Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
KCNK9
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3П1Н , 3П1О , 3П1П , 3П1Q , 3П1Р , 3П1С , 3СМК , 3СМЛ , 3СММ , 3СМН , 3СМО , 3СПР , 3UX0 , 4ФР3 , 3СП5

Идентификаторы
ПсевдонимыKCNK9 , K2p9.1, KT3.2, TASK-3, TASK3, калиевый двухпористый канал подсемейства K член 9
Внешние идентификаторыOMIM : 605874 MGI : 3521816 HomoloGene : 56758 GeneCards : KCNK9
Расположение гена ( человек )
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек) [1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение KCNK9
Геномное расположение KCNK9
Группа8q24.3Начинать139 600 838 п.н. [1]
Конец139 704 109 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 15 (мышь)
Chr.Хромосома 15 (мышь) [2]
Хромосома 15 (мышь)
Геномное расположение KCNK9
Геномное расположение KCNK9
Группа15 | 15 D3Начинать72 501 089 п.н. [2]
Конец72 546 340 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• напряжение закрытого канала активность калия
• Белки гомодимеризация активность
• белок гетеродимеризации активность
• активность калиевого канала
• калий ионного канал утечка активность
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• клеточная мембрана
• мембрана
• синаптический пузырек
• неотъемлемый компонент плазматической мембраны
Биологический процесс• перенос ионов калия
• перенос ионов
• стабилизация мембранного потенциала
• калий ионного трансмембранный транспорт
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

51305

223604

Ансамбль

ENSG00000169427

ENSMUSG00000036760

UniProt

Q9NPC2

Q3LS21

RefSeq (мРНК)

NM_001282534

NM_001033876

RefSeq (белок)

NP_001269463

NP_001029048

Расположение (UCSC)Chr 8: 139,6 - 139,7 МбChr 15: 72,5 - 72,55 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Калий канала подсемейства К элемент 9 представляет собой белок , который у человека кодируется KCNK9 гена . [5] [6] [7]

Этот ген кодирует K 2P 9.1, один из членов суперсемейства белков калиевых каналов, содержащих два порообразующих P домена. Этот открытый канал сильно выражен в мозжечке. Он ингибируется внеклеточным подкислением и арахидоновой кислотой , и сильно ингибируется форбол 12-миристат 13-ацетатом. [7] [8] Форбол 12-миристат 13-ацетат также известен как 12- O- тетрадеканоилфорбол-13-ацетат (TPA). Каналы TASK дополнительно ингибируются гормонами и передатчиками, которые передают сигнал через GqPCR. Полагают, что возникающая клеточная деполяризация регулирует такие процессы, как моторный контроль и альдостерон.секреция. Несмотря на ранних споры о точном механизме , лежащем в основе этого ингибирование, текущий вид является то , что диацил-глицерин , получает путем пробоем фосфатидилинозит-4,5-бис-фосфат с помощью фосфолипазы Cβ вызывает закрытие канала. [9]

Выражение [ править ]

Ген KCNK9 экспрессируется как ионный канал, более известный как TASK 3. Этот канал имеет разнообразный паттерн экспрессии. TASK 3 коэкспрессируется с TASK 1 ( KCNK3 ) в гранулярных клетках мозжечка, голубом пятне , мотонейронах, ядрах моста, некоторых клетках неокортекса, габенулах, гранулярных клетках обонятельной луковицы и клетках внешнего плексиформного слоя обонятельной луковицы. [10] Каналы TASK-3 также экспрессируются в гиппокампе; как на пирамидных клетках, так и на интернейронах. [11] Считается, что эти каналы могут образовывать гетеродимеры, где их выражения локализуются совместно. [12] [13]

Функция [ править ]

Мыши, у которых был удален ген TASK-3, имели пониженную чувствительность к ингаляционным анестетикам, повышенную ночную активность и когнитивный дефицит, а также значительно увеличили аппетит и прибавку в весе. [14] [15] Также была описана роль каналов TASK-3 в колебаниях нейронной сети: мыши с нокаутом TASK-3 лишены чувствительных к атропину галотана-индуцированных тета-колебаний (4-7 Гц) из гиппокампа и не могут поддерживать тета-колебания во время сна с быстрым движением глаз (REM). [15]

Интерактивная карта проезда [ править ]

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]

  1. ^ Интерактивную карту путей можно отредактировать на WikiPathways: "NicotineDopaminergic_WP1602" .

