Скоба смерти - это мотив третичной структуры, обычно обнаруживаемый в белках, участвующих в апоптозе или процессах, связанных с воспалением . Этот мотив обычно обнаруживается в доменах, которые участвуют в межбелковых взаимодействиях, ведущих к образованию больших функциональных комплексов. Примеры доменов «складки смерти» включают домен смерти (DD), домен эффектора смерти (DED), домен рекрутирования каспазы (CARD) и домен пирина (PYD).
Домены «складки смерти» представляют собой эволюционно консервативное суперсемейство доменов, которые обеспечивают передачу сигналов апоптоза. Два типа апоптоза, внешний и внутренний, жестко регулируются взаимодействием активирующих и тормозных путей. Взаимодействия между четырьмя различными мотивами складки смерти являются объединяющим механизмом в обоих типах апоптоза.
Структура [ править ]
Существует большое различие в первичной аминокислотной последовательности четырех разных мотивов гибкой складки, но каждый из них имеет аналогичную трехмерную структуру. Мотивы «складки смерти» характеризуются от шести до семи плотно скрученных альфа-спиралей, образующих складку «греческого ключа». Мотивы состоят из нескольких определенных белковых взаимодействий с другими предполагаемыми апоптотическими ролями (Лам).
Четыре смертоносных домена [ править ]
Домен рекрутирования каспаз (CARD) CARD-содержащие белки встречаются во всем животном мире. Домены CARD присутствуют на нескольких прокаспазах млекопитающих и выполняют функции апоптоза , процессинга цитокинов , иммунной защиты и активации NF-κB . У насекомых и нематод использование CARD пока что ограничивается апоптотическими белками.
DD доменов смерти (DD) обнаруживаются в основном у позвоночных (хотя они также присутствуют у некоторых других животных). DD содержатся на рецепторах цитокинов в семействе рецепторов TNF . Белки DD участвуют в апоптозе и передаче сигналов NF-κB у млекопитающих, но только Drosophila, передающих сигналы NF-κB .
Смерть эффекторных домена (ПСД) DEDs присутствует на каспаз и участвует в активации каспазы. DED-содержащие каспазы участвуют в апоптозе, индуцированном рецептором смерти, у млекопитающих, но у насекомых они различаются в том, что касается передачи сигналов NF-κB и антибактериальных реакций.
ПИРИНЫ ПИРИНЫ являются наиболее недавно обнаруженным доменом складки смерти, и их функции и взаимодействия еще не выяснены.
Связывание и взаимодействие [ править ]
Смерть-кратная мотивы , как полагает, оказывает свое действие только через одновалентные , гомотипические взаимодействия. В этих взаимодействиях складки смерти связываются с другим доменом, содержащим складки смерти, через домен взаимодействия с белками того же типа. Эти взаимодействия высокоспецифичны, и нет никаких известных взаимодействий между различными типами гибких доменов - во всех известных случаях партнеры связывания имеют гомологичный домен (DD-DD, CARD-CARD, DED-DED). Считается, что роль этих гомотипических взаимодействий заключается в самосборке (Лам). Это приводит к образованию больших многосубъединичных структур, состоящих только из одного типа белка.
Ссылки [ править ]
- Лам А., Парадиси А., Грин Д.Р., Мелино Дж. (Январь 2003 г.). «Взаимодействие домена гибкой складки при апоптозе». Смерть клетки отличается . 10 (1): 10–2. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401203 . PMID 12655289 .
- Нам Й.Дж., Мани К., Эштон А.В. и др. (Сентябрь 2004 г.). «Подавление как внешних, так и внутренних путей смерти посредством негомотипических взаимодействий кратности смерти». Мол. Cell . 15 (6): 901–12. DOI : 10.1016 / j.molcel.2004.08.020 . PMID 15383280 .
