Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Схема путей восстановления несоответствия ДНК. В первом столбце показано восстановление несоответствия у эукариот, а во втором - восстановление у большинства бактерий. Третий столбец показывает восстановление несоответствия, а именно в E. coli .
Микрофотография, показывающая потерю окрашивания на MLH1 при колоректальной аденокарциноме в соответствии с восстановлением несоответствия ДНК (слева от изображения) и доброкачественной слизистой оболочки толстой кишки (справа от изображения).

Восстановление несоответствия ДНК ( MMR ) - это система для распознавания и исправления ошибочной вставки, делеции и неправильного включения оснований, которые могут возникнуть во время репликации и рекомбинации ДНК , а также для восстановления некоторых форм повреждений ДНК . [1] [2]

Исправление несоответствия зависит от цепи. Во время синтеза ДНК вновь синтезированная (дочерняя) цепь обычно будет содержать ошибки. Чтобы начать восстановление, механизм восстановления несоответствия отличает вновь синтезированную цепь от шаблона (родительского). У грамотрицательных бактерий временное гемиметилирование различает цепи (родительский элемент метилирован, а дочерний - нет). Однако у других прокариот и эукариот точный механизм не ясен. Предполагается, что у эукариот вновь синтезированная ДНК с отстающей цепью временно содержит зазоры.(перед запечатыванием ДНК-лигазой) и обеспечивает сигнал, который направляет системы проверки несоответствия на соответствующую цепь. Это означает, что эти зазубрины должны присутствовать в ведущей нити, и недавно были обнаружены доказательства этого. [3] Недавняя работа [4] показала, что зарубки являются сайтами для RFC-зависимой загрузки репликационного скользящего зажима PCNA специфическим для ориентации образом, так что одна сторона белка в форме пончика соприкасается с 3'- ОН конец на нике. Затем загруженная PCNA направляет действие эндонуклеазы MutLalpha [5] на дочернюю цепь в присутствии несоответствия и MutSalpha или MutSbeta.

Любое мутационный событие , которое разрушает сверхвитков структуру из ДНК несет в себе потенциал , чтобы поставить под угрозу генетической стабильности клетки. Тот факт, что системы обнаружения и исправления повреждений столь же сложны, как и сам механизм репликации, подчеркивает важность, которую эволюция придает точности ДНК.

Примеры несовпадающих оснований включают спаривание G / T или A / C (см. Восстановление ДНК ). Несоответствия обычно возникают из-за таутомеризации оснований во время репликации ДНК. Повреждение восстанавливается путем распознавания деформации, вызванной несоответствием, определения цепи матрицы и цепи, не являющейся шаблоном, и удаления неправильно встроенного основания и замены его правильным нуклеотидом . Процесс удаления включает не только сам несовпадающий нуклеотид. Может быть удалено несколько или до тысяч пар оснований вновь синтезированной цепи ДНК.

Белки восстановления несоответствия [ править ]

Белок репарации несоответствия ДНК, С-концевой домен
hpms2-atpgs
Идентификаторы
СимволDNA_mis_repair
PfamPF01119
Клан пфамCL0329
ИнтерПроIPR013507
PROSITEPDOC00057
SCOP21bkn / SCOPe / SUPFAM
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Восстановление несоответствия - это очень консервативный процесс от прокариот до эукариот . Первые доказательства репарации несовпадений были получены на S. pneumoniae ( гены hexA и hexB ). Последующая работа над E. coli определила ряд генов, которые при мутационной инактивации вызывают гипермутируемые штаммы. Поэтому генные продукты называются «Mut» белками и являются основными активными компонентами системы репарации несовпадений. Три из этих белков важны для обнаружения несоответствия и направления к нему механизма восстановления: MutS , MutH и MutL (MutS является гомологом HexA и MutL HexB).

