Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Бифидобактерии
Bifidobacterium adolescentis
Bifidobacterium adolescentis
Научная классификация е
Домен:Бактерии
Тип:Актинобактерии
Класс:Актинобактерии
Приказ:Бифидобактерии
Семья:Bifidobacteriaceae
Stackebrandt et al. 1997 исправление. Zhi et al. 2009 г.
Роды

Bifidobacteriaceae единственная семья из бактерий , [1] в порядке от Bifidobacteriales . Согласно выпуску 106 LTP на основе 16S рРНК, опубликованному Проектом «Живое дерево всех видов» , отряд Bifidobacteriales представляет собой кладу, вложенную в подотряд Micrococcineae , также род Bifidobacterium является парафилетическим по отношению к другим родам в семействе, т. Е. другие роды гнездятся внутри Bifidobacterium .

Филогения [ править ]

В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) [2] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) [3], а филогения основана на выпуске 106 LTP на основе 16S рРНК, разработанном «The Проект «Всевидовое живое дерево» . [4]

 
 

? B. actinocoloniiforme Killer et al. 2011 г.

 
 

? B. bohemicum Killer et al. 2011 г.

 
 

? B. bombi Killer et al. 2009 г.

 
 

? B. cuniculi Scardovi et al. 1979 г.

 
 

? B. kashiwanohense Morita et al. 2011 г.

 
 

? B. thermophilum Mitsuoka 1969 г.

 
 

? B. coagulans ♠ Killer et al. 2007 г.

 
 

? B. crudilactis ♠ Delcenserie et al. 2007 г.

 
 

? B. simiae ♠ Falsen et al. 2001 г.

 
 
 

B. mongoliense Watanabe et al. 2009 г.

 
 

B. Psycheraerophilum Simpson et al. 2004 г.

 
 
 
 

B. Minimum Biavati et al. 1982 г.

 
 
 
 
 
 

B. catenulatum Scardovi и Crociani 1974 г.

 
 

B. pseudocatenulatum Scardovi et al. 1979 г.

 
 
 
 

B. angulatum Scardovi и Crociani 1974 г.

 
 

B. merycicum Biavati and Mattarelli 1991 г.

 
 
 
 
 

B. dentium Scardovi и Crociani 1974 г.

 
 
 

B. ruminantium Biavati and Mattarelli 1991 г.

 
 
 

B. adolescentis Reuter 1963 г.

 
 

B. stercoris Kim et al. 2010 г.

 
 
 
 
 
 
 

B. scardovii Hoyles et al. 2002 г.

 
 
 

B. bifidum (Tissier 1900) Орла-Йенсен 1924

 
 
 
 

B. subtile Biavati et al. 1982 г.

 
 

Gardnerella vaginalis (Gardner and Dukes 1955) Гринвуд и Пикетт 1980

 
 
 
 
 

B. breve Reuter 1963 г.

 
 Б. лонгум
 

Б. л. Infantis (Reuter 1963) Mattarelli et al. 2008 г.

 
 
 

Б. л. longum (Reuter, 1963), Mattarelli et al. 2008 г.

 
 

Б. л. suis (Matteuzzi et al. 1971) Mattarelli et al. 2008 г.

 
 
 
 
 
 
 

B. pullorum Trovatelli et al. 1974 г.

 
 
 

B. gallinarum Watabe et al. 1983 г.

 
 

B. saeculare Biavati et al. 1992 г.

 
 
 
 
 
 

B. gallicum Lauer 1990 г.

 
 
 

B. magnum Scardovi и Zani 1974 г.

 
 
 Б. псевдолонгум
 

Б. п. globosum (Biavati et al. 1982) Yaeshima et al. 1992 г.

 
 

Б. п. pseudolongum (Mitsuoka 1969) Yaeshima et al. 1992 г.

 
 
 
 

B. choerinum Scardovi et al. 1979 г.

 
 B. animalis
 

Б. а. animalis (Мицуока, 1969) Masco et al. 2004 г.

 
 

Б. а. lactis (Meile et al. 1997) Masco et al. 2004 г.

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

B. boum Scardovi et al. 1979 г.

 
 Б. термацидофилум
 

Б. т. porcinum Zhu et al. 2003 г.

 
 

Б. т. thermacidophilum (Dong et al. 2000) Zhu et al. 2003 г.

 
 
 
 
 

B. asteroides Scardovi and Trovatelli 1969 г.

 
 
 

B. coryneforme (ex Scardovi and Trovatelli 1969) Biavati et al. 1982 г.

 
 

B. indicum Scardovi и Trovatelli 1969 г.

 
 
 
 
 
 

B. tsurumiense Okamoto et al. 2008 г.

 
 
 

Aeriscardovia aeriphila Simpson et al. 2004 г.

 
 
 
 

Alloscardovia omnicolens Huys et al. 2007 г.

 
 

Metascardovia criceti Okamoto et al. 2007 г.

 
 
 
 

Parascardovia denticolens (Crociani et al. 1996) Jian and Dong 2002

 
 Скардовия
 

S. inopinata (Crociani et al. 1996) Jian and Dong 2002 исправлено. Даунс и др. 2011 г.

 
 

S. wiggsiae Downes et al. 2011 г.

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не перечисленные в Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)

Ссылки [ править ]

  1. ^ Mantzourani M, Фенлон M, Бейтон D (февраль 2009). «Связь между Bifidobacteriaceae и клинической серьезностью поражения корневым кариесом». Oral Microbiol. Иммунол . 24 (1): 32–7. DOI : 10.1111 / j.1399-302X.2008.00470.x . PMID  19121067 .
  2. ^ JP Euzéby. «Бифидобактерии» . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Архивировано из оригинала на 2013-01-27 . Проверено 17 ноября 2011 .
  3. ^ Сэйерс; и другие. «Бифидобактерии» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2011 .
  4. ^ Проект «Живое дерево всех видов» . «Выпуск 106 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF) . Silva Полная база данных рибосомных РНК . Проверено 17 ноября 2011 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Systema Naturae 2000 / Классификация - Семейство Bifidobacteriaceae