Philippine Геном Центр ( PGC ) является многопрофильным научно - исследовательский центр в Кесон - Сити , Метро Манила , Филиппины , которая специализируется в области геномики .
Филиппинский геномный центр был впервые создан в 2009 году в ответ на вспышку атипичной пневмонии, поразившую Гонконг, вспышки денге, поразившие Филиппины, и продолжавшуюся тогда пандемию гриппа H1N1, возникшую в Мексике. Первые гранты, полученные PGC, были направлены на диагностическое тестирование лихорадки денге и эпиднадзор за H1N1 . [1] Первоначально объект был передан под юрисдикцию Управления президента Дилимана Филиппинского университета (UP) в соответствии с одобрением Попечительского совета UP на его заседании 31 июля 2009 года. [2]
26 февраля 2016 г. Попечительский совет UP одобрил передачу управления и контроля PGC из офиса президента университета в офис вице-президента по академическим вопросам. [2]
PGC имеет два «основных объекта»; основной центр по биониформатике (CFB) и основной центр по секвенированию ДНК. Биобанк планируется в качестве третьего объекта PGC в. [3] Два объекта финансировались за счет гранта в размере 100 миллионов фунтов стерлингов (2,2 миллиона долларов США) в течение трех лет от Филиппинского совета по исследованиям и разработкам в области промышленности, энергетики и новых технологий (PCIEERD) Министерства науки и технологий . [1]
Основное предприятие по секвенированию ДНК [ править ]
Открытие 24 сентября 2013 г. Основное предприятие по секвенированию ДНК (DSCF) было первым открытым центром. Геномные исследования в области сельского хозяйства, биоразнообразия, судебной экспертизы, здравоохранения и этнической принадлежности проводятся в DSCF с намерением удовлетворить потребности филиппинцев. [3] DSCF предоставляет услуги по секвенированию ДНК и генома . [1]
Core Facility for Bioinformatics (CFB) - это объект, который обеспечивает создание и анализ данных в масштабе генома для местных исследователей в академических кругах, государственных учреждений и частных организаций. Он также обеспечивает хранение геномных данных. Он также дополняется суперкомпьютером IBM Blue Gene, который также используется Филиппинским управлением атмосферных, геофизических и астрономических служб (PAGASA) и проектом Nationwide Operational Assessment of Hazards (Project NOAH) для целей прогнозирования погоды и моделирования изменения климата в дополнение к геномному. исследовательское использование. CFB был запущен 14 апреля 2014 года, а суперкомпьютер был введен в эксплуатацию в тот же день. [4]
^ a b "О" . Филиппинский центр генома . Проверено 21 апреля 2018 года .
^ a b Люсес, Ким (25 сентября 2013 г.). «Центр генома PHL открывает для местных исследователей новый центр секвенирования ДНК» . Новости GMA . Проверено 21 апреля 2018 года .
↑ Ронда, Ренье Аллан (15 апреля 2014 г.). «DOST активирует суперкомпьютер IBM» . Новости ABS-CBN . Philippine Daily Inquirer . Проверено 21 апреля 2018 года .