MutS образует димер (MutS 2 ), который распознает несовпадающее основание на дочерней цепи и связывает мутировавшую ДНК. MutH связывается в гемиметилированных сайтах дочерней ДНК, но его действие является латентным, активируясь только при контакте с димером MutL (MutL 2 ), который связывает комплекс MutS-ДНК и действует как медиатор между MutS 2 и MutH, активируя последний. ДНК зацикливается для поиска ближайшего сайта метилирования d (GATC) к несоответствию, который может находиться на расстоянии до 1 т.п.н. После активации комплексом MutS-ДНК MutH разрывает дочернюю цепь рядом с сайтом гемиметилирования. MutL новобранцы UvrD хеликаза(ДНК-геликаза II) для разделения двух цепей с определенной полярностью от 3 'до 5'. Затем весь комплекс MutSHL скользит по ДНК в направлении несовпадения, высвобождая нить, которую нужно вырезать по ходу движения. Экзонуклеаза следует за комплексом и переваривает хвост β-ДНК. Привлечение экзонуклеазы зависит от того, с какой стороны несовпадающего MutH надрезает цепь - 5 'или 3'. Если ник, сделанный MutH, находится на 5'-конце несоответствия, используется либо RecJ, либо ExoVII (обе экзонуклеазы от 5 'до 3'). Если, однако, ника находится на 3'-конце несовпадения, используется ExoI ( фермент от 3 'до 5').

Весь процесс заканчивается за сайтом несоответствия, т.е. как сам сайт, так и окружающие его нуклеотиды полностью вырезаются. Одноцепочечный разрыв, созданный экзонуклеазой, затем может быть восстановлен ДНК-полимеразой III (с помощью одноцепочечного связывающего белка), который использует другую цепь в качестве матрицы и, наконец, запечатан ДНК-лигазой. Затем ДНК-метилаза быстро метилирует дочернюю цепь.

Гомологи MutS [ править ]

При связывании димер MutS 2 изгибает спираль ДНК и экранирует примерно 20 пар оснований. Он обладает слабой АТФазной активностью, и связывание АТФ приводит к образованию третичных структур на поверхности молекулы. Кристаллическая структура из MutS показывает , что это исключительно асимметричное, и, в то время как его активная конформация представляет собой димер, только один из двух половин взаимодействуют с сайтом рассогласования.

В эукариот, М ут S ч omologs образуют две основные гетеродимеры: Msh2 / Msh6 (MutSα) и Msh2 / Msh3 (MutSβ). Путь MutSα участвует в основном в замене оснований и репарации ошибочного спаривания с малой петлей. Путь MutSβ также участвует в репарации малой петли в дополнение к репарации большой петли (~ 10 нуклеотидных петель). Однако MutSβ не восстанавливает замены оснований.

Гомологи MutL [ править ]

MutL также имеет слабую активность АТФазы (он использует АТФ для движения). Он образует комплекс с MutS и MutH, увеличивая след MutS в ДНК.

Однако процессивность (расстояние, на которое фермент может пройти по ДНК до диссоциации) UvrD составляет всего ~ 40-50 п.н. Поскольку расстояние между ником, созданным MutH, и несоответствием может составлять в среднем ~ 600 пар оснований, если другой UvrD не загружен, размотанная секция может повторно отжигаться до своей дополнительной цепи, заставляя процесс начинаться заново. Однако при помощи MutL скорость загрузки UvrD значительно увеличивается. Хотя процессивность (и использование АТФ) отдельных молекул UvrD остается неизменной, общее воздействие на ДНК значительно усиливается; ДНК не имеет шанса на повторный отжиг, поскольку каждый UvrD раскручивает 40-50 п.н. ДНК, диссоциирует, а затем немедленно заменяется другим UvrD, повторяя процесс. Это подвергает большие участки ДНК воздействию экзонуклеазы.пищеварение, позволяющее быстро удалить (а затем заменить) неправильную ДНК.

Эукариот есть пяти М ут л ч omologs , обозначенный как MLH1, MLH2, MLH3, PMS1 и PMS2. Они образуют гетеродимеры, имитирующие MutL в E. coli . Человеческие гомологи прокариотического MutL образуют три комплекса, обозначаемых как MutLα, MutLβ и MutLγ. Комплекс MutLα состоит из субъединиц MLH1 и PMS2, гетеродимер MutLβ состоит из MLH1 и PMS1, тогда как MutLγ состоит из MLH1 и MLH3. MutLα действует как эндонуклеаза, которая вводит разрывы цепи в дочернюю цепь при активации ошибочным спариванием и другими необходимыми белками, MutSα и PCNA. Эти разрывы цепей служат точками входа для экзонуклеазной активности, которая удаляет несовпадающую ДНК. Роли, которые играют MutLβ и MutLγ в репарации несоответствий, менее понятны.

MutH: эндонуклеаза, присутствующая в E. coli и Salmonella [ править ]

MutH - очень слабая эндонуклеаза, которая активируется после связывания с MutL (который сам связан с MutS). Он разрывает неметилированную ДНК и неметилированную цепь гемиметилированной ДНК, но не разрывает полностью метилированную ДНК. Эксперименты показали, что восстановление несоответствия является случайным, если ни одна из цепей не метилирована. [ необходима цитата ] Такое поведение привело к предположению, что MutH определяет, какая нить содержит несоответствие. MutH не имеет эукариотического гомолога. Его эндонуклеазная функция выполняется гомологами MutL, которые обладают некоторой специализированной 5'-3'-экзонуклеазной активностью. Смещение цепи для удаления несовпадений из вновь синтезированной дочерней цепи у эукариот может быть обеспечено свободными 3'-концами фрагментов Окадзаки. в новой цепи, созданной во время репликации.

Β-скользящий зажим PCNA [ править ]

PCNA и β-скользящий зажим связаны с MutSα / β и MutS соответственно. Хотя первоначальные сообщения предполагали, что комплекс PCNA-MutSα может усиливать распознавание ошибочного спаривания, [6] недавно было продемонстрировано [7], что нет очевидного изменения аффинности MutSα к несовпадению в присутствии или в отсутствие PCNA. Кроме того, мутанты MutSα, которые не могут взаимодействовать с PCNA in vitro, проявляют способность осуществлять распознавание ошибочного спаривания и удаление ошибочного спаривания до уровней, близких к дикому типу. Такие мутанты являются дефектными в реакции репарации, направляемой разрывом 5'-цепи, что впервые указывает на функцию MutSα на стадии реакции после эксцизии.

Клиническое значение [ править ]

Унаследованные дефекты при исправлении несоответствия [ править ]

Мутации в человеческих гомологах белков Mut влияют на стабильность генома, что может привести к микросателлитной нестабильности (MSI), связанной с некоторыми видами рака человека. В частности, наследственный неполипозный колоректальный рак ( HNPCC или синдром Линча) приписывается повреждающим вариантам зародышевой линии в генах, кодирующих MutS и MutL гомологи MSH2 и MLH1 соответственно, которые, таким образом, классифицируются как гены-супрессоры опухоли. Один подтип HNPCC, синдром Мюира-Торре (MTS), связан с опухолями кожи. Если обе унаследованные копии (аллели) гена MMR содержат повреждающие генетические варианты, это приводит к очень редкому и тяжелому состоянию: синдрому рака исправления несоответствия.(или конституциональная недостаточность восстановления несоответствия, CMMR-D), проявляющаяся в виде множественных опухолей в раннем возрасте, часто опухолей толстой кишки и головного мозга . [8]

Эпигенетическое подавление генов восстановления несоответствия [ править ]

Спорадические виды рака с дефицитом репарации ДНК лишь изредка имеют мутацию в гене репарации ДНК, но вместо этого имеют тенденцию иметь эпигенетические изменения, такие как метилирование промотора, которые ингибируют экспрессию гена репарации ДНК. [9] Приблизительно в 13% случаев колоректального рака не удается восстановить несоответствие ДНК, обычно из-за потери MLH1 (9,8%), а иногда и MSH2, MSH6 или PMS2 (все ≤1,5%). [10] Для большинства спорадических случаев колоректального рака с дефицитом MLH1 этот дефицит был вызван метилированием промотора MLH1. [10] Другие типы рака имеют более высокие частоты потери MLH1 (см. Таблицу ниже), что опять же в значительной степени является результатом метилирования промотора MLH1.ген. Другой эпигенетический механизм, лежащий в основе дефицита MMR, может включать сверхэкспрессию микроРНК, например, уровни miR-155 обратно коррелируют с экспрессией MLH1 или MSH2 при колоректальном раке. [11]

