Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Centisome представляет собой единицу длины определяется как один процент от длины конкретной хромосомы . [1] Эта единица измерения физической длины ДНК начала использоваться на ранних этапах исследования геномов с помощью молекулярной биологии, прежде чем стало возможным разрешение последовательностей нуклеиновых кислот хромосом.

Одним из основных применений этой единицы было описание локуса гена путем указания расстояния в сантисомах от контрольной точки на хромосоме. Например, когда в 1997 году был окончательно завершен полный геном бактерии Escherichia coli , он был представлен в виде шкалы в сантисомах (а также в килобазах ). [2] Поскольку бактериальные хромосомы имеют круговую форму , точкой отсчета не может быть конец молекулы ДНК, но должна быть точка, которая имеет некоторую легко определяемую уникальную характеристику. Часто эта точка является точкой начала репликации , хотя для E. coli это точка начала переноса во время конъюгации.. [3] Следовательно, точкой отсчета для положений центисом является просто соглашение, установленное для каждого отдельного вида организмов.

По большей части в современной научной литературе термин «центисома» используется как часть сокращенного способа обозначения определенной интересующей области на хромосоме определенных организмов. Например, было проведено много исследований в области хромосом видов сальмонелл "Centisome 63" . [4] [5]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Питер Д. Карп; Моника Райли (11 января 2009 г.), Представления метаболических знаний (PDF)
  2. ^ Блаттнер, Франция; Планкетт G, 3-й; Блох, Калифорния; Perna, NT; Burland, V; Райли, М; Collado-Vides, J; Glasner, JD; Роде, СК; Mayhew, GF; Грегор, Дж; Дэвис, Северо-Запад; Киркпатрик, штат Джорджия; Годен, Массачусетс; Роза, диджей; Mau, B; Шао, Y (5 сентября 1997 г.). «Полная последовательность генома Escherichia coli K-12». Наука . 277 (5331): 1453–62. DOI : 10.1126 / science.277.5331.1453 . PMID 9278503 . 
  3. ^ "Escherichia coli K-12 substr. MG1655 oriC" . biocyc.org . EcoCyc . Проверено 4 апреля 2021 года . По историческим причинам нумерация кольцевой хромосомы E. coli начинается не с точки начала репликации, а с точки начала переноса во время конъюгации.
  4. Перейти ↑ Galán, JE (апрель 1996). «Молекулярно-генетические основы проникновения сальмонелл в клетки-хозяева». Молекулярная микробиология . 20 (2): 263–71. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.1996.tb02615.x . PMID 8733226 . 
  5. ^ "Google Scholar ищет" Centisome 63 " " . scholar.google.com .