Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Остреококк
Научная классификация е
(без рейтинга):Виридипланты
Тип:Хлорофита
Учебный класс:Mamiellophyceae
Заказ:Mamiellales
Семья:Батикокковые
Род:Ostreococcus
C. Courties & M.-J. Кретьенно-Дине (1995)
Разновидность

Ostreococcus - это род одноклеточных кокковидных или шаровидных зеленых водорослей, принадлежащих к классу Mamiellophyceae . В его состав входят видные представители глобальногосообщества пикопланктона , играющего центральную роль в углеродном цикле океана.

История [ править ]

Первый представитель этого рода, O. tauri , был обнаружен в 1994 году при исследовании пикопланктона в лагуне Тау Куртисом и Кретьенно-Дине с использованием проточной цитометрии . [1] Одноклеточные фотосинтезирующие организмы обычно поддаются изучению с помощью проточной цитометрии из-за аутофлуоресценции, обеспечиваемой хлорофиллом и другими флуорофорами.используется клетками для сбора и контроля солнечного света, что позволяет изучать такие пигменты без какого-либо окрашивания клеток. Различные присутствующие пигменты можно различать и идентифицировать для каждой клетки с помощью проточной цитометрии, что позволяет исследователям выявлять различные виды, присутствующие в образце, и помогать классифицировать любые новые обнаруженные виды. [2] O. tauri был немедленно отнесен к классу Prasinophyceae на основании присутствия характерных пигментов хлорофилла и связанных с Chlorophyceae каротиноидов [1], а также ультраструктуры клетки, и его положение было позже подтверждено анализом его 18S рДНК. [3] Молекулярно-филогенетический анализ, основанный на последовательности 18SrDNA, привел к определению нового класса Mamiellophyceae, который содержит виды Ostreococcus, и поместил их в семейство Bathycoccaceae . [4] Mamiellophyceae представляют собой одну из наиболее экологически успешных групп эукариотических фотосинтезирующих пикопланктеров в морской и, вероятно, пресноводной среде. Метагеномные [5] и метабаркодирующие [6] исследования выявили присутствие других представителей рода Ostreococcus во многих океанических регионах. На сегодняшний день описано четыре разных вида: O. tauri , O. lucimarinus , [7] O. mediterraneus [8] и O spp. RCC809. [9]

Анатомия [ править ]

Род содержит самые маленькие из известных свободноживущих эукариотических видов, средний размер которых составляет 0,8 мкм. [1] ультраструктуры клеток в этом роде до сих пор характеризуются замечательной простотой, будучи кокковидные клетки , лишенные клеточной стенки и содержащие один хлоропласт , единственный митохондрии , и единый корпус Гольджи , а также его ядра . [1] Доступны последовательности генома трех представителей этого рода: ядерный геном O. tauri RCC4221 размером 13 Mb, опубликованный в 2006 г. [10] и обновленный в 2014 г .; [11] O. lucimarinusCCMP2514 [7] и штамм RCC809. [9] Проект метаболических сетей этих двух видов Ostreococcus был реконструирован из базы данных KEGG , термодинамически ограничен, элементно сбалансирован и функционально оценен в 2012 году. [12]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c d Courties, C. et al. (1994). «Самый маленький эукариотический организм» Nature 370 : 255
  2. ^ Davey, HM и Kell, DB (1996) "Проточная цитометрия и сортировка клеток гетерогенных микробных популяций: важность анализа отдельных клеток" Microbiological Reviews 60 (4): 641-696
  3. ^ Courties, C. et al. (1998). «Филогенетический анализ и размер генома Ostreococcus tauri (Chlorophyta, Prasinophyceae)» J. Phycol. 34 (5): 844-849.
  4. ^ Марин Б, Мелконян М. (2010). Молекулярная филогения и классификация класса Mamiellophyceae. ноя (Chlorophyta) на основе сравнения последовательностей оперонов рРНК, кодируемых ядром и пластидом. Протист . 161 (2) : 304-36. DOI: 10.1016 / j.protis.2009.10.002.
  5. ^ Piganeau G, H. Moreau (2007). Скрининг метагенома Саргассова моря на предмет данных для исследования эволюции генома Ostreococcus . Джин . 406 : 184-90 DOI: 10.1016 / j.gene.2007.09.015
  6. ^ Demir-Hilton E et al . (2011). Глобальные закономерности распространения отдельных клад фотосинтетических пикоэукариот Ostreococcus . ИСМЕ Дж . 5 (7) : 1095-107. DOI: 10.1038 / ismej.2010.209.
  7. ^ a b Крошечный эукариот Ostreococcus дает геномное понимание парадокса видообразования планктона. Слушания Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки 104 : 7705–7710. DOI: 10.1073 / pnas.0611046104
  8. ^ Субирана Л. и др. (2013). Морфология, пластичность генома и филогения рода ostreococcus позволяют выявить криптический вид O. mediterraneus sp. ноя (Mamiellales, Mamiellophyceae). Протист . 164 (5) : 643-59. DOI: 10.1016 / j.protis.2013.06.002.
  9. ^ а б http://genome.jgi-psf.org/OstRCC809_2/OstRCC809_2.home.html
  10. ^ Derelle, E. et al. (2006). «Анализ генома самого маленького свободноживущего эукариота Ostreococcus tauri раскрывает множество уникальных особенностей» Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки 103 : 11647-52.
  11. ^ Blanc-Mathieu R и др. (2014). Улучшенный геном модельной морской водоросли Ostreococcus tauri раскрывается путем оценки сборок Illumina de novo. BMC Genomics . 15 : 1103. DOI: 10.1186 / 1471-2164-15-1103.
  12. ^ Элиас В. Крумхольц и др. (2012). «Полногеномная реконструкция метаболической сети picoalga Ostreococcus » Журнал экспериментальной ботаники 63 (6) : 2353-2362.