Связать домен

Домен Link или модуль Link , также известный как домен Xlink (X для внеклеточного ), представляет собой белковый домен , который связывается с гиалуроновой кислотой . ^[1] Это важно для миграции клеток крови и апоптоза . ^[2] Link-домен обнаружен в некоторых внеклеточных белках позвоночных , таких как гиалектаны . ^[3] По-видимому, он участвует в сборке и стабильности внеклеточного матрикса , клеточной адгезии и миграции . ^[3]^[4]

Структура

Было показано, что структура состоит из двух альфа-спиралей и двух антипараллельных бета-листов, расположенных вокруг большого гидрофобного ядра , подобного лектину С-типа. ^[5] Этот домен содержит четыре консервативных цистеина , вовлеченных в две дисульфидные связи . Ссылочный домен также называют HABM ( модуль связывания гиалуроновой кислоты ) ^[4] и PTR (протеогликановый тандемный повтор). ^[6]

Связывающие доменные белки

Белки , которые содержат домен ссылки, включают:

гиалектаны (семейство протеогликанов ): аггрекан , бревикан , нейрокан и версикан , которые экспрессируются в ЦНС;
белок хрящевой связи (LP), протеогликан, который вместе с НА и аггреканом образует мультимолекулярные агрегаты;
Белок 6, индуцируемый фактором некроза опухоли ( TSG-6 ), который может участвовать во взаимодействиях между клетками и клетками и матриксом во время воспаления и онкогенеза;
Антиген CD44 , основной рецептор ГК на клеточной поверхности.

Смотрите также

Гиаладгерин

использованная литература

^ «Связать подпись домена и профиль» . ПРОСИТ . декабрь 2004 года . Проверено 30 сентября 2016 года .
^ Йонеда М., Накамура Т., Мураи М., Вада Х. (2010). «Доказательства способности домена Xlink асцидий связывать гепарин и понимание эволюции домена Xlink у хордовых». Джей Мол Эвол . 71 (1): 51–9. Bibcode : 2010JMolE..71 ... 51Y . doi : 10.1007/s00239-010-9363-x . PMID 20582409 . S2CID 10614265 .
^ б Хайнс, RO ; Наба, А. (21 сентября 2011 г.). «Обзор матрисомы - перечень компонентов и функций внеклеточного матрикса» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 4 (1): а004903. doi : 10.1101/cshperspect.a004903 . ПВК 3249625 . PMID 21937732 .
^ a b Барта Э., Деак Ф., Поцелуй I (июнь 1993 г.). «Эволюция гиалуронан-связывающего модуля связующего белка» . Биохим. Дж . 292 (3): 947–9. дои : 10.1042/bj2920947 . ПВК 1134205 . PMID 8318021 .
↑ Kohda D, Morton CJ, Parkar AA, Hatanaka H, Inagaki FM, Campbell ID, Day AJ (сентябрь 1996 г.). «Структура решения связующего модуля: гиалуронан-связывающий домен, участвующий в стабильности внеклеточного матрикса и миграции клеток» . Сотовый . 86 (5): 767–75. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80151-8 . PMID 8797823 . S2CID 16347386 .
↑ Brissett NC, Perkins SJ (июнь 1996 г.). «Белковая складка тандемного повторяющегося домена связывающего гиалуронат протеогликана связующего белка, аггрекана и CD44 аналогична сгибу суперсемейства лектинов C-типа». ФЕБС Летт . 388 (2–3): 211–6. doi : 10.1016/0014-5793(96)00576-5 . PMID 8690089 . S2CID 24295651 .

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR000538 .

[1] «Связать подпись домена и профиль» . ПРОСИТ . декабрь 2004 года . Проверено 30 сентября 2016 года .

[pmid20582409-2] Йонеда М., Накамура Т., Мураи М., Вада Х. (2010). «Доказательства способности домена Xlink асцидий связывать гепарин и понимание эволюции домена Xlink у хордовых». Джей Мол Эвол . 71 (1): 51–9. Bibcode : 2010JMolE..71 ... 51Y . doi : 10.1007/s00239-010-9363-x . PMID 20582409 . S2CID 10614265 .

[RH-3] б Хайнс, RO ; Наба, А. (21 сентября 2011 г.). «Обзор матрисомы - перечень компонентов и функций внеклеточного матрикса» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 4 (1): а004903. doi : 10.1101/cshperspect.a004903 . ПВК 3249625 . PMID 21937732 .

[pmid8318021-4] Барта Э., Деак Ф., Поцелуй I (июнь 1993 г.). «Эволюция гиалуронан-связывающего модуля связующего белка» . Биохим. Дж . 292 (3): 947–9. дои : 10.1042/bj2920947 . ПВК 1134205 . PMID 8318021 .

[pmid8797823-5] ↑ Kohda D, Morton CJ, Parkar AA, Hatanaka H, Inagaki FM, Campbell ID, Day AJ (сентябрь 1996 г.). «Структура решения связующего модуля: гиалуронан-связывающий домен, участвующий в стабильности внеклеточного матрикса и миграции клеток» . Сотовый . 86 (5): 767–75. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80151-8 . PMID 8797823 . S2CID 16347386 .

[pmid8690089-6] Brissett NC, Perkins SJ (июнь 1996 г.). «Белковая складка тандемного повторяющегося домена связывающего гиалуронат протеогликана связующего белка, аггрекана и CD44 аналогична сгибу суперсемейства лектинов C-типа». ФЕБС Летт . 388 (2–3): 211–6. doi : 10.1016/0014-5793(96)00576-5 . PMID 8690089 . S2CID 24295651 .

[1]