См. Также [ править ]

  • Калиевый канал с тандемной поровой областью

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000169427 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036760 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Kim Y, Bang H, Kim D (май 2000 г.). «ТАСК-3, новый член семейства тандемных каналов K (+)» . J Biol Chem . 275 (13): 9340–7. DOI : 10.1074 / jbc.275.13.9340 . PMID 10734076 . 
  6. ↑ Goldstein SA, Bayliss DA, Kim D, Lesage F, Plant LD, Rajan S (декабрь 2005 г.). "Международный союз фармакологии. LV. Номенклатура и молекулярные отношения двух-P калиевых каналов" . Pharmacol Rev . 57 (4): 527–40. DOI : 10,1124 / pr.57.4.12 . PMID 16382106 . S2CID 7356601 .  
  7. ^ a b «Ген Entrez: калиевый канал KCNK9, подсемейство K, член 9» .
  8. ^ "UniProtKB - Q9NPC2 (KCNK9_HUMAN)" . Uniprot . Проверено 29 мая 2019 .
  9. ^ Wilke, Bettina U .; Линднер, Мориц; Грайфенберг, Ли; Альбус, Александра; Кронимус, Янник; Бюнеманн, Мориц; Leitner, Michael G .; Оливер, Доминик (25 ноября 2014 г.). «Диацилглицерин опосредует регуляцию калиевых каналов TASK с помощью рецепторов, связанных с Gq» . Nature Communications . 5 (1): 5540. DOI : 10.1038 / ncomms6540 . ISSN 2041-1723 . PMID 25420509 .  
  10. ^ Бейлиса Д.А., Sirois JE, Тэлли EM (июнь 2003). «Семейство TASK: двухпористые доменные фоновые K + каналы». Молекулярные вмешательства . 3 (4): 205–19. DOI : 10.1124 / mi.3.4.205 . PMID 14993448 . 
  11. ^ Torborg CL, Berg AP, Джеффрис BW, Бейлис DA, Макбейн CJ (12 июля 2006). «TASK-подобные проводимости присутствуют в субпопуляциях интернейронов слоя CA1 гиппокампа» . Журнал неврологии . 26 (28): 7362–7. DOI : 10.1523 / jneurosci.1257-06.2006 . PMC 6674194 . PMID 16837582 .  
  12. Перейти ↑ Berg AP, Talley EM, Manger JP, Bayliss DA (28 июля 2004 г.). «Мотонейроны экспрессируют гетеромерные TWIK-связанные кислоточувствительные K + (TASK) каналы, содержащие субъединицы TASK-1 (KCNK3) и TASK-3 (KCNK9)» . Журнал неврологии . 24 (30): 6693–702. DOI : 10.1523 / jneurosci.1408-04.2004 . PMC 6729708 . PMID 15282272 .  
  13. Перейти ↑ Kang D, Han J, Talley EM, Bayliss DA, Kim D (1 января 2004 г.). «Функциональная экспрессия гетеромеров TASK-1 / TASK-3 в гранулярных клетках мозжечка» . Журнал физиологии . 554 (Pt 1): 64–77. DOI : 10.1113 / jphysiol.2003.054387 . PMC 1664745 . PMID 14678492 .  
  14. ^ Linden А.М., Aller М.И., Леппя E, Розенберг PH, Висден W, Korpi ER (октябрь 2008). «Мыши с нокаутом K + канала TASK-1 демонстрируют повышенную чувствительность к атаксическим и снотворным эффектам лигандов рецептора ГАМК (А)». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии . 327 (1): 277–86. DOI : 10,1124 / jpet.108.142083 . PMID 18660435 . S2CID 31086459 .  
  15. ^ a b Панг Д.С., Робледо С.Дж., Карр Д.Р., Гент Т.К., Высоцкий А.Л., Кейли А., Захария А.Ю., Висден В., Брикли С.Г., Фрэнкс Н.П. «Неожиданная роль калиевых каналов TASK-3 в колебаниях сети с последствиями для механизмов сна и анестезирующего действия» (PDF) . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (41): 17546–51. DOI : 10.1073 / pnas.0907228106 . PMC 2751655 . PMID 19805135 .   

