Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Остреококк Таури
Просвечивающая электронная микрофотография клетки О. таури
Научная классификация редактировать
(без рейтинга):Виридипланты
Тип:Хлорофита
Учебный класс:Mamiellophyceae
Заказ:Mamiellales
Семья:Батикокковые
Род:Остреококк
Разновидность:
О. таури
Биномиальное имя
Остреококк Таури
C. Courties и M.-J. Кретьенно-Дине (1995)

Ostreococcus Тельца является одноклеточные виды из морских зеленых водорослей около 0,8 микрометров (мкм) в диаметре, наименьшего свободного живого (не симбиотической ) эукариот еще описано. У него очень простая ультраструктура и компактный геном .

Являясь обычным членом глобальных океанических популяций пикопланктона , этот организм играет важную роль в углеродном цикле во многих областях. В последнее время О. Тельца было предметом исследований с использованием сравнительной геномики и функциональной геномики , [1] [2] [3] [4] , поскольку это представляет интерес для исследователей из - за своего компактного генома и зеленой линии.

История [ править ]

Ostreococcus tauri был обнаружен в 1994 году в лагуне Тау , Франция , в ходе годичного исследования популяции пикопланктона лагуны с использованием проточной цитометрии . Было обнаружено, что O. tauri является основным компонентом популяции пикопланктона в лагуне, а изображения клеток, полученные с помощью просвечивающей электронной микроскопии, выявили самые маленькие, но описанные свободноживущие эукариотические клетки. [5] O. tauri был немедленно отнесен к классу Prasinophyceae на основании наличия характерных пигментов хлорофилла и связанных с Chlorophyceae каротиноидов , [5]и эта классификация была подтверждена дальнейшей работой. [6] [7]

Анатомия [ править ]

Клетки имеют приблизительно сферическую форму ( кокковидные ), в среднем около 1 мкм в длину и 0,7 мкм в ширину. Ультраструктура клетки очень проста, в ней отсутствует клеточная стенка и она состоит из ядра , единственной митохондрии , единственного хлоропласта и единственного аппарата Гольджи . [5] В клетках также отсутствуют жгутики .

Первоначально описанное как содержащее 14 хромосом [7], теперь известно, что ядро ​​содержит 20 хромосом [ необходима цитата ] , всего около 33 фг ДНК . [5]

Экология [ править ]

Ostreococcus tauri - доминирующий вид водорослей по количеству клеток в лагуне Тау на юге Франции. Считается, что условия, которые приводят к такому преобладанию, заключаются, во-первых, в том, что лагуна используется для интенсивного выращивания моллюсков, а во-вторых, в том, что уровни меди в лагуне высоки. Первое соображение выбирает клетки меньшего размера ( пикопланктон ); более крупные эукариотические виды водорослей и многие хищники более мелких водорослей преимущественно потребляются моллюсками, которые являются фильтраторами . Второе соображение направлено против цианобактерий , поскольку считается , что O. tauri лучше справляется с «неблагоприятными условиями». Считается, что избыток меди в лагуне происходит из-за сельскохозяйственных химикатов, используемых окружающимивиноградники . [8]

Использовать в качестве модельного организма [ править ]

Еще в 1998 году O. tauri был определен как «хороший кандидат для биологических моделей, таких как исследования деления клеток и / или секвенирования генома». [7]

Геномика [ править ]

В 2006 году геном O. tauri был секвенирован Derelle et al. . [1] 12.56 Мб геном организован в 20 хромосомах показали крайнюю плотность генов и несколько интронов отработанных генов. Были идентифицированы две хромосомы с внешними характеристиками (содержание G + C, структура интрона ), а именно хромосома 2 и хромосома 19. Секвенирование других видов отряда Mamiellales показало наличие подобных удаленных хромосом у других видов ( O. lucimarinus , [2] Micromonas pusilla [9] и B. prasinos [10] ).

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b Дерелль, Э., Ферраз, К., Ромбоутс, С., Рузе, П., Уорден, Аризона, Роббенс, С.,… Моро, Х. (2006). Анализ генома самого маленького свободноживущего эукариота Ostreococcus tauri выявил множество уникальных особенностей. Слушания Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки, 103 (31), 11647–52. http://doi.org/10.1073/pnas.0604795103
  2. ^ a b Паленик, Б., Гримвуд, Дж., Аертс, А., Рузе, П., Саламов, А., Патнэм, Н.,… Григорьев, И.В. (2007). Крошечный эукариот Ostreococcus дает геномное понимание парадокса видообразования планктона. Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки, 104 (18), 7705–10. http://doi.org/10.1073/pnas.0611046104
  3. ^ Blanc-Матье, Р., Verhelst Б., Derelle Е., Rombauts С., Bouget, F.-Y., Карре, И., ... Piganeau, G. (2014). Улучшенный геном модельной морской водоросли Ostreococcus tauri раскрывается путем оценки сборок Illumina de novo. BMC Genomics, 15 (1), 1103. http://doi.org/10.1186/1471-2164-15-1103
  4. ^ Krumholz, EW, Ян Х., Weisenhorn П., Генри, CS, и Либурель, ИГЛ (2012). Полногеномная реконструкция метаболической сети picoalga Ostreococcus. Журнал экспериментальной ботаники, 63 (6), 2353–2362. http://doi.org/10.1093/jxb/err407
  5. ^ a b c d Courties, C. et al. (1994). Самый маленький эукариотический организм. Природа 370 : 255.
  6. ^ Courties, C. et al. (1995). Новый морской пикоэукариот - Ostreococcus tauri Gen et Sp-NOV (Chlorophyta, Prasinophyceae). Phycologia 34 (4): 285-292
  7. ^ a b c Courties, C. et al. (1998). «Филогенетический анализ и размер генома Ostreococcus tauri (Chlorophyta, Prasinophyceae)» J. Phycol. 34 (5): 844-849.
  8. ^ Vaquer, A. et al. (1996). Запас и динамика пикофитопланктона в лагуне Тау (северо-западное побережье Средиземного моря). Лимнология и океанография 41 (8): 1821-1828
  9. ^ Уорден, AZ, Ли, J.-H., Мок, Т., Rouzé, П. Симмонс, М., Аэртс, AL, ... Григорьев, IV (2009). Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas. Наука, 324 (5924), 268–272. http://doi.org/10.1126/science.1167222
  10. ^ Moreau, Х., Верхельст, Б., Couloux, А., Derelle Е., Rombauts, С., Гримсли, Н., ... Vandepoele, К. (2012). Функции генов и структура генома Bathycoccus prasinos отражают клеточную специализацию, лежащую в основе зеленой линии. Геномная биология, 13 (8), R74. http://doi.org/10.1186/gb-2012-13-8-r74