Раки с дефицитом MLH1
Тип ракаЧастота дефицита при ракеЧастота дефицита дефекта соседнего поля
Желудок32% [12] [13]24% -28%
Желудок (опухоли фовеолярного типа)74% [14]71%
Желудок в Кашмирской долине с высокой заболеваемостью73% [15]20%
Пищевода73% [16]27%
Плоскоклеточный рак головы и шеи (HNSCC)31% -33% [17] [18]20% -25%
Немелкоклеточный рак легкого (НМРЛ)69% [19]72%
Колоректальный10% [10]

Ошибки MMR в полевых дефектах [ править ]

Поле дефект (поле cancerization) является областью эпителия , которая была обусловлена эпигенетическими или генетическими изменениями, предрасполагающего его к развитию рака. Как указывает Рубин, «... есть свидетельства того, что более 80% соматических мутаций, обнаруженных в опухолях толстой кишки человека с мутаторным фенотипом, происходят до начала терминальной клональной экспансии». [20] [21] Аналогичным образом, Vogelstein et al. [22] отмечают, что более половины соматических мутаций, выявленных в опухолях, произошли в предопухолевой фазе (в области дефекта поля), во время роста явно нормальных клеток.

Дефицит MLH1 был обычным явлением в полевых дефектах (гистологически нормальных тканях), окружающих опухоли; см. таблицу выше. Эпигенетически замалчиваемый или мутированный MLH1, вероятно, не предоставит селективного преимущества стволовым клеткам, однако это вызовет повышенную частоту мутаций, и один или несколько мутировавших генов могут предоставить клетке селективное преимущество. Дефицит MLH1 ген затем может быть увлекаются как выборочно вблизи нейтральный пассажир (устройство-путешественник) гена , когда мутантные стволовые клетки генерируют расширенный клон. Продолжающееся присутствие клона с эпигенетически репрессированным MLH1 будет продолжать генерировать дальнейшие мутации, некоторые из которых могут вызвать опухоль.

Компоненты MMR у людей [ править ]

У человека семь белков репарации ошибочного спаривания ДНК (MMR) ( MLH1 , MLH3 , MSH2 , MSH3 , MSH6 , PMS1 и PMS2 ) работают скоординированно в последовательных этапах, чтобы инициировать репарацию несовпадений ДНК. [23] Кроме того, существуют Exo1- зависимые и Exo1-независимые подпути MMR. [24]

Другие генные продукты, участвующие в репарации ошибочного спаривания (после инициации генами MMR) у людей, включают ДНК-полимеразу дельта , PCNA , RPA , HMGB1 , RFC и ДНК-лигазу I , а также факторы, модифицирующие гистоны и хроматин . [25] [26]

При определенных обстоятельствах путь MMR может привлекать подверженную ошибкам ДНК-полимеразу eta ( POLH ). Это происходит в B-лимфоцитах во время соматической гипермутации , когда POLH используется для введения генетической изменчивости в гены антител. [27] Однако этот подверженный ошибкам путь MMR может запускаться в других типах клеток человека при воздействии генотоксинов [28], и действительно, он широко активен при различных раковых заболеваниях человека, вызывая мутации, несущие сигнатуру активности POLH. [29]

MMR и частота мутаций [ править ]

Распознавание и устранение несовпадений и инделек важно для клеток, потому что неспособность сделать это приводит к микросателлитной нестабильности (MSI) и повышению скорости спонтанных мутаций (мутаторный фенотип). По сравнению с другими типами рака, рак с дефицитом MMR (MSI) имеет очень высокую частоту мутаций, близких к меланоме и раку легких [30], типам рака, вызванным сильным воздействием УФ-излучения и мутагенных химических веществ.

