| Фосфотирозин-связывающий домен | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Структура PTB-домена tensin1. [1] | ||||||||||
| Идентификаторы | ||||||||||
| Символ | PTB | |||||||||
| Pfam | PF08416 | |||||||||
| ИнтерПро | IPR013625 | |||||||||
| CDD | cd00934 | |||||||||
| ||||||||||
| Домен PTB (тип IRS-1) | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 IRS-1 домен ptb в комплексе с фосфопептидом рецептора il-4, ЯМР, минимизированная средняя структура | ||||||||
| Идентификаторы | ||||||||
| Символ | IRS | |||||||
| Pfam | PF02174 | |||||||
| ИнтерПро | IPR002404 | |||||||
| УМНАЯ | PTBI | |||||||
| SCOP2 | 1cli / SCOPe / SUPFAM | |||||||
| CDD | cd01204 | |||||||
| ||||||||
В молекулярной биологии фосфотирозин-связывающие домены представляют собой белковые домены, которые связываются с фосфотирозином .
Фосфотирозин-связывающий домен (PTB, также взаимодействующий с фосфотирозином или PI-домен) в белке тензина обычно находится на С-конце . Тенсин является белком мульти-домен , который связывается с актиновыми филаментами и функций в качестве фокальной адгезии молекулы (фокальные адгезии являются областями плазматической мембраны , через которую клетки прикрепляются к внеклеточному матриксу). Тензин человека имеет сайты связывания актина , домен SH2 ( Pfam PF00017 ) и область, аналогичную опухолевому супрессору PTEN . [2] Домен PTB взаимодействует с цитоплазматическимхвосты бета- интегрина путем связывания с мотивом NPXY. [3]
Фосфотирозин-связывающий домен субстрата-1 рецептора инсулина не связан с фосфотирозин-связывающим доменом тензина. Белки субстрата-1 рецептора инсулина содержат как домен гомологии плекстрина, так и домен связывания фосфотирозина (PTB). В PTB домены облегчают взаимодействие с активированным тирозин - фосфорилируется рецептора инсулина . Домен PTB расположен ближе к N-концу . Два аргинина в этом домене ответственны за водородные связи остатков фосфотирозина на Ac -LYASSNPApY- NH2пептид в прилегающей к мембране области рецептора инсулина. Дальнейшие взаимодействия через «мостиковые» молекулы воды координируются остатками Asn и остатками Ser. [4] Домен PTB имеет компактную 7-цепочечную бета-сэндвич- структуру, ограниченную С-концевой спиралью . Пептид- субстрат входит в L-образную поверхностную щель, образованную С-концевой спиралью и нитями 5 и 6. [5]
Белки человека, содержащие эти домены [ править ]
APBA1 ; APBA2 ; APBA3 ; APPL1 ; EPS8 ; EPS8L1 ; EPS8L2 ; EPS8L3 ; TENC1 ; TNS ; TNS1 ; TNS3 ; TNS4 ; DOK1 ; DOK2 ; DOK3 ; DOK4 ; DOK5 ; DOK6 ; DOK7 ; FRS2 ; FRS3 ; IRS1 ; IRS2 ; IRS4 ; NOS1AP ;TLN1 ; TLN2
См. Также [ править ]
- Домены SH2 также связывают фосфорилированные тирозины.
Ссылки [ править ]
- ^ McCleverty CJ, Lin DC, Liddington RC (июнь 2007). «Структура домена PTB тензина1 и модель его рекрутирования на фибриллярные адгезии» . Protein Sci . 16 (6): 1223–9. DOI : 10.1110 / ps.072798707 . PMC 2206669 . PMID 17473008 .
- ↑ Chen H, Ishii A, Wong WK, Chen LB, Lo SH (октябрь 2000 г.). «Молекулярная характеристика тензина человека» . Биохим. Дж . 351 (2): 403–11. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3510403 . PMC 1221376 . PMID 11023826 .
- ↑ Lo SH (январь 2004 г.). «Тенсин». Int. J. Biochem. Cell Biol . 36 (1): 31–4. DOI : 10.1016 / S1357-2725 (03) 00171-7 . PMID 14592531 .
- ↑ Eck MJ, Dhe-Paganon S, Trub T, Nolte RT, Shoelson SE (май 1996). «Структура домена IRS-1 PTB, связанного с прилегающей мембранной областью рецептора инсулина». Cell . 85 (5): 695–705. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81236-2 . PMID 8646778 . S2CID 8896348 .
- ^ Чжоу М.М., Хуан Б., Олейничак Е.Т., Медоуз Р.П., Шукер С.Б., Миядзаки М., Труб Т., Шоелсон С.Е., Фесик С.В. (апрель 1996 г.). «Структурная основа распознавания фосфопептида рецептора IL-4 доменом IRS-1 PTB». Nat. Struct. Биол . 3 (4): 388–93. DOI : 10.1038 / nsb0496-388 . PMID 8599766 . S2CID 41440041 .
Внешние ссылки [ править ]
- Ресурсный мотив Eukaryotic Linear Motif, класс LIG_PTB_Phospho_1
