Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
FOXA1
Идентификаторы
ПсевдонимыFOXA1 , HNF3A , TCF3A, вилка A1
Внешние идентификаторыOMIM: 602294 MGI: 1347472 HomoloGene: 3307 Генные карты : FOXA1
Расположение гена (человек)
Хромосома 14 (человек)
Chr.Хромосома 14 (человека) [1]
Хромосома 14 (человек)
Геномное расположение FOXA1
Геномное расположение FOXA1
Группа14q21.1Начинать37 589 552 п.н. [1]
Конец37 596 059 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 12 (мышь)
Chr.Хромосома 12 (мышь) [2]
Хромосома 12 (мышь)
Геномное расположение FOXA1
Геномное расположение FOXA1
Группа12 C1 | 12 24,7 смНачинать57 540 628 п.н. [2]
Конец57 546 916 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• Последовательно-специфическое связывание ДНК
• Специфическое связывание с доменом белка
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, специфическая
для РНК-полимеразы II • Связывание с фактором транскрипции
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Связывание с ДНК
• Связывание с белком GO: 0001948
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, РНК-полимераза II -специфический
Сотовый компонент• микроворсинки
• ядро клетки
• фибриллярный центр
• нуклеоплазма
Биологический процесс• сигнальный путь Notch
• морфогенез стромы предстательной железы
• дифференцировка дофаминергических нейронов
• положительная регуляция внутриклеточного сигнального пути рецептора эстрогена
• ответ на эстрадиол
• регуляция транскрипции, матрица ДНК
• морфогенез легких
• гомеостаз глюкозы
• позитивная регуляция сглаженного сигнального пути
• развитие легких
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• спецификация судьбы нейрона
• формирование анатомической структуры, участвующей в морфогенезе
• позитивная регуляция митотического клеточного цикла
• позитивная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• морфогенез трубки
• дифференцировка секреторных столбчатых люминарных эпителиальных клеток, участвующих в железистой ацинусе предстательной железы развитие
• транскрипция, ДНК-шаблон
• регуляция клеточного цикла
• развитие многоклеточного организма
• морфогенез эпителия предстательной железы
• развитие соединительной ткани
• положительная регуляция дифференцировки нейронов
• созревание эпителиальных клеток, участвующих в развитии предстательной железы
• регуляция экспрессии генов
• дифференциация эпителиальных клеток легких
• формирование паттерна дорсальной / вентральной нервной трубки
• эпителиально-мезенхимальная передача сигналов, участвующая в развитии предстательной железы
• разветвление эпителиальной трубки, участвующее в морфогенезе легких
• Дифференцировка базальных респираторных клеток
• процесс метаболизма гормонов
• развитие вторичной альвеолярной перегородки
• негативная регуляция перехода эпителия в мезенхиму
• позитивная регуляция межклеточной адгезии, опосредованная кадгерином
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• ремоделирование хроматина
• морфогенез анатомической структуры
• позитивная регуляция апоптотического процесса
• организация хроматина
• дифференцировка клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

3169

15375

Ансамбль

ENSG00000129514

ENSMUSG00000035451

UniProt

P55317

P35582

RefSeq (мРНК)

NM_004496

NM_008259

RefSeq (белок)

NP_004487

NP_032285

Расположение (UCSC)Chr 14: 37,59 - 37,6 МбChr 12: 57,54 - 57,55 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Forkhead коробка белка A1 (FOXA1), также известный как гепатоцитов ядерного фактора 3-альфа (HNF-3A), представляет собой белок , который у человека кодируется FOXA1 гена . [5] [6] [7]

Функция [ править ]

FOXA1 является членом Forkhead класса ДНК-связывающих белков. Эти ядерные факторы гепатоцитов являются активаторами транскрипции для печеночно-специфичных транскриптов, таких как альбумин и транстиретин , и они также взаимодействуют с хроматином как с пионерским фактором . Подобные члены семейства у мышей играют роль в регуляции метаболизма и дифференцировке поджелудочной железы и печени. [5]

Маркер рака груди [ править ]

