Перейти к навигации Перейти к поиску
Cistrome относится к «набору цис-действующих целей в транс-действующий фактор на геном масштабе, также известный как в естественных условиях генома местоположении [связывания фактора транскрипции-сайтов] или гистоновых модификаций». [1] Термин cistrome является портманто из cistr (от цистрона ) + Оме (от генома ). Термин цистром был придуман исследователями из Института рака Дана-Фарбер и Гарвардской медицинской школы . [2]
Такие технологии, как иммунопреципитация хроматина в сочетании с анализом микрочипов « ChIP-on-chip » или с массовым параллельным секвенированием ДНК « ChIP-Seq », значительно облегчили определение цистрома факторов транскрипции и других белков, связанных с хроматином .
Ссылки [ править ]
- ^ Лю Т., Ортис Дж.А., Тайнг Л., Мейер К.А., Ли Б., Чжан И, Шин Х, Вонг С.С., Ма Дж., Лей И, Папе У. Дж., Пойдингер М, Чен Й, Йунг К., Браун М, Турпаз Й, Лю XS (2011). «Цистром: интегративная платформа для исследований регуляции транскрипции» . Genome Biol . 12 (8): R83. DOI : 10.1186 / ГБ-2011-12-8-r83 . PMC 3245621 . PMID 21859476 .
- ^ "cistrome / FrontPage" . PBWiki, Inc.
Дальнейшее чтение [ править ]
- Lupien M, Eeckhoute J, Meyer CA, Wang Q, Zhang Y, Li W, Carroll JS, Liu XS, Brown M (март 2008 г.). «FoxA1 переводит эпигенетические сигнатуры в транскрипцию, специфичную для клонов, управляемую энхансером» . Cell . 132 (6): 958–70. DOI : 10.1016 / j.cell.2008.01.018 . PMC 2323438 . PMID 18358809 .
- Lupien M, Brown M (июнь 2009 г.). «Цистромики гормонозависимого рака» . Endocr. Relat. Рак . 16 (2): 381–9. DOI : 10.1677 / ERC-09-0038 . PMID 19369485 .