| Изоцитратдегидрогеназа | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 1.1.1.42 | ||||||||
| Количество CAS | 9028-48-2 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| BRENDA | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | Amigo / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| изоцитратдегидрогеназа (НАД + ) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 1.1.1.41 | ||||||||
| Количество CAS | 9001-58-5 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| BRENDA | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Генная онтология | Amigo / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Мономерная изоцитратдегидрогеназа | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
кристаллическая структура мономерной изоцитратдегидрогеназы в комплексе с изоцитратом и mn | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | IDH | ||||||||
| Pfam | PF03971 | ||||||||
| Клан пфам | CL0270 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR004436 | ||||||||
| SCOP2 | 1ofg / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Изоцитратдегидрогеназа ( IDH ) ( EC 1.1.1.42 ) и ( EC 1.1.1.41 ) - это фермент, который катализирует окислительное декарбоксилирование изоцитрата с образованием альфа-кетоглутарата (α-кетоглутарата) и CO 2 . Это двухэтапный процесс, который включает окисление изоцитрата (вторичного спирта ) до оксалосукцината ( кетона ) с последующим декарбоксилированием бета-карбоксильной группы до кетона с образованием альфа-кетоглутарата. У человека IDH существует в трех изоформах: IDH3 катализирует третью стадиюцикл лимонной кислоты при превращении НАД + в НАДН в митохондриях . Изоформы IDH1 и IDH2 катализируют ту же реакцию вне контекста цикла лимонной кислоты и используют НАДФ + в качестве кофактора вместо НАД + . Они локализуются в цитозоле, а также в митохондриях и пероксисомах . [2]
Изоферменты [ править ]
Ниже приводится список изоферментов изоцитратдегидрогеназы человека:
НАДП + зависимый [ править ]
Каждый НАДФ + -зависимый изофермент функционирует как гомодимер:
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NAD + иждивенец [ править ]
Изоцитратдегидрогеназа 3 представляет собой гетеротетрамер, который состоит из двух альфа-субъединиц, одной бета-субъединицы и одной гамма-субъединицы:
|
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Структура [ править ]
НАД-ИДГ состоит из 3 субъединиц, регулируется аллостерически и требует интегрированного иона Mg 2+ или Mn 2+ . Ближайшим гомологом, имеющим известную структуру, является НАДФ-зависимая IDH E. coli , которая имеет только 2 субъединицы и 13% идентичности и 29% сходства на основе аминокислотных последовательностей, что делает ее непохожей на IDH человека и не подходит для близких сравнение. Все известные НАДФ-ИДГ являются гомодимерами.
Большинство изоцитратдегидрогеназ являются димерами, а именно гомодимерами (две идентичные мономерные субъединицы, образующие одно димерное звено). При сравнении C. glutamicum и E. coli , [4] мономера и димера, соответственно, было обнаружено, что оба фермента «эффективно катализируют идентичные реакции». Однако было зарегистрировано , что C. glutamicum обладает в десять раз большей активностью, чем E. coli, и в семь раз более аффинитивной / специфичной для НАДФ. C. glutamicum предпочтительнее НАДФ +, чем НАД + . Что касается стабильности в зависимости от температуры, оба фермента имели одинаковую Tm или температуру плавления примерно от 55 ° C до 60 ° C. Однако мономер C. glutamicumпоказал более стабильную стабильность при более высоких температурах, чего и следовало ожидать. Димер E. coli показал стабильность при более высокой температуре, чем обычно, из-за взаимодействий между двумя мономерными субъединицами.
