило сертификат ISO9001» . 23 марта 2010 . Проверено 14 января 2014 года .
- ^ «BGI получит 1,5 миллиарда долларов в виде« совместных фондов »в течение 10 лет от Китайского банка развития | Последовательность | Секвенирование | GenomeWeb» . Проверено 29 марта 2010 года .
- ^ а б Fox, J .; Клинг, Дж. (2010). «Китайский институт делает смелую постановку последовательности» . Природа Биотехнологии . 28 (3): 189–191. DOI : 10.1038 / nbt0310-189c . PMC 7097335 . PMID 20212469 . S2CID 205266392 .
- ^ а б Пецко, Г.А. (2010). «Восхождение на Восток» . Геномная биология . 11 (1): 102. DOI : 10.1186 / GB-2010-11-1-102 . PMC 2847708 . PMID 20156314 . S2CID 7008023 .
- ^ "BGI Americas" . BGI . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ "BGI Europe & Africa" . BGI . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ "BGI Asia Pacific" . BGI . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ «Офисы и лаборатории» . BGI . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ a b Spectre, Майкл (6 января 2014 г.) The Gene Factory The New Yorker, дата обращения 28 октября 2014 г.
- ^ а б Ван Луяо; Хан Вэй (19 июля 2018 г.). «Genome Giant ищет 1 миллиард долларов на оборудование для потенциального IPO» . Caixin . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ «Большой и связанный в научном издательстве запуск журнала больших данных GigaScience» . EurekAlert! . Проверено 17 июня 2019 .
- ^ Поллак, Эндрю (30 ноября 2011 г.). «Секвенирование ДНК, пойманное в потоке данных» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 17 июня 2019 .
- ^ Введение в фармацевтические и биотехнологические услуги , BGI
- ^ BGI - Промышленность , BGI
- ^ Дэвид Сираноски (6 января 2016 г.). «Китай широко использует точную медицину» . Природа . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ Ребекка Роббинс; Кейт Шеридан (26 октября 2018). «Китайская компания представляет новый мощный секвенсор. Но сможет ли он конкурировать в США?» . Стат . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ «Китайская геномная компания BGI дебютирует на фондовом рынке» . China Daily . 14 июля 2017 . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ а б в г Li, R .; Fan, W .; Tian, G .; Zhu, H .; Он, Л .; Cai, J .; Хуанг, Q .; Cai, Q .; Li, B .; Bai, Y .; Zhang, Z .; Zhang, Y .; Wang, W .; Li, J .; Wei, F .; Li, H .; Jian, M .; Li, J .; Zhang, Z .; Nielsen, R .; Li, D .; Gu, W .; Ян, З .; Xuan, Z .; Райдер, О.А.; Леунг, FCC; Zhou, Y .; Cao, J .; Солнце, X .; и другие. (2009). «Последовательность и сборка de novo генома гигантской панды» . Природа . 463 (7279): 311–317. Bibcode : 2010Natur.463..311L . DOI : 10,1038 / природа08696 . PMC 3951497 . PMID 20010809 . S2CID 4317858 .
- ^ а б Li, R .; Zhu, H .; Ruan, J .; Qian, W .; Fang, X .; Ши, З .; Li, Y .; Li, S .; Shan, G .; Kristiansen, K .; Li, S .; Ян, H .; Wang, J .; Ван, Дж. (2009). «Сборка de novo геномов человека с массовым параллельным секвенированием короткого чтения» . Геномные исследования . 20 (2): 265–272. DOI : 10.1101 / gr.097261.109 . PMC 2813482 . PMID 20019144 .
