В генетике HAPPY Mapping , впервые предложенный Полом Х. Диром и Питером Р. Куком в 1989 году, представляет собой метод, используемый для изучения связи между двумя или более последовательностями ДНК . [1] По данным Single Molecule Genomics Group , это «картирование, основанное на анализе приблизительно HAPloid образцов ДНК с использованием полимеразной цепной реакции» . В геномике картирование HAPPY может применяться для оценки синтении и ориентации различных последовательностей ДНК в определенном геноме — создание «геномной» карты.
Как и в случае картирования сцепления , картирование HAPPY основано на дифференциальной вероятности разделения двух или более последовательностей ДНК. При генетическом картировании вероятность события рекомбинации между двумя генетическими локусами на одной и той же хромосоме прямо пропорциональна расстоянию между ними. Картирование HAPPY заменяет рекомбинацию фрагментацией — вместо того, чтобы полагаться на рекомбинацию в отдельные генетические локусы, весь геном фрагментируется, например, с помощью радиации или механического разрезания. Если ДНК разрывается случайным образом, чем больше расстояние между двумя последовательностями ДНК, тем выше вероятность разрыва между ними, и наоборот.
Картирование HAPPY сохраняет преимущества генетического картирования, устраняя при этом некоторые проблемы, связанные с рекомбинацией. Т.е. нужен полиморфизм и селекция. Кроме того, рекомбинация может быть локализованной, тогда как разрушение геномной ДНК радиацией или механическим сдвигом кажется более случайным. Он был использован для генетического картирования нескольких организмов. [2] [3]
Картирование HAPPY также было адаптировано для обеспечения точного анализа вариации числа копий и, в частности, анализа изменений числа копий при раке. [4]