Структура Mycobacterium tuberculosis (Mtb) ICDH-1, связанная с NADPH и Mn (2+), была определена с помощью рентгеновской кристаллографии. Это гомодимер, в котором каждая субъединица имеет складку Россмана и общую верхнюю область взаимосвязанных β-листов. Mtb ICDH-1 наиболее структурно сходен с мутантным R132H ICDH человека, обнаруженным в глиобластомах. Подобно человеческому R132H ICDH, Mtb ICDH-1 также катализирует образование α-гидроксиглутарата. [5]
Регламент [ править ]
Стадия IDH цикла лимонной кислоты часто (но не всегда) является необратимой реакцией в цикле лимонной кислоты из-за ее большого отрицательного изменения свободной энергии. Поэтому его необходимо тщательно регулировать, чтобы избежать истощения изоцитрата (и, следовательно, накопления альфа-кетоглутарата). Реакция стимулируется простыми механизмами доступности субстрата (изоцитрат, NAD + или NADP + , Mg 2+ / Mn 2+ ), ингибирования продукта NADH (или NADPH вне цикла лимонной кислоты) и альфа-кетоглутаратом, а также конкурентной обратной связи. ингибирование АТФ . [6]
Каталитические механизмы [ править ]
Изоцитратдегидрогеназа катализирует химические реакции :
- Изоцитрат + НАД + 2-оксоглутарат + CO 2 + НАДН + H +
- Изоцитрат + НАДФ + 2-оксоглутарат + CO 2 + НАДФН + H + [7] [8] [9]
Общая свободная энергия для этой реакции составляет -8,4 кДж / моль. [10]
Шаги [ править ]
В кислотах цикла лимонного , изоцитрат , полученный из изомеризации цитрата, претерпевает как окисление и декарбоксилирование . Используя фермент изоцитратдегидрогеназу (IDH), изоцитрат удерживается в своем активном центре за счет окружающих аминокислот аргинина , тирозина , аспарагина , серина , треонина и аспарагиновой кислоты . В первом поле показана общая реакция изоцитратдегидрогеназы. Реагентами, необходимыми для работы этого ферментного механизма, являются изоцитрат, НАД + / НАДФ +.и Mn 2+ или Mg 2+ . Продуктами реакции являются альфа-кетоглутарат , диоксид углерода и НАДН + Н + / НАДФН + Н + . [8] Молекулы воды используются для депротонирования кислорода (O3) изоцитрата.
Второй блок - это этап 1, который представляет собой окисление альфа-C (C # 2). [7] [8] Окисление - это первая стадия, через которую проходит изоцитрат. В этом процессе, [7] спирт группа от альфа-углерода (C # 2) депротонируются и электроны текут к альфа-С образуя кетон группы и удаления гидрида от C # 2 с использованием НАД + / НАДФ + , как электроноакцепторный кофактор . Окисление альфа-C позволяет создать положение, в котором электроны (на следующем этапе) будут выходить из карбоксильной группы.группа и толкает электроны (создавая двойной связанный кислород) обратно на кислород или захватывая соседний протон с соседней аминокислоты лизина .
Третье поле - это этап 2, который представляет собой декарбоксилирование оксалосукцината . На этом этапе [7] [8] кислород карбоксильной группы депротонируется близлежащей аминокислотой тирозин, и эти электроны текут вниз к углероду 2. Двуокись углерода покидает бета-углерод изоцитрата в виде уходящей группы, а электроны текут в кетон. кислород от альфа-C, создавая отрицательный заряд на кислороде альфа-C и образуя ненасыщенную двойную связь альфа-бета между атомами углерода 2 и 3. Неподеленная пара в кислороде альфа-C улавливает протон от ближайшего лизина. аминокислота.
Четвертый прямоугольник - это этап 3, который представляет собой насыщение альфа-бета-ненасыщенной двойной связи между атомами углерода 2 и 3. На этом этапе реакции [7] [8] лизин депротонирует кислород с альфа-углерода и неподеленной пары. Электронов на кислород альфа-углерода идет вниз, реформируя двойную связь кетона и отталкивая неподеленную пару (формирующую двойную связь между альфа- и бета-углеродом), забирая протон из соседней аминокислоты тирозин. [12] Эта реакция приводит к образованию альфа-кетоглутарата, НАДН + Н + / НАДФН + Н + и CO 2 .
Подробный механизм [ править ]
Два аминокислотных остатка аспартата (внизу слева) взаимодействуют с двумя соседними молекулами воды (w6 и w8) в изоцитратном свином комплексе IDH Mn 2+, чтобы депротонировать спирт с альфа-углеродного атома. Окисление альфа-С также имеет место на этой картинке, где НАД + принимает гидрид, в результате чего получается оксалосукцинат. Наряду со стереохимическим изменением sp 3 в sp 2 вокруг альфа-C, из спиртовой группы образуется кетонная группа. Образование этой двойной связи кетона позволяет иметь место резонансу, когда электроны, идущие от уходящей карбоксилатной группы, движутся к кетону.
