Negativicutes

Negativicutes
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Фирмикуты
Класс:	Negativicutes Marchandin et al. 2010 г.
Заказы и семьи
Selenomonadales Marchandin et al. 2010 исправление. Кэмпбелл и др. 2015 г. Selenomonadaceae Campbell et al. 2015 г. Sporomusaceae Campbell et al. 2015 г. Acidaminococcales Campbell et al. 2015 г. Acidaminococcaceae Marchandin et al. 2010 исправление. Кэмпбелл и др. 2015 г. Veillonellales Campbell et al. 2015 г. Veillonellaceae Рогоза 1969 исправлять. Кэмпбелл и др. 2015 г.

В Negativicutes является классом из бактерий в филюме Firmicutes , члены которого имеют стенки клеток свойственны с липополисахаридом внешней мембраной , который окрашивает грамотрицательный , в отличии от большинства других членов Firmicutes . ^[1] Хотя несколько соседних видов Clostridia (бактерии-фирмикуты) также окрашивают грамотрицательные, белки, ответственные за необычную дидермальную структуру Negativicutes , на самом деле могли быть получены латерально от Proteobacteria . ^{[1] [2] [3][4]} Требуются дополнительные исследования, чтобы подтвердить происхождение оболочки клеток дидерм у Negativicutes.

Большинство представителей этого класса являются облигатными анаэробами и встречаются в таких средах обитания, как реки, озера и кишечник позвоночных. Они варьируются от сферических форм, таких как Megasphaera и Veillonella , до изогнутых стержней, так как характеризуютс selenomonads . Selenomonas имеет характерную серповидную форму со жгутиками, вставленными на вогнутой стороне, в то время как Sporomusa похожа, но неподвижна. Их имена относятся к этой отличительной морфологии: селене означает луна, а муса означает банан . ^[5] Шейх Саньет

Таксономия [ править ]

В настоящее время класс состоит из 32 правомерных родов трех отрядов и четырех семейств. ^{[6] [7]} Заказы Veillonellales и Acidaminococcales каждый из которых содержит одну семью, Veillonellaceae и Acidaminococcaceae , соответственно, в то время как порядок Selenomonadales содержит два семейства, Selenomonadaceae и Sporomusaceae. ^[7]

Молекулярные подписи [ править ]

Исторически Negativicutes состояли из одного отряда Selenomonadales и двух семейств Veillonellaceae и Acidaminococcaceae на основе сходства последовательностей гена 16S рРНК. ^{[8] [9]} Однако в эти группы не входили несколько членов Negativicutes, которые разветвлялись за пределами двух семейств. Текущее таксономическое представление включает этих членов, которые были правомерно отнесены к семействам Selenomonadaceae и Sporomusaceae в измененном порядке Selenomonadales. ^[7] Молекулярные маркеры в виде консервативных инделей подписи.(CSI) и белки (CSP) оправдывают нынешнее таксономическое деление. Эти молекулярные маркеры находятся в каждом таксономическом ранге, и их распределение согласуется с наблюдаемым филогенетическим ветвлением. ^{[10] [11]}

Многие работы предполагают, что Negativicutes следует реклассифицировать как отряд внутри класса Clostridia на основании близкого филогенетического ветвления и наблюдения, что спорообразующие члены Negativicutes имеют общие гены споруляции, что и Clostridia, и что оба окрашивают грампластинки. отрицательный. ^{[10] [11]} Однако неоднородность членов внутри Negativicutes, а также распределение молекулярных сигнатур, поддерживает точку зрения, что Negativicutes фактически являются независимым классом внутри Firmicutes, с Clostridia как их ближайшими филогенетическими соседями. ^{[9] [11] [12] [13]}Кроме того, было обнаружено, что несколько CSI и CSP являются уникально общими для всех Negativicutes, в то время как CSI не являются общими для Negativicutes и Clostridia . ^[7]

Филогения [ править ]

В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) ^[14] и Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) ^[15]

• Selenomonadales Marchandin et al. 2010 исправление. Кэмпбелл и др. 2015 г.
  • Selenomonadaceae Campbell et al. 2015 г.
    • Anaerovibrio Hungate 1966 г.
    • Centipeda (бактерии) Lai et al. 1983 г.
    • Мегамонас Шах и Коллинз, 1983
    • Мицуокелла Шах и Коллинз 1983
    • Pectinatus Lee et al. 1978 исправление. Ювонен и Суйко 2006
    • Propionispira Schink et al. 1983 г.
    • Schwartzia van Gylswyk et al. 1997 г.
    • Selenomonas фон Prowazek 1913
    • Zymophilus Schleifer et al. 1990 г.
  • Sporomusaceae Campbell et al. 2015 г.
    • Ацетонема Кейн и Брезнак 1992 г.
    • Anaeroarcus Strömpl et al. 1999 г.
    • Anaeromusa Baena et al. 1999 г.
    • Anaerosinus Strömpl et al. 1999 г.
    • Anaerospora ♠ Woo et al. 2005 г.
    • Dendrosporobacter Strömpl et al. 2000 г.
    • Desulfosporomusa ♠ Sass et al. 2004 г.
    • Pelosinus Shelobolina et al. 2007 г.
    • Propionispora Biebl et al. 2001 г.
    • Psychrosinus ♠ Sattley et al. 2008 г.
    • Sporolituus Ogg и Patel 2009
    • Sporomusa Möller et al. 1985 г.
    • Thermosinus Sokolova et al. 2004 г.
• Acidaminococcales Campbell et al. 2015 г.
  • Acidaminococcaceae Marchandin et al. 2010 исправление. Кэмпбелл и др. 2015 г.
    • Acidaminococcus Рогоза 1969 исправлять. Юмас-Билак и др. 2007 г.
    • Phascolarctobacterium Del Dot et al. 1994 г.
    • Succiniclasticum ван Gylswyk 1995
    • Сукциниспира Янссен и О'Фаррелл, 1999 г.
• Veillonellales Campbell et al. 2015 г.
  • Veillonellaceae Рогоза 1969 исправлять. Кэмпбелл и др. 2015 г.
    • Allisonella Garner et al. 2003 г.
    • Anaeroglobus Carlier et al. 2002 г.
    • Dialister (бывший Bergey et al. 1923) Мур и Мур 1994 исправляют. Morotomi et al. 2008 г.
    • Megasphaera Rogosa 1971 исправить. Marchandin et al. 2003 г.
    • Negativicoccus Marchandin et al. 2010 г.
    • Veillonella Prevot 1933 исправить. Mays et al. 1982 г.
• Неклассифицированный
  • • Quinella ♪ Krumholz et al. 1993 г.

Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не перечисленные в Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)
♪ Прокариоты, у которых нет чистых ( аксенических ) культур, не выделенных или доступных, т.е. не может поддерживаться в культуре более чем на несколько последовательных отрывков

Ссылки [ править ]