- ^ а б Расмуссен, М .; Li, Y .; Lindgreen, S .; Педерсен, JS; Альбрехтсен, А .; Мольтке, I .; Мецпалу, М .; Мецпалу, Э .; Кивисилд, Т .; Gupta, R .; Берталан, М .; Nielsen, K .; Гилберт, MTP; Wang, Y .; Рагхаван, М .; Кампос, ПФ; Камп, HM; Wilson, AS; Gledhill, A .; Tridico, S .; Bunce, M .; Lorenzen, ED; Binladen, J .; Guo, X .; Zhao, J .; Чжан, X .; Zhang, H .; Ли, З .; Chen, M .; Орландо, Л. (2010). «Древняя последовательность генома человека вымершего палео-эскимоса» . Природа . 463 (7282): 757–762. Bibcode : 2010Natur.463..757R . DOI : 10,1038 / природа08835 . PMC 3951495 . PMID 20148029 . S2CID 4423505 .
- ^ а б Wang, J .; Wang, W .; Li, R .; Li, Y .; Tian, G .; Goodman, L .; Fan, W .; Zhang, J .; Li, J .; Zhang, J .; Guo, Y .; Feng, B .; Li, H .; Lu, Y .; Fang, X .; Liang, H .; Ду, З .; Li, D .; Zhao, Y .; Hu, Y .; Ян, З .; Zheng, H .; Hellmann, I .; Inouye, M .; Pool, J .; Yi, X .; Zhao, J .; Duan, J .; Zhou, Y .; Цинь, Дж. (2008). «Диплоидная последовательность генома азиатского человека» . Природа . 456 (7218): 60–65. Bibcode : 2008 Натур 456 ... 60 Вт . DOI : 10,1038 / природа07484 . PMC 2716080 . PMID 18987735 . S2CID 4397887 .
- ^ Li, R .; Li, Y .; Zheng, H .; Luo, R .; Zhu, H .; Li, Q .; Qian, W .; Ren, Y .; Tian, G .; Li, J .; Чжоу, G .; Чжу, X .; Wu, H .; Qin, J .; Джин, X .; Li, D .; Cao, H .; Ху, X .; Бланш, HLN; Cann, H .; Чжан, X .; Li, S .; Bolund, L .; Kristiansen, K .; Ян, H .; Wang, J .; Ван, Дж. (2009). «Построение карты последовательностей пангенома человека». Природа Биотехнологии . 28 (1): 57–63. DOI : 10.1038 / nbt.1596 . PMID 19997067 . S2CID 205274447 .
- ^ а б «Чтобы начать построение« пангенома человека », BGI De Novo собирает два генома из данных Illumina | Последовательность | Секвенирование | GenomeWeb» . Проверено 29 марта 2010 года .
- ^ а б в г Аарон Саенс (11 ноября 2010 г.). «BGI - Китайский центр геномики приложил руку ко всему» . Singularity Hub . Университет сингулярности . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ Qin, J .; Li, R .; Raes, J .; Arumugam, M .; Бургдорф, Канзас; Manichanh, C .; Nielsen, T .; Pons, N .; Levenez, F .; Yamada, T .; Mende, DR; Li, J .; Xu, J .; Li, S .; Li, D .; Cao, J .; Ван, Б .; Liang, H .; Zheng, H .; Xie, Y .; Tap, J .; Lepage, P .; Берталан, М .; Batto, JM; Hansen, T .; Le Paslier, D .; Linneberg, A .; Nielsen, HBR; Pelletier, E .; Рено, П. (2010). «Каталог микробных генов кишечника человека, созданный путем метагеномного секвенирования» . Природа . 464 (7285): 59–65. Bibcode : 2010Natur.464 ... 59. . DOI : 10,1038 / природа08821 . PMC 3779803 . PMID 20203603 . S2CID 4426541 .
- ^ "Международная группа по каталогам микробных генов в кишечнике человека | Ежедневные новости GenomeWeb | Секвенирование | GenomeWeb" . Архивировано 7 марта 2010 года . Проверено 29 марта 2010 года .
- ^ Энзеринк, М. (2003). «ТОРС В КИТАЕ: упущенный шанс Китая». Наука . 301 (5631): 294–296. DOI : 10.1126 / science.301.5631.294 . PMID 12869735 . S2CID 166598822 .
- ^ Немецкие команды, BGI и Life Technologies идентифицируют смертельный европейский штамм E.coli. Архивировано 2 сентября 2011 г.в Wayback Machine , 23 марта 2012 г. | Био-IT мир
- ^ а б Xia, Q .; Guo, Y .; Zhang, Z .; Li, D .; Xuan, Z .; Ли, З .; Dai, F .; Li, Y .; Cheng, D .; Li, R .; Cheng, T .; Jiang, T .; Becquet, C .; Сюй, X .; Liu, C .; Zha, X .; Fan, W .; Lin, Y .; Shen, Y .; Jiang, L .; Jensen, J .; Hellmann, I .; Tang, S .; Zhao, P .; Xu, H .; Yu, C .; Zhang, G .; Li, J .; Cao, J .; Лю С. (2009). «Полное ресеквенирование 40 геномов выявляет случаи одомашнивания и гены у шелкопряда (Bombyx)» . Наука . 326 (5951): 433–436. Bibcode : 2009Sci ... 326..433X . DOI : 10.1126 / science.1176620 . PMC 3951477 . PMID 19713493 .
- ^ Сираноски, Д. (2010). «Китайская бионаука: фабрика последовательностей» . Природа . 464 (7285): 22–24. DOI : 10.1038 / 464022a . PMC 7095434 . PMID 20203579 . S2CID 205053566 .
- ^ Huang, S .; Li, R .; Zhang, Z .; Li, L .; Гу, X .; Fan, W .; Лукас, В .; Ван, X .; Се, В .; Ni, P .; Ren, Y .; Zhu, H .; Li, J .; Ссылка на сайт.; Jin, W .; Fei, Z .; Li, G .; Staub, J .; Килиан, А .; Ван дер Фоссен, ЕАГ; Wu, Y .; Guo, J .; He, J .; Цзя, З .; Ren, Y .; Tian, G .; Lu, Y .; Ruan, J .; Qian, W .; Ван, М. (2009). «Геном огурца Cucumis sativus L» . Генетика природы . 41 (12): 1275–1281. DOI : 10.1038 / ng.475 . PMID 19881527 . S2CID 10711523 .
- ^ а б «Почести и награды» . BGI . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ «Таблицы 2016: Организации - корпоративные (Китай)» . Природа . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ «Таблицы 2016: Институты - корпоративные (Глобальные)» . Природа . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ «Сотрудничество резко возрастает, поскольку компании передают научные исследования на аутсорсинг» . Природа. 6 декабря 2017 . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ Б с д е е г Чжаочэнь Ван; и другие. (2014). «Следуя шагам гиганта - вопросы управления и биоэтические размышления в Китае» . BMC Med Ethics . 15 : 79. DOI : 10,1186 / 1472-6939-15-79 . PMC 4226894 . PMID 25361573 . S2CID 15568900 .
- ^ Shukman, Дэвид (14 января 2014) Китай Клонирование на «промышленном масштабе» BBC News науки и окружающей среды, Получено 14 января 2014
- ^ «Последние новости: BGI представляет два важных глобальных плана на конференции JP Morgan Healthcare» . genomics.cn . BGI. 11 января 2018 . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ https://www.technologyreview.com/s/615289/china-bgi-100-dollar-genome/
- ^ «Китайские ученые расшифровывают геном 1-го добровольца» . Жэньминь жибао в Интернете. 7 января 2008 . Проверено 29 октября 2014 года .
- ^ а б Цю, Джейн; Хайден, Чек (2008). «Геномика в размерах» . Природа . 451 (7176): 234. Bibcode : 2008Natur.451..234Q . DOI : 10.1038 / 451234a . PMID 18202611 . S2CID 5088288 .
- ^ а б «BGI предлагает услугу секвенирования нового поколения, запускает проект по секвенированию 100 геномов | Последовательность | Секвенирование | GenomeWeb» . Genomeweb LLC. 8 января 2008 . Проверено 29 октября 2014 года .