FOXA1 в раке молочной железы хорошо коррелируют с ERα + , GATA3 + и PR - + экспрессией белка , а также эндокринной сигнализацией . FOXA1 действует как пионерный фактор для ERa при ERα + раке молочной железы, и его экспрессия может идентифицировать ERα + раковые образования, которые подвергаются быстрому перепрограммированию передачи сигналов ERa, что связано с плохими результатами и резистентностью к лечению. [8] Напротив, при ERα - раке молочной железы FOXA1 сильно коррелирует с морфологией низкой степени злокачественности и повышенной выживаемостью без болезней. FOXA1 является конечной целью GATA3в молочной железе. [9] Выражение в ERα - виды рака может идентифицировать подмножество опухолей, которое реагирует с другой эндокринной терапией , такими как андрогены рецептора лечение антагониста. [10] [11]

Роль в раке [ править ]

Мутации в этом гене неоднократно наблюдались при раке простаты. [12]

Экспрессия FOXA1 коррелирует с двумя маркерами EMT, а именно Twist1 и E-кадгерином при раке груди. [13]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000129514 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035451 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b "Entrez Gene: вилка A1" .
  6. ^ Bingle CD, Gowan S (1996). «Молекулярное клонирование фактора транскрипции вилки HNF-3 альфа из линии клеток легочной аденокарциномы человека». Biochim Biophys Acta . 1307 (1): 17–20. DOI : 10.1016 / 0167-4781 (96) 00058-9 . PMID 8652662 . 
  7. ^ Mincheva А, Личтер Р, Шютц G, Кэстнер КН (1997). «Отнесение человеческих генов ядерного фактора гепатоцитов 3-альфа, -бета и -гамма (HNF3A, HNF3B, HNF3G) к 14q12-q13, 20p11 и 19q13.2-q13.4». Геномика . 39 (3): 417–9. DOI : 10.1006 / geno.1996.4477 . PMID 9119385 . 
  8. ↑ Ross-Innes CS, Stark R, Teschendorff AE, Holmes KA, Ali HR, Dunning MJ, Brown GD, Gojis O, Ellis IO, Green AR, Ali S, Chin SF, Palmieri C, Caldas C, Carroll JS (4 января 2012). «Дифференциальное связывание рецептора эстрогена связано с клиническим исходом рака груди» . Природа . 481 (7381): 389–93. DOI : 10,1038 / природа10730 . PMC 3272464 . PMID 22217937 .  
  9. ^ Курос-Мехр H, Slorach EM, Sternlicht MD, Werb Z (декабрь 2006). «GATA-3 поддерживает дифференцировку судьбы люминальных клеток в молочной железе» . Cell . 127 (5): 1041–55. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.09.048 . PMC 2646406 . PMID 17129787 .  
  10. ^ Албергария А, Паредес Дж, Соуза В, Milanezi Ж, Карнейро В, Бастос Дж, Коста - S, Виейра D, Лопиш N, Lam EW, Lunet N, Шмитта F (2009). «Экспрессия FOXA1 и GATA-3 при раке груди: прогностическое значение в опухолях, отрицательных по рецепторам гормонов» . Исследование рака груди . 11 (3): R40. DOI : 10.1186 / bcr2327 . PMC 2716509 . PMID 19549328 .  
  11. ^ Санга S, Метла Б.М., Cristini В, Эдджертон МЕ (2009). «Мета-анализ экспрессии генов подтверждает существование апокринного молекулярного рака груди с ролью рецептора андрогенов и предполагает взаимодействие с семейством ErbB» . BMC Medical Genomics . 2 : 59. DOI : 10,1186 / 1755-8794-2-59 . PMC 2753593 . PMID 19747394 .  