Декарбоксилирование оксалосукцината (внизу в центре) является ключевым этапом в образовании альфа-кетоглутарата. В этой реакции неподеленная пара на соседнем гидроксиле тирозина отрывает протон от карбоксильной группы. [12] Эта карбоксильная группа также называется бета-субъединицей в молекуле изоцитрата. Депротонирование карбоксильной группы заставляет неподеленную пару электронов двигаться вниз, образуя диоксид углерода и отделяясь от оксалосукцината. Электроны продолжают двигаться к альфа-углероду, выталкивая электроны с двойной связью (образуя кетон), чтобы оторвать протон от соседнего остатка лизина. Альфа-бета-ненасыщенная двойная связь образуется между углеродом 2 и 3. Как вы можете видеть на картинке, зеленый ион представляет собой Mg 2+ или Mn 2+., который является кофактором, необходимым для протекания этой реакции. Ион металла образует небольшой комплекс в результате ионного взаимодействия с атомами кислорода на четвертом и пятом атомах углерода (также известный как гамма-субъединица изоцитрата).
После отделения диоксида углерода от оксалосукцината на стадии декарбоксилирования (внизу справа) енол будет таутомеризоваться в кето из. Образование двойной связи кетона начинается с депротонирования этого кислорода с альфа-углерода (C # 2) тем же лизином, который в первую очередь протонировал кислород. [12]Неподеленная пара электронов движется вниз, отталкивая неподеленные пары, образующие двойную связь. Эта неподеленная пара электронов отрывает протон от тирозина, который депротонировал карбоксильную группу на стадии декарбоксилирования. Причина, по которой мы можем сказать, что остатки Lys и Tyr будут такими же, как на предыдущем этапе, заключается в том, что они помогают удерживать молекулу изоцитрата в активном центре фермента. Эти два остатка будут способны образовывать водородные связи туда и обратно, пока они находятся достаточно близко к субстрату . [4]
Стадия оксидоредуктазы, на которой NAD + используется для принятия гидрида. [12] | Декарбоксилирование оксалосукцината. [12] | Насыщение альфа-бета-ненасыщенной двойной связи. [12] |
Фермент изоцитратдегидрогеназа, как указано выше, продуцирует альфа-кетоглутарат, диоксид углерода и НАДН + Н + / НАДФН + Н + . За время реакции произошло три изменения. Окисление углерода 2, декарбоксилирование (потеря диоксида углерода) углерода 3 и образование кетонной группы со стереохимическим изменением от sp 3 до sp 2 . [12]
Митохондриальная НАДФ + -зависимая изоцитратдегидрогеназа свиней в комплексе с Mn 2+ и изоцитратом. Вид поверхности кармана активного центра, где изоцитрат ограничен полярными аминокислотами. [3] | Митохондриальная НАДФ + -зависимая изоцитратдегидрогеназа свиней в комплексе с Mn 2+ и изоцитратом. [3] | Свиной ферментный комплекс; Изоцитрат активного сайта и соседние АК [3] |
Активный сайт [ править ]
Структура фермента изоцитратдегидрогеназа (IDH) в Escherichia coli была первой структурой, которая была выяснена и понята. [12] С тех пор структура IDH Escherichia coli использовалась большинством исследователей для сравнения с другими ферментами изоцитратдегидрогеназы. Об этом бактериальном ферменте известно много подробностей, и было обнаружено, что большинство изоцитратдегидрогеназ схожи по структуре и, следовательно, по функциям. Это сходство структуры и функции дает основание полагать, что структуры консервативны так же, как и аминокислоты. [9]Следовательно, активные центры среди большинства прокариотических ферментов изоцитратдегидрогеназы также должны быть сохранены, что наблюдается во многих исследованиях, проведенных на прокариотических ферментах. С другой стороны, эукариотические ферменты изоцитратдегидрогеназы еще не полностью открыты. Каждый димер IDH имеет два активных центра. [12] Каждый активный сайт связывает молекулу NAD + / NADP + и ион двухвалентного металла (Mg 2+ , Mn 2+ ). В общем, каждый активный сайт имеет консервативную последовательность аминокислот для каждого специфического сайта связывания. У Desulfotalea psychophila ( Dp IDH) [12] и свиней ( Pc IDH) [3] с активным сайтом связаны три субстрата.
