| FYVE цинковый палец | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | FYVE | ||||||||
| Pfam | PF01363 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR000306 | ||||||||
| PROSITE | PDOC50178 | ||||||||
| SCOP2 | 1vfy / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM суперсемейство | 59 | ||||||||
| Белок OPM | 1vfy | ||||||||
| CDD | cd00065 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии домен цинкового пальца FYVE назван в честь четырех богатых цистеином белков : F ab 1 (дрожжевой ортолог PIKfyve ), Y OTB, V ac 1 (белок транспорта везикул) и E EA1 , в котором он был обнаружен. . FYVE домены связывания фосфатидилинозитолы 3-фосфат , [2] таким образом , в зависимости от его иона металла координации и основных аминокислот. Домен FYVE встраивается в клеточные мембраны в зависимости от pH. [3] Домен FYVE связан с сортировкой вакуолярных белков и функцией эндосом . [4]
Структура [ править ]
Домен FYVE состоит из двух маленьких бета-шпилек (или цинковых суставов), за которыми следует альфа-спираль. [5] FYVE-палец связывает два иона цинка . Палец FYVE имеет восемь потенциальных положений цистеина для координации цинка и характеризуется наличием основных аминокислот вокруг цистеина. Многие члены этого семейства также включают два гистидина в мотив последовательности:
Палец FYVE структурно похож на домен RING и палец PHD .
Примеры [ править ]
Ниже приводится список белков человека, содержащих этот домен:
- ANKFY1 , EEA1 , FGD1 , FGD2 , FGD3 , FGD4 , FGD5 , FGD6 , FYCO1 , HGS , MTMR3 , MTMR4 , PIKFYVE , PLEKHF1 , PLEKHF2
- RUFY1 , RUFY2 , WDF3 , WDFY1 , WDFY2 , WDFY3 , ZFYVE1 , ZFYVE16 , ZFYVE19 , ZFYVE20 , ZFYVE21 , ZFYVE26 , ZFYVE27 , ZFYVE28 , ZFYVE9
Ссылки [ править ]
- ^ Dumas JJ, Merithew E, Sudharshan E, et al. (Ноябрь 2001 г.). «Многовалентное нацеливание на эндосомы с помощью гомодимерного EEA1». Мол. Cell . 8 (5): 947–58. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00385-9 . PMID 11741531 .
- ^ Gaullier JM, Симонсена А, Д Арриго А, Bremnes В, Штенмарк Н, Осланд R (июль 1998 года). «Пальцы FYVE связывают PtdIns (3) P». Природа . 394 (6692): 432–3. DOI : 10,1038 / 28767 . PMID 9697764 . S2CID 4385768 .
- ^ He J, Vora M, Haney RM и др. (Сентябрь 2009 г.). «Встраивание домена FYVE в мембрану регулируется pH» . Белки . 76 (4): 852–60. DOI : 10.1002 / prot.22392 . PMC 2909462 . PMID 19296456 .
- ^ Leevers SJ, Vanhaesebroeck B, Уотерфилд MD (апрель 1999). «Передача сигналов через фосфоинозитид-3-киназы: липиды в центре внимания». Curr. Мнение. Cell Biol . 11 (2): 219–25. DOI : 10.1016 / S0955-0674 (99) 80029-5 . PMID 10209156 .
- ^ Мишра S, Херли JH (май 1999). «Кристаллическая структура фосфатидилинозитол-3-фосфат-специфичного мембранно-целевого мотива, FYVE-домен Vps27p». Cell . 97 (5): 657–66. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80776-X . PMID 10367894 . S2CID 15448444 .
Дальнейшее чтение [ править ]
- Стенмарк Х., Осланд Р., То Б. Х., Д'Арриго А. (сентябрь 1996 г.). «Эндосомная локализация аутоантигена EEA1 опосредована цинк-связывающим пальцем FYVE» . J. Biol. Chem . 271 (39): 24048–54. DOI : 10.1074 / jbc.271.39.24048 . PMID 8798641 .
- Стенмарк Х., Осланд Р. (декабрь 1999 г.). «Белки FYVE-finger - эффекторы липида инозита». J. Cell Sci . 112 (Pt 23): 4175–83. PMID 10564636 .