- ^ (20 ноября 2008) TuanHuang - Первый азиатский Диплоидной Геном архивации 2010-01-30 в Вайбак машины вебстраницы BGI Shenzen, Проверено 29 октября 2014
- ^ а б «BGI объявляет о новом партнерстве и 8-й годовщине в США» . BGI. 4 мая 2018 . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ а б Эд Йонг (14 мая 2013 г.). «Китайский проект исследует генетику гения» . Природа . 497 (7449): 297–299. Bibcode : 2013Natur.497..297Y . DOI : 10.1038 / 497297a . PMID 23676731 .
- ^ Джейсон Дорриер (19 марта 2013 г.). «Китайский BGI отследит 2200 гениев в поисках« умных »генов» . Singularity Hub . Университет сингулярности . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ Чанг, Кристофер С .; Чоу, Карсон С.; Телье, Лоран САМ; Ваттикути, Шашаанк; Перселл, Шон М .; Ли, Джеймс Дж. (01.12.2015). «PLINK второго поколения: ответ на вызов более крупных и богатых наборов данных» . GigaScience . 4 (1): 7. DOI : 10,1186 / s13742-015-0047-8 . PMC 4342193 . PMID 25722852 .
- ^ «Геномное предсказание» . genomicprediction.com . Проверено 25 октября 2020 .
- ^ Моро, Ив (2019-12-03). «Прекратите надзор за геномом» . Природа . 576 (7785): 36–38. Bibcode : 2019Natur.576 ... 36M . DOI : 10.1038 / d41586-019-03687-х . PMID 31796907 . S2CID 208621060 .
- ^ «BGI официально входит в зону высоких технологий Урумчи» . www.uhdz.gov.cn (на китайском языке). 2016-07-27. Архивировано 07 декабря 2019 года . Проверено 7 декабря 2019 .
- ^ Сираноски, Дэвид (25 мая 2017 г.). «Китай расширяет сбор данных о ДНК в неспокойном западном регионе» . Природа . 545 (7655): 395–396. Bibcode : 2017Natur.545..395C . DOI : 10.1038 / 545395a . ISSN 0028-0836 . PMID 28541335 .
- ^ Ви, Суи-Ли; Мозур, Пол (2019-12-03). «Китай использует ДНК для нанесения на карту лиц с помощью Запада» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 15 февраля 2020 .
- ^ Аллен-Эбрагимиан, Бетани; Дорфман, Зак (3 июня 2020 г.). «Китайский производитель тестов на коронавирус согласился создать генобанк Синьцзяна» . Axios . Архивировано 3 июня 2020 года . Проверено 3 июня 2020 года .
- ^ Аллен-Эбрагимиан, Бетани (20 июля 2020 г.). «Дочерняя компания китайского биотехнологического гиганта в США возвращает кредит ГЧП после истории Axios» . Axios . Проверено 20 июля 2020 года .
- ^ Басу, Захари (20 июля 2020 г.). «США занесли в черный список китайские компании, связанные с проектом генного банка Синьцзяна» . Axios . Проверено 20 июля 2020 года .
- ^ «Министерство торговли добавляет одиннадцать китайских организаций, причастных к нарушениям прав человека в Синьцзяне, в список юридических лиц» . Министерство торговли США . 2020-07-20 . Проверено 20 июля 2020 .
- ^ Мир, Республика. «Китайская генетическая компания BGI отрицает нарушения прав человека уйгуров» . Республика Мир . Проверено 1 ноября 2020 .
- ^ Либенс-Мак, Джеймс Х .; Баркер, Майкл С .; Карпентер, Эрик Дж .; Дейхолос, Майкл К .; Gitzendanner, Matthew A .; Грэм, Шон У .; Гроссе, Иво; Ли, Чжэн; Мелконян, Майкл; Мирараб, Сиаваш; Порш, Мартин (октябрь 2019 г.). «Тысяча транскриптомов растений и филогеномика зеленых растений» . Природа . 574 (7780): 679–685. DOI : 10.1038 / s41586-019-1693-2 . ISSN 1476-4687 . PMC 6872490 . PMID 31645766 .