Помимо очень высокого бремени мутаций, дефицит MMR приводит к необычному распределению соматических мутаций по геному человека: это предполагает, что MMR преимущественно защищает богатые генами, рано реплицирующиеся эухроматические области. [31] Напротив, бедные генами, поздно реплицирующиеся гетерохроматические области генома демонстрируют высокую скорость мутаций во многих опухолях человека. [32]

Гистона модификации H3K36me3 , эпигенетическое марка активного хроматина, имеет возможность набирать MSH2-Msh6 (hMutSα) сложный. [33] Соответственно, области человеческого генома с высоким уровнем H3K36me3 накапливают меньше мутаций из-за активности MMR. [29]

Потеря нескольких путей репарации ДНК в опухолях [ править ]

Отсутствие MMR часто происходит в координации с потерей других генов репарации ДНК. [9] Например, гены MMR MLH1 и MLH3, а также 11 других генов репарации ДНК (таких как MGMT и многие гены пути NER ) были значительно подавлены как в астроцитомах низкого, так и в более высоких уровнях, в отличие от нормального мозга. ткань. [34] Более того, экспрессия MLH1 и MGMT тесно коррелировала в 135 образцах рака желудка, а потеря MLH1 и MGMT, по-видимому, синхронно ускорялась во время прогрессирования опухоли. [35]

Недостаточная экспрессия нескольких генов репарации ДНК часто встречается при раке [9] и может вносить вклад в тысячи мутаций, обычно обнаруживаемых при раке (см. Частота мутаций при раке ).

См. Также [ править ]

  • Базовая эксцизионная пластика
  • Эксцизионная репарация нуклеотидов

Ссылки [ править ]

