РНК micF представляет собой некодирующие РНК гена реакция на стресс найдены в кишечной палочки и связанных с ними бактерий , которые посттранскрипционно контролирует экспрессию гена наружной мембраны поринового OmpF. [1] Ген micF кодирует нетранслируемую антисмысловую РНК из 93 нуклеотидов, которая связывает свою мРНК- мишень ompF и регулирует экспрессию ompF путем ингибирования трансляции.и ухудшение качества сообщения. Кроме того, другие факторы, такие как белок-шаперон РНК StpA, также играют роль в этой регуляторной системе. Выражение micF контролируется факторами окружающей среды и внутреннего стресса. Известно, что четыре регулятора транскрипции связываются с промоторной областью micF и активируют экспрессию micF.
MicF РНК | |
---|---|
Идентификаторы | |
Символ | MicF |
Рфам | RF00033 |
Прочие данные | |
Тип РНК | Джин ; антисмысловой |
Домен (ы) | Бактерии |
ИДТИ | GO: 0006950 GO: 0003729 |
ТАК | ТАК: 0000383 |
Структуры PDB | PDBe |
Распространение видов
Гомологи РНК MicF были охарактеризованы методом Саузерн-блоттинга для различных бактерий, включая Salmonella typhimurium , Klebsiella pneumoniae и Pseudomonas aeruginosa . [2] MicF также был идентифицирован компьютерным путем у Yersinia pestis и Yersinia enterocolitica . [3]
Рекомендации
- ^ Delihas N, Форст S (октябрь 2001). «MicF: ген антисмысловой РНК, участвующий в ответе Escherichia coli на глобальные стрессовые факторы». Журнал молекулярной биологии . 313 (1): 1–12. DOI : 10.1006 / jmbi.2001.5029 . PMID 11601842 .
- ^ Эстерлинг Л., Делихас Н. (май 1994 г.). «Регуляторный ген РНК micF присутствует у нескольких видов грамотрицательных бактерий и филогенетически консервативен». Молекулярная микробиология . 12 (4): 639–646. DOI : 10.1111 / j.1365-2958.1994.tb01051.x . PMID 7523827 . S2CID 24389234 .
- ^ Делихас Н. (июнь 2003 г.). «Аннотации и эволюционные отношения небольшого регуляторного гена РНК micF и его мишени ompF у видов Yersinia» . BMC Microbiology . 3 : 13. DOI : 10,1186 / 1471-2180-3-13 . PMC 166144 . PMID 12834539 .