CSS Indian Chief использовался в качестве принимающего корабля в Чарльстоне, Южная Каролина , с 1862 по 1865 год. Одной из его дополнительных деталей в 1863 году была поддержка местных торпедных операций. Флагманский офицер ВМС Конфедеративных Штатов Дж. Р. Такер писал о своем командире лейтенанте В. Г. Дозье 24 августа 1863 года: «Вам будет приятно иметь столько лодок, оснащенных торпедами, сколько вы сможете поднять к шлюпбалкам вождя Индии». Ее первым командиром был лейтенант Дж. Х. Ингрэхэм. Она была сожжена конфедератами перед эвакуацией Чарльстона 18 февраля 1865 года.
В 1929 году обломки корабля Indian Chief были уничтожены динамитом во время дноуглубительных работ. [2]