Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из гаплогруппы E-P2 (Y-ДНК) )
Перейти к навигации Перейти к поиску

E-P2 , также известный как E1b1 , представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы человека . Эта отцовская ветвь издревле присутствовала на Ближнем Востоке , а в настоящее время в основном распространена в Африке, где, как полагают, возникла, с меньшей частотой на Ближнем Востоке и в Европе .

Происхождение [ править ]

Тромбетта и др. 2011 г., предполагают происхождение из Восточной Африки:

Представленная здесь новая топология имеет важное значение для происхождения гаплогруппы E-P2. Используя принцип филогеографической экономичности, разрешение трифуркации E-M215 в пользу общего предка E-M2 и E-M329 решительно поддерживает гипотезу о том, что гаплогруппа E-P2 возникла в Восточной Африке, как предполагалось ранее, и что хромосомы E-M2, которые так часто наблюдаются в Африке к югу от Сахары, ведут свое происхождение от общего предка, обитавшего в Восточной Африке. [2]

Распространение [ править ]

Окаменелости натуфийцев, которые были проанализированы на наличие древней ДНК, несли отцовскую гаплогруппу E1b1 (xE1b1a1, E1b1b1b1) (1/5; 20%). [3]

Эта гаплогруппа в настоящее время встречается в основном в Африке , в основном в форме преобладающих субкладов E-M215 и E-V38 . E-M215 чаще встречается в Северной Африке и на Африканском Роге , а также с более низкими частотами на Ближнем Востоке , в Европе и на юге Африки . E-V38 чаще встречается в Западной Африке , Центральной Африке , Южной Африке и в Великих африканских озерах , а с низкой частотой встречается в Северной Африке и на Ближнем Востоке.

Параклад, называемый E-P2 *, включая случаи, которых нет ни в E-V38, ни в E-M215, либо редки, либо отсутствуют. Пока ничего не найдено. [2]

Semino et al. (2004) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) в 10,4% из 48 эфиопских амхар , 12,8% из 78 эфиопских оромо , 1,9% из 53 южноафриканских банту и 2,9% из 139 сенегальцев . [4]

Wood et al. (2005) сообщили о обнаружении E-P2 (xP1, xM35) в 11% (1/9) выборки оромо из Эфиопии, 11% (1/9) выборки из Ирака из Танзании, 10% (2 / 20) смешанной выборки носителей различных южносемитских языков из Эфиопии, 6% (1/18) выборки амхара из Эфиопии, 3% (1/30) выборки овец из Ганы, 3% (1 / 32) образца Fante из Ганы, и 3% (1/34) образца Wolof из Гамбии / Сенегала. [5]

Stefflova et al. (2009) сообщили об одном человеке из выборки из 199 афроамериканцев из Филадельфии с E-P2 (xM35, xM2). [6]

Cruciani et al. (2002) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у: 18% из 22 эфиопских евреев , 2% из 49 мосси из Буркина-Фасо , 3% из 37 римаибе также из Буркина-Фасо и 6% из 17 фульбе из Камеруна . [7]

Semino et al. (2002) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у 18,2% из 88 эфиопов. [8] [9]

Moran et al. (2004) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у эфиопских спортсменов и контрольных групп и сообщили о следующих результатах; Общий контроль: 4% (4/95), контроль Арси: 8% (7/85), 5-10 км: 22% (5/23) и легкая атлетика: 11% (2/11).

Филогенетика [ править ]

Филогенетическая история [ править ]

До 2002 г. в академической литературе было по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Публикации исследований [ править ]

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании дерева YCC.

  • α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
  • β Андерхилл 2000
  • γ Hammer 2001
  • δ Карафет 2001
  • ε Семино 2000
  • ζ вс 1999
  • η Капелли 2001

Филогенетические деревья [ править ]

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве YCC 2008Karafet2008 [10] и последующих опубликованных исследованиях.

