В энзимологии , imidazoleglycerol-фосфат дегидратаз ( ЕС 4.2.1.19 ) представляет собой фермент , который катализирует в химическую реакцию
имидазолеглицеринфосфатдегидратаза | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
ЕС нет. | 4.2.1.19 | |||||||
№ CAS | 9024-35-5 | |||||||
Базы данных | ||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | |||||||
BRENDA | BRENDA запись | |||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | |||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | |||||||
MetaCyc | метаболический путь | |||||||
ПРИАМ | профиль | |||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Генная онтология | Amigo / QuickGO | |||||||
|
Имидазолеглицеринфосфатдегидратаза | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||
Символ | IGPD | |||||||
Pfam | PF00475 | |||||||
Клан пфам | CL0329 | |||||||
ИнтерПро | IPR000807 | |||||||
ПРОФИЛЬ | PDOC00738 | |||||||
SCOP2 | 1rhy / SCOPe / SUPFAM | |||||||
|
- D-эритро-1- (имидазол-4-ил) глицерин-3-фосфат 3- (имидазол-4-ил) -2-оксопропилфосфат + H 2 O
Таким образом, этот фермент имеет один субстрат D-эритро-1- (имидазол-4-ил) глицерин - 3-фосфат, и две продукты , 3- (имидазол-4-ил) -2-оксопропил фосфата и Н 2 O . Эта реакция является шестым шагом в биосинтезе из гистидина в бактерий , грибов и растений .
Этот фермент принадлежит к семейству лиаз , а именно к гидролазам, которые расщепляют углерод-кислородные связи. Систематическое название данного фермента класса D-эритро-1- (имидазол-4-ил) глицерин-3-фосфат - гидро-лиазы [3- (имидазол-4-ил) -2-оксопропил-фосфат-образующий] . Другие широко используемые названия включают IGP-дегидратазу и D-эритро-1- (имидазол-4-ил) глицерин-3-фосфат-гидролазу . Этот фермент участвует в метаболизме гистидина, поскольку он участвует в 6-м этапе биосинтеза гистидина как часть девятиступенчатого циклического пути.
Есть две изоформы IGPD; IGPD1 и IGPD2. Различные изоформы являются высококонсервативными, и между ними различаются только 8 аминокислот. Эти тонкие различия, однако, влияют на их активность, но пока неизвестно как.
У большинства организмов IGPD представляет собой монофункциональный белок размером примерно от 22 до 29 кДа . У некоторых бактерий, таких как Escherichia coli , именно С-концевой домен бифункционального белка включает домен гистидинол-фосфатазы . [1] В E. coli это белок, кодируемый геном hisB . [2]
Торможение
Некоторые соединения, которые ингибируют IGPD, использовались в качестве гербицидов, поскольку животные не имеют этого белка. Одним из этих ингибиторов является 3-амино-1,2,4-триазол (3-AT), который также использовался в качестве конкурентного ингибитора продукта дрожжевого гена HIS3 (другого IGPD), например, в дрожжевых двух- гибридная система . [3] [4]
Структурные исследования
По состоянию на конец 2007 г. для этого класса ферментов были решены 3 структуры с кодами доступа 1RHY , 2AE8 и 2F1D . [5]
Рекомендации
- ^ Carlomagno МС, Chiariotti л, Alifano Р, Nappo А.Г., Бруни CB (октябрь 1988 г.). «Структура и функция оперонов гистидина Salmonella typhimurium и Escherichia coli K-12». J. Mol. Биол . 203 (3): 585–606. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (88) 90194-5 . PMID 3062174 .
- ^ Brilli, M .; Фани, Р. (2004). «Молекулярная эволюция генов hisB». Журнал молекулярной эволюции . 58 (2): 225–237. Bibcode : 2004JMolE..58..225B . DOI : 10.1007 / s00239-003-2547-х . PMID 15042344 . S2CID 1684458 .
- ^ Бреннан, МБ; Струль, К. (1980-01-25). «Механизмы увеличения экспрессии дрожжевого гена в Escherichia coli». Журнал молекулярной биологии . 136 (3): 333–338. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (80) 90377-0 . ISSN 0022-2836 . PMID 6990004 .
- ^ Cagney, G .; Uetz, P .; Филдс, С. (2000). «Высокопроизводительный скрининг белок-белковых взаимодействий с использованием двухгибридного анализа». Методы в энзимологии . 328 : 3–14. DOI : 10.1016 / s0076-6879 (00) 28386-9 . ISBN 9780121822293. ISSN 0076-6879 . PMID 11075334 .
- ^ Глинн С.Е., Бейкер П.Дж., Седельникова С.Е., Дэвис К.Л., Эдсфорт Т.К., Леви К.В., Роджерс Х.Ф., Блэкберн Г.М., Хоукс Т.Р., Винер Р., Райс Д.В. (2005). «Структура и механизм имидазолеглицеринфосфатдегидратазы». Структура . 13 (12): 1809–17. DOI : 10.1016 / j.str.2005.08.012 . PMID 16338409 .
дальнейшее чтение
- AMES BN (1957). «Биосинтез гистидина; D-эритроимидазолеглицеринфосфатдегидраза». J. Biol. Chem . 228 (1): 131–43. PMID 13475302 .