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Гольдштейн С.А., Бокенхауэр Д., О'Келли I, Зильберберг Н. (2001). «Каналы утечки калия и семейство KCNK из двух P-доменных субъединиц» . Nat. Rev. Neurosci . 2 (3): 175–84. DOI : 10.1038 / 35058574 . PMID  11256078 . S2CID  9682396 .
  • Раджан С., Вишмайер Э., Синь Лю Г., Прейзиг-Мюллер Р., Даут Дж., Каршин А., Дерст С. (2000). «TASK-3, новый чувствительный к кислоте K + канал тандемного порового домена. Внеклеточный гистидинг в качестве датчика pH» . J. Biol. Chem . 275 (22): 16650–7. DOI : 10.1074 / jbc.M000030200 . PMID  10747866 .
  • Чепмен К. Г., Медоуз Х. Дж., Годден Р. Дж., Кэмпбелл Д. А., Дакворт М., Келселл Р. Э., Мердок П. Р., Рэндалл А. Д., Ренни Г. И., Глогер И. С. (2001). «Клонирование, локализация и функциональная экспрессия нового человеческого, специфичного для мозжечка, двухпорового калиевого канала». Brain Res. Мол. Brain Res . 82 (1–2): 74–83. DOI : 10.1016 / S0169-328X (00) 00183-2 . PMID  11042359 .
  • Вега-Саенс де Миера Э, Лау Д.Х., Жадина М., Паунтни Д., Кутзи В.А., Руди Б. (2001). «KT3.2 и KT3.3, два новых двухпоровых K (+) канала человека, тесно связанных с TASK-1». J. Neurophysiol . 86 (1): 130–42. DOI : 10,1152 / jn.2001.86.1.130 . PMID  11431495 .
  • Талли Э.М., Бейлисс Д.А. (2002). «Модуляция калиевых каналов TASK-1 (Kcnk3) и TASK-3 (Kcnk9): летучие анестетики и нейротрансмиттеры имеют общий молекулярный сайт действия» . J. Biol. Chem . 277 (20): 17733–42. DOI : 10.1074 / jbc.M200502200 . PMID  11886861 .
  • Раджан С., Прейзиг-Мюллер Р., Вишмайер Э., Неринг Р., Хэнли П.Дж., Ренигунта В., Мюссет Б., Шлихторл Г., Дерст С., Каршин А., Даут Дж. (2003). «Взаимодействие с белками 14-3-3 способствует функциональной экспрессии калиевых каналов TASK-1 и TASK-3» . J. Physiol . 545 (Pt 1): 13–26. DOI : 10.1113 / jphysiol.2002.027052 . PMC  2290646 . PMID  12433946 .
  • Mu D, Chen L, Zhang X, See LH, Koch CM, Yen C, Tong JJ, Spiegel L, Nguyen KC, Servoss A, Peng Y, Pei L, Marks JR, Lowe S, Hoey T, Jan LY, McCombie WR , Виглер М.Х., Пауэрс С. (2003). «Геномная амплификация и онкогенные свойства гена калиевого канала KCNK9». Раковая клетка . 3 (3): 297–302. DOI : 10.1016 / S1535-6108 (03) 00054-0 . PMID  12676587 .
  • Пей Л., Мудрый О., Славин А., Мю Д., Пауэрс С., Ян Л. Я., Хои Т. (2003). «Онкогенный потенциал TASK3 (Kcnk9) зависит от функции K + канала» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 100 (13): 7803–7. DOI : 10.1073 / pnas.1232448100 . PMC  164668 . PMID  12782791 .
  • Rusznák Z, Pocsai K, Kovács I, Pór A, Pál B, Bíró T, Szücs G (2004). «Дифференциальное распределение иммунореактивностей TASK-1, TASK-2 и TASK-3 в мозжечке крысы и человека». Клетка. Мол. Life Sci . 61 (12): 1532–42. DOI : 10.1007 / s00018-004-4082-3 . PMID  15197476 . S2CID  11439105 .
  • Кларк CE, Вил Э.Л., Грин П.Дж., Мидоуз Х.Дж., Мати А. (2005). «Селективная блокировка калиевого канала 2-P домена человека, TASK-3, и естественного тока утечки калия, IKSO, цинком» . J. Physiol . 560 (Pt 1): 51–62. DOI : 10.1113 / jphysiol.2004.070292 . PMC  1665210 . PMID  15284350 .
  • Ким СиДжей, Чо Й.Г., Чжон С.В., Ким Ю.С., Ким СИ, Нам СВ, Ли С.Х., Ю Н.Дж., Ли Джи, Пак В. «Измененная экспрессия KCNK9 при колоректальном раке». АПМИС . 112 (9): 588–94. DOI : 10.1111 / j.1600-0463.2004.apm1120905.x . PMID  15601307 . S2CID  41751315 .
  • Почсаи К., Коштка Л., Баконди Г., Генци М., Фодор Дж., Диенес Б., Сентези П., Ковач И., Фенигер-Бариш Р., Копф Е., Жархары Д., Сзуч Г., Чернох Л., Рушнак З. (2006). «Клетки меланомы проявляют сильную внутриклеточную TASK-3-специфическую иммунопозитивность как в срезах ткани, так и в культуре клеток». Клетка. Мол. Life Sci . 63 (19–20): 2364–76. DOI : 10.1007 / s00018-006-6166-8 . PMID  17013562 . S2CID  30705845 .
  • Zuzarte M, Rinné S, Schlichthörl G, Schubert A, Daut J, Preisig-Müller R (2007). «Мотив двухкислой последовательности усиливает поверхностную экспрессию калиевого канала TASK-3» . Трафик . 8 (8): 1093–100. DOI : 10.1111 / j.1600-0854.2007.00593.x . PMID  17547699 . S2CID  9662403 .

Внешние ссылки [ править ]

  • KCNK9 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9NPC2 (член K подсемейства 9 калиевых каналов) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .