Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Питовирус
Pithovirus sibericum sketch.jpg
Классификация вирусов
Группа:
Группа I ( дцДНК )
Заказ:
Megavirales
Семья:
Pithoviridae
Род:
Питовирус
Разновидность
  • P. massiliensis
  • P. sibericum

Питовирус , впервые описанный в статье 2014 года, представляет собой род гигантского вируса, известного от двух видов, Pithovirus sibericum , который поражает амеб [1] [2] и Pithovirus massiliensis . [3] Это двухцепочечный ДНК-вирус, который входит в кладу ядерно-цитоплазматических крупных ДНК-вирусов . Открытие 2014 года было сделано, когда жизнеспособный образец был обнаружен в 30-тысячном ледяном керне, извлеченном из вечной мерзлоты в Сибири , Россия.

Описание [ править ]

Название рода Pithovirus , отсылка к большим контейнерам для хранения древней Греции, известным как pithoi , было выбрано для описания нового вида. Образец питовируса имеет размеры примерно 1,5  мкм (1500 нм ) в длину и 0,5 мкм (500 нм) в диаметре, что делает его самым крупным вирусом, который когда-либо был обнаружен. Это на 50% больше по размеру , чем Pandoraviridae , предыдущие крупнейших известные вирусы, [4] больше , чем Ostreococcus самой маленькая эукариотической клетки, хотя Pandoravirus имеет самый большой вирусный геном, содержащий от 1,9 до 2,5 megabases из ДНК . [5]

Питовирус имеет толстую овальную стенку с отверстием на одном конце. Внутренне его структура напоминает соты . [1]

Генома из Pithovirus содержит 467 различных генов , больше , чем типичный вируса , но намного меньше , чем 2556 предполагаемых белок-кодирующих последовательностей , обнаруженных в Pandoravirus . [4] Таким образом, его геном гораздо менее плотно упакован, чем любой другой известный вирус. Две трети его белков не похожи на белки других вирусов. Несмотря на физическое сходство с Pandoravirus , последовательность генома Pithovirus показывает, что он почти не связан с этим вирусом, но больше напоминает представителей Marseilleviridae , Megaviridae и Iridoviridae . [6]Все эти семейства содержат большие икосаэдрические вирусы с ДНК-геномами. Pithovirus геном имеет 36% GC-содержание , похожий на Megaviridae , в отличие от более чем 61% для pandoraviruses. [7]

Репликация [ править ]

Геном питовируса представляет собой одну кольцевую хромосому с двухцепочечной ДНК ( дцДНК ) из примерно 610 000 пар оснований (п.н.), кодирующую примерно 467 открытых рамок считывания (ORF), которые транслируются в 467 различных белков. [8] Геном кодирует все белки, необходимые для производства мРНК ; эти белки присутствуют в очищенных вирионах. [6] Питовирус, таким образом, проходит полный цикл репликации в цитоплазме хозяина , а не более типичный метод захвата ядра хозяина. [1] [6] [9]

Открытие [ править ]

Pithovirus sibericum был обнаружен в образце вечной мерзлоты Сибири возрастом 30 000 лет Шанталь Абергель и Жан-Мишель Клавери из Университета Экс-Марсель . [1] [10] Вирус был обнаружен погребенным на 30 м (100 футов) ниже поверхности отложений позднего плейстоцена . [2] [6] Это было обнаружено, когда образцы, собранные на берегу реки в 2000 году, подверглись воздействию амеб . [11] Амебы начали умирать, и при исследовании было обнаружено, что они содержат гигантские образцы вируса. Авторы заявили, что идея исследовать образцы вечной мерзлоты на наличие новых вирусов пришла к авторам после того, как они прочитали об эксперименте, в котором были возрождены семена аналогичного возрастаSilene stenophylla двумя годами ранее. [1] Результатыисследования питовируса были опубликованы в Proceedings of the National Academy of Sciences в марте 2014 года. [4] [7] Хотя вирус безвреден для людей, его жизнеспособность после тысячелетнего замораживания вызвала опасения, что глобальное изменение климата иБурение в тундре может привести к обнаружению ранее не обнаруженных и потенциально патогенных вирусов. [4] Однако другие ученые спорят, что этот сценарий представляет реальную угрозу. [1]

Современный вид этого рода, Pithovirus massiliensis , был изолирован в 2016 году. Ключевые особенности, такие как порядок ORF и орфанных генов (ORFans), хорошо сохраняются между двумя известными видами. [3]

Эволюция [ править ]

Скорость мутации генома была оценена как 2,23 × 10 -6 замен / сайт / год. [12] Авторы предположили, что эти вирусы возникли по крайней мере сотни тысяч лет назад.

См. Также [ править ]

  • ДНК-вирус
  • Список вирусов
  • Микробиология
  • Вирусология
  • Классификация вирусов

Ссылки [ править ]

  1. ^ Б с д е е Yong, Ed (3 марта 2014). «Гигантский вирус воскрес из льда возрастом 69 000 лет». Природа . DOI : 10.1038 / nature.2014.14801 .
  2. ^ a b Морелль, Ребекка (3 марта 2014 г.). «Гигантский вирус, которому 30 000 лет,« оживает » » . BBC News .
  3. ^ a b Levasseur A, Андреани J, Делерс J, Боу Халил J, Роберт C, Ла Скола B, Рауль Д. (июль 2016 г.). «Сравнение современного и ископаемого питовируса показывает его генетическое сохранение и эволюцию» . Genome Biol Evol . 8 (8): 2333–9. DOI : 10.1093 / GbE / evw153 . PMC 5010891 . PMID 27389688 .  
  4. ^ a b c d Сиручек, Стефан (3 марта 2014 г.). "Древний" гигантский вирус "возродился из вечной мерзлоты Сибири" . National Geographic .
  5. ^ Brumfiel, Geoff (18 июля 2013). «Самый большой вирус в мире может иметь древние корни» . Национальное общественное радио .
  6. ^ a b c d Раканиелло, Винсент (4 марта 2014 г.). «Питовирус: больше, чем Пандоровирус, с меньшим геномом» . Блог вирусологии .
  7. ^ а б Лежандр, М .; Bartoli, J .; Шмакова, Л .; Jeudy, S .; Labadie, K .; Адрайт, А .; Lescot, M .; Пуаро, О .; Bertaux, L .; Bruley, C .; Coute, Y .; Ривкина, Е .; Abergel, C .; Claverie, J.-M. (Март 2014 г.). «Тридцатитысячелетний дальний родственник гигантских икосаэдрических ДНК-вирусов с морфологией пандоровируса» . Proc. Natl. Акад. Sci. США 111 (11): 4274–9. Bibcode : 2014PNAS..111.4274L . DOI : 10.1073 / pnas.1320670111 . PMC 3964051 . PMID 24591590 .   
  8. ^ "Pithovirus sibericum" . Швейцарский институт биоинформатики (SIB) . Проверено 10 марта 2014 .
  9. ^ Колен, Энди (3 марта 2014). «Самый крупный вирус, возродившийся из вечной мерзлоты каменного века» . NewScientist . Архивировано 5 марта 2014 года.
  10. ↑ Паппас, Стефани (16 сентября 2015 г.). «Замороженный гигантский вирус все еще заразен спустя 30 000 лет» . Yahoo News . Проверено 20 сентября 2015 года .
  11. Рианна Циммер, Карл (3 марта 2014 г.). "Из сибирских льдов возродился вирус" . Нью-Йорк Таймс .
  12. ^ Duchêne, S; Холмс, ЕС (2018). «Оценка темпов эволюции гигантских вирусов с использованием древних геномов» . Virus Evol . 4 . DOI : 10,1093 / ве / vey006 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Вирусная зона : питовирус
  • « Pithovirus sibericum » . Браузер таксономии NCBI . 1450746.