Filamin А, альфа ( FLNA ) представляет собой белок , который у человека кодируется FLNA гена . [5] [6]
FLNA |
---|
|
Доступные конструкции |
---|
PDB | Ортолог поиск: PDBe RCSB |
---|
Список идентификационных кодов PDB |
---|
2AAV , 2BP3 , 2BRQ , 2J3S , 2JF1 , 2K3T , 2K7P , 2MTP , 2W0P , 2WFN , 3CNK , 3HOC , 3HOP , 3HOR , 3ISW , 3RGH , 4M9P , 4P3W |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | FLNA , ABP-280, ABPX, CSBS, CVD1, FLN, FLN-A, FLN1, FMD, MNS, NHBP, OPD, OPD1, OPD2, XLVD, XMVD, филамин A, FGS2 |
---|
Внешние идентификаторы | OMIM : 300017 MGI : 95556 HomoloGene : 1119 GeneCards : FLNA |
---|
Расположение гена ( человек ) |
---|
| Chr. | Х-хромосома (человека) [1] |
---|
| Группа | Xq28 | Начинать | 154 348 524 п.н. [1] |
---|
Конец | 154 374 634 п.н. [1] |
---|
|
Расположение гена ( Мышь ) |
---|
| Chr. | Х-хромосома (мышь) [2] |
---|
| Группа | X A7.3 | X 37,89 см | Начинать | 74 223 461 п.н. [2] |
---|
Конец | 74 249 820 п.н. [2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
| Дополнительные данные эталонного выражения |
|
Онтология генов |
---|
Молекулярная функция | • белок гомодимеризация активность • ГО: 0032403 белок , содержащий сложный связывающий • транскрипционный фактор связывания • связывание рецептора опиоидного мю-типа • активность преобразователя сигнала • актина нити связывания • небольшой GTPase связывания • киназа связывания • актина связывания • Smad связывания • Fc-гамма рецептора Я комплексное связывание • связывание G-белком рецептора • ГТФ связывание • связывание РНК • калиевые каналы регулятора активности • ионного канала связывания • кадгерин связывания • GO: 0001948 связывание белка
|
---|
Сотовый компонент | • цитоплазма • мембраны • фокальной адгезии • кортикального цитоскелета • плазматической мембраны • Myb комплекс • дендритных вал • внеклеточная область • нейрональные клетки тела • клеток коры головного мозга • Ядрышко • актина нити • актинового цитоскелета • перинуклеарной область цитоплазмы • внеклеточного экзосом • цитоскелета • ядро • апикальный дендрит • нитчатый актин • внеклеточный матрикс GO: 0005578 • межклеточное соединение • цитозоль • Z-диск
|
---|
Биологический процесс | • актинового цитоскелет реорганизация • негативная регуляция транскрипции с помощью РНК - полимеразы I • негативной регуляции процесса катаболического белка • создания локализации белка • стабилизации белка • тромбоциты дегрануляция • мРНК транскрипция с помощью РНК - полимераза II • негативной регуляции апоптоза процесса • кластеризации рецепторов • отрицательное регулирование ДНК-связывающего фактора транскрипции активности • цитоплазматической секвестрации белка • активация тромбоцитов • митотическое веретено в сборе • положительное регулирование субстрата адгезии в зависимости от клетки расширяющей • локализацию белка к клеточной поверхности • организации проекции клеток • аденилатциклазы рецептора допамина циклаза-ингибирующее сигнальный путь • актина сшивки образования • положительного регулирования I-kappaB киназы / сигнализация NF-kappaB • положительного регулирования сигнального путь интегриной-опосредованная • агрегация тромбоциты • межклеточных контакты в сборе • регулирование миграции клеток • заживления ран, распространение клеток • семафорина-плексина сигнализации погладить путь • формирование радиальных глиальных каркасов • развитие коры головного мозга • сборка ресничек • локализация белка в плазматической мембране • положительная регуляция трансмембранного транспорта ионов калия • регуляция реполяризации мембраны во время действия потенциала клеток сердечной мышцы предсердия • регуляция реполяризации мембран во время действия клеток сердечной мышцы потенциал • положительная регуляция пролиферации нервных клеток-предшественников • положительная регуляция миграции нейронов
|
---|
Источники: Amigo / QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Разновидность | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ансамбль | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Расположение (UCSC) | Chr X: 154,35 - 154,37 Мб | Chr X: 74.22 - 74.25 Мб |
---|
PubMed поиск | [3] | [4] |
---|
Викиданные |
Просмотр / редактирование человека | Просмотр / редактирование мыши |
|
Актин-связывающий белок, или филамин , представляет собой белок массой 280 кДа, который сшивает актиновые филаменты в ортогональные сети в кортикальной цитоплазме и участвует в закреплении мембранных белков для актинового цитоскелета . Ремоделирование цитоскелета играет центральную роль в модуляции формы и миграции клеток. Филамин А, кодируемый геном FLNA, представляет собой широко экспрессируемый филамин, который регулирует реорганизацию актинового цитоскелета путем взаимодействия с интегринами , трансмембранными рецепторными комплексами и вторичными мессенджерами . [7]
Структура белка включает актин- связывающий N-концевой домен, 24 внутренних повтора и 2 шарнирные области. [8] [9]
Было показано, что филамин взаимодействует с:
- BRCA2 , [10]
- CD29 [11] [12]
- CASR , [13] [14]
- FBLIM1 , [15]
- FILIP1 , [16]
- ЛНБ , [17]
- НПХП1 , [18]
- РАЛА , [19]
- SH2B3 , [20]
- ТРИО , [21] и
- ВХЛ . [22] [23]
Отредактированный остаток был ранее записан как однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в dbSNP .
Тип
Редактирование РНК от A до I катализируется семейством аденозиндезаминаз, действующих на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре-мРНК и дезаминируют их до инозина. Инозины распознаются как гуанозин механизмом трансляции клеток. Есть три члена семейства ADAR, ADAR 1-3, причем ADAR 1 и ADAR 2 являются единственными ферментативно активными членами. Считается, что ADAR3 играет регулирующую роль в мозге. ADAR1 и ADAR 2 широко экспрессируются в тканях, в то время как ADAR 3 ограничивается мозгом. Двухцепочечные области РНК образуются спариванием оснований между остатками в области, комплементарной области сайта редактирования. Эта комплементарная область обычно находится в соседнем интроне, но также может располагаться в экзонной последовательности. Область, которая образует пары оснований с областью редактирования, известна как редактируемая комплементарная последовательность (ECS).
Сайт
Один сайт редактирования пре-мРНК FLNA расположен в пределах аминокислоты 2341 конечного белка. Глютамин (Q) , кодон изменяется из - за специфического сайта дезаминирование аденозина на месте монтажа к аргинином (R) кодона. Предполагается, что область редактирования будет образовывать двухцепочечную область длиной 32 пары оснований с комплементарной последовательностью примерно на 200 нуклеотидов ниже сайта редактирования. Этот ECS находится в интронной последовательности. [24] Редактирование на сайте Q / R, вероятно, будет включать как ADAR1, так и ADAR2. Нокауты ADAR2 на мышах показывают уменьшение редактирования на сайте Q / R. Двойные нокауты ADAR1 не влияют на редактирование. [25]
Состав
Отредактированный аденозин расположен в 22 иммуноглулиноподобном повторе белка. Эта область представляет собой связывающий домен интегрина β [26] и связывающий домен RAC1 . [19] Замена аминокислот, вероятно, повлияет на электростатический потенциал связывающих доменов. [24] Сайт редактирования FLNA - это 2 нуклеотида от сайта сплайсинга, такого как сайт R / G GluR-2. Оба транскрипта имеют 7/8 идентичных нуклеотидов вокруг сайтов редактирования. Поскольку широко распространено мнение, что редактирование на сайте GLUR-2 Q / R влияет на сплайсинг, сходство последовательности и сайта редактирования может означать, что редактирование на сайте FLNA может также регулировать сплайсинг. Эксперименты с gluR-2 in vitro показали, что присутствие ADAR2 приводит к ингибированию сплайсинга. [27] Анализ данных EST для FLNA показывает, что существует связь между редактированием последнего кодона экзона и сохранением следующего интрона. [24]
Функция
Изменение электростатического потенциала, вероятно, повлияет на связывание FLNA со многими белками, с которыми она взаимодействует. [28]