См. Также [ править ]

Генетика [ править ]

  • Африканская примесь в Европе
  • Генетическая генеалогия
  • Гаплогруппа D (Y-ДНК)
  • Гаплогруппа DE
  • Гаплогруппа
  • Гаплотип
  • Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
  • Молекулярная филогенетика
  • Парагруппа
  • Субклад
  • Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
  • Гаплогруппы Y-ДНК по этнической группе
  • Гаплогруппы Y-ДНК в популяциях Африки к югу от Сахары

Субклады Y-ДНК E [ править ]

  • Гаплогруппа E-L485
  • Гаплогруппа E-M123
  • Гаплогруппа E-M180
  • Гаплогруппа E-M215
  • Гаплогруппа E-M33
  • Гаплогруппа E-M521
  • Гаплогруппа E-M75
  • Гаплогруппа E-M96
  • Гаплогруппа E-P147
  • Гаплогруппа E-P177
  • Гаплогруппа E-P2
  • Гаплогруппа E-V12
  • Гаплогруппа E-V13
  • Гаплогруппа E-V22
  • Гаплогруппа E-M2
  • Гаплогруппа E-V65
  • Гаплогруппа E-V68
  • Гаплогруппа E-Z820
  • Гаплогруппа E-Z827

Основное дерево Y-ДНК [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ https://www.yfull.com/tree/E-P177/
  2. ^ а б Тромбетта и др. (2011)
  3. ^ Лазаридис, Иосиф; и другие. (17 июня 2016 г.). «Генетическая структура первых фермеров мира». bioRxiv 10.1101 / 059311 . - Таблица S6.1 - Гаплогруппы Y-хромосомы
  4. ^ Семино и др. (2004)
  5. ^ Вуд и др. (2005)
  6. ^ Стеффлова и др. (2009)
  7. ^ Cruciani et al. (2002)
  8. ^ Семино и др. (2002)
  9. ^ Андерхилл и др. (2000)
  10. ^ Karafet et al. (2008)

Дополнительные источники [ править ]

