| Бифидобактерии | |
|---|---|
 | |
| Bifidobacterium adolescentis | |
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Актинобактерии |
| Учебный класс: | Актинобактерии |
| Заказ: | Бифидобактерии Stackebrandt et al. 1997 исправление. Zhi et al. 2009 г. |
Bifidobacteriales представляет собой порядок из бактерий , [1] в подклассе из Actinobacteridae .
Семья и роды [ править ]
Геномика [ править ]
В филогенетическом дереве для заказа Bifidobacteriales , на основе гр , RpoC , и ДНК - гиразы B , Gardnerella влагалищной ветви между различными Bifidobacterium видами, что делает род Bifidobacterium полифилетическим . Род можно было бы сделать монофилетическим, если бы G. vaginalis был помещен в Bifidobacterium . Сравнительный анализ выровненных белковых последовательностей привел к открытию двух консервативных инделей сигнатур, которые специфичны для порядка Bifidobacteriales . Первыйindel , делеция из 1 аминокислоты в рибосомном белке L13 , обнаруживается у всех видов Bifidobacteriales и ни у каких других актинобактерий , обеспечивая потенциальный молекулярный маркер для всего отряда Bifidobacteriales . Второй обнаруженный индель представляет собой вставку из 1 аминокислоты в глюкозо-6-фосфатдегидрогеназу, обнаруженную у всех видов Bifidobacterium и G. vaginalis , но не у других актинобактерий . Таким образом, этот индель характерен для клады, состоящей из видов Bifidobacterium и G. vaginalis.и может использоваться для отличия этих родов от остальной части порядка Bifidobacteriales . Также было идентифицировано 16 консервативных сигнатурных белков, которые являются уникальными для отряда Bifidobacteriales и могут использоваться в качестве молекулярных маркеров для этого отряда. Кроме того, были идентифицированы 6 консервативных сигнатурных белков, которые являются уникальными для Bifidobacterium и Gardnerella, что является дополнительным доказательством того, что виды этих двух родов тесно связаны, и обеспечивает молекулярные маркеры для клады, состоящей из этих родов. [2]
Ссылки [ править ]
- ^ Крогиус-Курикка Л., Кассинен А., Паулин Л. и др. (2009). «Анализ последовательности процентных библиотек фракций G + C фекальной бактериальной ДНК человека показывает большое количество актинобактерий» . BMC Microbiol . 9 : 68. DOI : 10,1186 / 1471-2180-9-68 . PMC 2679024 . PMID 19351420 .
- ^ Gao, B .; Гупта, RS (2012). «Филогенетическая основа и молекулярные сигнатуры для основных кладов филума актинобактерий» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 76 (1): 66–112. DOI : 10.1128 / MMBR.05011-11 . PMC 3294427 . PMID 22390973 .
Внешние ссылки [ править ]
- Systema Naturae 2000 / Классификация - Порядок бифидобактерий