- ^ «BGI ищет предложения по секвенированию 1000 геномов растений и животных; обещает 100 миллионов долларов на цели» . GenomeWeb. 12 января 2010 . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ Ченг, Шифэн; Мелконян, Майкл; Смит, Стивен А.; Брокингтон, Сэмюэл; Арчибальд, Джон М; Дело, Пьер-Марк; Ли, Фэй-Вэй; Мелконян, Барбара; Мавродиев, Евгений В; Солнце, Венцзин; Фу, Юань (20.02.2018). «10KP: план секвенирования филодиверсионного генома» . GigaScience . 7 (3): 1–9. DOI : 10,1093 / gigascience / giy013 . ISSN 2047-217X . PMC 5869286 . PMID 29618049 .
- ^ «Запуск геномных проектов для трех животных, обитающих в экстремальных условиях» . 26 апреля 2009 . Дата обращения 22 мая 2015 .
- ^ Ге, Ри-Ли; Цай, Цингл; Шен, Юн-И; Сан, А .; Ма, Лан; Чжан, Юн; Йи, Синь; Чен, Ян; Ян, Линфэн; Хуанг, Инь; Он, Ронгджун (14.05.2013). «Проект последовательности генома тибетской антилопы» . Nature Communications . 4 (1): 1858. DOI : 10.1038 / ncomms2860 . ISSN 2041-1723 . PMC 3674232 . PMID 23673643 .
- ^ Лю, судоходство; Lorenzen, Eline D .; Фумагалли, Маттео; Ли, Бо; Харрис, Келли; Сюн, Цзыцзюнь; Чжоу, Лонг; Корнелиуссен, Торфинн Санд; Сомель, Мехмет; Бэббит, Кортни; Рэй, Грег (2014-05-08). «Популяционная геномика выявляет недавнее видообразование и быструю эволюционную адаптацию у белых медведей» . Cell . 157 (4): 785–794. DOI : 10.1016 / j.cell.2014.03.054 . ISSN 0092-8674 . PMC 4089990 . PMID 24813606 .
- ^ Ли, Цай; Чжан, Юн; Ли, Цзяньвэнь; Конг, Лешэн; Ху, Хаофу; Пан, Хайлин; Сюй, Луохао; Дэн, юань; Ли, Ци Ё; Цзинь, Лицзюнь; Ю, Хао (декабрь 2014 г.). «Два генома антарктических пингвинов раскрывают понимание их эволюционной истории и молекулярных изменений, связанных с окружающей средой Антарктики» . GigaScience . 3 (1): 27. DOI : 10,1186 / 2047-217x-3-27 . ISSN 2047-217X . PMC 4322438 . PMID 25671092 .
- ^ «BGI для секвенирования видов тигров, львов и леопардов в этом году | Последовательность | Секвенирование | GenomeWeb» . Архивировано 28 февраля 2010 года . Проверено 29 марта 2010 года .
- ^ «БГИ» . Архивировано из оригинального 17 февраля 2010 года . Проверено 29 марта 2010 года .
- ^ Чо, Ю.С.; Hu, L .; Hou, H .; Lee, H .; Xu, J .; Kwon, S .; Ой, S .; Kim, HM; Jho, S .; Kim, S .; Шин Ю.А.; Ким, Британская Колумбия; Kim, H .; Ким, CU; Луо, SJ; Джонсон, МЫ; Кёпфли, КП; Schmidt-Küntzel, A .; Тернер, JA; Маркер, л .; Harper, C .; Миллер, С.М.; Jacobs, W .; Бертола, LD; Ким, TH; Lee, S .; Чжоу, Q .; Юнг, HJ; Сюй, X .; и другие. (2013). «Геном тигра и сравнительный анализ с геномами льва и снежного барса» . Nature Communications . 4 : 2433. Bibcode : 2013NatCo ... 4.2433C . DOI : 10.1038 / ncomms3433 . ЛВП : 2263/32583 . PMC 3778509 . PMID 24045858 .
