Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с DcR3 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
TNFRSF6B
Доступные конструкции
PDBПоиск человеческого UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3K51 , 3MHD , 3MI8 , 4J6G , 4KGG , 4KGQ , 4MSV

Идентификаторы
ПсевдонимыTNFRSF6B , DcR3, DJ583P15.1.1, М68, M68E, TR6, фактор некроза опухоли рецептора суперсемейства член 6б, TNFрецептора суперсемейства членом 6б
Внешние идентификаторыOMIM : 603361 HomoloGene : 48242 GeneCards : TNFRSF6B
Расположение гена ( человек )
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человека) [1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение TNFRSF6B
Геномное расположение TNFRSF6B
Группа20q13.33Начинать63 696 652 п.н. [1]
Конец63 698 684 п.н. [1]
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с белком GO: 0001948
• Активность рецептора, активируемого фактором некроза опухоли
• Активность сигнального рецептора
Сотовый компонент• внеклеточная область
• неотъемлемый компонент плазматической мембраны
• внеклеточное пространство
Биологический процесс• развитие многоклеточного организма
• апоптотический сигнальный путь
• ответ на липополисахарид
• воспалительный ответ
• сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли
• негативная регуляция апоптотического процесса
• регуляция пролиферации клеточной популяции
• иммунный ответ
• апоптотический процесс
• негативная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа участвует в апоптотическом процессе
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

8771

н / д

Ансамбль

ENSG00000243509

н / д

UniProt

O95407

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_032945
NM_003823

н / д

RefSeq (белок)

NP_003814

н / д

Расположение (UCSC)Chr 20: 63,7 - 63,7 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Рецептор- ловушка 3 ( Dcr3 ), также известный как член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли 6B ( TNFRSF6B ), TR6 и M68 , представляет собой растворимый белок суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли, который ингибирует апоптоз, индуцированный лигандом Fas . [3] [4] [5]

Открытие [ править ]

Dcr3 был идентифицирован в 1998 году путем поиска генов, гомологичных суперсемейству генов TNFR, в базе данных меток экспрессируемой последовательности (EST).

Структура [ править ]

Открытая рамка считывания TNFRSF6B кодирует 300 аминокислот с сигнальной последовательностью из 29 остатков и четырьмя тандемными повторами, богатыми цистеином. Для этого гена наблюдались два варианта транскрипта, кодирующие одну и ту же изоформу, но отличающиеся 5'-UTR. [5] В отличие от большинства других членов суперсемейства TNFR, TNFRSF6 представляет собой растворимый белок, не содержащий трансмембранного домена.

Функция [ править ]

Этот ген принадлежит к суперсемейству рецепторов фактора некроза опухолей . Он действует как рецептор-ловушка, который конкурирует с рецепторами смерти за связывание лиганда. Постулируется, что кодируемый белок играет регулирующую роль в подавлении опосредованной FasL и LIGHT гибели клеток и активации Т-клеток, а также индуцирует ангиогенез посредством нейтрализации TL1A . Сверхэкспрессия этого гена была отмечена в различных опухолях, например опухолях желудочно-кишечного тракта, и он расположен в богатом генами кластере на хромосоме 20 вместе с другими генами, потенциально связанными с опухолью. [5]

Взаимодействия [ править ]

TNFRSF6B взаимодействует с:

  • TNFSF14 [4] [6] [7]
  • Fas-лиганд . [3] [4] [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000243509 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ a b Питти Р.М., Марстерс С.А., Лоуренс Д.А., Рой М., Кишкель ФК, Дауд П., Хуанг А., Донахью С.Дж., Шервуд С.В., Болдуин Д.Т., Годовски П.Дж., Вуд В.И., Герни А.Л., Хиллан К.Дж., Коэн Р.Л., Годдард А.Д. , Ботштейн Д., Ашкенази А. (январь 1999 г.). «Геномная амплификация рецептора-ловушки для лиганда Fas при раке легких и толстой кишки». Природа . 396 (6712): 699–703. DOI : 10.1038 / 25387 . PMID 9872321 . S2CID 4427455 .  
  4. ^ a b c Yu KY, Kwon B, Ni J, Zhai Y, Ebner R, Kwon BS (июнь 1999 г.). «Недавно идентифицированный член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухоли (TR6) подавляет LIGHT-опосредованный апоптоз» . J Biol Chem . 274 (20): 13733–6. DOI : 10.1074 / jbc.274.20.13733 . PMID 10318773 . 
  5. ^ a b c «Ген Entrez: суперсемейство рецепторов фактора некроза опухоли TNFRSF6B, член 6b, приманка» .
  6. ↑ Zhang J, Salcedo TW, Wan X, Ullrich S, Hu B, Gregorio T, Feng P, Qi S, Chen H, Cho YH, Li Y, Moore PA, Wu J (июнь 2001 г.). «Модуляция Т-клеточных ответов на аллоантигены с помощью TR6 / DcR3» . J. Clin. Инвестируйте . 107 (11): 1459–68. DOI : 10.1172 / JCI12159 . PMC 209323 . PMID 11390428 .  
  7. ^ a b Сюй Т.Л., Чанг Ю.С., Чен С.Дж., Лю Ю.Дж., Чиу А.В., Чио С.К., Чен Л., Се С.Л. (май 2002 г.). «Модуляция дифференцировки и созревания дендритных клеток с помощью рецептора-ловушки 3» . J. Immunol . 168 (10): 4846–53. DOI : 10.4049 / jimmunol.168.10.4846 . PMID 11994433 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К. и др. (1999). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Res . 6 (3): 197–205. DOI : 10.1093 / dnares / 6.3.197 . PMID  10470851 .
  • Бай С., Коннолли Б., Мецкер М.Л. и др. (2000). «Сверхэкспрессия M68 / DcR3 в опухолях желудочно-кишечного тракта человека независимо от амплификации гена и его местоположения в кластере из четырех генов» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (3): 1230–5. DOI : 10.1073 / pnas.97.3.1230 . PMC  15578 . PMID  10655513 .
  • Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. DOI : 10.1038 / 414865a . PMID  11780052 .
  • Мигоне Т.С., Чжан Дж., Ло Х и др. (2002). «TL1A является TNF-подобным лигандом для DR3 и TR6 / DcR3 и функционирует как костимулятор Т-клеток» . Иммунитет . 16 (3): 479–92. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (02) 00283-2 . PMID  11911831 .
  • Hsu TL, Chang YC, Chen SJ и др. (2002). «Модуляция дифференцировки и созревания дендритных клеток с помощью рецептора-ловушки 3» . J. Immunol . 168 (10): 4846–53. DOI : 10.4049 / jimmunol.168.10.4846 . PMID  11994433 .
  • Мягкий G, Bachmann F, Boulay JL и др. (2002). «Локус DCR3 является прогностическим маркером адъювантной химиотерапии на основе 5-фторурацила при колоректальном раке». Int. J. Рак . 102 (3): 254–7. DOI : 10.1002 / ijc.10711 . PMID  12397645 . S2CID  23680078 .
  • Гилл РМ; Ni J; Hunt JS (2003). «Дифференциальная экспрессия света и его рецепторов в ворсинах плаценты человека и мембранах амниохориона» . Являюсь. J. Pathol . 161 (6): 2011–7. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 64479-3 . PMC  1850908 . PMID  12466117 .
  • Ван X, Чжан Дж., Ло Х. и др. (2003). «Член семейства TNF LIGHT преобразует костимулирующие сигналы в человеческие Т-клетки» . J. Immunol . 169 (12): 6813–21. DOI : 10.4049 / jimmunol.169.12.6813 . PMID  12471113 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Ван X, Ши Г., Семенюк М. и др. (2003). «DcR3 / TR6 модулирует взаимодействия иммунных клеток». J. Cell. Биохим . 89 (3): 603–12. DOI : 10.1002 / jcb.10523 . PMID  12761893 . S2CID  39322989 .
  • Цуджи С., Хосотани Р., Йонехара С. и др. (2003). «Эндогенный рецептор-ловушка 3 блокирует сигналы ингибирования роста, опосредованные лигандом Fas, в аденокарциноме поджелудочной железы человека» (PDF) . Int. J. Рак . 106 (1): 17–25. DOI : 10.1002 / ijc.11170 . hdl : 2433/148465 . PMID  12794752 . S2CID  34900944 .
  • Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабные усилия по идентификации новых секретируемых и трансмембранных белков человека: оценка биоинформатики» . Genome Res . 13 (10): 2265–70. DOI : 10.1101 / gr.1293003 . PMC  403697 . PMID  12975309 .
  • Ши Джи; Wu Y; Чжан Дж; Ву Дж (2004). «Рецептор-ловушка смерти TR6 / DcR3 ингибирует хемотаксис Т-клеток in vitro и in vivo» . J. Immunol . 171 (7): 3407–14. DOI : 10.4049 / jimmunol.171.7.3407 . PMID  14500635 .
  • Ву С.Ф., Лю Т.М., Лин Ю.С. и др. (2004). «Иммуномодулирующее действие рецептора-приманки 3 на дифференциацию и функцию дендритных клеток костного мозга у мышей, не страдающих ожирением: от регуляторного механизма до клинического значения» . J. Leukoc. Биол . 75 (2): 293–306. DOI : 10,1189 / jlb.0303119 . PMID  14634066 . S2CID  14226200 .
  • Чанг YC, Hsu TL, Lin HH и др. (2004). «Модуляция дифференцировки и активации макрофагов рецептором-ловушкой 3» . J. Leukoc. Биол . 75 (3): 486–94. DOI : 10,1189 / jlb.0903448 . PMID  14657214 . S2CID  31939119 .
  • Ким С., МакОлифф В.Дж., Зарицкая Л.С. и др. (2004). «Селективная индукция фактора 6 рецептора некроза опухоли / высвобождения рецептора-ловушки 3 бактериальными антигенами в человеческих моноцитах и ​​миелоидных дендритных клетках» . Заразить. Иммун . 72 (1): 89–93. DOI : 10.1128 / IAI.72.1.89-93.2004 . PMC  343977 . PMID  14688085 .
  • Hsu MJ, Lin WW, Tsao WC, et al. (2004). «Повышенная адгезия моноцитов через обратную передачу сигналов, запускаемую рецептором-ловушкой 3». Exp. Cell Res . 292 (2): 241–51. DOI : 10.1016 / j.yexcr.2003.09.019 . PMID  14697332 .
  • Гилл РМ; Хант JS (2004). «Растворимый рецептор (DcR3) и клеточный ингибитор апоптоза-2 (cIAP-2) защищают клетки цитотрофобласта человека от LIGHT-опосредованного апоптоза» . Являюсь. J. Pathol . 165 (1): 309–17. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 63298-1 . PMC  1618528 . PMID  15215185 .

Внешние ссылки [ править ]

  • GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись об аутоиммунном лимфопролиферативном синдроме

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .