Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску Эта статья
требует дополнительных ссылок для проверки .
Пожалуйста, помогите улучшить эту статью , добавив цитаты из надежных источников . Материал, не полученный от источника, может быть оспорен и удален. Найти источники: «Список программ визуализации системной биологии» - новости · газеты · книги · ученый · JSTOR ( ноябрь 2020 г. ) ( Узнайте, как и когда удалить это сообщение-шаблон )
Онлайн-программное обеспечение [ править ] Имя Описание Сайт ГЕСТАЛЬТ Верстак графический инструмент для анализа крупномасштабных данных геномной последовательности [1] N-Просмотр интерактивный графический браузер для биологических сетей [2] NetPath кураторский ресурс путей передачи сигналов от человека [3] МЕГА бесплатно, онлайн, с открытым исходным кодом, филогенетический анализ, рисование дендрограмм и т. д. [4] РЕАКТАЦИЯ бесплатная онлайн-база данных с открытым исходным кодом и курируемая база данных путей, охватывающая многие области биологии человека [5] WikiPathways курировать биологические пути [6] MetaboMAPS визуализировать данные omics об общих метаболических путях [1] [7]
Приложения [ править ] Имя Описание Операционные системы Лицензия Сайт БиоГобелен интерактивный инструмент для построения, визуализации и моделирования сетей генетического регулирования мультиплатформенный (на основе Java) LGPL [8] Cytoscape интеграция данных, визуализация сети и анализ мультиплатформенный (на основе Java) LGPL [9] GenMAPP визуализировать и анализировать геномные данные в контексте путей Окна Лицензия Apache [10] MATLAB инструмент для моделирования, моделирования и анализа динамических биологических систем Windows, Linux, macOS Проприетарный [11] МЕГА бесплатно, онлайн, с открытым исходным кодом, филогенетический анализ, рисование дендрограмм и т. д. Windows / DOS-Win / Mac / Linux Условно-бесплатное ПО [12] PathVisio инструмент для отображения и редактирования биологических путей мультиплатформенный (на основе Java) Лицензия Apache [13] InCroMAP инструмент для интеграции данных omics и совместной визуализации экспериментальных данных в путях мультиплатформенный (на основе Java) LGPL [14] Просмотр пути интеграция и визуализация данных на основе путей, проста в использовании и интегрируется в анализ путей мультиплатформенный (R / Bioconductor) GPL [15] [16] Systrip анализ данных временных рядов в контексте биологических сетей Windows , Linux LGPL , GPL[17]
Ссылки [ править ] ^ Коблиц Дж, Шомбург Д и Нейман-Шааль М., «MetaboMAPS: обмен Пути и мульти-omics визуализация данных в контексте обмена веществ» , F1000Research , 17 июля 2020. 