- Изоцитрат связывается в активном сайте с консервативной последовательностью примерно из восьми аминокислот посредством водородных связей. Эти кислоты включают (могут различаться по остатку, но с аналогичными свойствами) тирозин, серин, аспарагин, аргинин, аргинин, аргинин, тирозин и лизин. Их положение в основной цепи различается, но все они находятся в близком диапазоне (т.е. Arg131 DpIDH и Arg133 PcIDH, Tyr138 DpIDH и Tyr140 PcIDH). [12]
- Ион металла (Mg 2+ , Mn 2+ ) связывается с тремя консервативными аминокислотами посредством водородных связей. Эти аминокислоты включают три остатка аспартата. [12]
- НАД + и НАДФ + связываются в активном центре в четырех областях с аналогичными свойствами среди ферментов IDH. Эти регионы различаются, но составляют около [250–260], [280–290], [300–330] и [365–380]. Снова регионы различаются, но близость регионов сохраняется. [12]
Клиническое значение [ править ]
Специфические мутации в гене изоцитратдегидрогеназы IDH1 были обнаружены в нескольких опухолях головного мозга, включая астроцитому , олигодендроглиому и мультиформную глиобластому , причем мутации обнаруживаются почти во всех случаях вторичных глиобластом, которые развиваются из глиом более низкой степени, но редко в первичной глиобластоме высокой степени. многоформный . [14] Пациенты, у которых опухоль имела мутацию IDH1, выживали дольше. [15] [16] Кроме того, мутации IDH2 и IDH1 были обнаружены почти в 20% цитогенетически нормальных острых миелоидных лейкозов (AML). [17] [18]Известно, что эти мутации продуцируют (D) -2-гидроксиглутарат из альфа-кетоглутарата. [19] (D) -2-гидроксиглутарат накапливается до очень высоких концентраций, что подавляет функцию ферментов, зависящих от альфа-кетоглутарата. [20] Это приводит к гиперметилированному состоянию ДНК и гистонов, что приводит к различной экспрессии генов, которые могут активировать онкогены и инактивировать гены-супрессоры опухолей. В конечном итоге это может привести к описанным выше типам рака. [21] Соматические мозаики мутации этого гена также были найдены , связанные с болезнью Ollier и синдромом маффуччи . [22]Однако недавние исследования также показали, что (D) -2-гидроксиглутарат может превращаться обратно в альфа-кетоглутарат ферментативно или неферментативно. [23] [24] Необходимы дальнейшие исследования, чтобы полностью понять роль мутации IDH1 (и (D) -2-гидроксиглутарата) при раке.
См. Также [ править ]
- Оксидоредуктаза
- Миелодиспластический синдром # мутации IDH1 и IDH2
Ссылки [ править ]
- ^ PDB : 1CW7 ; Cherbavaz DB, Lee ME, Stroud RM, Koshland DE (январь 2000 г.). «Молекулы воды с активным центром, обнаруженные в структуре разрешения 2.1 A сайт-направленного мутанта изоцитратдегидрогеназы». J. Mol. Биол . 295 (3): 377–85. DOI : 10.1006 / jmbi.1999.3195 . PMID 10623532 .
- ^ Corpas FJ, Баррозо JB, Sandalio LM, Palma JM, Lupiáñez JA, LA - дель - Рио (1999). «Пероксисомальная НАДФ-зависимая изоцитратдегидрогеназа. Характеристика и регуляция активности во время естественного старения» . Plant Physiol . 121 (3): 921–928. DOI : 10.1104 / pp.121.3.921 . PMC 59455 . PMID 10557241 .
- ^ a b c d e f PDB : 1LWD ; Чеккарелли С., Нил Б. (2002). "Кристаллическая структура свиной митохондриальной НАДФ + -зависимой изоцитратдегидрогеназы в комплексе с Mn 2+ и изоцитратом" . Журнал биологической химии . 277 (45): 43454–43462. DOI : 10.1074 / jbc.M207306200 . PMID 12207025 .
- ^ а б Чен Р., Ян Х (ноябрь 2000 г.). «Высокоспецифичная мономерная изоцитратдегидрогеназа из Corynebacterium glutamicum ». Arch. Биохим. Биофиз . 383 (2): 238–45. DOI : 10,1006 / abbi.2000.2082 . PMID 11185559 .
- ^ Quartararo CE, Hazra S, Т Хади, Бланшар JS (2013). «Структурный, кинетический и химический механизм изоцитратдегидрогеназы-1 из Mycobacterium tuberculosis» . Биохимия . 52 (10): 1765–75. DOI : 10.1021 / bi400037w . PMC 3706558 . PMID 23409873 .
- ^ Maeting, Инес; Шмидт, Георг; Sahm, Hermann; Стахманн, К.-Петер (2000). «Роль пероксисомальной НАДФ-специфической изоцитратдегидрогеназы в метаболизме избыточного продуцента рибофлавина Ashbya gossypii». Журнал молекулярного катализа B: энзиматический . 10 (1–3): 335–343. DOI : 10.1016 / S1381-1177 (00) 00135-1 .
