| GAPDH | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | GAPDH , GAPD, G3PD, HEL-S-162eP, глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа | ||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | OMIM: 138400 MGI: 5434255 HomoloGene: 107053 Генные карты : GAPDH | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
| Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
| Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
| RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
| Расположение (UCSC) | Chr 12: 6.53 - 6.54 Мб | н / д | |||||||||||||||||||||||
| PubMed поиск | [2] | [3] | |||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа, NAD-связывающий домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
детерминанты термостабильности фермента, наблюдаемые в молекулярной структуре d-глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы thermus aquaticus при разрешении 2,5 ангстрем | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Gp_dh_N | ||||||||
| Pfam | PF00044 | ||||||||
| Клан пфам | CL0063 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR020828 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00069 | ||||||||
| SCOP2 | 1gd1 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа, C-концевой домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
кристаллическая структура глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы из pyrococcus horikoshii ot3 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Gp_dh_C | ||||||||
| Pfam | PF02800 | ||||||||
| Клан пфам | CL0139 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR020829 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00069 | ||||||||
| SCOP2 | 1gd1 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (сокращенно GAPDH ) ( EC 1.2.1.12 ) - это фермент с массой около 37 кДа, который катализирует шестую стадию гликолиза и, таким образом, служит для расщепления глюкозы для получения энергии и молекул углерода. В дополнение к этой давно установленной метаболической функции, GAPDH недавно был вовлечен в несколько неметаболических процессов, включая активацию транскрипции , инициацию апоптоза , [4] перемещение ER к пузырькам Гольджи и быстрый аксональный или аксоплазматический транспорт . [5] В сперме изофермент, специфичный для семенников. GAPDHS выражается.
Структура [ править ]
В нормальных клеточных условиях цитоплазматический GAPDH существует в основном в виде тетрамера . Эта форма состоит из четырех идентичных субъединиц 37 кДа, каждая из которых содержит одну каталитическую тиоловую группу и имеет решающее значение для каталитической функции фермента. [6] [7] Ядерный GAPDH имеет повышенную изоэлектрическую точку (pI) pH 8,3–8,7. [7] Следует отметить, что остаток цистеина C152 в активном центре фермента необходим для индукции апоптоза при окислительном стрессе . [7] В частности, посттрансляционные модификациицитоплазматического GAPDH вносят свой вклад в его функции вне гликолиза. [6]
GAPDH кодируется одним геном, который продуцирует один транскрипт мРНК с 8 вариантами сплайсинга, хотя изоформа действительно существует как отдельный ген, который экспрессируется только в сперматозоидах . [7]
Реакция [ править ]
| глицеральдегид-3-фосфат | глицеральдегид фосфатдегидрогеназа | D - глицерат 1,3-бисфосфат | |
| НАД + + P i | НАДН + Н + | ||
| НАД + + P i | НАДН + Н + | ||
Соединение C00118 в базе данных KEGG Pathway. Фермент 1.2.1.12 из базы данных KEGG Pathway. Реакция R01063 в базе данных пути KEGG . Соединение C00236 в базе данных пути KEGG .
Двухэтапное преобразование G3P [ править ]
Первая реакция - это окисление глицеральдегид-3-фосфата (G3P) в положении-1 (на диаграмме он показан как 4-й углерод от гликолиза), в котором альдегид превращается в карбоновую кислоту (ΔG ° '= - 50 кДж / моль (-12 ккал / моль)) и НАД + одновременно восстанавливается эндергонически до НАДН.
Энергия , выделяемая этих высокий экзэргонические приводы реакции окисления эндергонической второй реакции (ΔG ° '= + 50 кДж / моль (+ 12kcal / моль)), в котором молекула неорганического фосфата переносится в GAP промежуточной с образованием продукта с высокий потенциал переноса фосфорила: 1,3-бисфосфоглицерат (1,3-BPG).
Это пример фосфорилирования в сочетании с окислением, и общая реакция является несколько эндергонической (ΔG ° '= + 6,3 кДж / моль (+1,5)). Энергетическая связь здесь стала возможной благодаря GAPDH.
Механизм [ править ]
GAPDH использует ковалентный катализ и общий щелочной катализ для уменьшения очень большой энергии активации второй стадии (фосфорилирования) этой реакции.
1: Окисление [ править ]
Во-первых, остаток цистеина в активном центре GAPDH атакует карбонильную группу GAP, создавая полупродукт на основе гемитиоацеталя (ковалентный катализ).
Гемитиоацеталь депротонируется остатком гистидина в активном центре фермента (общий щелочной катализ). Депротонирование способствует реформированию карбонильной группы в последующем промежуточном тиоэфире и выбросу гидрид-иона .
Затем соседняя, прочно связанная молекула НАД + принимает ион гидрида , образуя НАДН, в то время как гемитиоацеталь окисляется до тиоэфира .
Эта разновидность сложного тиоэфира имеет гораздо более высокую энергию (менее стабильна), чем разновидность карбоновой кислоты, которая могла бы возникнуть, если бы GAP был окислен в отсутствие GAPDH (разновидность карбоновой кислоты настолько низка по энергии, что энергетический барьер для второй стадии реакции (фосфорилирование) было бы слишком высоким, а следовательно, и слишком медленной и неблагоприятной для живого организма реакцией).
2: Фосфорилирование [ править ]
НАДН покидает активный центр и замещается другой молекулой НАД + , положительный заряд которой стабилизирует отрицательно заряженный карбонильный кислород в переходном состоянии следующей и последней стадии. Наконец, молекула неорганического фосфата атакует тиоэфир и образует тетраэдрический промежуточный продукт, который затем разрушается, высвобождая 1,3-бисфосфоглицерат и тиольную группу остатка цистеина фермента.
Регламент [ править ]
Этот белок может использовать морфеиновую модель аллостерической регуляции . [8] Активность GAPDH в аэробном и анаэробном гликолизе может регулироваться комплексом протекающих каналов с L-лактатдегидрогеназой, который может образовываться только при предельных концентрациях NAD (H). [9] Положительное электрическое поле доминирует между соседними сайтами связывания NAD (H) на тетрамерах GAPDH и сливается с положительными электрическими полями между сайтами связывания NAD (H) на соседних субъединицах в тетрамерах LDH. Структуры показывают, что NAD (H) -канал внутри временного комплекса GAPDH-LDH может быть продолжением NAD (H) -каналов между соседними субъединицами в тетрамере GAPDH. [10]
Функция [ править ]
Метаболический [ править ]
Как указывает его название, глицеральдегид - 3-фосфат - дегидрогеназы (GAPDH) катализирует превращение глицеральдегид 3-фосфата в D - глицерат 1,3-бисфосфат . Это шестой шаг в гликолитическом распаде глюкозы, важном пути снабжения энергией и молекулами углерода, который происходит в цитозоле эукариотических клеток. Преобразование происходит в два связанных этапа. Первый благоприятен и допускает второй неблагоприятный шаг.
Транскрипция и апоптоз [ править ]
GAPDH может сам активировать транскрипцию . Комплекс транскрипционных коактиваторов OCA-S содержит GAPDH и лактатдегидрогеназу , два белка, которые ранее считались вовлеченными только в метаболизм . GAPDH перемещается между цитозолем и ядром и, таким образом, может связывать метаболическое состояние с транскрипцией гена. [11]
В 2005 году Hara et al. показали, что GAPDH инициирует апоптоз . Это не третья функция, но ее можно рассматривать как активность, опосредованную связыванием GAPDH с ДНК, как при активации транскрипции, обсуждаемой выше. Исследование показало, что GAPDH S-нитрозилируется NO в ответ на клеточный стресс, который заставляет его связываться с белком SIAH1 , убиквитинлигазой . Комплекс перемещается в ядро, где Siah1 нацеливается на ядерные белки для деградации , тем самым инициируя контролируемое отключение клеток. [12] В последующем исследовании группа продемонстрировала, что депренил , который использовался в клинических условиях для лечения болезни Паркинсона, сильно снижает апоптотическое действие GAPDH, предотвращая его S-нитрозилирование, и поэтому может использоваться в качестве лекарственного средства. [13]
Метаболический переключатель [ править ]
GAPDH действует как обратимый метаболический переключатель при окислительном стрессе. [14] Когда клетки подвергаются действию оксидантов , они нуждаются в чрезмерном количестве кофактора антиоксиданта НАДФН . В цитозоле НАДФН восстанавливается из НАДФ + несколькими ферментами, три из которых катализируют первые шаги пентозофосфатного пути . Обработка оксидантами вызывает инактивацию GAPDH. Эта инактивация временно перенаправляет метаболический поток с гликолиза на пентозофосфатный путь, позволяя клетке вырабатывать больше НАДФН. [15] В стрессовых условиях НАДФН необходим некоторым антиоксидантным системам, включая глутаредоксин и тиоредоксин.а также необходим для переработки глутатиона .
От скорой до транспорта Гольджи [ править ]
GAPDH также, по-видимому, участвует в транспорте везикул из эндоплазматического ретикулума (ER) в аппарат Гольджи, который является частью пути доставки секретируемых белков. Было обнаружено, что GAPDH рекрутируется rab2 в везикулярно-канальцевые кластеры ER, где он помогает формировать везикулы COP 1 . GAPDH активируется посредством фосфорилирования тирозина с помощью Src . [16]
Дополнительные функции [ править ]
GAPDH, как и многие другие ферменты, выполняет несколько функций. Помимо катализа 6-й стадии гликолиза , недавние данные указывают на участие GAPDH в других клеточных процессах. Было описано, что GAPDH проявляет многофункциональность более высокого порядка в контексте поддержания клеточного гомеостаза железа [17], в частности, в качестве белка-шаперона для лабильного гема внутри клеток. [18] Это стало сюрпризом для исследователей, но с эволюционной точки зрения имеет смысл повторно использовать и адаптировать существующие белки вместо того, чтобы создавать новый белок с нуля.
Использовать в качестве контроля загрузки [ править ]
Поскольку ген GAPDH часто стабильно и постоянно экспрессируется на высоком уровне в большинстве тканей и клеток, он считается геном домашнего хозяйства . По этой причине GAPDH обычно используется биологическими исследователями в качестве контроля загрузки для вестерн-блоттинга и в качестве контроля для количественной ПЦР . Однако исследователи сообщили о различном регулировании GAPDH при определенных условиях. [19] Например, было показано , что фактор транскрипции MZF-1 регулирует ген GAPDH. [20] Гипоксия также сильно активирует GAPDH. [21] Следовательно, использование GAPDH в качестве контроля загрузки следует тщательно продумать.
Сотовая связь [ править ]
Все стадии гликолиза происходят в цитозоле, как и реакция, катализируемая GAPDH. В эритроцитах GAPDH и несколько других гликолитических ферментов собираются в комплексы на внутренней стороне клеточной мембраны . По-видимому, этот процесс регулируется фосфорилированием и оксигенацией. [22] Ожидается, что близкое расположение нескольких гликолитических ферментов значительно увеличит общую скорость распада глюкозы. Недавние исследования также показали, что GAPDH экспрессируется зависимым от железа способом на внешней стороне клеточной мембраны, где он играет роль в поддержании гомеостаза клеточного железа. [23] [24]
Клиническое значение [ править ]
Рак [ править ]
GAPDH сверхэкспрессируется при множественных раковых заболеваниях человека, таких как меланома кожи , и его экспрессия положительно коррелирует с прогрессированием опухоли. [25] [26] Его гликолитические и антиапоптотические функции способствуют пролиферации и защите опухолевых клеток, способствуя онкогенезу . Примечательно, что GAPDH защищает от укорачивания теломер, вызванного химиотерапевтическими препаратами, которые стимулируют сфинголипид церамид . Между тем, такие условия, как окислительный стресс, нарушают функцию GAPDH, что приводит к старению и смерти клеток. [7] Кроме того, истощение GAPDH привело к старениюв опухолевых клетках, таким образом представляя новую терапевтическую стратегию для контроля роста опухоли. [27]
Нейродегенерация [ править ]
GAPDH причастен к нескольким нейродегенеративным заболеваниям и расстройствам, в основном через взаимодействия с другими белками, специфичными для этого заболевания или расстройства. Эти взаимодействия могут влиять не только на энергетический метаболизм, но и на другие функции GAPDH. [6] Например, взаимодействия GAPDH с белком - предшественником бета-амилоида (betaAPP) могут мешать его функции в отношении цитоскелета или мембранного транспорта, в то время как взаимодействия с хантингтином могут влиять на его функцию в отношении апоптоза, транспорта ядерной тРНК , репликации ДНК и ДНК. ремонт . Кроме того, сообщалось о ядерной транслокации GAPDH при болезни Паркинсона.(PD) и несколько антиапоптотических препаратов для лечения PD, таких как разагилин , действуют, предотвращая ядерную транслокацию GAPDH. Предполагается, что гипометаболизм может быть одним из факторов развития БП, но точные механизмы, лежащие в основе участия GAPDH в нейродегенеративном заболевании, еще предстоит выяснить. [28] SNP rs3741916 в 5' UTR из GAPDH гена может быть связано с поздним началом болезни Альцгеймера . [29]
Взаимодействия [ править ]
Партнеры по связыванию белков [ править ]
GAPDH участвует в ряде биологических функций через свои белок-белковые взаимодействия с:
- тубулин для облегчения связывания микротрубочек; [6]
- актин для облегчения полимеризации актина; [6]
- VDAC1 для индукции проницаемости митохондриальной мембраны (MMP) и апоптоза; [6]
- Инозитол-1,4,5-трифосфатный рецептор для регулирования внутриклеточной передачи сигналов Ca2 + ; [6]
- Окт-1 , чтобы сформировать коактиватор комплекс ОСА-S, который необходим для гистона H2B синтеза во время S фазы от клеточного цикла ; [7]
- p22 для помощи в организации микротрубочек ; [7]
- Rab2 для облегчения транспорта эндоплазматического ретикулума (ER) - Гольджи ; [7]
- Трансферрин на поверхности различных клеток и во внеклеточной жидкости; [7] [24] [30]
- Лактатдегидрогеназа ; [7]
- Лактоферрин; [31]
- Апуриновая / апиримидиновая эндонуклеаза ( APE1 ), таким образом превращая окисленный APE1 в его восстановленную форму, чтобы возобновить его эндонуклеазную активность; [7]
- Белок промиелоцитарного лейкоза (PML) РНК- зависимым образом; [7]
- Rheb для секвестрации GTPase в условиях низкого уровня глюкозы; [7]
- Siah1 с образованием комплекса, который перемещается в ядро, где убиквитинирует и разрушает ядерные белки в условиях нитрозативного стресса; [7]
- GAPDH, конкурент белка Siah, увеличивает жизнь (GOSPEL), чтобы блокировать взаимодействие GAPDH с Siah1 и, таким образом, гибель клеток в ответ на окислительный стресс; [7]
- p300 / CREB-связывающий белок (CBP), который ацетилирует GAPDH и, в свою очередь, усиливает ацетилирование дополнительных апоптотических мишеней; [7]
- Са2 + / кальмодулин-зависимая протеинкиназа, специфичная для скелетных мышц; [7]
- Акт ; [7]
- Белок - предшественник бета-амилоида (betaAPP); [28]
- Хантингтин . [28]
- GAPDH может самоассоциироваться в гомотипные олигомеры / агрегаты.
Партнеры по связыванию нуклеиновых кислот [ править ]
GAPDH связывается с одноцепочечной РНК [32] и ДНК, и был идентифицирован ряд партнеров по связыванию нуклеиновых кислот: [7]
- тРНК ,
- РНК вируса гепатита А ,
- РНК вируса гепатита В ,
- РНК вируса гепатита С ,
- HPIV3,
- мРНК лимфокина ,
- МРНК IFN-γ ,
- МРНК JEV и
- теломерная ДНК.
Ингибиторы [ править ]
- Конингиновая кислота
Интерактивная карта проезда [ править ]
Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]
- ^ Интерактивную карту путей можно отредактировать на WikiPathways: " GlycolysisGluconeogenesis_WP534 " .
Ссылки [ править ]
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000111640 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Tarze А, Deniaud А, Le Bras M, Maillier E, D Molle, Larochette N, N Zamzami, Ян G, G Кремер, Brenner C (апрель 2007). «GAPDH, новый регулятор проапоптотической проницаемости митохондриальной мембраны» . Онкоген . 26 (18): 2606–20. DOI : 10.1038 / sj.onc.1210074 . PMID 17072346 .
- ^ Zala D, Hinckelmann М.В., Ю Н, Лира - да - Кунья М.М., Liot G, Cordelières FP, Marco S, Saudou F (январь 2013). «Везикулярный гликолиз обеспечивает бортовую энергию для быстрого аксонального транспорта» . Cell . 152 (3): 479–91. DOI : 10.1016 / j.cell.2012.12.029 . PMID 23374344 .
- ^ Б с д е е г Тристан C, N, Шахани Sedlak TW, Sawa A (февраль 2011 г.). «Разнообразные функции GAPDH: взгляды из разных субклеточных компартментов» . Сотовая связь . 23 (2): 317–23. DOI : 10.1016 / j.cellsig.2010.08.003 . PMC 3084531 . PMID 20727968 .
- ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s Николлс К., Ли Х., Лю Дж. П. (август 2012 г.). «GAPDH: обычный фермент с необычными функциями». Клиническая и экспериментальная фармакология и физиология . 39 (8): 674–9. DOI : 10.1111 / j.1440-1681.2011.05599.x . PMID 21895736 . S2CID 23499684 .
- ^ Selwood T, Джаффе EK (март 2012). «Динамические диссоциирующие гомоолигомеры и контроль функции белков» . Архивы биохимии и биофизики . 519 (2): 131–43. DOI : 10.1016 / j.abb.2011.11.020 . PMC 3298769 . PMID 22182754 .
- ^ Сведружич Ž.M .; Odorčić I .; Chang CH; Сведружич Д. (2020). «Субстратный канал через переходный белок-белковый комплекс: случай D-глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы и L-лактатдегидрогеназы» . Sci. Rep . 10 (10): 10404. DOI : 10.1038 / s41598-020-67079-2 . PMC 7320145 . PMID 32591631 .
- ^ Сведружич Ž.M .; Odorčić I .; Chang CH; Сведружич Д. (2020). «Субстратный канал через переходный белок-белковый комплекс: случай D-глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы и L-лактатдегидрогеназы» . Sci. Rep . 10 (10): 10404. DOI : 10.1038 / s41598-020-67079-2 . PMC 7320145 . PMID 32591631 .
- ↑ Zheng L, Roeder RG, Luo Y (июль 2003 г.). «Активация S-фазы промотора гистона H2B с помощью OCA-S, коактиваторного комплекса, который содержит GAPDH в качестве ключевого компонента». Cell . 114 (2): 255–66. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (03) 00552-X . PMID 12887926 . S2CID 5543647 .
- ^ Hara MR, Agrawal N, Kim SF, Cascio MB, Fujimuro M, Ozeki Y, Takahashi M, Cheah JH, Tankou SK, Hester LD, Ferris CD, Hayward SD, Snyder SH, Sawa A (июль 2005 г.). «S-нитрозилированный GAPDH инициирует апоптотическую гибель клеток путем ядерной транслокации после связывания Siah1». Природа клеточной биологии . 7 (7): 665–74. DOI : 10.1038 / ncb1268 . PMID 15951807 . S2CID 1922911 .
- ^ Hara MR, Thomas B, Cascio MB, Bae BI, Hester LD, Dawson VL, Dawson TM, Sawa A, Snyder SH (март 2006). «Нейропротекция фармакологической блокадой каскада смерти GAPDH» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (10): 3887–9. DOI : 10.1073 / pnas.0511321103 . PMC 1450161 . PMID 16505364 .
- ^ Агарвал Р., Чжао л, Sancheti Н, Сундар И.К., Рахман I, Каденас Е (ноябрь 2012 года). «Кратковременное воздействие сигаретного дыма вызывает обратимые изменения в энергетическом обмене и окислительно-восстановительном статусе клеток, независимо от воспалительных реакций в легких мыши». Американский журнал физиологии. Клеточная и молекулярная физиология легких . 303 (10): L889–98. DOI : 10,1152 / ajplung.00219.2012 . PMID 23064950 .
- ^ Ральсер М., Вамелинк М.М., Ковальд А., Гериш Б., Херен Г., Стройс Е.А., Клипп Э., Якобс С., Брайтенбах М., Лехрах Н., Кробич С. (2007). «Динамическое изменение маршрута потока углеводов является ключом к противодействию окислительному стрессу» . Журнал биологии . 6 (4): 10. DOI : 10,1186 / jbiol61 . PMC 2373902 . PMID 18154684 .
- ^ Тисдейл EJ, Artalejo CR (июнь 2007). «Мутант GAPDH, дефектный по Src-зависимому фосфорилированию тирозина, препятствует Rab2-опосредованным событиям» . Трафик . 8 (6): 733–41. DOI : 10.1111 / j.1600-0854.2007.00569.x . PMC 3775588 . PMID 17488287 .
- ^ Boradia В.М., Raje M, Raje CI (декабрь 2014). «Белок подрабатывает метаболизмом железа: глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа (GAPDH)». Сделки Биохимического Общества . 42 (6): 1796–801. DOI : 10.1042 / BST20140220 . PMID 25399609 .
- ^ Суини Э.А., Сингх А.Б., Чакраварти Р., Мартинес-Гусман О., Сайни А., Хак М.М. и др. (Июль 2018). «Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа - шаперон, выделяющий лабильный гем в клетках» . Журнал биологической химии . 293 (37): 14557–14568. DOI : 10.1074 / jbc.RA118.004169 . PMC 6139559 . PMID 30012884 .
- ^ Barber RD, Хармера DW, Coleman RA, Кларк BJ (Май 2005). «GAPDH как ген домашнего хозяйства: анализ экспрессии мРНК GAPDH на панели из 72 тканей человека». Физиологическая геномика . 21 (3): 389–95. CiteSeerX 10.1.1.459.7039 . DOI : 10.1152 / physiolgenomics.00025.2005 . PMID 15769908 .
- ^ Piszczatowski RT, Рафферти BJ, Rozado A, S Тобак, Ленц NH (август 2014). «Ген глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (GAPDH) регулируется миелоидным цинковым пальцем 1 (MZF-1) и индуцируется кальцитриолом». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 451 (1): 137–41. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2014.07.082 . PMID 25065746 .
- ^ Ян, Инчжун; Fan, Wenhong; Чжу, Линлинг; Чжао, Тонг; Ма, Лан; Ву, Ян; Ге, Рили; Вентилятор, Мин (2008). «Влияние гипоксии на экспрессию мРНК генов домашнего хозяйства в ткани мозга крысы и первичных культивируемых нервных клетках». Границы медицины в Китае . 2 (3): 239–243. DOI : 10.1007 / s11684-008-0045-7 . S2CID 85327763 .
- Перейти ↑ Campanella ME, Chu H, Low PS (февраль 2005 г.). «Сборка и регуляция комплекса гликолитических ферментов на мембране эритроцитов человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (7): 2402–7. DOI : 10.1073 / pnas.0409741102 . PMC 549020 . PMID 15701694 .
- ^ Sirover MA (декабрь 2014). «Структурный анализ функционального разнообразия глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы» . Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 57 : 20–6. DOI : 10.1016 / j.biocel.2014.09.026 . PMC 4268148 . PMID 25286305 .
- ^ а б Кумар С., Шеоканд Н., Мхадешвар М.А., Радже С.И., Радже М. (январь 2012 г.). «Характеристика глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы как нового рецептора трансферрина». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 44 (1): 189–99. DOI : 10.1016 / j.biocel.2011.10.016 . PMID 22062951 .
- ^ Рамос Д, Пеллин-Carcelén А, Agustí Дж, Murgui А, Жорды Е, Пеллин А, С Монтеагудо (январь 2015). «Нарушение регуляции экспрессии глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы во время опухолевой прогрессии меланомы кожи человека». Противораковые исследования . 35 (1): 439–44. PMID 25550585 .
- ^ Ван D, Moothart DR, Лоуи DR, Цянь X (2013). «Экспрессия генов связанного с глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназой клеточного цикла (GACC) коррелирует со стадией рака и плохой выживаемостью у пациентов с солидными опухолями» . PLOS ONE . 8 (4): e61262. DOI : 10.1371 / journal.pone.0061262 . PMC 3631177 . PMID 23620736 .
- ^ Пхадка М, Krynetskaia Н, Мишр А, Krynetskiy Е (июль 2011 года). «Фенотип ускоренного клеточного старения GAPDH-истощенных клеток карциномы легких человека» . Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 411 (2): 409–15. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2011.06.165 . PMC 3154080 . PMID 21749859 .
- ^ a b c Mazzola JL, Sirover MA (октябрь 2002 г.). «Изменение внутриклеточной структуры и функции глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы: общий фенотип нейродегенеративных нарушений?». Нейротоксикология . 23 (4–5): 603–9. DOI : 10.1016 / s0161-813x (02) 00062-1 . PMID 12428732 .
- ^ Аллен M, Кокс C, Белбин O, Ma L, Bisceglio GD, Wilcox SL, Howell CC, Hunter TA, Culley O, Walker LP, Carrasquillo MM, Dickson DW, Petersen RC, Graff-Radford NR, Younkin SG, Ertekin- Танер Н (январь 2012 г.). «Ассоциация и гетерогенность в локусе GAPDH при болезни Альцгеймера» . Нейробиология старения . 33 (1): 203.e25–33. DOI : 10.1016 / j.neurobiolaging.2010.08.002 . PMC 3017231 . PMID 20864222 .
- ^ Raje CI, Kumar S, Harle A, Нанда JS, Raje M (февраль 2007). «Глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа поверхности клеток макрофагов представляет собой новый рецептор трансферрина» . Журнал биологической химии . 282 (5): 3252–61. DOI : 10.1074 / jbc.M608328200 . PMID 17121833 .
- ^ Секретируемая многофункциональная глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа секвестрирует лактоферрин и железо в клетки неканоническим путем. Ануп С. Чаухан, Пуджа Рават, Химаншу Малхотра, Навдип Шеоканд, Манодж Кумар, Анил Патидар, Сурбхи Чаудхари, Приянка Джахар, Чая И. Радже и Манодж Радже Scientific Reports 5, 18465; DOI: 10.1038 / srep18465 (2015)
- ^ Белого М. Р., Хан М., Deredge Д, Росс CR, Квинтин R, Zucconi BE, Высоцкий В.Х., Wintrode ЛП, Уилсон Г.М., Гарсен ЭД (январь 2015). «Мутация интерфейса димера в глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназе регулирует его связывание с AU-богатой РНК» . Журнал биологической химии . 290 (3): 1770–85. DOI : 10.1074 / jbc.M114.618165 . PMC 4340419 . PMID 25451934 .
Дальнейшее чтение [ править ]
- Воет Д., Воет Дж. Г. (2010). Биохимия . Нью-Йорк: Вили. ISBN 978-0-470-57095-1.
- Страйер Л., Берг Дж. М., Тимочко Дж. Л. (2002). Биохимия, пятое издание и лекционная тетрадь . Сан-Франциско: WH Freeman. ISBN 978-0-7167-9804-0.
- диаграмма механизма реакции GAPDH от Lodish MCB на книжной полке NCBI
- похожая диаграмма из Альберта Клетка на книжной полке NCBI
Внешние ссылки [ править ]
- PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы человека.
| vте Путь метаболизма гликолиза |
|---|
Глюкоза Гексокиназа АТФ ADP Глюкозо-6-фосфат Глюкозо-6-фосфат- изомераза Фруктоза 6-фосфат Фосфофруктокиназа-1 АТФ ADP 1,6-бисфосфат фруктозы Бисфосфат-фруктозы альдолазы Дигидроксиацетонфосфат + + Глицеральдегид 3-фосфат Триозофосфат изомераза 2 × Глицеральдегид-3-фосфат 2 × Глицеральдегид-3- фосфатдегидрогеназа НАД + + P i НАДН + Н + НАД + + P i НАДН + Н + 2 × 1,3-бисфосфоглицерат 2 × Фосфоглицераткиназа ADP АТФ ADP АТФ 2 × 3-фосфоглицерат 2 × Фосфоглицерат мутаза 2 × 2-фосфоглицерат 2 × Phosphopyruvate гидратаз ( енолаз ) H 2 O H 2 O 2 × Фосфоенолпируват 2 × Пируваткиназа ADP АТФ 2 × Пируват 2 × |
