FNTA

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1JCQ , 1LD7 , 1LD8 , 1MZC , 1S63 , 1SA4 , 1TN6 , 2F0Y , 2H6F , 2H6G , 2H6H , 2H6I , 2IEJ , 3E37

Идентификаторы

Псевдонимы

FNTA , FPTA, PGGT1A, PTAR2, фарнезилтрансфераза, CAAX-бокс, альфа

Внешние идентификаторы

OMIM : 134635 MGI : 104683 HomoloGene : 1534 GeneCards : FNTA

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 8 (человек) ^[1]

Группа	8p11.21	Начинать	43 034 194 п.н. ^[1]
Группа	8p11.21	Конец	43 085 788 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 8 (мышь) ^[2]

Группа	8 A2 \| 8 14,27 см	Начинать	25 998 722 п.н. ^[2]
Группа	8 A2 \| 8 14,27 см	Конец	26 015 650 п.н. ^[2]

Генная онтология
Молекулярная функция	• трансферазной активность • белок prenyltransferase активность • geranylgeranyltransferase активность белок • связывание микротрубочек • Rab geranylgeranyltransferase активность • рецептор тирозинкиназа связывание • связывание альфа-тубулин • белок фарнезилтрансфераза активность • Регулятора активность рецептора ацетилхолина • ГО: 0001948 связывание белок • prenyltransferase активности • СА-белок активность геранилгеранилтрансферазы
Сотовый компонент	• цитоплазма • цитозоль • комплекс протеин-фарнезилтрансфераза • комплекс, связанный с микротрубочками • комплекс CAAX-протеин-геранилгеранилтрансфераза • клеточная мембрана
Биологический процесс	• положительное регулирование тубулина деацетилирования • Белок пренилирование • geranylgeranylation белок • развитие нервно - мышечного соединения • скелетных мышц ацетилхолина закрытого канала кластеризация • положительное регулирование деацетилаз активности • фарнезилирования белок • трансформирующий фактор роста бета - рецепторов сигнальный путь • нейромедиатор рецепторов метаболический процесс • регулирование нейромедиатора рецепторная активность • регуляция сигнального пути, опосредованного родопсином
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


2339


14272

Ансамбль


ENSG00000168522


ENSMUSG00000015994

UniProt


P49354


Q61239

RefSeq (мРНК)


NM_001018676 NM_001018677 NM_002027


NM_008033

RefSeq (белок)


NP_002018


NP_032059

Расположение (UCSC)

Chr 8: 43.03 - 43.09 Мб

Chr 8: 26 - 26,02 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Белок фарнезилтрансфераза / geranylgeranyltransferase 1- го типа альфа - субъединица является ферментом , который в организме человека кодируется FNTA ген . ^[5]^[6]