- ^ a b c d e Тадг П. Бегли; Макмерри, Джон (2005). Органическая химия биологических путей . Робертс и Ко. Издатели. С. 189–190. ISBN 0-9747077-1-6.
- ^ a b c d e Кокс, Майкл; Нельсон, Дэвид Р .; Ленингер, Альберт Л. (2005). Принципы биохимии Ленингера . Сан-Франциско: WH Freeman. С. 609–611 . ISBN 0-7167-4339-6.
- ^ a b Ясутакэ Y, Ватанабэ S, Яо М., Такада Y, Фукунага N, Танака I (2003). «Кристаллическая структура мономерной изоцитратдегидрогеназы в присутствии НАДФ + » . Журнал биологической химии . 278 (38): 36897–36904. DOI : 10.1074 / jbc.M304091200 . PMID 12855708 .
- ^ Гарретт, Реджинальд; Гришем, Чарльз М. (2012). Биохимия . Cengage Learning. п. 621. ISBN 978-1133106296.
- ^ Aoshima M, Игараси Y (март 2008). «Недекарбоксилирующие и декарбоксилирующие изоцитратдегидрогеназы: оксалосукцинатредуктаза как предковая форма изоцитратдегидрогеназы» . Журнал бактериологии . 190 (6): 2050–5. DOI : 10.1128 / JB.01799-07 . PMC 2258884 . PMID 18203822 .
- ^ a b c d e f g h i j k l m Fedøy AE, Yang N, Martinez A, Leiros HK, Steen IH (сентябрь 2007 г.). «Структурные и функциональные свойства изоцитратдегидрогеназы из психрофильной бактерии Desulfotalea Psyrophila показывают активный холода фермент с необычно высокой термостабильностью». J. Mol. Биол . 372 (1): 130–49. DOI : 10.1016 / j.jmb.2007.06.040 . PMID 17632124 .
- ^ Шапочник Д, Zentgraf Н, Балсс Дж, Хартманн С, фон Deimling А (ноябрь 2009 г.). «Моноклональные антитела, специфичные к мутации IDH1 R132H». Acta Neuropathol . 118 (5): 599–601. DOI : 10.1007 / s00401-009-0595-Z . PMID 19798509 . S2CID 36093146 .
- ^ Bleeker, FE; Molenaar, RJ; Леенстра, S (май 2012 г.). «Последние достижения в молекулярном понимании глиобластомы» . Журнал нейроонкологии . 108 (1): 11–27. DOI : 10.1007 / s11060-011-0793-0 . PMC 3337398 . PMID 22270850 .
- ^ Hartmann C, Hentschel B, Wick W и др. (Декабрь 2010 г.). «Пациенты с анапластическими астроцитомами IDH1 дикого типа имеют худший прогноз, чем глиобластомы с мутациями IDH1, а статус мутации IDH1 объясняет неблагоприятный прогностический эффект старшего возраста: значение для классификации глиом» (PDF) . Acta Neuropathol . 120 (6): 707–18. DOI : 10.1007 / s00401-010-0781-Z . PMID 21088844 . S2CID 7323032 .
- ^ Molenaar, RJ; Verbaan, D; Ламба, S; Занон, К; Jeuken, JW; Ботинки-Шпренгер, SH; Wesseling, P; Hulsebos, TJ; Troost, D; ван Тилборг, AA; Leenstra, S; Вандертоп, В.П .; Барделли, А; van Noorden, CJ; Бликер, ИП (сентябрь 2014 г.). «Комбинация мутаций IDH1 и статуса метилирования MGMT предсказывает выживаемость при глиобластоме лучше, чем только IDH1 или MGMT» . Нейроонкология . 16 (9): 1263–73. DOI : 10.1093 / neuonc / nou005 . PMC 4136888 . PMID 24510240 .
- ^ Уорд П.С., Патель Дж., Мудрый Д.Р. и др. (Март 2010 г.). «Общей чертой связанных с лейкемией мутаций IDH1 и IDH2 является активность неоморфного фермента, превращающего альфа-кетоглутарат в 2-гидроксиглутарат» . Раковая клетка . 17 (3): 225–34. DOI : 10.1016 / j.ccr.2010.01.020 . PMC 2849316 . PMID 20171147 .
