Диаграммы реакций гидролитического (слева) и фосфоролитического (справа) расщепления РНК 3'-5'-экзорибонуклеазой.
Exoribonuclease является экзонуклеазной рибонуклеазы , которые являются ферменты , которые разлагаются РНК путем удаления концевых нуклеотидов либо из 5' - конца или 3' - концу молекулы РНК. Ферменты, удаляющие нуклеотиды с 5'-конца, называются 5'-3'-экзорибонуклеазами , а ферменты, удаляющие нуклеотиды с 3'-конца, называются 3'-5'-экзорибонуклеазами .
Экзорибонуклеазы могут использовать воду для разрыва нуклеотидно-нуклеотидной связи (которая называется гидролитической активностью) или неорганический фосфат (что называется фосфоролитической активностью). Гидролитические экзорибонуклеазы классифицируются под номером ЕС 3.1, а фосфоролитические экзорибонуклеазы - под номером EC 2.7.7. Поскольку фосфоролитические ферменты используют неорганический фосфат для расщепления связей, они высвобождают нуклеотиддифосфаты , тогда как гидролитические ферменты (которые используют воду) высвобождают нуклеотидные монофосфаты .
Экзорибонуклеазы существуют во всех царствах жизни, среди бактерий , архей и эукариот . Экзорибонуклеазы участвуют в деградации многих различных видов РНК, включая информационную РНК , транспортную РНК , рибосомную РНК и миРНК . Экзорибонуклеазы могут быть отдельными белками (такими как РНКаза D или РНКаза PH ), но также могут быть комплексами из нескольких белков, такими как экзосомный комплекс (в котором представлены четыре основных семейства экзорибонуклеаз).