Пренилтрансферазы присоединяют либо фарнезильную группу, либо геранилгеранильную группу в тиоэфирной связи с цистеиновым остатком белка с C-концевым CAAX-боксом. Геранилгеранилтрансфераза CAAX и фарнезилтрансфераза CAAX являются гетеродимерами, которые имеют одну и ту же альфа-субъединицу, но разные бета-субъединицы. Этот ген кодирует альфа-субъединицу этих трансфераз. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. ^[6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что FNTA взаимодействует с бета-рецептором 1 TGF . ^[7]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000168522 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015994 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Andres Д.А., Milatovich А, Т Озчелика, Wenzlau Ю.М., Браун М.С., Goldstein JL, Франк U (февраль 1994 г.). «Клонирование кДНК двух субъединиц фарнезилтрансферазы CAAX человека и хромосомное картирование локусов FNTA и FNTB и родственных последовательностей». Геномика . 18 (1): 105–12. DOI : 10.1006 / geno.1993.1432 . PMID 8276393 .
^ a b «Ген Энтреза: FNTA фарнезилтрансфераза, CAAX box, альфа» .
^ Кавабата, М; Имамура Т; Miyazono K; Engel ME; Моисей Х.Л. (декабрь 1995 г.). «Взаимодействие рецептора трансформирующего фактора роста-бета типа I с фарнезил-протеинтрансферазой-альфа» . J. Biol. Chem . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 270 (50): 29628–31. DOI : 10.1074 / jbc.270.50.29628 . ISSN 0021-9258 . PMID 8530343 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Адамсон П., Маршалл С.Дж., Холл А, Тилбрук, Пенсильвания (1992). «Посттрансляционные модификации белков p21rho». J. Biol. Chem . 267 (28): 20033–8. PMID 1400319 .
Манн В., Робертс Д., Тобин А. и др. (1990). «Идентификация и предварительная характеристика протеин-цистеин фарнезилтрансферазы» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 87 (19): 7541–5. Bibcode : 1990PNAS ... 87.7541M . DOI : 10.1073 / pnas.87.19.7541 . PMC 54783 . PMID 2217184 .
Армстронг С.А., Ханна В.К., Гольдштейн Дж.Л., Браун М.С. (1995). «Геранилгеранилтрансфераза CAAX переносит фарнезил так же эффективно, как геранилгеранил на RhoB» . J. Biol. Chem . 270 (14): 7864–8. DOI : 10.1074 / jbc.270.14.7864 . PMID 7713879 .
Zhang FL, Diehl RE, Kohl NE и др. (1994). «Клонирование кДНК и экспрессия крысиного и человеческого белка геранилгеранилтрансферазы типа I». J. Biol. Chem . 269 (5): 3175–80. PMID 8106351 .
Sinensky M, Fantle K, Trujillo M и др. (1994). «Путь переработки преламина А.». J. Cell Sci . 107. (Pt 1): 61–7. PMID 8175923 .
Андрес Д.А., Гольдштейн Дж.Л., Хо Ю.К., Браун М.С. (1993). «Мутационный анализ альфа-субъединицы протеина фарнезилтрансферазы. Доказательства каталитической роли». J. Biol. Chem . 268 (2): 1383–90. PMID 8419339 .
Омер К.А., Крал А.М., Диль Р.Э. и др. (1993). «Характеристика рекомбинантной человеческой фарнезил-протеинтрансферазы: клонирование, экспрессия, связывание фарнезилдифосфата и функциональная гомология с дрожжевыми пренил-протеинтрансферазами». Биохимия . 32 (19): 5167–76. DOI : 10.1021 / bi00070a028 . PMID 8494894 .
Кавабата М., Имамура Т., Миязоно К. и др. (1996). «Взаимодействие рецептора трансформирующего фактора роста-бета типа I с фарнезил-протеинтрансферазой-альфа» . J. Biol. Chem . 270 (50): 29628–31. DOI : 10.1074 / jbc.270.50.29628 . PMID 8530343 .
Ван Т., Дэниэлсон П.Д., Ли Б.И. и др. (1996). «Субъединица альфа фарнезилтрансферазы p21 (RAS) в TGF-бета и передаче сигналов активина». Наука . 271 (5252): 1120–2. Bibcode : 1996Sci ... 271.1120W . DOI : 10.1126 / science.271.5252.1120 . PMID 8599089 . S2CID 83164753 .
Nantais DE, Schwemmle M, Stickney JT и др. (1996). «Пренилирование интерферон-гамма-индуцированного GTP-связывающего белка: человеческий гуанилат-связывающий белок, huGBP1». J. Leukoc. Биол . 60 (3): 423–31. DOI : 10.1002 / jlb.60.3.423 . PMID 8830800 . S2CID 33727864 .
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Genome Res . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Goalstone ML, Дразнин Б (1996). «Влияние инсулина на активность фарнезилтрансферазы в адипоцитах 3T3-L1» . J. Biol. Chem . 271 (44): 27585–9. DOI : 10.1074 / jbc.271.44.27585 . PMID 8910345 .
Prakash B, Praefcke GJ, Renault L и др. (2000). «Структура человеческого гуанилат-связывающего белка 1, представляющего уникальный класс GTP-связывающих белков». Природа . 403 (6769): 567–71. DOI : 10.1038 / 35000617 . PMID 10676968 . S2CID 4431592 .
Zeng Q, Si X, Horstmann H, et al. (2000). «Зависимая от пренилирования ассоциация протеин-тирозинфосфатаз PRL-1, -2 и -3 с плазматической мембраной и ранней эндосомой» . J. Biol. Chem . 275 (28): 21444–52. DOI : 10.1074 / jbc.M000453200 . PMID 10747914 .
Ашар Х.Р., Джеймс Л., Грей К. и др. (2000). «Ингибиторы фарнезилтрансферазы блокируют фарнезилирование CENP-E и CENP-F и изменяют ассоциацию CENP-E с микротрубочками» . J. Biol. Chem . 275 (39): 30451–7. DOI : 10.1074 / jbc.M003469200 . PMID 10852915 .
Guenzi E, Töpolt K, Cornali E, et al. (2001). «Спиральный домен GBP-1 опосредует ингибирование пролиферации эндотелиальных клеток воспалительными цитокинами» . EMBO J . 20 (20): 5568–77. DOI : 10.1093 / emboj / 20.20.5568 . PMC 125279 . PMID 11598000 .
Лонг С.Б., Хэнкок П.Дж., Крал А.М. и др. (2001). «Кристаллическая структура человеческого белка фарнезилтрансферазы раскрывает основу для ингибирования тетрапептидами CaaX и их миметиками» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (23): 12948–53. Bibcode : 2001PNAS ... 9812948L . DOI : 10.1073 / pnas.241407898 . PMC 60805 . PMID 11687658 .
Белл И.М., Галликкио С.Н., Абрамс М. и др. (2002). «Ингибиторы 3-аминопирролидинона фарнезилтрансферазы: разработка макроциклических соединений с улучшенной фармакокинетикой и превосходной клеточной активностью». J. Med. Chem . 45 (12): 2388–409. DOI : 10.1021 / jm010531d . PMID 12036349 .
Лонг С.Б., Кейси П.Дж., Биз Л.С. (2002). «Путь реакции протеина фарнезилтрансферазы при атомном разрешении». Природа . 419 (6907): 645–50. Bibcode : 2002Natur.419..645L . DOI : 10,1038 / природа00986 . PMID 12374986 . S2CID 4412580 .

Внешние ссылки [ править ]

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P49354 (белковая фарнезилтрансфераза / геранилгеранилтрансфераза альфа-субъединица типа 1) в PDBe-KB .

Эта статья о гене на хромосоме 8 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000168522 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015994 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8276393-5] Andres Д.А., Milatovich А, Т Озчелика, Wenzlau Ю.М., Браун М.С., Goldstein JL, Франк U (февраль 1994 г.). «Клонирование кДНК двух субъединиц фарнезилтрансферазы CAAX человека и хромосомное картирование локусов FNTA и FNTB и родственных последовательностей». Геномика . 18 (1): 105–12. DOI : 10.1006 / geno.1993.1432 . PMID 8276393 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: FNTA фарнезилтрансфераза, CAAX box, альфа» .

[pmid8530343-7] Кавабата, М; Имамура Т; Miyazono K; Engel ME; Моисей Х.Л. (декабрь 1995 г.). «Взаимодействие рецептора трансформирующего фактора роста-бета типа I с фарнезил-протеинтрансферазой-альфа» . J. Biol. Chem . СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 270 (50): 29628–31. DOI : 10.1074 / jbc.270.50.29628 . ISSN 0021-9258 . PMID 8530343 .

[1]