  12. ^ Барбьери CE, Baca SC, Лоуренс MS, Демикелис F, Блаттнер M, Theurillat JP, White TA, Stojanov P, Van Allen E, Stransky N, Nickerson E, Chae SS, Boysen G, Auclair D, Onofrio RC, Park K, Китабаяши Н., Макдональд Т.Ю., Шейх К., Вуонг Т., Гвидуччи К., Цибульскис К., Сиваченко А., Картер С.Л., Саксена Г., Воет Д., Хуссейн В.М., Рамос А.Х., Винклер В., Редман М.С., Ардли К., Тевари А.К., Москера Дж. М. , Рупп Н., Уайлд П.Дж., Мох Х., Моррисси С., Нельсон П.С., Кантофф П.В., Габриэль С.Б., Голуб Т.Р., Мейерсон М., Ландер Э.С., Гетц Дж., Рубин М.А., Гарравей Л.А. (июнь 2012 г.). «Секвенирование экзома выявляет повторяющиеся мутации SPOP, FOXA1 и MED12 при раке простаты» . Nat. Genet . 44 (6): 685–9. DOI : 10.1038 / ng.2279 . ЧВК 3673022 . PMID  22610119 .
  13. ^ BenAyed-Guerfali, Dorra; Даббеш-Бурича, Эмна; Аяди, Ваджди; Трифа, Фатьма; Charfi, Slim; Хабир, Абдельмаджид; Селлами-Будавара, Тахия; Мокдад-Гаргури, Раджа (2019). «Ассоциация маркеров FOXA1 и EMT (Twist1 и E-cadherin) при раке груди». Отчеты по молекулярной биологии . 46 (3): 3247–3255. DOI : 10.1007 / s11033-019-04784-w . ISSN 0301-4851 . PMID 30941644 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Song L, Xu Z, Zhang C и др. (2009). «Повышение регуляции HSP72 с помощью Foxa1 в линии клеток рака груди человека MCF-7». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 386 (1): 30–4. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2009.05.120 . PMID  19486887 .
  • Чжан Ю., Али Т.З., Чжоу Х. и др. (2010). «Связывающий белок 1 ErbB3 подавляет белок 2 переднего градиента гена, способствующий метастазированию, при раке простаты» . Cancer Res . 70 (1): 240–8. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-09-2904 . PMC  3724404 . PMID  20048076 .
  • Макмаллин Р.П., Доби А., Баттон Л.Н. и др. (2010). «Усилитель связывания FOXA1 регулирует экспрессию Hoxb13 в предстательной железе» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 107 (1): 98–103. DOI : 10.1073 / pnas.0902001107 . PMC  2806740 . PMID  20018680 .
  • Сан Q, Yu X, Degraff DJ, Matusik RJ (2009). «Восходящий стимулирующий фактор 2, новый белок, взаимодействующий с FoxA1, участвует в экспрессии генов, специфичных для простаты» . Мол. Эндокринол . 23 (12): 2038–47. DOI : 10.1210 / me.2009-0092 . PMC  2796152 . PMID  19846536 .
  • Лю Н, Ню Й, Ван С.Л. и др. (2010). «[Диагностическое и прогностическое значение экспрессии FOXA1 в молекулярных подтипах инвазивной карциномы протоков молочной железы]». Чжунхуа И Сюэ За Чжи . 90 (20): 1403–7. PMID  20646630 .
  • Haiman CA, Garcia RR, Hsu C и др. (2009). «Скрининг и ассоциативное тестирование общих вариаций кодирования в генах коактиватора и ко-репрессора рецептора стероидных гормонов в отношении риска рака груди: многонациональная когорта» . BMC Рак . 9 : 43. DOI : 10.1186 / 1471-2407-9-43 . PMC  2637888 . PMID  19183483 .
  • Колер С., Чирилло Л.А. (2010). «Стабильное связывание хроматина предотвращает ацетилирование FoxA, сохраняя ремоделирование хроматина FoxA» . J. Biol. Chem . 285 (1): 464–72. DOI : 10.1074 / jbc.M109.063149 . PMC  2804194 . PMID  19897491 .
  • Малик С., Цзян С., Гари Дж. П. и др. (2010). «Гистоновая деацетилаза 7 и FoxA1 в эстроген-опосредованной репрессии RPRM» . Мол. Клетка. Биол . 30 (2): 399–412. DOI : 10.1128 / MCB.00907-09 . PMC  2798473 . PMID  19917725 .
