Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Институт генома Макдоннелла
Учредил1993 г.
Поле исследований
ДиректорДжеффри Милбрандт
Место расположенияСент-Луис, штат Миссури
Принадлежности
Интернет сайтgenome.wustl.edu
Расположение Института генома Макдоннелла

Институт генома Макдоннелла ( Институт генома Элизабет Х. и Джеймса С. Макдоннелла III ) при Вашингтонском университете в Сент-Луисе , штат Миссури , является одним из трех крупномасштабных центров секвенирования в Соединенных Штатах, финансируемых Национальными институтами здравоохранения . [1] Связанный с Медицинской школой Вашингтонского университета и Онкологическим центром Элвина Дж. Ситмана , Институт генома Макдоннелла создает, тестирует и внедряет новые подходы к изучению геномики с целью понимания здоровья и болезней человека, а также эволюции. и биология других организмов.

История [ править ]

Основанный в 1993 году Институт генома Макдоннелла, ранее бывший Центром секвенирования генома и Институтом генома, начинал как ключевой игрок в Проекте генома человека , внося в конечном итоге более 25 процентов готовой последовательности. [2] После завершения рабочего проекта генома человека в 2000 г. и окончательной последовательности генома человека в 2003 г. McDonnell Genome Institute направил свои навыки секвенирования и анализа на определение геномов многих других организмов, чтобы предоставить первые эталонные последовательности. для этих видов. [3]В 2014 году общественные деятели и давние филантропы Элизабет Х. и Джеймс С. Макдоннелл III пообещали выделить 25 миллионов долларов Институту генома, который был переименован в Институт генома Элизабет Х. и Джеймса С. Макдоннелл III в Вашингтонском университете. [4]

Проекты [ править ]

  • Атлас генома рака сравнивает последовательности ДНК взрослых больных раком и их опухоли, чтобы определить генетические изменения, важные для рака.
  • Проект "Микробиом человека" занимается секвенированием геномов микробов, влияющих на здоровье и болезни человека.
  • Проект «1000 геномов» стремится каталогизировать огромные человеческие вариации, записанные в генетический код.
  • Инициатива по раковому геному Вашингтонского университета предусматривает секвенирование сотен образцов опухолевых и нормальных геномов.
  • Проект «Геном детского рака» - это сотрудничество с Детской исследовательской больницей Сент-Джуда, целью которого является выявление генетических изменений, которые вызывают одни из самых смертоносных детских онкологических заболеваний в мире.
  • Медицинское секвенирование нацелено на последовательности заболеваний, таких как метаболические синдромы и нарушения зрения, чтобы помочь индивидуализировать лечение пациента.

Персонал [ править ]

В McDonnell Genome Institute работают более 300 преподавателей и сотрудников различных специальностей. Основной персонал включает:

Джеффри Милбрандт , доктор медицины, доктор философии: Доктор Милбрандт является исполнительным директором Института генома Макдоннелла.

Действия [ править ]

Повторное секвенирование всего генома : Группа повторного секвенирования всего генома занимается разработкой и оптимизацией процесса отбора образцов, производственного секвенирования и анализа последовательностей для геномных исследований болезней человека с упором на рак.

Сборка De Novo: Группа сборки De Novo несет ответственность за сбор секвенированных частей геномов различных видов и объединение их как можно более связно и точно.

Микробная геномика: Группа микробной геномики представляет ряд мероприятий, от секвенирования отдельных бактерий до исследований популяционной геномики видов микробов и анализа сложных метагеномных образцов.

Целевое повторное секвенирование: Группа целевого повторного секвенирования секвенирует определенные области геномов с использованием нескольких различных методов, включая ПЦР, а также методы гибридной селекции.

Транскриптомы: Группа транскриптомов работает над различными аспектами секвенирования и анализа транскриптомов на основе секвенирования РНК следующего поколения.

Данные [ редактировать ]

Институт генома Макдоннелла делает все данные о последовательностях доступными для исследовательского сообщества в ожидании соответствующего анализа качества. Некоторые из этих данных являются предварительными и могут содержать ошибки и пропуски. Данные также изменяются в зависимости от наличия новых версий данных и сборок.

В соответствии с политикой публикации данных NHGRI , все пользователи должны указывать McDonnell Genome Institute в качестве источника данных. [5]

Информационная поддержка [ править ]

Информационно-пропагандистский отдел Института генома Макдоннелла был создан в 2003 году в ответ на План действий Национального института исследования генома человека в отношении меньшинств. [6]С момента своего создания Outreach проводит мероприятия, которые служат для обучения школьников и общества в целом геномике и роли, которую Институт генома Макдоннелла играет в этой области. Информационно-пропагандистская деятельность привлекла тысячи посетителей посредством туров, презентаций, научных ярмарок и различных выездных мероприятий. Департамент создал возможности в исследованиях в области геномики, целью которых является увеличение числа недостаточно представленных меньшинств, получивших докторские степени в области геномики / генетики. В рамках OGR были реализованы две программы, которые предоставляют исследовательские возможности студентам (бакалавриат) и недавним выпускникам колледжей (экстенсивное обучение).

Услуги [ править ]

Институт генома Макдоннелла расположен в кампусе Медицинской школы Вашингтонского университета в Сент-Луисе, штат Миссури, по адресу 4444 Forest Park Avenue. До него можно добраться на метро (станция Central West End).

У института генома Макдоннелла есть отдельный центр обработки данных, расположенный через дорогу на 222 Newstead Avenue. ЦОД стоимостью 20 миллионов долларов и площадью 16 000 квадратных футов был построен с полностью резервированными системами питания и охлаждения, способными вместить более 100 стоек с вычислительными системами и системами хранения высокой плотности.

Центр обработки данных McDonnell Genome Institute - первое «зеленое» здание на территории медицинского факультета, получившее золотой статус Leadership in Energy and Environment Design (LEED) от Совета по экологическому строительству США . [7] В центре обработки данных также находится устаревшее серверное помещение площадью 1 200 кв. Футов (110 м 2 ) с фальшполами, резервным питанием и охлаждением.

Ссылки [ править ]

  1. ^ Арбанас, Каролина (30 ноября 2006). «Геномный центр получает 156 миллионов долларов» . Вашингтонский университет в Сент-Луисе . Проверено 29 июля 2012 года .
  2. ↑ Парди, Майкл (21 октября 2004 г.). «Геномный центр вносит основной вклад в« законченную »последовательность генома человека» . Вашингтонский университет в Сент-Луисе . Проверено 29 июля 2012 года .
  3. ↑ Драйден, Джим (23 апреля 2003 г.). «Проект генома человека завершен» . Вашингтонский университет в Сент-Луисе . Проверено 29 июля 2012 года .
  4. ^ Персонал журнала Outlook. (1 апреля 2015 г.). «Новое имя, новая эра» . Вашингтонский университет в Сент-Луисе. Архивировано из оригинала на 3 мая 2015 года . Проверено 1 мая 2015 года .
  5. ^ «Подтверждение и расширение политики быстрого выпуска данных NHGRI» . genome.gov . Национальный институт исследования генома человека. Февраль 2003 . Проверено 29 июля 2012 года .
  6. ^ «О плане действий NHGRI в отношении меньшинств» . genome.gov . Национальный институт исследования генома человека. 23 февраля 2012 . Проверено 29 июля 2012 года .
  7. ^ Арбанас Каролина (21 октября 2009). «Центр обработки данных Genome Center получил сертификат LEED Gold» . Вашингтонский университет в Сент-Луисе . Проверено 29 июля 2012 года .

Внешние ссылки [ править ]

  • Официальный веб-сайт

Координаты : 38 ° 38′13,7 ″ с.ш., 90 ° 15′24,8 ″ з.д. / 38,637139 ° с.ш. 90,256889 ° з. / 38.637139; -90,256889