  1. ^ Айер RR, Pluciennik A, Burdett V, Modrich PL (февраль 2006). «Ремонт рассогласования ДНК: функции и механизмы». Химические обзоры . 106 (2): 302–23. DOI : 10.1021 / cr0404794 . PMID  16464007 .
  2. Перейти ↑ Larrea AA, Lujan SA, Kunkel TA (май 2010 г.). «SnapShot: восстановление несоответствия ДНК». Cell . 141 (4): 730–730.e1. DOI : 10.1016 / j.cell.2010.05.002 . PMID 20478261 . S2CID 26969788 .  
  3. ↑ Heller RC, Marians KJ (декабрь 2006 г.). «Реплисомная сборка и прямой перезапуск застрявших вилок репликации». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология . 7 (12): 932–43. DOI : 10.1038 / nrm2058 . PMID 17139333 . S2CID 27666329 .  
  4. ^ Pluciennik A, Дзантии L, Айер RR, Constantin N, Кадыров Ф.А., Modrich P (сентябрь 2010). «Функция PCNA в активации и направлении цепи эндонуклеазы MutLα при репарации ошибочного спаривания» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (37): 16066–71. DOI : 10.1073 / pnas.1010662107 . PMC 2941292 . PMID 20713735 .  
  5. ^ Кадыров Ф.А., Дзантии L, N Constantin, Modrich P (июль 2006). «Эндонуклеолитическая функция MutLalpha в репарации несоответствия человека». Cell . 126 (2): 297–308. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.05.039 . PMID 16873062 . S2CID 15643051 .  
  6. ^ Flores-Росас H, D Clark, Колоднер RD (ноябрь 2000). «Ядерный антиген пролиферирующих клеток и Msh2p-Msh6p взаимодействуют с образованием активного комплекса распознавания неправильной пары». Генетика природы . 26 (3): 375–8. DOI : 10.1038 / 81708 . PMID 11062484 . S2CID 20861705 .  
  7. ^ Айер RR, Pohlhaus TJ, Chen S, Hura GL, Дзантии L, Beese LS, Modrich P (май 2008). «Взаимодействие ядерного антигена MutSalpha-пролиферирующих клеток в репарации несоответствия ДНК человека» . Журнал биологической химии . 283 (19): 13310–9. DOI : 10.1074 / jbc.M800606200 . PMC 2423938 . PMID 18326858 .  
  8. ^ Интернет Менделирующее наследование в человеке (OMIM): 276300
  9. ^ a b c Бернштейн C, Бернштейн H (май 2015 г.). «Эпигенетическое снижение репарации ДНК при прогрессировании рака желудочно-кишечного тракта» . Всемирный журнал онкологии желудочно-кишечного тракта . 7 (5): 30–46. DOI : 10,4251 / wjgo.v7.i5.30 . PMC 4434036 . PMID 25987950 .  
  10. ^ a b c Truninger K, Menigatti M, Luz J, Russell A, Haider R, Gebbers JO и др. (Май 2005 г.). «Иммуногистохимический анализ показывает высокую частоту дефектов PMS2 при колоректальном раке». Гастроэнтерология . 128 (5): 1160–71. DOI : 10,1053 / j.gastro.2005.01.056 . PMID 15887099 . 
  11. ^ Валери Н., Гаспарини П., Фаббри М., Бракони С., Веронезе А., Ловат Ф. и др. (Апрель 2010 г.). «Модуляция репарации несовпадений и стабильности генома с помощью miR-155» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (15): 6982–7. Bibcode : 2010PNAS..107.6982V . DOI : 10.1073 / pnas.1002472107 . PMC 2872463 . PMID 20351277 .  
  12. ^ Kupčinskaitė-Noreikienė R, Skiecevičienė J, Jonaitis L, Ugenskienė R, Kupčinskas J, Markelis R, et al. (2013). «Метилирование CpG-островка генов MLH1, MGMT, DAPK и CASP8 в злокачественных и прилегающих нераковых тканях желудка». Medicina . 49 (8): 361–6. DOI : 10.3390 / medicina49080056 . PMID 24509146 . 
  13. ^ Ваки T, Тамура G, Цутия T, Sato K, Nishizuka S, Мотояма T (август 2002). «Статус метилирования промотора генов E-cadherin, hMLH1 и p16 в неопухолевом эпителии желудка» . Американский журнал патологии . 161 (2): 399–403. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 64195-8 . PMC 1850716 . PMID 12163364 .  
  14. ^ ЭндоН Y, G Тамура, Ajioka Y, Ватанабе Н, Мотояма Т (сентябрь 2000 г.). «Частое гиперметилирование промотора гена hMLH1 в опухолях дифференцированного типа желудка с фовеолярным фенотипом желудка» . Американский журнал патологии . 157 (3): 717–22. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 64584-1 . PMC 1949419 . PMID 10980110 .  
