Примитивный Восточная Римская христианская церковь стояла на месте, и некоторые исследователи идентифицировали это с построенному в 6 - м веке императором Юстинианом I . Она была заменена старой Великой мечетью Сеуты, архитектурным сооружением огромного богатства, согласно сохранившимся описаниям, и, хотя она претерпела несколько расширений, вряд ли какие-либо ее остатки сегодня можно увидеть.
После португальского завоевания 1415 года Великая мечеть была преобразована в христианскую церковь путем переделок, но нет никаких свидетельств того, чем они были. Время и ущерб, нанесенный военными инцидентами, привели к разрушению здания, и в конце 17 века было решено заменить его новой церковью, спроектированной архитектором Хуаном де Очоа. Строительные работы начались в 1686 году, но в последующие годы возникло много трудностей в результате большой осады, которой подверглась Сеута, и новый собор не был освящен до 1726 года, когда он был посвящен Успению Богоматери.
К собору примыкает здание, в котором находятся Викариат, Секретариат, Епархиальный архив, Библиотека, Соборный музей и другие ответвления епархии, а также дворец епископа, окружающий небольшой треугольный двор.
Важными достопримечательностями собора являются Часовня Пресвятой Троицы, алтарь в стиле барокко и фрески Мигеля Бернардини , а также три больших полотна и фигура Пресвятой Богородицы португальского происхождения XV века.