Вирус эшерихии Т5 , иногда называемый бактериофагом Т5, является каудальным вирусом в семействе Demerecviridae . Этот бактериофаг специфически инфицируетбактериальные клетки E. coli и следует литическому жизненному циклу .
Вирус эшерихии Т5 | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство : | Дуплоднавирия |
Королевство: | Heunggongvirae |
Тип: | Уровирикота |
Класс: | Caudoviricetes |
Заказ: | Caudovirales |
Семья: | Демереквириды |
Род: | Текинтавирус |
Разновидность: | Вирус эшерихии Т5 |
Синонимы [1] | |
|
Структура и геном
T5 вириона включает в себя 90 нанометрового икосаэдрической капсида (голова) и 250 нанометра длиной гибкой, не- сократительной хвост. [2]
Капсид содержит 121 750 пар оснований, геном двухцепочечной ДНК фага, который кодирует около 168 белков (теперь их количество сокращено до 162). [3] Геном имеет уникальную последовательность 111 613 п.н. с двумя идентичными большими прямыми концевыми повторениями по 10 139 п.н. Когда последовательность генома была опубликована в 2005 году, только 61 (36,3%) из 168 кодируемых белков были назначены функции на основе гомологии с известными последовательностями. Более половины всех генов (92 или 54,7%) были предсказанными ORF, не имеющими сходства с какими-либо известными белками. [4] Количество неохарактеризованных белков остается высоким - около 50% генома (на основе последней аннотации эталонного протеома в Uniprot, 2021 ). [3]
Инфекционное заболевание
Бактериофаг T5, как было показано, заражает E. coli после того, как его рецептор-связывающий белок, pb5, связывается с переносчиком феррихрома внешней мембраны клетки-хозяина , FhuA. Связывание запускает структурные изменения в pb5 и в конечном итоге приводит к высвобождению ДНК из капсида фага. [5] [6]
Рекомендации
- ^ Крупович, Март; и другие. (Май 2015 г.). «Переименовать все (522) существующие бактериальные вирусы и 2 вида вирусов архей» (PDF) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 27 февраля 2020 года .
- ^ Эффантин Г. и др.: Структура бактериофага T5 обнаруживает сходство с HK97 и T4, предполагая эволюционные отношения. J Mol Biol. (2006) 361, 993–1002, DOI : 10.1016 / j.jmb.2006.06.081
- ^ а б «Фаг Escherichia T5 (фаг Enterobacteria T5)» . www.uniprot.org . Проверено 2 апреля 2021 .
- ^ Ван, Цзяньбинь; Цзян, Ян; Винсент, Мириам; Сунь, Юнцяо; Ю, Хун; Ван, Цзин; Бао, Цию; Конг, Хуйминь; Ху, Суннянь (2005-02-05). «Полная последовательность генома бактериофага Т5» . Вирусология . 332 (1): 45–65. DOI : 10.1016 / j.virol.2004.10.049 . ISSN 0042-6822 . PMID 15661140 .
- ^ Флайхан, А; Wien, F; Патерностре, М; Boulanger, P; Брейтон, К. (сентябрь 2012 г.). «Новые сведения о pb5, рецептор-связывающем белке бактериофага T5, и его взаимодействии с его рецептором Escherichia coli FhuA» . Биохимия . 94 (9): 1982–9. DOI : 10.1016 / j.biochi.2012.05.021 . PMID 22659573 .
- ^ Басит, Н; Шиваджи Шарма, К. Ван дер Хейден, А; Гондран, К; Брейтон, К; Думи, П; Винник, FM; Лаббе, П. (11 мая 2012 г.). «Амфипол-опосредованная иммобилизация FhuA на поверхности: платформа для безметочного обнаружения белка бактериофага pb5». Chemical Communications (Кембридж, Англия) . 48 (48): 6037–9. DOI : 10.1039 / c2cc31107k . PMID 22576748 . S2CID 19703515 .
Внешние ссылки
- UniProt: фаг энтеробактерий Т5
- Таксономия NCBI: фаг энтеробактерий T5