vтеСистема Университета Филиппин
UP - президент , UP Совет регентов
Единицы
Учредительные университеты
UP Багио
UP Себу
UP Дилиман
UP Los Baños
UP Манила
UP Минданао
UP Открытый университет
UP Visayas
Спутниковые блоки
UP South Road Properties (Себу)
UP Бонифачо Глобал Сити (Дилиман)
Программа повышения квалификации UP в Олонгапо (Дилиман)
Программа повышения квалификации UP в Пампанге (Дилиман)
Школа медицинских наук UP, Аврора (Манила)
Школа медицинских наук UP, Коронадал-Сити (Манила)
Школа медицинских наук UP, Лейте (Манила)
UP Visayas Tacloban College (Висайские острова)
Единицы основного образования
UP High School Cebu (Себу)
Средняя школа UP в Илоило (Висайи)
UP Integrated School (Дилиман)
UP Rural High School (Бэй, Лагуна)
Исследование
Национальный
Институт Морских Наук
Национальный центр транспортных исследований
Национальный колледж государственного управления и управления
Национальная защита растений
Национальный институт развития естествознания и математического образования
Национальный институт геологических наук
Национальные институты здоровья
Национальный институт молекулярной биологии и биотехнологии
Национальный институт физики
Национальный инженерный центр
Филиппинский геномный центр
Sentro ng Wikang Filipino
Международный (размещенный)
Центр биоразнообразия АСЕАН
Международный научно-исследовательский институт риса
Региональный центр образовательных инноваций и технологий SEAMEO
СЕАМЕО Сеть тропической медицины и общественного здравоохранения
Региональный центр аспирантуры и исследований в области сельского хозяйства Юго-Восточной Азии
Статьи по Теме
ДЗУП Радио Круг
Люди
Жертвоприношение
Жертвенный бег
UP – Ayala Land TechnoHub
UP – DND согласие
UP Centennial
Тест для поступления в колледж UP
UP Fighting Maroons
" UP Naming Mahal "
UP Центр города
vтеБиоинформатика
Базы данных
Базы данных последовательностей: GenBank , Европейский архив нуклеотидов и Банк данных ДНК Японии
Вторичные базы данных: UniProt , база данных последовательностей белков, объединяющая Swiss-Prot , TrEMBL и Protein Information Resource.
Другие базы данных: Protein Data Bank , Ensembl и InterPro
Специализированные геномные базы данных: BOLD , Saccharomyces Геном базы данных , FlyBase , VectorBase , WormBase , Rat Геном базы данных , PHI-база , Arabidopsis информационных ресурсов и данио рерио Информационная Сеть
Программного обеспечения
ВЗРЫВ
Галстук-бабочка
Clustal
ЭМБОСС
HMMER
МЫШЦЫ
SAMtools
Набор SOAP
TopHat
Другой
Сервер: ExPASy
Онтология: генная онтология
Розалинд (образовательная платформа)
Учреждения
Broad Institute
Китайский национальный генетический банк (CNGB)
Отдел вычислительной биологии (CBD)
Microsoft Research - Центр вычислительной и системной биологии Университета Тренто (COSBI)
Центр баз данных для наук о жизни (DBCLS)
Банк данных ДНК Японии (DDBJ)
Европейский институт биоинформатики (EMBL-EBI)
Европейская лаборатория молекулярной биологии (EMBL)
Институт Флэтайрон
Институт Дж. Крейга Вентера (JCVI)
Институт молекулярной клеточной биологии и генетики Макса Планка (MPI-CBG)
Национальный центр биотехнологической информации США (NCBI)
Японский институт генетики
Нидерландский центр биоинформатики (NBIC)
Филиппинский геномный центр (PGC)
Scripps Research
Швейцарский институт биоинформатики (SIB)
Институт Wellcome Sanger
Институт Уайтхеда
Организации
Африканское общество биоинформатики и вычислительной биологии (ASBCB)
Ресурсы по биоинформатике Австралии (EMBL-AR)
Европейская сеть молекулярной биологии (EMBnet)
Международное сотрудничество с базами данных нуклеотидных последовательностей (INSDC)
Международное общество биодокументации (ISB)
Международное общество вычислительной биологии (ISCB)
Студенческий совет (ISCB-SC)
Институт геномики и интегративной биологии (CSIR-IGIB)
Японское общество биоинформатики (JSBi)
Встречи
Базель вычислительной биологии конференции ([BC 2 ])
Европейская конференция по вычислительной биологии (ECCB)
Интеллектуальные системы для молекулярной биологии (ISMB)
Международная конференция по биоинформатике (InCoB)
ISCB Africa Конференция ASBCB по биоинформатике
Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу (PSB)
Исследования в области вычислительной молекулярной биологии (РЕКОМБ)