  • Motallebipour M, Ameur A, Reddy Bysani MS и др. (2009). «Дифференциальное связывание и паттерн совместного связывания FOXA1 и FOXA3 и их связь с H3K4me3 в клетках HepG2, выявленная с помощью ChIP-seq» . Genome Biol . 10 (11): R129. DOI : 10.1186 / ГБ-2009-10-11-r129 . PMC  3091322 . PMID  19919681 .
  • Eeckhoute J, Lupien M, Meyer CA и др. (2009). «Селективное ремоделирование хроматина клеточного типа определяет активную подгруппу FOXA1-связанных энхансеров» . Genome Res . 19 (3): 372–80. DOI : 10.1101 / gr.084582.108 . PMC  2661808 . PMID  19129543 .
  • Накшатри Х, Бадве С (2007). «FOXA1 как терапевтическая мишень при раке груди». Мнение эксперта. Ther. Цели . 11 (4): 507–14. DOI : 10.1517 / 14728222.11.4.507 . PMID  17373880 .
  • Якобацци V, Инфантино V, Бисачча Ф. и др. (2009). «Роль FOXA в экспрессии гена митохондриального цитрата-носителя и секреции инсулина». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 385 (2): 220–4. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2009.05.030 . PMID  19445897 .
  • Nucera C, Eeckhoute J, Finn S и др. (2009). «FOXA1 - потенциальный онкоген анапластической карциномы щитовидной железы» . Clin. Cancer Res . 15 (11): 3680–9. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-08-3155 . PMID  19470727 .
  • Накшатри Х, Бадве С (2009). «FOXA1 при раке груди». Эксперт Rev Mol Med . 11 : e8. DOI : 10.1017 / S1462399409001008 . PMID  19261198 .
  • Песня Y, Вашингтон МК, Кроуфорд ХК (2010). «Потеря FOXA1 / 2 важна для перехода эпителия в мезенхиму при раке поджелудочной железы» . Cancer Res . 70 (5): 2115–25. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-09-2979 . PMC  2831111 . PMID  20160041 .
  • Ли HJ, Chattopadhyay S, Yoon WH и др. (2010). «Сверхэкспрессия ядерного фактора гепатоцитов-3альфа вызывает апоптоз за счет активации и накопления цитоплазматического р53 в клетках рака простаты». Простаты . 70 (4): 353–61. DOI : 10.1002 / pros.21069 . PMID  19866472 .
  • Бернардо Г.М., Лозада К.Л., Мидлер Д.Д. и др. (2010). «FOXA1 является важным детерминантом экспрессии ERalpha и морфогенеза протоков молочной железы» . Развитие . 137 (12): 2045–54. DOI : 10.1242 / dev.043299 . PMC  2875844 . PMID  20501593 .
  • Альбергария А., Паредес Дж., Суза Б. и др. (2009). «Экспрессия FOXA1 и GATA-3 при раке груди: прогностическое значение в опухолях, отрицательных по рецепторам гормонов» . Рак молочной железы Res . 11 (3): R40. DOI : 10.1186 / bcr2327 . PMC  2716509 . PMID  19549328 .
  • Хуан Цюй, Ли Г.Х., Кунг А.В. (2009). «Полиморфизм -9247 T / C в вышестоящей регуляторной области SOST, который потенциально влияет на связывание C / EBPalpha и FOXA1, связан с остеопорозом». Кость . 45 (2): 289–94. DOI : 10.1016 / j.bone.2009.03.676 . PMID  19371798 .
  • Сано М., Аояги К., Такахаши Х. и др. (2010). «Путь транскрипции Forkhead box A1 в плоскоклеточных карциномах пищевода, экспрессирующих KRT7, с обширными метастазами в лимфатические узлы» . Int. J. Oncol . 36 (2): 321–30. DOI : 10.3892 / ijo_00000503 . PMID  20043065 .

Внешние ссылки [ править ]

  • FactorBook FOXA1

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , находящийся в открытом доступе .