  15. ^ Wani M, Afroze D, Makhdoomi M, Hamid I, Wani B, Bhat G и др. (2012). «Статус метилирования промотора гена репарации ДНК (hMLH1) у пациентов с карциномой желудка в Кашмирской долине» (PDF) . Азиатско-Тихоокеанский журнал профилактики рака . 13 (8): 4177–81. DOI : 10,7314 / apjcp.2012.13.8.4177 . PMID 23098428 .  
  16. ^ Чанг З, Чжан В, Чанг З, Сонг М, Цинь И, Чанг Ф и др. (Январь 2015 г.). «Характеристики экспрессии FHIT , p53 , BRCA2 и MLH1 в семьях с историей рака пищевода в регионе с высокой заболеваемостью раком пищевода» . Письма онкологии . 9 (1): 430–436. DOI : 10.3892 / ol.2014.2682 . PMC 4246613 . PMID 25436004 .  
  17. ^ Tawfik HM, Эль-Максуд Н.М., Хак BH, Эль-Sherbiny YM (2011). «Плоскоклеточная карцинома головы и шеи: иммуногистохимия восстановления несоответствия и гиперметилирование промотора гена hMLH1». Американский журнал отоларингологии . 32 (6): 528–36. дои : 10.1016 / j.amjoto.2010.11.005 . PMID 21353335 . 
  18. ^ Zuo C, Zhang H, Spencer HJ, Vural E, Suen JY, Schichman SA и др. (Октябрь 2009 г.). «Повышенная микросателлитная нестабильность и эпигенетическая инактивация гена hMLH1 при плоскоклеточной карциноме головы и шеи». Отоларингология - хирургия головы и шеи . 141 (4): 484–90. DOI : 10.1016 / j.otohns.2009.07.007 . PMID 19786217 . S2CID 8357370 .  
  19. ^ Safar AM, Spencer H, Su X, Coffey M, Cooney CA, Ratnasinghe LD, et al. (Июнь 2005 г.). «Профилирование метилирования заархивированного немелкоклеточного рака легкого: многообещающая прогностическая система» . Клинические исследования рака . 11 (12): 4400–5. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-04-2378 . PMID 15958624 . 
  20. Перейти ↑ Rubin H (март 2011). «Поля и полевая канцеризация: пренеопластическое происхождение рака: бессимптомные гиперпластические поля являются предшественниками неоплазии, и их прогрессирование в опухоли можно отслеживать по плотности насыщения в культуре». BioEssays . 33 (3): 224–31. DOI : 10.1002 / bies.201000067 . PMID 21254148 . S2CID 44981539 .  
  21. ^ Tsao JL, Yatabe Y, Salovaara R, Järvinen HJ, Mecklin JP, Aaltonen LA и др. (Февраль 2000 г.). «Генетическая реконструкция истории индивидуальных колоректальных опухолей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (3): 1236–41. Bibcode : 2000PNAS ... 97.1236T . DOI : 10.1073 / pnas.97.3.1236 . PMC 15581 . PMID 10655514 .  
  22. ^ Фогельштейна B, Пападопулос N, Velculescu В.Е., Чжоу S, Диас LA, Кинзлер KW (март 2013 г. ). «Пейзажи генома рака» . Наука . 339 (6127): 1546–58. Bibcode : 2013Sci ... 339.1546V . DOI : 10.1126 / science.1235122 . PMC 3749880 . PMID 23539594 .  
  23. ^ Pal T, Permuth-Уэй J, Продавцы TA (август 2008). «Обзор клинической значимости дефицита репарации несоответствия при раке яичников» . Рак . 113 (4): 733–42. DOI : 10.1002 / cncr.23601 . PMC 2644411 . PMID 18543306 .  
  24. ^ Goellner Е.М., Putnam CD, Колоднер RD (август 2015). «Зависимая от экзонуклеазы 1 и независимая репарация несоответствия» . Ремонт ДНК . 32 : 24–32. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2015.04.010 . PMC 4522362 . PMID 25956862 .  
  25. ↑ Ли GM (январь 2008 г.). «Механизмы и функции репарации рассогласования ДНК» . Клеточные исследования . 18 (1): 85–98. DOI : 10.1038 / cr.2007.115 . PMID 18157157 . 
  26. ↑ Li GM (июль 2014 г.). «Новые идеи и проблемы в устранении несоответствия: преодоление барьера хроматина» . Ремонт ДНК . 19 : 48–54. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2014.03.027 . PMC 4127414 . PMID 24767944 .  
  27. ^ Chahwan R, Эдельман W, Scharff MD, Роа S (август 2012). «Содействие разнообразию антител с помощью исправления несоответствия, подверженного ошибкам» . Семинары по иммунологии . 24 (4): 293–300. DOI : 10.1016 / j.smim.2012.05.005 . PMC 3422444 . PMID 22703640 .  
  28. ^ Се П (сентябрь 2012 г.). «Восстановление несоответствия ДНК: доктор Джекил и мистер Хайд?» . Молекулярная клетка . 47 (5): 665–6. DOI : 10.1016 / j.molcel.2012.08.020 . PMC 3457060 . PMID 22980456 .  
  29. ^ a b Supek F, Lehner B (июль 2017 г.). «Кластерные сигнатуры мутаций показывают, что подверженная ошибкам репарация ДНК нацелена на мутации активных генов» . Cell . 170 (3): 534–547.e23. DOI : 10.1016 / j.cell.2017.07.003 . ЛВП : 10230/35343 . PMID 28753428 . 
  30. Перейти ↑ Tuna M, Amos CI (ноябрь 2013 г.). «Геномное секвенирование при раке» . Письма о раке . 340 (2): 161–70. DOI : 10.1016 / j.canlet.2012.11.004 . PMC 3622788 . PMID 23178448 .  
  31. ^ Supek F, Ленер B (май 2015). «Дифференциальная репарация несовпадений ДНК лежит в основе вариаций скорости мутаций в геноме человека» . Природа . 521 (7550): 81–4. Bibcode : 2015Natur.521 ... 81S . DOI : 10,1038 / природа14173 . PMC 4425546 . PMID 25707793 .  
  32. ↑ Schuster-Böckler B, Lehner B (август 2012 г.). «Организация хроматина оказывает большое влияние на частоту региональных мутаций в раковых клетках человека». Природа . 488 (7412): 504–7. Bibcode : 2012Natur.488..504S . DOI : 10.1038 / nature11273 . PMID 22820252 . S2CID 205229634 .  
  33. Перейти ↑ Li F, Mao G, Tong D, Huang J, Gu L, Yang W, Li GM (апрель 2013 г.). «Гистоновая метка H3K36me3 регулирует репарацию ошибочного спаривания ДНК человека посредством взаимодействия с MutSα» . Cell . 153 (3): 590–600. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.03.025 . PMC 3641580 . PMID 23622243 .  
  34. ↑ Jiang Z, Hu J, Li X, Jiang Y, Zhou W, Lu D (декабрь 2006 г.). «Анализ экспрессии 27 генов репарации ДНК в астроцитоме с помощью набора низкой плотности TaqMan». Письма неврологии . 409 (2): 112–7. DOI : 10.1016 / j.neulet.2006.09.038 . PMID 17034947 . 
  35. ^ Kitajima Y, Miyazaki K, Мацукура S, M Танака, Секигучи M (2003). «Потеря экспрессии ферментов репарации ДНК MGMT, hMLH1 и hMSH2 во время прогрессирования опухоли при раке желудка» . Рак желудка . 6 (2): 86–95. DOI : 10.1007 / s10120-003-0213-Z . PMID 12861399 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Се П., Ямане К. (2008). «Восстановление несоответствия ДНК: молекулярный механизм, рак и старение» . Механизмы старения и развития . 129 (7–8): 391–407. DOI : 10.1016 / j.mad.2008.02.012 . PMC  2574955 . PMID  18406444 .
  • Iyer RR, Pluciennik A, Burdett V, Modrich PL (февраль 2006 г.). «Ремонт рассогласования ДНК: функции и механизмы». Химические обзоры . 106 (2): 302–23. DOI : 10.1021 / cr0404794 . PMID  16464007 .
  • Джозеф Н., Дуппатла В., Рао Д. Н. (2006). Ремонт несоответствия ДНК прокариот . Прогресс в исследованиях нуклеиновых кислот и молекулярной биологии . 81 . С. 1–49. DOI : 10.1016 / S0079-6603 (06) 81001-9 . ISBN 9780125400817. PMID  16891168 .
  • Ян В. (август 2000 г.). «Структура и функция белков репарации несовпадений» . Мутационные исследования . 460 (3–4): 245–56. DOI : 10.1016 / s0921-8777 (00) 00030-6 . PMID  10946232 .
  • Гриффитс Дж. Ф., Гилберт В. М., Левонтин Р. К., Весслер С. Р., Сузуки Д. Т., Миллер Дж. Х. (2004). Введение в генетический анализ (8-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Фриман. ISBN 978-0-7167-4939-4.
  • Кункель Т.А., Эри Д.А. (2005). «Ремонт рассогласования ДНК» . Ежегодный обзор биохимии . 74 : 681–710. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.74.082803.133243 . PMID  15952900 .
  • Фридберг EC, Walker GC, Siede W, Wood RD , Schultz RA, Ellenberger (2005). Ремонт ДНК и мутагенез (2-е изд.). Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. ISBN 978-1-55581-319-2.

Внешние ссылки [ править ]

  • Ремонт ДНК
  • ДНК + несоответствие + восстановление в предметных заголовках медицинской тематики Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)