Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
MMP8
Белок MMP8 PDB 1a85.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1A86 , 1JAP , 1I76 , 1ZVX , 3TT4 , 2OY2 , 1ZS0 , 1JAN , 1MMB , 1I73 , 1A85 , 1KBC , 1ZP5 , 1JH1 , 3DPF , 1JAQ , 3DPE , 1BZS , 4QKZ , 1JAO , 3DNG , 2OY4 , 1JAO , 3DNG , 2OY4

Идентификаторы
ПсевдонимыMMP8 , CLG1, HNC, MMP-8, PMNL-CL, матричная металлопептидаза 8
Внешние идентификаторыOMIM: 120355 MGI: 1202395 HomoloGene: 22482 Генные карты : MMP8
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человека) [1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение MMP8
Геномное расположение MMP8
Группа11q22.2Начинать102 711 796 п.н. [1]
Конец102 727 050 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Chr.Хромосома 9 (мышь) [2]
Группа9 | 9 A1Начинать7 558 456 п.н. [2]
Конец7 568 485 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ион цинк связывание
• пептидазы активности
• гидролазы активности
• metallopeptidase активности
• ион металла связывания
• серин-тип эндопептидаза активность
• metalloendopeptidase активность
• эндопептидаза активность
Сотовый компонент• внеклеточный матрикс
• внеклеточная область
• специфический просвет гранулы
• просвет третичной гранулы
• внеклеточный
• внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
Биологический процесс• катаболический процесс коллагена
• разборка внеклеточного матрикса
• дифференцировка энтодермальных клеток
• протеолиз
• дегрануляция нейтрофилов
• позитивная регуляция экспрессии генов
• негативная регуляция экспрессии гена
• негативная регуляция выработки интерлейкина-10
• позитивная регуляция продукции интерлейкина-6
• позитивная регуляция ДНК связывание
• позитивная регуляция каскада MAPK
• позитивная регуляция процесса биосинтеза оксида азота
• позитивная регуляция каскада JNK
• регуляция нейровоспалительного ответа
• позитивная регуляция нейровоспалительного ответа
• позитивная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB
• позитивная регуляция процесса биосинтеза активных форм кислорода
• регуляция активации микроглиальных клеток
• позитивная регуляция активации микроглиальных клеток
• организация внеклеточного матрикса
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

4317

17394

Ансамбль

ENSG00000118113

ENSMUSG00000005800

UniProt

P22894

O70138

RefSeq (мРНК)

NM_001304441
NM_001304442
NM_002424

NM_008611

RefSeq (белок)

NP_001291370
NP_001291371
NP_002415

NP_032637

Расположение (UCSC)Chr 11: 102,71 - 102,73 МбChr 9: 7.56 - 7.57 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нейтрофильная коллагеназа , также известная как матриксная металлопротеиназа-8 (MMP-8) или коллагеназа PMNL (MNL-CL), представляет собой фермент, расщепляющий коллаген, который присутствует в соединительной ткани большинства млекопитающих. [5] В организме человека ММР8 белок кодируется ММР8 гена . [6] [7] Ген является частью кластера генов MMP, локализованных на хромосоме 11q22.3. [5] Большинство ММП секретируются в виде неактивных пропротеинов, которые активируются при расщеплении внеклеточными протеиназами. Однако фермент, кодируемый этим геном, хранится во вторичных гранулах внутри нейтрофилов и активируется автолитическим расщеплением.

Функция [ править ]

Белки семейства матриксных металлопротеиназ (ММП) участвуют в разрушении внеклеточного матрикса в нормальных физиологических процессах, таких как эмбриональное развитие, размножение и ремоделирование тканей, а также в болезненных процессах, таких как артрит и метастазирование. Основная функция MMP-8 - разрушение коллагенов I, II и III типов. При раке потеря MMP-8 в мышиной модели рака молочной железы MMTV-PyMT была связана с усилением роста опухоли и метастатической нагрузкой, а также с усилением васкуляризации опухоли и измененной инфильтрацией иммунных клеток. [8]Кроме того, анализ MMP-8 в клеточных линиях рака молочной железы выявил причинную связь между активностью MMP-8 и продуцированием IL6 и IL8, предполагая роль MMP-8 в регуляции врожденной иммунной системы. [9]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000118113 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005800 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Entrez: матричная металлопептидаза 8 MMP8 (нейтрофильная коллагеназа)» .
  6. ^ Hasty KA, Pourmotabbed TF, Goldberg GI, Thompson JP, Spinella DG, Stevens RM, Mainardi CL (июль 1990). «Коллагеназа нейтрофилов человека. Отдельный генный продукт с гомологией с другими матриксными металлопротеиназами» . J. Biol. Chem . 265 (20): 11421–4. PMID 2164002 . 
  7. ^ Devarajan P, K Mookhtiar, Ван Варт H, Berliner N (июнь 1991). «Структура и экспрессия кДНК, кодирующей коллагеназу нейтрофилов человека» . Кровь . 77 (12): 2731–8. DOI : 10.1182 / blood.V77.12.2731.2731 . PMID 1646048 . [ постоянная мертвая ссылка ]
  8. ^ Декок, Джули; Хендрикс, Воутер; Тиркеттл, Салли; Гутьеррес-Фернандес, Ана; Робинсон, Стивен Д; Эдвардс, Дилан Р. (2015). «Плейотропные функции подавляющей опухоль и метастазы матричной металлопротеиназы-8 при раке молочной железы у трансгенных мышей MMTV-PyMT» . Рак молочной железы Res . 17 : 38. DOI : 10,1186 / s13058-015-0545-8 . PMC 4380014 . PMID 25848906 .  
  9. ^ Тиркеттл, Салли; Декок, Джули; Арнольд, Хью; Пеннингтон, Кэролайн Дж; Jaworski, Diane M; Эдвардс, Дилан Р. (2013). «Матриксная металлопротеиназа 8 (коллагеназа 2) индуцирует экспрессию интерлейкинов 6 и 8 в клетках рака груди» . J Biol Chem . 288 (23): 16282–16294. DOI : 10.1074 / jbc.M113.464230 . PMC 3675567 . PMID 23632023 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Чандлер С., Миллер К.М., Клементс Дж. М. и др. (1997). «Матричные металлопротеиназы, фактор некроза опухолей и рассеянный склероз: обзор». J. Neuroimmunol . 72 (2): 155–61. DOI : 10.1016 / S0165-5728 (96) 00179-8 . PMID  9042108 . S2CID  26495949 .
  • Массова И., Котра Л.П., Фридман Р., Mobashery S (1998). «Матричные металлопротеиназы: структуры, эволюция и диверсификация». FASEB J . 12 (25n26): 1075–95. CiteSeerX  10.1.1.31.3959 . DOI : 10.1142 / S0217984998001256 . PMID  9737711 .
  • Нагасе Х., Весснер Дж. Ф. (1999). «Матричные металлопротеиназы» . J. Biol. Chem . 274 (31): 21491–4. DOI : 10.1074 / jbc.274.31.21491 . PMID  10419448 .
  • Bläser J, Triebel S, Reinke H, Tschesche H (1992). «Образование ковалентной связи Hg-Cys во время ртутной активации проколлагеназы PMNL свидетельствует о механизме переключения цистеина» . FEBS Lett . 313 (1): 59–61. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (92) 81184-N . PMID  1330697 . S2CID  36829374 .
  • Девараджан П., Мухтияр К., Ван Варт Х., Берлинер Н. (1991). «Структура и экспрессия кДНК, кодирующей коллагеназу нейтрофилов человека» . Кровь . 77 (12): 2731–8. DOI : 10.1182 / blood.V77.12.2731.2731 . PMID  1646048 .
  • Bläser J, Knäuper V, Osthues A, et al. (1992). «Ртутная активация проколлагеназы полиморфноядерных лейкоцитов человека» . Евро. J. Biochem . 202 (3): 1223–30. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1991.tb16494.x . PMID  1662606 .
  • Knäuper V, Krämer S, Reinke H, Tschesche H (1990). «Характеристика и активация проколлагеназы из полиморфноядерных лейкоцитов человека. Определение N-концевой последовательности профермента и различных протеолитически активированных форм» . Евро. J. Biochem . 189 (2): 295–300. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1990.tb15489.x . PMID  2159879 .
  • Hasty KA, Pourmotabbed TF, Goldberg GI, et al. (1990). «Коллагеназа нейтрофилов человека. Отдельный генный продукт с гомологией с другими матриксными металлопротеиназами». J. Biol. Chem . 265 (20): 11421–4. PMID  2164002 .
  • Knäuper V, Krämer S, Reinke H, Tschesche H (1990). «Неполная аминокислотная последовательность проколлагеназы лейкоцитов человека PMN». Биол. Chem. Хоппе-Зейлер . 371 Дополнение: 295–304. PMID  2169256 .
  • Knäuper V, Krämer S, Reinke H, Tschesche H (1990). «Неполная аминокислотная последовательность проколлагеназы лейкоцитов человека PMN». Биол. Chem. Хоппе-Зейлер . 371 (8): 733–734. DOI : 10.1515 / bchm3.1990.371.2.733 . PMID  2169766 .
  • Малля С.К., Мухтияр К.А., Гао Ю.и др. (1991). «Характеристика коллагеназы нейтрофилов человека 58 килодальтон: сравнение с коллагеназой фибробластов человека». Биохимия . 29 (47): 10628–34. DOI : 10.1021 / bi00499a008 . PMID  2176876 .
  • Штамс Т., Спурлино Дж. К., Смит Д. Л. и др. (1995). «Структура коллагеназы нейтрофилов человека выявляет большой карман специфичности S1 '». Nat. Struct. Биол . 1 (2): 119–23. DOI : 10.1038 / nsb0294-119 . PMID  7656015 . S2CID  35458800 .
  • Fosang AJ, Last K, Neame PJ и др. (1995). «Нейтрофильная коллагеназа (ММР-8) расщепляет аггреканазный сайт E373-A374 в межглобулярном домене аггрекана хряща» . Biochem. Дж . 304 (2): 347–51. DOI : 10.1042 / bj3040347 . PMC  1137499 . PMID  7998967 .
  • Боде В., Рейнемер П., Хубер Р. и др. (1994). «Рентгеновская кристаллическая структура каталитического домена коллагеназы нейтрофилов человека, ингибируемая аналогом субстрата, выявляет основы катализа и специфичности» . EMBO J . 13 (6): 1263–9. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06378.x . PMC  394940 . PMID  8137810 .
  • Fosang AJ, Last K, Knäuper V и др. (1993). «Коллагеназы фибробластов и нейтрофилов расщепляются на двух участках в агреканском межглобулярном домене хряща» . Biochem. Дж . 295 (1): 273–6. DOI : 10.1042 / bj2950273 . PMC  1134849 . PMID  8216228 .
  • Райнемер П., Грамм Ф., Хубер Р. и др. (1994). «Структурные последствия роли N-конца в« суперактивации »коллагеназ. Кристаллографическое исследование» . FEBS Lett . 338 (2): 227–33. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (94) 80370-6 . PMID  8307185 . S2CID  2454182 .
  • Томас ДБ, Дэвис М., Петерс Дж. Р., Уильямс Дж. Д. (1993). «Белок Тамма Хорсфалла связывается с одним классом специфичных для углеводов рецепторов на нейтрофилах человека» . Kidney Int . 44 (2): 423–9. DOI : 10.1038 / ki.1993.260 . PMID  8397318 .
  • Коул А.А., Чубинская С., Шумахер Б. и др. (1996). «Металлопротеиназа-8 матрикса хондроцитов. Хондроциты суставов человека экспрессируют нейтрофильную коллагеназу» . J. Biol. Chem . 271 (18): 11023–6. DOI : 10.1074 / jbc.271.18.11023 . PMID  8631924 .
  • Накахара Ю., Мията Т., Хамуро Т. и др. (1996). «Аминокислотная последовательность и углеводная структура ингибитора пути рекомбинантного тканевого фактора человека, экспрессируемого в клетках яичника китайского хомячка: одна N- и две O-связанные углеводные цепи расположены между доменами 2 и 3 Кунитца, а одна N-связанная углеводная цепь находится в Kunitz домен 2 ". Биохимия . 35 (20): 6450–9. DOI : 10.1021 / bi9524880 . PMID  8639592 .
  • Пендас А.М., Сантамария I, Альварес М.В. и др. (1997). «Тонкое физическое картирование генов матричной металлопротеиназы человека, сгруппированных на хромосоме 11q22.3». Геномика . 37 (2): 266–8. DOI : 10.1006 / geno.1996.0557 . PMID  8921407 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: M10.002