  • Кручиани, Фульвио; Сантоламацца, Пьеро; Шен, Пейдун; Маколей, Винсент; Мораль, Педро; Олькерс, Антонель; Модиано, Дэвид; Холмс, Сьюзен; Дестро-Бизоль, Джованни; Коя, Валентина; Уоллес, Дуглас С.; Oefner, Питер Дж .; Торрони, Антонио; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Скоццари, Розария; Андерхилл, Питер А. (2002), «Обратная миграция из Азии в Африку к югу от Сахары подтверждается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением», Американский журнал генетики человека , 70 (5): 1197–214 , DOI : 10,1086 / 340257 , PMC  447595 , PMID  11910562
  • Кручиани, Фульвио; Ла Фратта, Роберта; Сантоламацца, Пьеро; Селлитто, Даниэле; Пасконе, Роберто; Мораль, Педро; Ватсон, Элизабет; Гуида, Валентина; Коломб, Элиан Беро; Захарова, Бориана; Лавинья, Жуан; Вона, Джузеппе; Аман, Рашид; Кали, Франческо; Акар, Неджат; Ричардс, Мартин; Торрони, Антонио; Новеллетто, Андреа; Скоццари, Розарий (2004), «Анализ филогеографической гаплогруппа E3b (E-M215) Y хромосомы показывают множественное мигрирующим событие внутри и из Африки», Американский журнал генетики человека , 74 (5): 1014-22, DOI : 10,1086 / 386294 , PMC  1181964 , PMID  15042509
  • Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, SL; Молоток, MF (2008), "Новые бинарные полиморфизмы изменения формы и увеличение разрешения человеческого Y хромосомные гаплогруппы дерева", Genome Research , 18 (5): 830-8, DOI : 10,1101 / gr.7172008 , PMC  2336805 , PMID  18385274
  • Moran, Colin N .; Скотт, Роберт А .; Адамс, Сьюзен М .; Уоррингтон, Саманта Дж .; Джоблинг, Марк А .; Уилсон, Ричард Х .; Гудвин, Уильям Х .; Георгиадес, Эвелина; Вольде, Безабхе; Pitsiladis, Яннис П. (2004), "Y - хромосомы гаплогруппы элитных Эфиопский выносливость бегунов", Генетика человека , 115 (6): 492-7, DOI : 10.1007 / s00439-004-1202-у , PMID  15503146 , S2CID  13960753
  • Семино, Орнелла; Сантачиара-Бенеречетти, А. Сильвана; Фаласки, Франческо; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Андерхилл, Питер А. (2002), "эфиопы и койсанский Делите Глубочайшие клады из человеческих Y-хромосомы филогении", Американский журнал генетики человека , 70 (1): 265-268, DOI : 10,1086 / 338306 , PMC  384897 , PMID  11719903
  • Семино, Орнелла; Магри, Кьяра; Бенуцци, Джорджия; Лин, Алиса А .; Аль-Захери, Надия; Батталья, Винченца; Макчиони, Лилиана; Triantaphyllidis, Costas; Шен, Пейдун; Oefner, Питер Дж .; Животовский, Лев А .; Кинг, Рой; Торрони, Антонио; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Андерхилл, Питер А .; Сантачиара-Бенеречетти, А. Сильвана (2004), «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморском регионе», Американский журнал генетики человека , 74 (5): 1023-34, DOI : 10,1086 / 386295 , ПМК  1181965 , PMID  15069642
  • Стефлова, Клара; Дулик, Мэтью С .; Pai, Athma A .; Уокер, Эми Х .; Zeigler-Johnson, Charnita M .; Gueye, Serigne M .; Schurr, Theodore G .; Реббек, Тимоти Р. (2009), Релетфорд, Джон (редактор), «Оценка группового генетического происхождения популяций из Филадельфии и Дакара в контексте сексуально-предвзятого смешения в Америке», PLOS ONE , 4 (11): e7842, Bibcode : 2009PLoSO ... 4.7842S , doi : 10.1371 / journal.pone.0007842 , PMC  2776971 , PMID  19946364
  • Тромбетта, Бениамино; Кручиани, Фульвио; Селлитто, Даниэле; Скоццари, Розария (2011), Маколей, Винсент (редактор), «Новая топология гаплогруппы E1b1 (E-P2) Y-хромосомы человека, выявленная с помощью недавно охарактеризованных бинарных полиморфизмов», PLOS ONE , 6 (1): e16073, Bibcode : 2011PLoSO ... 616073T , doi : 10.1371 / journal.pone.0016073 , PMC  3017091 , PMID  21253605
  • Андерхилл, Питер А .; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А .; Джин, Ли; Пассарино, Джузеппе; Ян, Вэй Х .; Кауфман, Эрин; Бонне-Тамир, Батшева; Бертранпетит, Жауме; Франкалаччи, Паоло; Ибрагим, Мунтасер; Дженкинс, Трефор; Кидд, Джудит Р .; Мехди, С. Касим; Зайелстад, Марк Т .; Уэллс, Р. Спенсер; Пьяцца, Альберто; Дэвис, Рональд У .; Фельдман, Маркус В .; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Эфнер, Питер. J. (2000), "вариации Y - хромосомы последовательность и история человеческих популяций", Nature Genetics , 26 (3): 358-61, DOI : 10.1038 / восемьдесят одна тысяча шестьсот восемьдесят-пять , PMID  11062480 , S2CID  12893406
  • Вуд, Элизабет Т; Стовер, Дарин А; Эрет, Кристофер; Дестро-Бизоль, Джованни; Спедини, Габриэлла; Маклеод, Ховард; Луи, Лесли; Бамшад, Майк; Штрассманн, Беверли I; Судьял, Химла; Молоток, Майкл F (2005), "Контрастные модели Y - хромосомы и изменчивости мтДНК в Африке: данные для секс-смещена демографических процессов", Европейский журнал генетики человека , 13 (7): 867-76, DOI : 10.1038 / Sj. ejhg.5201408 , PMID  15856073

Внешние ссылки [ править ]

  • Y-ДНК гаплогруппа E и субклады от ISOGG
  • Проект ДНК Британских островов
  • E1b1.org - Международный проект Y-ДНК гаплогруппы E1b1 и ее субкладов