- ^ Ван Y, Сяо М, Чен X, Чен L, Сюй Y, Lv L, Ван П, Ян Х, Ма С, Лин Х, Цзяо Б., Рен Р, Йе Д, Гуань К.Л., Сюн Y (февраль 2015 г.). «WT1 рекрутирует TET2 для регулирования экспрессии своего целевого гена и подавления пролиферации лейкозных клеток» . Молекулярная клетка . 57 (4): 662–73. DOI : 10.1016 / j.molcel.2014.12.023 . PMC 4336627 . PMID 25601757 .
- ↑ Dang L, White DW, Gross S, Bennett BD, Bittinger MA, Driggers EM, Fantin VR, Jang HG, Jin S, Keenan MC, Marks KM, Prins RM, Ward PS, Yen KE, Liau LM, Rabinowitz JD, Cantley LC, Thompson CB, Vander Heiden MG, Su SM (июнь 2010 г.). «Связанные с раком мутации IDH1 продуцируют 2-гидроксиглутарат» . Природа . 465 (7300): 966. Bibcode : 2010Natur.465..966D . DOI : 10,1038 / природа09132 . PMC 3766976 . PMID 20559394 . CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ Чоудхури R, Йео KK, Тянь YM, Hillringhaus L, Бэгг EA, Rose NR, Leung IKH, Li XS, Вун EC, Ян М, МакДонох М. Кинг О, Клифтон IJ, Клозе RJ, Claridge TDW, Ratcliffe PJ, Шофилд CJ, Kawamura A (май 2011 г.). «Онкометаболит 2-гидроксиглутарат ингибирует гистоновые лизиндеметилазы» . EMBO Reports . 12 (5): 463–9. DOI : 10.1038 / embor.2011.43 . PMC 3090014 . PMID 21460794 . CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ Molenaar, RJ; Радивоевич, Т; Maciejewski, JP; van Noorden, CJ; Бликер, ИП (28 мая 2014 г.). «Драйвер и пассажир эффекты мутаций изоцитратдегидрогеназы 1 и 2 в онкогенезе и продлении выживаемости». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Обзоры рака . 1846 (2): 326–341. DOI : 10.1016 / j.bbcan.2014.05.004 . PMID 24880135 .
- ^ Amary МФ, Damato S, Halai D, Eskandarpour М, Бериша Ж, Бонар Ж, Маккарти S, Фантен В.Р., Straley К.С., Лобо S, Aston Вт, зеленый CL, Gale RE, Tirabosco R, Futreal А, Кэмпбелл Р, Presneau Н., Фланаган AM (2011). «Болезнь Олли и синдром Маффуччи вызваны соматическими мозаичными мутациями IDH1 и IDH2». Nat. Genet . 43 (12): 1262–5. DOI : 10.1038 / ng.994 . PMID 22057236 . S2CID 5592593 .
- ^ Tarhonskaya H, Rydzik AM, Leung IKH, Лоик Н.Д., Chan MC, КАВАМУРА A, McCullagh JS, Claridge TDW, Flashman E Шофилд CJ (март 2014). «Неферментативная химия делает возможным активацию 2-оксоглутарат оксигеназ, опосредованную 2-гидроксиглутаратом» . Nature Communications . 5 : 3423. Bibcode : 2014NatCo ... 5.3423T . DOI : 10.1038 / ncomms4423 . PMC 3959194 . PMID 24594748 . CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
- ^ Койвунен Р, Ли S, Дункан CG, Лопес G, Лу G, Ramkissoon S, Losman JA, Йоэнсуу Р, Bergmann U, Гросс S, Travins J, Вайс S, Лупер R, Лигон KL, Verhaak РГ, Ян Н, Келин WG Jr (февраль 2012 г.). «Трансформация (R) -энантиомером 2-гидроксиглутарата, связанного с активацией EGLN» (PDF) . Природа . 483 (7390): 484–8. Bibcode : 2012Natur.483..484K . DOI : 10,1038 / природа10898 . PMC 3656605 . PMID 22343896 . CS1 maint: использует параметр авторов ( ссылка )
Внешние ссылки [ править ]
- Изоцитратдегидрогеназа: молекула месяца RCSB PDB
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O75874 (цитоплазматическая изоцитратдегидрогеназа [NADP]) в PDBe-KB .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P48735 ( изоцитратдегидрогеназа [NADP], митохондриальная) в PDBe-KB .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P50213 (альфа-субъединица изоцитратдегидрогеназы [NAD], митохондриальная) в PDBe-KB .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O43837 (бета-субъединица изоцитратдегидрогеназы [NAD], митохондриальная) в PDBe-KB .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P51553 (гамма-субъединица изоцитратдегидрогеназы [NAD], митохондриальная) в PDBe-KB .