- ^ «БГИ» . Архивировано из оригинального 21 августа 2010 года . Проверено 29 марта 2010 года .
- ↑ Проект генома морского слизня Elysia chlorotica, работающего на солнечной энергии. Научные данные 6, 190022 (2019). doi: 10.1038 / sdata.2019.22 в научных отчетах в 2019 г.
- ^ « План создания 10 000 генома микробов начинается в Шэньчжэне» . Китайская академия наук. 5 августа 2009 года Архивировано из оригинала 25 сентября 2010 года . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ Нидхэм, Кирсти (2021-01-30). «Китай ген фирма , оказывающая по всему миру испытания COVID работал с китайскими военными» . Рейтер . Проверено 30 января 2021 .
- ^ Джонсон, Саймон. «Тысячи шведов получили ложноположительный результат на COVID-19 из-за неисправности тестового набора» . Рейтер . Архивировано 27 августа 2020 года . Проверено 27 августа 2020 .
- ^ Всемирная организация здравоохранения. «Перечень использования ВОЗ в чрезвычайных ситуациях для диагностики in vitro (IVD) при обнаружении SARS-CoV-2» (PDF) .
- ^ «Китайский набор для тестирования Covid-19 превосходит альтернативы в голландском исследовании» . Южно-Китайская утренняя почта . 2020-05-20 . Проверено 1 ноября 2020 .
- ^ «Китайский BGI защищает набор для тестирования COVID-19 после критики со стороны Швеции» . Рейтер . 2020-08-26 . Проверено 1 ноября 2020 .
- ^ «BGI использует новый алгоритм кратковременного считывания для сборки генома панды в качестве доказательства концепции человеческого генома | Биоинформ | Информатика | GenomeWeb» . Проверено 28 марта 2010 года .
- ^ а б «BGI модернизирует полную технологию геномики для своего нового высокопроизводительного настольного секвенсора» . Bio-ITWorld . Кембриджский институт медицинских технологий. 28 октября 2015 . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ а б в «BGI запускает новый настольный секвенсор в Китае, регистрирует более крупную версию в CFDA» . 360Dx . GenomeWeb. 11 ноября 2016 . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ Юлия Каров (26 октября 2015 г.). «BGI запускает настольный секвенсор в Китае; планирует зарегистрировать платформу в CFDA» . GenomeWeb . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ Моника Хегер (21 сентября 2016 г.). «Китайский национальный генетический банк открывается за счет инвестиций от BGI, правительства» . GenomeWeb . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ Моника Хегер (26 октября 2018 г.). «BGI запускает новый секвенсор, поскольку клиенты сообщают данные с более ранних инструментов» . GenomeWeb . Проверено 2 декабря 2018 .
- ^ «MGI Tech от BGI запускает две новые платформы NGS» . PR Newswire . 31 октября 2017 . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ «MGI представляет революционный секвенсор со сверхвысокой пропускной способностью MGISEQ-T7» . PR Newswire . 27 октября 2018 . Проверено 3 декабря 2018 .
- ^ Нидхэм, Кирсти (14 мая 2020 г.). «Китайский BGI закрепился в Австралии благодаря массовым тестам на коронавирус» . Рейтер . Проверено 3 июня 2020 года .
- ^ «Illumina близка к победе в тендере на блокирование продаж продуктов ДНК BGI» . Закон360 . 11 мая 2020 . Проверено 3 июня 2020 года .
- ^ «BGI подает в суд на Illumina за нарушение антимонопольного законодательства, заявляет, что фирма получила патенты последовательного доступа посредством мошенничества» . GenomeWeb . Проверено 13 января 2021 .
Внешние ссылки
- Официальный веб-сайт